BAC end | BAC-end 1 | BAC-end 2 |
---|
end name | MSMg01-306A22.T7 (MSMg01no306_a22.b1) | MSMg01-306A22.TJ (MSMg01no306_a22.g1) |
ACC | AG430831 | AG430832 |
length | 755 | 751 |
length of high quality (start - end) | 368 (388 - 755) | 294 (74 - 367) |
definition | CHROMAT_FILE: MSMg01no306_a22.b1 PHD_FILE: MSMg01no306_a22.b1.phd.1 CHEM: term DYE: big TIME: Tue May 17 21:46:43 2005 | CHROMAT_FILE: MSMg01no306_a22.g1 PHD_FILE: MSMg01no306_a22.g1.phd.1 CHEM: term DYE: big TIME: Tue May 17 21:46:43 2005 |
singlet/doublet | singlet | --- |
---|
BLAST hit | unique | no hit data |
---|
sequence | NCTATCATXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXCG
CGGAATTCTTTGTTTAGCTGCGTACCCCATTTTTAAATAGTGTTATTTGC
TTCTCTGGTGTCAAACTTCTTGAGTTCCCCGTATATATTGGATATCAGCC
TTCTTTGGGATGTAGGATTGATAAAAATCTTTTCCCATTCTATTGGTTGC
CGTTTTGTCCAATTGACAGTGTCCTTTGCCTTACAAAGTCTTTGCGGTTT
TATGAGGTCCCATTTATCTATTGTTGATCTTATTTCTAACCTCCTACTCT
AGTACCATCTTTACCTACTTACTGCAGTGTTTCCCATCATGATGATTATG
GATTAAACTGTTAGCTAGCCTTTTGTAAATGCTCTTCTTTGTAAGAGGTG
CTTCAGTCATGGTTTCTCTTCTTTGTAATAAAACCCTAACTCAGTAACCT
TCTTAAAATTTTAAAGCTGAAGTTCCATCCTGAAAAATATTGTGTTGCCT
TCCCACTTCTAACAAATTACTAAGATTATATGCAGAGGAGGTCTTACAGT
GAAGGTTCTTTATGTCAGTATGCTTTTTTTAGGAGAATAAGAGACCCAAT
TTTTTAGGAGAATAAGAGACCCAATTTCTCTAAAATCAGGCAACAGACCT
CTCTACATTGTACTCACATCTGAATTTACTTTCCTTACAAACCAAACAGA
AGACCAACTATTCTATAGTTACATAGAAATGTAAAAAGCTAAACTTTTCT
TTCTN
| CGATGAXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXX
XXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXTTCCTTCTTCCATCTTTACTTTCCTGC
TTAGATGTCTTAAAGTCTTATGATACAAGTTTTTAACTTGCTAAATCAGA
GCTACCCCATGATATTTTGTAGTTTTTGAGCCTATTGTGGTTTTGTATGT
ATTCTTTCTCAGTATATTTGTATACAGGAAGGCTATTAAAATTTTTGTTT
GTTAGTATTTTATCCTACTACTATTTTGAAAATATTTATGAGATGTAGGA
ACTTCGTGGTATAATTTTAAGGTCACTTTTCTATAATACTGTATCATCTT
CAATTAAGATACTGTTTTTTCTTCCTCCCCACCCTTTATCCATTTGATTT
CTTCACATTTCCTGTCGTTCCTTAAAGTACTAAAATAATTAGGTGTGTAA
AGTAAAGAGCACACAACCTTATTTTACTTCTAATTTTAGATAAAATGCTT
TGGGTTTCTCCTCATTAAAGTTGATTTTGGCAATGGGTTTTCTATAAATT
GCTTTTAGCATACTGAGACATTTCTCTTGTATCCTATTCTCCAGGACTTT
TATCATGGAGGGGAGTTGGATTTTTTTCAAAGGCCTTTTCTGCATCAAGT
AAAATGATCATGGTTATATTCTTGTTGAATATATAGTACCATTATCTACT
ATAATATCCTATACATATAANATTTAATAATTATCATGAGGCCTAAAGAA
A
|
quality values | Open.Hide. 0 3 7 8 7 10 8 8 15 14 16 23 35 34 37 37 32 29 16 19 9 9 9 17 19 37 39 48 31 28 36 36 28 35 39 43 33 36 25 25 25 40 40 42 42 28 24 24 42 41
57 57 42 36 36 36 50 50 59 59 59 59 50 34 34 23 18 16 17 11 11 11 23 27 59 42 37 37 41 41 53 53 53 53 53 53 42 53 53 53 53 53 53 53 53 53 53 53 59 59
59 59 59 59 59 59 59 59 59 50 50 36 36 33 33 50 50 47 34 33 20 16 11 11 11 21 18 10 10 10 11 18 23 36 47 50 50 48 48 47 47 47 38 42 42 42 43 53 53 57
57 57 57 57 57 59 59 42 42 36 40 36 42 54 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 57 57 57 57 40 57 57 68 68 68
68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68
68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68
68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 59 59 59 59 59 59 57 54 54 59 59 59 68 68 68 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59
59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 50 43 34 25 16 12 10 10 10 10 11 11 14 18 26 18 14 12 12 12 11 11 11 18 18 28 21 28 26 37 47 59 59 59 59 59 59 59
59 59 59 59 59 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 47 44 43 46 46 44 46 46 46 57 57 57 68 68 57 57 57 57
