BAC end | BAC-end 1 | BAC-end 2 |
---|
end name | MSMg01-181C04.T7 (MSMg01no181_c04.b1) | MSMg01-181C04.TJ (MSMg01no181_c04.g1) |
ACC | AG374406 | AG374407 |
length | 719 | 721 |
length of high quality (start - end) | 676 (44 - 719) | 288 (75 - 362) |
definition | CHROMAT_FILE: MSMg01no181_c04.b1 PHD_FILE: MSMg01no181_c04.b1.phd.1 CHEM: term DYE: big TIME: Tue May 17 19:54:32 2005 | CHROMAT_FILE: MSMg01no181_c04.g1 PHD_FILE: MSMg01no181_c04.g1.phd.1 CHEM: term DYE: big TIME: Tue May 17 19:54:32 2005 |
singlet/doublet | singlet | --- |
---|
BLAST hit | unique | no hit data |
---|
sequence | TATXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXCGCGGAA
TTCCACCAGGTCTCACACAGCTAGGCACGTGCTCTACCACGCACCTGCAC
TCCCAGCTCATTTTTAATATGCTTGGAAAGTTCACCTTTTGGCATTCTGG
AAAGTGGTGGGTCACAGCACTCCATATGGAATCCTCTATCACAGGAATCA
CAAAAAAGCATGTTATCCTGTAATACAACAGATTAGAGACTAGTTGAGAC
TAAGACCAGCTGAAGAACATCAACACCCAAGTTACCAGGTTAACTAAGAT
GTAATAAAGGAGCCACAGTTTCCCAGTGTGGTGCACCATTACCAATGTTT
AAACACTGCAACATTGTGTTGGAGGAAGAGCCCCCCTCCATCACCGCCCT
GGCGCTGGGATGTGAGGAGCGTACTCACTGCATTTTTGCCCTGGACTCGA
CATGCGCTGCACGTCTTGCACTCGATGCACTGCCACCTCAAGGCCTTCAC
ATTTGCGGTTAACTCAGGACAAAACTTCAGACAGGATGGGTGTCCTGCAA
TACAAAGCAATTGCTCTGTCAGTAAACAGTGCCTTAGTTTATAAAGCCCT
CATTGCCTTCATTCAATGGATGCCACTGAGGCCGACCAGTGAGCCTTATG
AACTCGAGAACAAAACCAGCTGTAGCTGCACGGGCTTACTTTCTCTTCTT
TGTCTCTGACTTCTTTCCC
| AATAXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXX
XXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXTCCTTAAGTGACATCTACATAAGTTT
TGCTTTGTCACTACTCTTTATGGACAGATAATTCCTTGGCCCCTTTCTTT
ACAGTCACAGTATTAGCTGGGTGAGGTCTGATCTGAGGGCAGCAGCCCTT
TTATCCCATTTCCCTGATCTCTTTTAACACAGGCTTTGGTACCAACACTG
CATTTCCTGGTCTCCTTTGGCTCTCCAACTACAGTTTACTTTTCTTTTTG
CCCCACTTGCTCTTTTTCTTTGTAGACCAGCCTGAGTGATCACTAATTAC
ACATGACAGATTCTACATGAGACCGCCTTCAAATCTCCTCTGCCCACAAA
ATTATCCAAAATTTAGCCTCAGACAGATTCTTAGGACAAGGGCAAAAAGC
AGCCACATTATTTGCCAAAATGTTACAAGAATGGCCTGTATCCAAGTTGC
TAGTATTGTTTCCCTGTTCAGCTGGGTCTCCATAGTCCACACTGCTCTCA
GCCCTTCTGTCTTCCAAACTCCTGCCATAATGGCCCCACTTACAGCATTC
AACTACTTTCCTAGTCCATAGTCCCAACACCTCCCACAATCCTTCAAAAA
CCAACATGGCCAGCCCTGTCACAACAATGACCTGGTGCCCAGTGCCCGGT
ACCAACTTCTGTCTCAGTCAC
|
quality values | Open.Hide. 8 8 11 11 11 16 37 59 41 33 32 32 28 28 37 27 23 10 10 10 21 21 41 28 28 28 28 28 29 27 19 16 14 14 15 18 18 30 26 30 22 25 25 36 41 57 57 36 36 36
36 33 41 39 37 37 37 27 21 14 14 13 21 22 34 37 37 37 37 37 37 46 46 39 53 53 53 53 53 59 59 59 57 57 59 57 57 57 50 47 47 47 47 47 47 47 47 47 47 47
68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 59 59 57 57 57 38 25 13 10 10 10 14 21 44 57 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68
68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 57 57 57 57 59 59 59 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 57 57 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 57 57 57 57 57 57
68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 57 59 59 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 62 62 62 62 62 62 62 68 68 68 68 68 68 68
62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 68 62 62 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68
68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 62 62 62 62 62 62 62 62 62 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68
