BAC end | BAC-end 1 | BAC-end 2 |
---|
end name | MSMg01-171G21.T7 (MSMg01no171_g21.b1) | MSMg01-171G21.TJ (MSMg01no171_g21.g1) |
ACC | AG367677 | AG367678 |
length | 713 | 764 |
length of high quality (start - end) | 320 (45 - 364) | 292 (77 - 368) |
definition | CHROMAT_FILE: MSMg01no171_g21.b1 PHD_FILE: MSMg01no171_g21.b1.phd.1 CHEM: term DYE: big TIME: Tue May 17 19:41:39 2005 | CHROMAT_FILE: MSMg01no171_g21.g1 PHD_FILE: MSMg01no171_g21.g1.phd.1 CHEM: term DYE: big TIME: Tue May 17 19:41:39 2005 |
singlet/doublet | --- | singlet |
---|
BLAST hit | no hit data | unique |
---|
sequence | CTATXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXCGCGGA
ATTCTTTGTTCAGTTCTGAGCCCCATTTTTTAATGGGGTTATTTGATTTT
CTGGAGTCCACCTTCTTGAGTTCTTTATATATGTTGGATATTAGTCCCCT
ATCTGATTTAGGATAGGTAAAGATCCTTTCCCAATCTGTTGGTGGTCTTT
TTGTCTTATTGACGGTGTCTTTTGCCTTGCAGAAACTTTGGAGTTTCATT
AGGTCCCATTTGTCAATTCTCGATCTTACAGCACAAGCCATTGCTGTTCT
GTTCAGGAATTTTTCCCCTGTGCCCATATCTTCAAGGCTTTTCCCCACTT
TCTCCTCTATTATTTTCTTTGCCTNTGCTTCCATGTGAAGTTCCTTGATC
CACTTAGATTTGACCTTACCACAAGGAGGAAAGTATGGATCGATTCGCAT
TCTTCTACACGATAACAACCAGTTGTGCCAGCACCAATTGTTGAAAATGC
TGTCTTTCTTCCACTGGATGGTTTTAGCTCCCTTGTCGAAGATCAAGTGA
CCATAGGTGTGTGGGTTCATTTCTGGGTCTTCAATTCTATTCCATTGGTC
TACTTGTCTGTCTCTATACCAGTACCATGCAGTTTTTATCACAATTGCTC
TGTAGTAAAGCTTTAGGTCTGGCATGTTGATTCCGCCAGAAGTTCTTTTA
TCCTTGAGAAGAT
| ACGATGXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXX
XXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXCCTTCCATTGCTGATGGAGATCTT
CAAATGTTTCCAGAACATGGTTACTGGCCACATGTTGCCTGTTCTTTGTT
CCCACTTATACACAAGGTCCTTTGATTTCATATGCATAAGCATCAAGGAG
ACAGCACACATGCCTAGAACTATGATAAATGCAGAAGACACAAAGCTGAT
AGCAAGCACCTCTTTCTTTTTCAAGACACAAAATCTTGTGGATGAAAAAG
ACACAGGTCAGTTCATGGGATGCTGTGTGTTGAAGCAAAGACCTACATTT
GTTTTCAGTAACTGAGTCTTCTTATATACCCACCCCCCACAATGAAAATG
TCGAATTTCTAAAATCTCTATTTGGCGAAAGATGACAAAATCTGTTTAGT
GAAATCAAATAAACTATTGCCCACAGCTCAAGTTAGATACAAGGAATGCT
ATCACATGACTTGAAAAATAACTGTGGGTCAGAAACAGAAGACCTATCTG
AATAAGAGCTTTTATTAATTATATTGAGGTTTTTTTTTCACAAATATCTT
ATTTTTGATGACCACTCTAGTCTCCTTAAATTGTAGCGCAACTATGTTAA
AAAAAACTCCACATTTATTTTTTTCCCATTGATCGATCCCGAAGCCTATT
AACCCCTTGTCCCTATCGCATGACCACTCCCCTAAAAACTTTAAATATAA
TCCACCCCACCACA
|
quality values | Open.Hide. 6 8 8 6 7 11 17 37 40 39 37 37 37 31 21 19 9 9 9 19 19 39 44 48 35 32 36 36 36 36 47 53 47 48 43 46 46 46 46 37 37 40 37 40 36 41 37 43 42 47
47 42 48 50 59 59 59 59 50 48 42 42 42 48 53 57 57 34 34 11 11 12 34 34 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68
68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 57 57 44 44 43 43 52 52 57 57 57 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68
68 68 68 57 57 57 57 57 57 68 57 57 57 57 57 57 68 68 68 68 57 57 57 57 57 57 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68
68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68
68 68 68 68 59 59 59 59 59 59 59 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68
68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 48 44 32 20 15 15 14 14 17 30 30 59 32 54 48 53 57 53 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59
59 59 59 59 50 42 41 27 22 8 6 6 6 8 16 9 8 8 9 8 11 11 9 3 0 3 6 6 6 6 7 11 11 11 11 18 24 36 59 50 50 50 50 53 53 57 57 57 57 57