59 57 43 43 35 35 35 43 50 57 57 59 57 57 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 57 57 59 59 57 57 59 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68
68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 57 57 57 57 59 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68
68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 59 57 57 57 57 57 57 59 59 59 59 59 59 68 68 57 57 57 57 57 59 57 57 57 57 57 57 59 47 47 47 54 54 54 54 54 59
59 68 68 57 57 54 54 57 57 57 57 57 57 57 57 59 48 57 48 57 57 57 57 57 57 59 59 59 48 48 48 40 40 41 39 39 39 41 37 37 41 41 41 41 47 47 47 48 48 50
59 57 57 57 57 48 48 48 57 48 48 48 48 48 48 41 41 41 43 43 59 21 18 17 17 17 28 39 39 41 47 47 50 47 47 31 31 22 19 19 28 30 31 32 37 37 37 37 37 31
25 27 15 19 18 30 34 41 41 46 46 46 46 42 39 39 41 41 34 34 41 41 37 39 37 37 39 36 31 41 41 41 41 41 41 37 37 41 41 41 37 37 41 41 37 37 43 59 44 32
32 18 18 3 0 | Open.Hide. 6 6 6 11 9 9 9 9 17 23 37 36 37 43 39 47 57 53 53 57 57 57 57 57 57 57 57 57 53 53 53 48 48 48 48 23 21 10 10 11 21 21 48 48 43 23 26 12 12 11
26 26 53 57 57 57 57 57 40 42 41 41 41 50 57 68 68 50 50 50 50 50 50 68 68 68 68 68 68 68 68 50 50 50 50 50 50 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68
59 68 57 57 52 57 57 57 57 57 57 68 57 57 57 57 57 57 52 57 50 50 35 32 32 28 44 44 68 68 68 68 68 68 68 59 59 59 59 57 59 59 57 57 57 57 57 52 52 52
57 59 59 59 68 68 59 59 57 57 57 57 57 57 68 68 57 57 59 59 57 59 59 59 59 68 68 68 68 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 68 68 68 57 57 57 57 57 57
57 57 57 57 59 59 59 57 57 57 57 57 68 68 68 57 68 68 68 68 68 68 57 57 57 57 57 68 68 68 57 59 59 59 59 59 59 68 68 68 68 68 57 68 68 68 57 57 57 57
57 57 57 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 57 57 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 59 59 57 57 54 57 57 57 59 54 54 57
57 57 57 57 57 57 57 57 59 59 68 68 68 68 68 68 68 68 68 57 57 59 59 47 43 43 48 59 59 68 68 68 68 68 68 68 57 59 59 59 48 59 57 59 59 57 57 57 50 50
50 57 57 57 59 59 48 48 37 36 23 30 12 21 19 18 22 25 32 20 20 20 28 28 13 13 13 15 29 11 11 11 12 12 12 13 21 30 34 41 50 50 50 50 59 59 59 59 59 59
59 57 57 57 57 57 57 57 57 59 59 59 59 57 59 59 59 59 57 57 57 57 68 44 44 28 18 18 12 13 13 15 34 35 20 20 20 32 23 23 12 25 32 57 59 59 59 47 47 44
44 43 57 57 57 59 57 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 59 59 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 59 59 59
59 57 59 59 57 57 59 57 57 57 57 57 54 57 57 68 68 57 57 57 57 57 57 59 59 68 59 59 68 68 59 59 57 59 57 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 57 59
59 59 59 57 57 57 48 57 57 59 59 59 59 59 59 54 54 54 57 48 57 48 48 48 48 48 59 59 48 48 48 48 48 47 47 47 47 47 48 47 47 47 47 47 47 48 48 48 48 59
59 47 47 44 44 39 37 41 44 44 44 47 47 47 47 48 48 48 48 48 57 57 48 59 59 41 39 37 37 37 37 37 37 32 31 37 59 47 47 47 41 41 48 48 48 48 48 48 57 57
48 44 44 37 37 37 37 41 41 39 37 32 31 31 31 39 34 39 39 39 36 28 28 28 28 36 40 36 37 41 41 47 39 39 39 40 40 41 37 34 39 44 44 41 47 47 47 48 59 48
48 48 48 48 48 48 57 57 48 48 48 37 37 30 30 30 37 23 27 3 0 3 18 16 22 22 22 24 27 27 36 30 33 33 30 30 28 34 30 21 18 16 16 20 20 24 27 41 31 36
36 |