BAC end | BAC-end 1 | BAC-end 2 |
---|
end name | MSMg01-161H13.T7 (MSMg01no161_h13.b1) | MSMg01-161H13.TJ (MSMg01no161_h13.g1) |
ACC | AG360868 | AG360869 |
length | 1,282 | 1,275 |
length of high quality (start - end) | 414 (41 - 454) | 380 (70 - 449) |
definition | CHROMAT_FILE: MSMg01no161_h13.b1 PHD_FILE: MSMg01no161_h13.b1.phd.1 CHEM: term DYE: big TIME: Tue May 17 19:28:07 2005 | CHROMAT_FILE: MSMg01no161_h13.g1 PHD_FILE: MSMg01no161_h13.g1.phd.1 CHEM: term DYE: big TIME: Tue May 17 19:28:07 2005 |
singlet/doublet | --- | singlet |
---|
BLAST hit | no hit data | unique |
---|
sequence | NNGGACACTGGGCGCTAXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXCGCGGAATTC
TAGGATAATCAGGCCTACAAACAGAGACCTTGTCTCAAACAAAACAACAA
CAACAACAACAAAACCAAACAAACAAACAACAAGAACAACAACAACAAAA
TGCCCTCCAGACCAAAATAACACATTCCCAAATTTTAGGAGGCTGGAAAG
ATGGCTCTGCAGTTAAGAGCAGTGGCTGCTCTTCCTGAATACTTAGGTTT
AACTGCCAGCATCTACCCAGTGCTTCACAACTGTCTGTAACTCCAGTTCT
GGGATTCCAATGCCCTCTTTATTCTCCTTGAACACCACATACATGTGAGC
AAAATACCTATATACATAAAAGGGGGGTGGTGATGAGCCTCTGTGAGCAC
TGTTTTTTCTTTATGTCTTTGTGAATCCCTTCCTTGCCAAGCAGCACTTA
CTTTTTTTTCCCCCCCCCCCCTGGGTNTTTGGTAGAACTCAAAAAGAGAG
GGGAGATAGTATTCTTCAGGTTTCCATCTGTCCTGGAGCTGATCATGTGC
CTCCATACTCAAATACCGCTGGGAGAGAGCTGGTCTTCCAGGAGTGCCAA
CACAAATGTGAGCACAGGTAAGACCACCACTGGAGAGAGTTTACACTACC
AGCTTAACAACACACCTGAAAACTCTAGAACAAAAATGAGCAAATTCACC
CAAGAGGAGTAGATGGCAGGAAATAATCAAACTCAGGGCTGAAATCTACC
AAGTAGAAACAAAAAGAACTATACTAAGAATCTACCAAACCAGGAGCTGA
TTCTTTAAAAAAATCACCAAGAAAGATAACCCCTTAGCCAGACAAACCAT
AAGGGTCAGAGACTGTATCCTTATTTAGAAAATCAGAAATTGAAAGGGAG
ATCTTACAACAGCTTCTGAGGAAATTAAAAAAAAAACCTTCAAATTCTAT
TACAAATGCCTTATATTTACCCTACTGGGAAAATTTGATTTAATGGACAG
GTTTCTTTAACTAAATCTCATTCTCTCAACTTATTCTCGGATTTAAAAAA
CCTTCTTCTGTGTCCTCCAAAAAAAAAATAAGACATTATTATATATTCCT
CCCCCTTAAATTATCCATGACCAAATGTGGTTATTGGTATAATTCTCCTC
CCTTTTTTAAGTAATTGATACTTTGTACTCTCTCACTTTCCTCCCTCTAA
ATATTCAACATCTCTTTTCCTTCCTTCTCTCATCTTAATTATTTCCATTA
TATTCCTCCGAATGCAATATCTCAGATATCTT
| NNGGAAGAAGGNAGGCTGGGGCGCCXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXX
XXXXXXXXXXXXXXXXXXXAATGATCAGATGCAGTGTGAATTATAAAAGG
AAGCATATATTCCTAAGGATCAGGCCCGCTTGTGCTCCACGATGTGATTT
CTCTTCTTTCTGACCCTCTGACCAGTGCTCAGCACCAAGCCAGGATTCAT
GTTGTTTCTCCAATGAAAGGAATTCTGCTGTCTCTAAACACACCTTGTAT
TGATTTGCTTCTTAACTTTAGTTCAGGCTGTATGTTAAAATAGATGAAGA
CACTCATTTAACTGTTCTAAGCACATGTGTCTGTTTTGTTTGGTTTGTCT
CAATGTTGATTCTTTTCACTTTCTGGAAGAGTATCCTTGCAGTTTCTGTT
TTTTGCATAATATTTGAAGTTTCAATGCCCACAGGGATTTTTTTTTTTTT
TTTTTTTCCCCCCCCCCCCCNNANAGAAANTGCCTCAAAAAAAAAAGGGG
AGCCGCCTGACCTGGGAAAGATCTGTGTGTCTCTTAGGGCCTCCCAAGTC
TCACCCACAATGCACTGGAAGTCCCTGCTGGTGAAACAAGTTCATCTTGC
TGTGACAGGAAACCTAACTCTACATGTCCACATAGAGAACCCCAGGTTCA
