BAC end | BAC-end 1 | BAC-end 2 |
---|
end name | MSMg01-161J09.T7 (MSMg01no161_j09.b1) | MSMg01-161J09.TJ (MSMg01no161_j09.g1) |
ACC | AG360952 | AG360953 |
length | 1,267 | 1,220 |
length of high quality (start - end) | 420 (29 - 448) | 391 (72 - 462) |
definition | CHROMAT_FILE: MSMg01no161_j09.b1 PHD_FILE: MSMg01no161_j09.b1.phd.1 CHEM: term DYE: big TIME: Tue May 17 19:28:21 2005 | CHROMAT_FILE: MSMg01no161_j09.g1 PHD_FILE: MSMg01no161_j09.g1.phd.1 CHEM: term DYE: big TIME: Tue May 17 19:28:21 2005 |
singlet/doublet | doublet | doublet |
---|
BLAST hit | unique | unique |
---|
Map location. | (14,292,525 - 14,292,929) | (14,173,190 - 14,173,570) |
---|
sequence | NNAAGCACTGGGCCTATAGACTCACTAAGGGAGAGGATCCGCGGAATTCT
CCATAGAGCCTTGGGCAAGTCACCAAGCTTTGCTTTTTCCTTCTTCTTAA
AGAAATTAACTCAGAGTTTTTTGACCACATGAGATTGAGGCTGTAATTTG
TTTCCTTCTGGGATGATCACTCATACAGCAGGTCTAACCCTACAGCAAAG
ACAACTGATGCCCCTGCAGTTTCTACCATATATCACTTTATACCCCAGAA
TCTTTACAGGTGTAAGGTGACCATCTGAAACCACCCAGTTAATGCTGCTG
AGGTAGCAGGCCAAGGCTCCACCACCCTTGCCTCTACCACTCCTTGGTAA
ATGGCCTTTACTACTCAAAAATAGACTAAAAGAGAAAATGGTACACTGTT
TTTATATCTGCATTTTTCATTAAATGTTATAATTTTGAATGATTTTGATT
TTTTTTTCCCCCCCCCCCCGATATATTAGTGTGAATCAAAAAAAAGAGAA
TTTTGGCTGCNAGGCTTTAGACACATAATCACGTTTTAGGTGTCTGCCAG
TCATTTGCTAAAGGAGATATATTTTAATATTGTCTCATTTGTTGTTTGCT
AGAACATAATGAGATAAGATAAGATATCCAGAGTAGTAAAGTGTTGCACA
AAAGGGTAGATTCAGGGAGAAGCTCACAGATGCTCCACTACACAGAAGCA
GGGGGTAGTGACCGGGAGAAGCTTACAGGTGCTCCACAAGCTTCAAACAA
GCTGTAGCATTAAGAAAACTACCAATCTAAGAATCCTAACATTAAAAGAA
GAAATGCCACAGGAAGAATCAGCCAAAGGTAATTTGTAAGTGTCTGGCAA
TGTTTCTCTTCTGATAGAAAAGCAGTTTGGTGAAAGCTTTTGACAATTTA
AGTCGCCTTAACTTAAGGTAAAAAGTGGCTTCTGAATTCTATTGGGTAAA
GCCCTTAAAGCTATTAAATATTTCCCAATGAGATTTTCTCCCCATTGATG
ATATGTGAAACCCCTAATAAGGCTAGTGATGGTCATCCTTGTCTTATTTA
AATTTCTCATCTTCCAAAAAAAGGATACTTGTTTTTTCCTTTACTGGCAT
TTTGTCCAAATATCTTTTTTATAAATTATCTCCCTTTCCTTTTTATGATG
AACTATGTTAATTCCTACTCTTCTTTAATCTTCTCTTTGTTTTTTATTAT
ATTCTTCTTTTGTTATCTCTATATTTATTATACTCTCTATTTCCTTTCAT
TATTCTTTACTCTTTTT
| NNNAATGCATGTGAGXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXX
XXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXATTTGCACTTTCCCTTTAAGTCTGGAAGC
CTGGAGCCTCTTCTCTCTCTTTGGAAGGCTCTATAACATTGTTTATTCAG
GCTGCATATGCCACCACAATTATGTGACCTGCTTAGCATGACAGGCCTGA
GTCAGCCCAGTTCATATCAAATGCAACTGCTCTGTATTTAAAAGAAAGAA
CTCTGTGATGTACTAGCATGGCCCAAGAGCTTAATCACCGGGTTGGTGCT
CCAGGCTTTCTAACAGGCCTGCTCTCTCTGCCATTGACTCACAGTCGCGT
ATTTCCAAATGGACAAGGGAATGAAGACAAAAACAAAATTGCTGGTGACT
ATTATTAGCATCCAGGCATCCTGGAAAGAAAGGCAGCCCTTGGGTGCTGT
GATTTTTTTTCCCCCCCCCCCAGCGGNCATGCCAGATAAACAAAAGAGAA
GATGGCTGATGTGAGCTCTGGGGACTTATAGCTCATGGGTGCAATTCTGC