68 68 68 68 62 62 62 43 43 39 39 39 43 43 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 68 68 62 62 62 62 62 62 62 62 62 68 68 68 68 68
68 68 68 68 68 62 68 68 68 68 68 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 62 57 57 68 68 68
68 68 68 68 68 68 59 59 59 59 59 59 59 68 68 68 68 68 68 59 59 57 57 57 59 57 57 68 68 68 68 68 57 57 57 57 57 59 57 57 59 59 59 59 59 57 57 54 54 57
57 57 68 68 68 68 68 59 59 54 59 57 57 57 59 52 57 57 57 57 68 68 68 68 59 57 57 57 48 57 48 57 57 57 57 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 57 57 59 59 59
57 57 57 57 57 57 57 57 57 59 59 68 59 59 57 59 59 57 57 54 54 54 57 57 57 57 59 59 57 57 59 59 59 59 59 54 54 54 54 43 48 48 48 42 44 40 36 36 39 59
59 59 59 59 48 48 48 43 43 48 41 40 40 39 37 37 40 29 35 37 37 37 37 47 59 46 47 47 30 22 18 15 13 21 15 20 16 27 30 41 37 33 33 30 30 25 25 12 12 12
25 25 37 39 40 40 40 43 37 41 37 37 33 32 27 25 23 25 37 37 36 37 34 30 28 28 30 34 37 40 34 36 36 57 30 30 26 32 35 59 59 47 47 47 47 47 43 41 37 37
43 41 41 41 47 59 37 37 30 30 28 34 33 22 22 28 26 24 24 | Open.Hide. 6 6 6 8 6 6 8 11 16 30 27 28 37 37 37 37 39 44 50 53 53 57 53 53 53 53 53 53 53 50 47 47 42 48 48 48 37 33 32 32 40 42 48 48 57 54 48 42 47 47
47 47 50 54 54 54 54 68 54 40 40 30 30 33 40 44 57 57 50 50 50 50 50 50 68 68 68 57 57 57 68 68 68 68 68 68 68 68 68 57 57 57 57 57 68 68 68 68 68 68
68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 51 50 50 57 57 57 57 57 59 59 59 59 59 68 59 59 59 59 57 57
57 57 57 68 68 68 68 68 68 68 57 57 57 57 57 57 57 59 59 59 68 68 57 57 57 57 57 57 57 57 57 68 68 62 62 62 68 68 68 68 68 68 68 68 59 59 59 59 59 68
68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 57 57 57 59 59 59 59 59 57 57 68 68 68 68 68 57 59 59 59 59
59 59 68 68 68 68 68 59 59 59 57 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 57 57 59 59 59 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68
68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 59 59 68 68 68 59 59 68 68 68 68 68 68 68 57 57 54 54 57 57 57 57 50 57 57 57 57 57 57 59 59 59 59 57 57 53
53 50 44 39 37 34 29 15 10 10 8 8 8 8 10 10 19 25 25 12 11 11 21 15 14 14 14 15 19 12 25 28 43 59 59 59 59 59 59 59 59 59 57 57 57 57 57 57 59 59
68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 59 59 54 47 47 43 47 43 47 47 47 59 44 48 48 48 54 54 57 59 48 59 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 59 68 57 68 68 68
68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 59 59 59 59 68 68 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 37 37 52 59 59 57 57 57 57 57 57 57 59 57 57 57
57 57 57 57 57 59 59 59 59 59 59 59 68 57 57 59 57 57 57 57 57 57 57 57 59 59 59 59 57 57 68 57 57 57 59 59 59 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57
57 57 57 57 59 68 59 57 57 57 57 57 50 50 50 50 50 50 59 59 59 59 59 57 57 57 57 57 57 57 57 59 59 59 59 59 57 57 57 57 57 57 47 47 47 57 48 54 54 68
68 68 68 68 68 68 57 59 59 59 59 57 48 48 48 54 54 54 57 50 53 48 48 47 47 47 47 47 57 57 57 59 50 50 57 48 48 48 48 41 46 47 41 41 41 41 37 28 31 32
30 30 33 36 36 36 37 31 31 39 37 34 34 32 30 37 37 30 25 25 25 33 33 39 37 37 37 37 41 39 39 37 39 31 28 35 30 28 28 26 20 21 21 18 15 15 30 34 37 37
32 29 29 29 34 39 39 37 37 37 30 30 32 28 28 23 28 28 34 34 26 |