ATTGGAGGCTAACTTAATAGGTAGGTGCTGGTAAAAGGATGACAACAACA
CGTTGTCAGGGACTGCCAGCCTGCACAGACTGTTTTCTCGACTTGCTGAA
CAAGGGTCCCAAATTCTCAGGGTTAATTTTTTTAATTTGTTCTCTGATAT
GGGTACTCCCTTGTCATACCTTTTTAGCTTATACTTCACTATCGCCTCAC
CTTCTGATAATTCTTTTTCTTTTTATACATGTTATAAAAATGTGACCTCT
AAGTGTTTGTTTTTTTCTTATAAATCCTAATATATATGTCAAATATTCCA
TTTTCTTTTTGATTTTTTTTTTTCTCTTTTTTTATAATATTATACATTTT
TTTCTATCTCTTTTATTTCTTTTTATTTATTCATATTATATCTTATTTTT
TTTTTATTCTATTTTTCTCTTTTTTCTATAATACTACTTCTATTATATTT
GTTCTCTCTTCTATTTTTTTTTTATCTTCTCTACTACAACTTATTTCATT
CTATTTTTCGTTCTTCTCACTTTCTTTTTNTTATTATTCTATCTTTTCAT
TAGTATATTTACTTTAATCTTTATATCATTATTATTTCTNTTATATCATC
TTCTTCTTTTTCATTTGATCTTTAT
|
quality values | Open.Hide. 0 0 3 6 6 6 6 6 6 8 8 9 10 11 10 9 8 8 8 8 12 16 10 10 10 13 12 14 19 19 35 47 34 37 34 36 36 37 37 40 50 48 48 48 42 47 47 47 47 47
41 41 41 41 42 50 47 48 48 54 54 54 54 43 42 36 36 22 28 28 39 39 47 47 48 57 57 57 50 50 50 50 48 47 47 50 50 57 44 43 28 32 32 33 35 59 59 59 54 48
48 59 59 59 59 59 59 57 57 57 57 57 57 57 57 57 50 48 48 59 59 59 59 59 29 24 12 11 12 15 18 28 25 46 46 47 59 59 48 48 48 59 57 50 48 48 48 50 57 57
57 59 57 57 57 50 53 53 54 54 54 57 57 68 68 68 50 50 50 50 50 50 48 48 48 50 50 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 59 59 57 57 57 57 57 59 59 59 57
57 57 57 57 57 57 57 57 59 59 59 57 68 57 57 57 57 57 59 59 59 48 48 47 57 52 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 59 57 57 57 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68
57 57 57 57 57 57 59 59 59 57 57 57 57 57 68 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 68 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 54 57 57
57 57 59 59 59 57 68 57 57 57 57 57 59 59 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 59 59 59 47 43 43 47 47 57 57 68 68 68 68 59 59 57 57 57 57 57 57 57 57
59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 54 54 48 59 48 59 59 59 54 48 48 48 48 59 59 59 57 43 57 57 57 57 57 57 59 59 59 47 43 43 40 37 30 25 16 16
11 12 12 19 14 16 18 26 30 43 59 59 47 48 48 48 48 57 59 59 59 48 47 59 39 48 48 59 59 59 59 48 48 47 59 43 59 59 59 59 59 59 59 48 34 32 28 23 31 18
18 14 11 16 15 18 18 15 18 18 18 25 27 32 19 19 15 8 10 9 9 10 12 25 23 3 0 3 9 19 18 15 12 11 12 12 22 12 11 11 12 23 17 7 6 6 6 6 6 11
16 17 27 18 18 9 9 8 8 6 7 17 19 43 43 59 46 41 43 40 40 44 43 59 59 59 39 43 43 39 35 35 32 34 28 35 32 42 37 48 48 48 48 54 59 59 59 54 54 57
57 57 59 54 54 54 54 48 44 44 37 37 39 43 46 47 57 43 43 42 44 37 43 46 57 57 57 57 57 57 44 42 33 33 32 40 40 44 42 42 42 35 35 31 35 35 39 39 39 40