TTCCCTGGAGCTGAATCCTGGTTCTGTCATGCTTGAATAAACTTGACACA
TTTTTTTAGTGGTCTCTGTTTAAACATGAGCATTATATTGCTGAGCAGCA
GTGGTAGCTTTGACTGTGTGCATGTGTTTGTATGTTCGTATGTTCATGTG
TTCATGTGTTCCTATGTGTGTGTATGTGTGTGTGTTTCCCACCATTCATT
TATTACAGCCTCTACAAAAAATCCCTGTGTTCCCCATTTTAATTCCACAT
GTCCCATATGTGTTTGTGTATTTACTCATATACTTAATGTTTATTCATCC
TCCTCCTTTTTTCTCATTATATTCTCCAACTTCTTTTTTTTGTTTACTTT
CTTTTTTCTTTTTTAAACTTCTTTTTTTACATCTTCTTTTTTATATTTTT
ATTTTTTCTTCTTTTCTTCTTTTTCATATTTTCTCTATCTTCTAACTTTA
TTTTGTATTTTCATCTTTTTACATCCTATTTTTCCTTTATTCTTTCCTTC
TTATTTATATATTTCTACTCTTCTTCTATTATATATCTCTTTACTTATCT
TCTTTTTCCTATTTTTTAATTATATTTTTTCATTTTTTTTTTTCTATACT
TTTTCTTCTTTTGAATTTATCTTTTTCTTTATTTTATATATCTTTATTTT
TTTTTATTTTTCTCTACTCT
|
quality values | Open.Hide. 0 0 3 6 6 6 6 6 6 10 6 10 8 8 8 8 8 8 8 12 15 21 21 13 13 8 8 8 15 21 36 36 37 34 36 36 37 37 40 50 48 57 57 40 47 47 47 50 50 42
42 41 41 41 41 48 50 59 59 68 68 68 68 48 48 37 39 39 57 57 57 68 68 68 50 50 50 68 68 68 68 68 68 68 68 51 68 46 46 37 34 36 36 43 43 43 42 42 37 37
42 59 59 59 57 57 57 42 42 42 36 38 38 36 36 48 48 50 50 59 32 30 19 11 11 9 10 9 22 23 43 39 46 48 50 53 53 57 57 57 57 42 43 43 43 47 53 59 59 59
57 57 53 53 68 68 68 68 68 68 57 59 59 57 57 68 68 50 51 50 50 50 50 50 53 53 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 59 59 59 59
59 59 57 57 57 57 57 57 57 57 68 68 68 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 68 57 57 57 57 57 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 57 57 57 57 57 57
57 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 59 59 59 59 68 68 68 68 57 68 68 68 68 68 68 68 68 68 57 57 57 57 57 57 57 57 59 59 59 59 68 68 68
68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 59 59 59 59 57 57 57 68 57 57 59 48 48 48 57 57 57 57 57 59 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 59 59
59 59 59 59 59 68 68 57 68 68 68 68 68 59 68 68 68 68 68 68 68 57 57 57 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 57 57 57 50 50 50 50 41 41 25 27 12 21 22 24
22 30 22 30 25 34 34 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 57 53 53 50 50 47 47 39 27 19 11 11 12 13
20 25 29 14 11 9 9 9 9 19 27 35 35 41 19 19 12 10 10 10 11 21 28 41 41 32 24 15 11 9 15 12 12 13 13 13 13 13 17 16 17 17 13 20 12 12 12 11 12 11
12 13 24 28 32 43 44 27 27 3 0 3 27 27 44 59 59 59 47 48 48 48 48 57 57 57 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 57 57 57 50 50 53 50 50 57 57 50 48 48
50 50 50 54 68 54 68 57 57 57 59 54 48 57 48 48 48 48 48 57 59 59 59 59 59 59 68 59 59 59 59 59 59 59 59 59 68 68 57 57 48 48 48 48 48 54 59 59 59 59