59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 50 50 50 47 41 32 32 18 17 17 18 26 25 28 19 19 10 9 9 9 10 9 14 14 15 28 32 40 43 47 48 48 48 48 39 39 35 35 35 39
39 46 48 57 59 57 57 57 50 50 53 57 57 54 57 57 57 57 57 59 59 59 59 59 57 50 50 50 48 50 50 57 59 59 59 50 50 50 47 47 44 39 39 39 35 37 37 37 37 37
46 59 59 59 59 59 59 59 59 41 41 41 41 39 39 37 37 39 30 22 19 17 17 22 32 39 41 47 59 59 59 59 48 47 39 39 47 44 44 32 32 25 34 28 39 39 39 37 37 37
31 31 37 41 41 41 37 41 41 41 41 41 37 39 37 41 41 41 43 47 59 59 59 41 35 36 35 41 43 37 37 37 29 29 29 31 39 39 47 59 41 41 39 39 39 39 37 37 43 32
32 28 35 28 32 32 48 43 43 43 43 41 39 41 39 39 35 35 24 27 30 41 37 35 30 30 37 37 33 34 28 28 24 27 30 29 35 26 23 11 9 9 9 9 9 21 28 37 37 37
37 21 21 17 19 28 24 25 22 18 17 11 15 9 11 11 17 21 22 19 11 9 10 10 14 10 9 9 10 10 10 10 10 16 21 25 18 14 10 10 10 10 10 23 23 18 17 11 9 9
10 11 9 9 9 10 9 10 10 10 9 9 9 | Open.Hide. 7 7 7 7 8 8 6 6 8 9 10 11 11 16 19 37 37 37 37 37 50 48 53 53 57 57 57 57 57 57 59 59 59 59 48 43 43 36 34 34 42 42 48 42 44 43 36 36 42 42
42 50 50 51 54 54 54 54 54 54 54 40 42 36 36 41 48 44 57 48 41 41 48 48 50 50 68 68 68 51 51 50 50 50 51 68 68 68 68 54 53 50 50 42 47 47 50 47 47 47
47 47 47 50 59 59 57 57 42 42 42 36 36 36 53 53 53 53 44 59 59 46 46 36 30 18 12 11 11 11 22 23 39 42 50 59 59 59 59 59 59 57 57 57 57 59 59 59 57 57
53 53 53 57 53 53 53 68 68 68 68 68 68 68 59 57 57 57 57 59 59 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 59 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 50 50
50 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 57 57 57 59 57 57 57 57 57 57 57 59 59 59 57 68 68 68 68 68
68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68
68 68 68 68 59 59 59 57 68 68 68 57 57 59 59 59 57 54 54 54 54 54 68 59 59 41 41 32 32 41 41 28 32 28 41 59 59 59 53 53 53 53 53 50 57 57 59 59 59 59
59 59 59 57 53 53 50 50 50 50 47 34 27 25 11 11 9 11 9 9 7 7 8 8 10 10 11 10 8 13 8 8 8 11 11 11 11 9 10 11 22 22 39 43 46 50 50 50 50 50
50 57 59 57 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 47 29 25 10 10 10 10 19 28 24 24 11 8 8 8 8 8 12 23 17 17 12 19 18 28 41 59 59 43 39
39 39 39 43 43 37 37 43 43 57 57 59 57 57 43 48 48 48 57 57 59 59 59 59 57 54 54 54 57 57 59 59 59 59 57 57 59 57 48 54 54 50 53 57 68 68 68 59 59 54
59 59 54 54 57 48 50 50 59 57 57 57 57 57 59 53 57 57 57 47 47 59 59 48 48 47 46 46 41 47 41 41 29 32 37 37 37 37 43 40 40 37 39 37 40 46 43 41 41 37
31 31 32 37 26 28 20 28 28 39 41 47 47 47 59 41 28 28 30 32 33 37 40 41 41 48 48 53 44 37 37 37 37 30 30 37 22 17 8 8 8 11 17 20 33 33 29 32 23 23
23 23 20 21 30 13 13 12 10 10 9 9 9 9 15 17 13 15 10 10 9 9 10 9 13 13 13 8 12 12 15 15 10 10 10 10 8 8 6 6 6 13 15 22 28 14 8 8 8 8
13 15 10 12 11 22 18 11 7 6 6 6 8 11 14 16 16 15 12 8 9 10 10 11 11 15 20 16 8 6 8 6 6 8 10 13 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 10
12 11 14 8 8 10 8 10 10 10 10 15 9 8 8 8 8 8 7 9 9 9 10 10 12 10 10 10 10 15 9 12 10 10 10 8 8 8 8 8 11 12 11 13 10 6 8 6 6 8
8 8 8 8 8 8 10 9 11 10 10 10 8 8 |