44 46 37 37 36 44 28 25 23 28 24 31 20 20 20 32 28 30 23 31 24 28 18 23 12 14 14 24 24 32 39 31 33 28 28 30 29 22 33 42 40 37 42 36 35 29 40 33 33 33
25 25 25 28 32 30 28 28 30 30 28 25 18 21 13 24 25 34 26 24 30 19 19 22 24 24 30 28 14 17 16 15 14 18 28 30 24 31 19 16 14 16 16 20 23 24 17 17 26 32
23 23 23 23 23 28 28 18 20 15 10 10 11 21 18 21 30 32 26 24 30 32 36 36 37 26 22 15 11 11 15 21 26 23 28 21 15 12 12 12 25 16 11 10 8 8 7 7 12 17
17 28 28 30 22 22 14 16 17 16 14 20 28 28 22 19 10 11 13 16 19 17 15 11 11 11 16 16 12 18 15 10 10 11 13 11 14 19 22 11 12 12 10 10 11 9 9 11 26 22
25 12 11 11 15 15 9 10 10 12 13 11 12 16 12 10 10 10 12 11 8 8 8 8 8 8 12 12 16 21 19 18 13 10 10 8 8 8 10 10 13 22 16 12 12 15 15 12 15 10
10 9 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 6 6 8 8 10 9 14 6 6 7 7 8 8 11 9 9 9 15 14 14 13 9 10 10 10 8 10 9 8 10 8 8 9 8 8 8 8 10
8 9 8 8 7 7 10 6 10 8 8 8 8 8 9 12 12 13 10 10 10 10 10 8 8 8 8 8 8 9 14 19 24 11 11 11 11 9 11 10 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8
8 9 14 14 12 12 15 15 16 10 10 8 9 8 8 11 11 11 11 12 8 9 9 8 10 8 9 8 8 10 16 15 13 11 10 8 8 8 8 8 8 8 8 8 10 10 11 11 11 11
9 9 15 10 8 8 8 10 9 8 9 9 8 8 6 6 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 10 8 10 10 9 8 11 7 7 8 8 8 8 8 8 8 8 8 9 10 10 10 19 18
18 12 6 6 6 6 6 7 8 6 11 10 8 8 6 6 8 8 10 10 10 16 10 9 9 9 10 10 11 11 6 6 6 6 8 8 8 8 8 8 8 8 7 6 6 8 8 8 11 19
17 12 6 11 11 10 9 10 10 12 10 7 6 8 8 8 6 6 8 8 9 10 10 9 9 12 11 8 6 6 6 8 8 8 8 8 8 8 8 8 9 9 9 8 8 6 7 6 6 8
8 6 6 8 10 12 11 11 8 8 6 6 6 6 6 6 6 8 8 8 8 8 8 9 9 9 8 8 8 8 8 8 8 6 6 10 10 12 8 10 10 12 9 9 11 8 8 6 6 6
6 8 8 8 10 6 6 6 6 6 6 6 8 8 8 10 10 15 13 10 10 6 6 8 6 6 13 12 10 10 10 10 10 8 8 8 8 6 6 7 7 11 13 10 8 8 6 6 8 8
7 6 6 6 6 8 7 7 6 6 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 7 6 8 8 8 8 9 10 12 12 12 12 | Open.Hide. 0 0 3 6 6 6 6 8 8 6 3 0 3 6 6 8 6 6 6 6 15 16 15 12 9 9 8 11 13 27 21 17 10 10 11 21 21 33 28 29 28 29 34 36 36 36 36 37 43 50
47 47 42 57 48 57 57 57 57 57 48 48 43 43 31 32 31 37 31 31 30 32 39 37 36 42 30 30 30 37 37 36 26 14 14 14 21 20 24 18 22 28 28 25 28 36 39 43 43 39
39 39 39 36 36 39 43 43 48 48 47 42 42 33 33 33 39 48 48 40 40 40 39 30 30 11 8 8 8 8 15 14 33 33 37 37 37 37 43 36 39 36 39 36 39 39 43 43 47 47
42 42 42 48 48 48 48 47 42 43 36 36 43 46 46 48 46 41 39 39 36 42 29 28 18 18 20 31 27 40 33 37 30 37 37 59 57 57 57 57 42 42 35 35 35 44 44 42 33 33
35 42 42 44 57 43 44 44 46 44 57 57 43 43 43 44 50 50 35 41 41 50 43 43 52 52 43 43 43 43 52 52 52 52 50 52 52 52 52 57 52 54 50 50 43 43 22 32 32 43