59 59 59 59 47 48 48 59 57 59 57 47 38 43 27 25 20 34 32 48 48 48 48 48 48 48 44 43 30 30 28 37 29 37 42 43 43 43 43 48 48 48 48 59 59 59 57 48 48 48
59 59 43 39 33 33 33 25 25 28 36 36 35 35 32 31 31 37 39 39 39 40 40 40 48 48 48 48 47 39 42 39 39 37 37 28 36 36 28 31 23 32 28 35 25 29 17 17 17 30
25 22 18 20 20 28 28 32 32 22 19 10 10 10 17 23 39 24 20 20 24 25 30 37 33 30 32 32 34 28 30 33 33 37 30 33 28 28 28 30 30 34 34 37 29 27 31 31 26 32
39 37 23 18 17 12 12 10 13 17 17 17 14 28 23 27 30 36 37 30 23 15 10 10 10 10 16 17 19 13 10 10 13 15 25 30 37 29 28 32 35 37 37 32 29 29 32 30 26 8
8 6 8 8 15 11 10 10 19 10 16 14 15 14 10 13 9 9 10 10 9 12 18 19 13 10 9 9 11 15 23 17 15 9 9 9 8 8 10 15 17 8 8 8 15 20 26 28 22 18
13 11 11 11 11 18 15 17 13 17 16 20 28 17 16 9 9 9 11 12 10 13 10 9 9 8 8 8 9 9 12 10 11 10 10 10 10 10 19 22 12 12 10 11 11 12 16 23 13 8
8 8 8 8 9 10 10 12 15 11 10 9 9 9 9 9 12 9 9 12 12 15 9 8 8 8 8 8 8 10 9 9 9 9 10 10 8 8 8 8 8 8 12 11 9 9 9 9 9 9
10 8 8 9 9 8 8 8 8 8 8 10 8 8 8 10 10 8 9 9 8 9 9 9 9 11 10 10 10 13 13 13 12 15 23 21 15 9 9 9 8 10 8 10 10 10 12 13 8 8
8 8 8 8 10 8 8 11 8 8 8 8 8 10 9 8 8 6 6 8 8 10 8 8 8 6 7 8 8 9 8 8 8 8 10 10 10 10 14 14 8 10 10 10 10 11 10 8 8 8
8 8 8 8 6 6 8 6 6 8 9 9 9 9 11 9 11 16 21 10 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 15 10 10 10 13 10 10 8 7 6 9 8 8 8 8 6 6 6
8 6 11 11 8 8 8 8 8 8 10 15 10 10 10 11 11 9 8 8 6 6 8 8 8 10 8 9 7 10 8 8 8 8 6 8 6 6 8 8 10 12 11 10 8 8 6 6 6 6
8 8 7 6 8 6 6 8 8 12 10 8 8 8 10 8 8 6 6 6 8 15 10 8 8 8 9 15 15 9 9 9 8 6 6 7 11 6 8 8 8 12 13 13 10 10 10 8 8 8
15 21 13 13 8 14 9 9 9 9 8 8 8 8 8 8 8 8 7 8 8 8 6 6 10 10 8 8 6 7 8 8 8 8 6 6 6 8 10 9 10 9 10 9 10 8 8 10 6 6
6 6 10 10 10 10 8 8 6 6 8 8 10 17 17 17 14 | Open.Hide. 0 0 0 3 6 6 6 6 6 7 6 6 6 6 6 15 8 8 8 11 9 9 9 15 9 8 8 8 8 11 14 21 19 21 9 10 11 21 21 29 22 22 28 36 35 35 32 33 33 42
42 47 47 47 48 57 48 57 57 57 68 68 57 57 48 43 37 42 31 39 36 36 36 43 44 54 50 48 48 48 50 57 50 50 50 46 48 48 42 42 20 24 24 28 30 42 44 44 44 44
42 42 35 42 42 44 44 46 46 47 50 50 50 50 50 50 50 50 50 57 57 57 43 27 16 12 12 14 16 28 30 50 50 50 57 57 57 57 54 57 52 50 47 50 52 57 57 52 57 57
52 52 54 54 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 52 57 43 57 39 57 57 57 57 57 57 57 59 59 57 57 57 57 57 45
57 57 57 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 52 52 52 62 62 52 52 52 52 57 57 57 57 45 57 59 57 57 57 68 57 57 52 52 52 59 57 57 57 57
57 57 57 57 57 52 52 57 57 57 57 57 57 57 52 44 43 43 43 52 57 57 57 57 57 52 52 52 52 52 57 57 57 54 54 54 59 57 57 57 57 57 43 52 52 52 52 52 57 57