43 52 57 59 52 52 52 57 52 57 57 43 43 39 57 57 57 57 57 52 57 52 52 57 57 50 43 39 39 39 50 43 52 52 57 57 57 57 57 44 44 27 23 23 43 43 38 35 35 35
44 43 42 43 37 37 37 44 44 43 42 32 33 42 44 50 54 47 46 46 47 44 44 36 42 35 42 42 42 42 43 44 43 47 59 48 48 44 59 42 42 35 59 47 43 46 43 43 43 47
42 39 30 30 32 42 37 43 43 46 48 54 57 59 48 48 48 48 43 43 43 46 39 42 37 36 36 25 25 25 33 33 40 43 43 57 43 47 39 47 47 47 41 32 22 22 11 12 12 21
19 13 12 11 12 12 28 30 41 46 46 46 59 48 48 48 48 57 48 48 48 48 47 47 35 35 35 34 30 20 20 15 23 16 14 14 15 27 34 43 47 37 37 32 35 22 23 11 12 15
22 23 23 23 20 11 11 15 16 19 19 32 32 32 21 21 21 12 10 3 0 0 3 0 3 22 20 9 3 0 3 13 8 8 6 6 12 9 24 26 24 26 16 9 8 8 8 8 8 9
9 9 9 15 13 13 8 10 10 19 12 24 22 28 25 35 35 39 39 47 47 32 25 25 12 10 10 10 12 19 21 33 37 32 32 31 28 35 32 32 31 30 30 35 40 27 14 12 12 26
27 36 39 37 31 28 15 15 13 15 18 19 18 22 18 18 20 25 36 22 22 19 27 24 19 22 12 12 28 24 32 35 37 32 33 25 25 29 21 25 21 29 15 18 17 30 28 32 17 17
17 24 24 26 19 15 12 12 13 24 32 28 28 28 28 24 13 11 10 15 15 15 10 12 12 10 9 9 10 10 12 15 15 12 12 13 15 15 21 13 15 13 11 19 11 17 17 30 26 19
19 16 19 17 14 8 8 6 6 8 8 9 10 26 13 12 11 13 11 8 8 8 8 8 10 11 11 11 10 11 11 15 10 10 8 8 8 11 10 11 11 16 10 10 10 10 10 15 15 19
16 8 8 6 6 8 8 10 13 10 14 15 15 15 10 10 8 10 8 9 15 24 9 8 10 10 8 8 9 19 13 8 10 10 14 14 10 10 11 10 9 8 8 8 8 11 10 12 9 8
8 8 8 8 8 8 8 15 8 8 8 12 10 15 12 12 9 9 9 9 9 9 10 10 13 10 9 9 10 14 15 12 10 8 6 6 8 8 10 9 10 10 10 10 9 9 9 9 9 9
9 9 11 9 8 7 8 8 8 11 12 10 8 8 8 8 8 8 8 8 8 15 15 15 14 10 10 10 8 8 6 6 6 6 8 10 10 6 6 8 8 8 10 10 8 8 8 6 7 8
8 15 8 8 10 9 9 9 9 10 9 16 16 21 12 12 11 9 9 9 12 8 8 8 8 8 9 10 10 11 15 10 12 8 8 8 8 10 10 9 9 9 9 9 9 9 10 12 12 12
12 11 12 11 11 11 15 9 9 9 12 13 12 14 12 21 15 15 11 12 12 10 10 12 12 8 8 7 7 8 8 8 8 8 8 8 8 6 6 6 6 8 8 7 7 10 8 9 9 9
9 15 14 10 10 11 20 10 10 8 8 8 8 8 9 11 13 22 19 17 10 10 10 8 6 7 7 8 6 9 10 10 10 8 8 8 8 10 10 14 19 20 11 8 8 8 10 10 10 15
10 8 6 6 8 8 8 10 10 10 10 8 13 8 10 10 11 9 9 9 9 10 11 15 13 13 10 10 11 9 9 11 12 12 8 10 7 7 8 8 8 8 8 10 12 15 19 12 10 17
17 16 16 24 19 10 10 8 8 8 8 10 10 8 8 6 6 6 8 8 8 8 9 10 9 10 9 8 8 8 8 7 7 7 7 8 8 8 8 8 8 10 8 6 6 6 6 8 10 8
8 9 8 8 10 10 8 10 10 7 6 8 10 10 15 10 10 15 10 13 12 10 8 6 6 10 8 8 10 9 9 9 9 8 8 8 6 6 8 8 6 6 7 8 12 6 6 10 8 6
6 8 8 9 9 11 8 8 7 7 8 9 9 9 8 8 8 8 10 11 16 12 6 6 6 8 9 12 3 0 3 9 9 10 15 10 10 9 9 8 8 8 10 10 15 10 9 9 9 10
16 9 8 8 8 6 6 8 8 8 6 6 8 11 10 8 6 6 7 8 8 8 8 8 10 6 6 6 8 8 8 8 6 6 7 12 8 10 3 0 3 8 9 8 8 6 6 10 8 11
8 10 8 10 9 8 10 8 8 10 12 12 8 8 8 8 8 8 6 6 8 8 9 9 9 |