57 57 57 57 54 54 54 57 57 57 57 57 57 57 68 68 57 59 48 50 48 59 57 68 57 57 57 57 57 54 59 59 59 57 57 57 57 57 57 68 68 59 59 59 59 59 59 59 39 39
35 42 42 59 59 59 59 59 47 47 47 59 59 59 59 59 57 48 39 39 42 42 42 42 37 37 43 43 44 57 59 48 48 48 59 57 57 57 48 57 48 48 47 43 43 28 26 22 18 10
10 9 9 9 9 10 13 20 37 47 47 59 59 59 48 59 59 57 57 57 59 43 43 43 43 48 48 57 57 57 57 43 43 43 39 39 59 59 59 59 59 48 48 48 39 39 47 25 25 9
9 9 9 11 17 31 39 34 17 15 15 15 18 20 32 23 23 23 20 18 16 14 12 20 27 3 0 3 27 19 19 10 8 8 8 10 24 20 21 12 12 12 11 11 11 11 11 11 11 12
15 19 18 18 30 28 50 50 50 50 57 48 48 48 48 48 48 59 59 59 59 57 57 48 57 43 57 47 47 43 43 43 48 59 48 47 43 47 43 43 46 59 59 59 48 57 57 57 57 59
57 57 48 59 59 48 46 40 40 37 37 37 37 31 35 41 44 59 41 32 34 41 43 59 59 47 41 41 48 48 48 48 59 57 57 48 59 59 57 57 57 57 57 57 59 48 48 48 48 48
48 59 59 50 50 41 39 37 28 28 19 18 20 20 28 30 39 39 46 48 48 48 48 48 48 48 43 43 41 43 39 43 40 57 48 48 48 57 57 57 59 37 37 28 28 28 31 28 39 39
37 37 31 34 39 37 37 39 41 41 37 23 18 11 11 23 16 30 30 39 39 47 48 48 48 48 57 57 48 48 48 48 43 43 33 28 23 12 12 11 18 13 24 24 34 36 39 48 48 48
43 43 43 39 39 35 35 35 37 32 32 30 37 37 39 35 35 22 19 9 8 8 8 8 19 13 14 10 10 9 9 9 13 10 11 15 16 13 10 10 11 15 10 8 8 8 8 8 11 16
19 15 12 10 10 10 15 15 10 9 12 8 8 8 9 10 10 11 8 19 13 11 12 11 19 12 13 9 9 9 15 13 13 10 10 10 11 10 19 10 10 10 13 15 15 10 10 10 10 10
12 12 21 18 22 22 22 21 15 14 8 8 8 15 13 8 8 8 8 10 10 12 10 6 6 8 8 8 6 6 8 8 10 10 15 14 12 9 10 10 10 10 15 10 10 10 8 6 6 8
8 10 11 13 10 10 10 15 19 17 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 9 9 9 9 8 8 8 8 8 8 8 7 6 8 10 9 9 8 8 8 8 8 10 8 8 8 8 8 9
9 9 9 12 10 10 13 9 9 16 9 9 9 13 8 8 8 8 10 8 10 8 8 8 8 8 8 9 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 15 15 9 9 9 9 9 9 10 8 10
7 7 8 8 11 15 15 14 12 19 19 16 15 13 11 13 8 8 8 8 8 10 10 10 8 8 6 6 8 8 8 8 10 8 10 10 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 11 6 6
8 8 13 9 9 10 10 10 10 10 8 8 8 8 10 8 11 8 8 6 6 8 10 8 8 6 6 6 6 8 10 10 6 6 8 8 8 9 8 8 6 6 10 10 10 10 8 8 6 6
8 8 6 9 10 10 8 8 8 8 8 9 10 8 6 6 6 8 6 6 8 8 6 6 8 8 8 8 8 9 9 9 9 9 10 9 9 9 9 8 8 8 10 8 8 10 10 10 10 9
9 9 9 9 9 10 8 8 6 6 8 8 14 18 18 12 8 8 6 6 8 8 8 8 8 8 11 8 6 6 6 8 8 8 9 9 9 9 9 12 12 18 13 17 10 10 8 8 6 6
8 8 13 11 10 10 7 7 10 8 12 11 10 10 11 11 8 8 6 6 8 8 13 21 21 25 24 24 10 6 6 6 8 8 9 9 9 12 11 14 13 8 8 6 6 6 8 8 10 18
13 11 8 10 8 8 8 10 12 13 8 10 8 8 6 6 8 8 8 7 |