BAC end | BAC-end 1 | BAC-end 2 |
---|
end name | MSMg01-313H09.T7 (MSMg01no313_h09.b1) | MSMg01-313H09.TJ (MSMg01no313_h09.g1) |
ACC | AG435380 | AG435381 |
length | 1,287 | 1,302 |
length of high quality (start - end) | 299 (508 - 806) | 263 (508 - 770) |
definition | CHROMAT_FILE: MSMg01no313_h09.b1 PHD_FILE: MSMg01no313_h09.b1.phd.1 CHEM: term DYE: big TIME: Tue May 17 21:55:11 2005 | CHROMAT_FILE: MSMg01no313_h09.g1 PHD_FILE: MSMg01no313_h09.g1.phd.1 CHEM: term DYE: big TIME: Tue May 17 21:55:11 2005 |
singlet/doublet | singlet | --- |
---|
BLAST hit | unique | no hit data |
---|
sequence | CCACTTANNNNNNGGGCATTGGGCGCTATAGACTCCTATAGGGAGAGGAT
CCGCGGAATTCTCACAAGGCTCCACCCCTATAAGGAGAACGATGGGCAAT
TAATAGTTGCTAGGAAACCTTTAATTAGCCTTCCCCTGGGATGAGCCCCC
TGATAGGCTATCCAATCCCAAGAGGTCATTCCTAACCACTCCTGAGCAAC
ACTCAGTTATCTCAGAAGGATGTATTTATAAATGCATATGTATATGTGTA
ACAATAATAAAGAATAAGAGGCCAGGGGCTAGAGAGATGATTCAATGGTA
AGGAGTCCTGGATGCTCTTCCACAGGCCCTAAGTTAGATTCCCAGCACTC
ACATGCAACCCACAGCTCCCTACAACAGGATCTGATGTCCTTTTCTGGTA
TTCAGATGTATATAAAGACAAAGAACCTGTATACATAAAATACACAGATA
AGTAAATCTTTTATTTATAAAAAGAGGAAGAAGAGGCCATGAATTTGAGG
AGAATGTATAGCAAAGAACTCAAGAGTTGGAGGGAGGAGAAGAAGGGGAA
ATTATATAAATACAGTACTTATATGTGAAATACATACAAAAATAAATATT
AAAAAAATCAAAACATGAAAAGAATTCAAGTCAGGCCCAACTGCAGATTT
GTGTTGGGTTTACAACAAGTGTTCAGCATTTTTTTTCTACCTCTCTCTAG
GGTGGACTGTGTGCTCAATGTCTATGTCACACTCAGTGGATTGCAAGGGC
CACATTTCTAAGACATGCCTGCAGCCAGGGGTCTAGATGTGCTGCTCTGC
CAATAGATAGAACTGGAGAGATCCAGAAAGCAGAAGTGCAACCAGAGCTG
TCTTCTTCTGCTCACTGTTTTCTTGCTTCCCTGGGAAGCTTGCAACAGGA
GGTTTGGTGTGTTGTGTAAGCATAATGTCCCTCTCTACTCTACTTCTCTT
ATGTTTTCCCATCAATATTTTCTTTTTCTTATCTTTTTATTTTCTTTTCT
CCTTCCTTCAATAAATTATTTTTCTCATCTTTCTTCTTCTTTCTTTTTCT
AAATTTTCATTATCATCTTTTTTCCTTGTTTTTTCTTCTCCTCTTCTCTT
TCCTTTCATTTTCCTGTCTTTACTTTCCTGATCATTATATCTCTACTCAC
TCCATCCTCACTTTACCTTCTGTTTTTTACTTACTACACTTTCCTAACTA
TATTCCTTCTCATCTTACTATTTCATTACTCAATATTCTACTTCTTTCTA
CATATTTCACTCCTACATTTTCTATCACTTCTATTTC
| NNNNCCCAAGAGGTGAGGCTGGGGCGCCXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXX
XXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXTCACCTGAGGAATACCGAATGGCAGAG
AAGCACCTGAAAAAATGTTCAACAACCTTAATCATCAGGGAAATGCAAAT
CAAAACAACCCTGAGATTCCACCTCACACCAGCCCGAATGGCTAAGATCA
AAAATTCAGGTGATGCTGGCGTGGATGTGGAGAAAGAGGAACACTCCTCC
ATTGTTGGTGGGATTGCAGGCTTGTACAACCACTCTGGAAATCAGTCTGG
CGGTTCCTCAGAAAATTGGACATAGTACTACCGGAGGATCCAGCAATACC
TCTCCTGGGCATATATCCAGAAGATGCCCCAACTGGTAAGAAGGACACAT
GCTCCACTATGTTCATAGCAGCCTTATTTATAATAGCCAGAAGCTGGAAA
GATTTTTTTTGCCCCCCACCAGAGGAATGGATACCCAAAAAGAAAAAGAG
GTACGCNATGGAGTACTACTCAGCTATTAAAAAGAATGAATTTATGAAAT
TCCTAGCCAAATGGATGGACCTGGAGGGCATCATCCTGAGTGAGGTAACA
AAATCACAAAGGAACTCACACAATATGTACTCACTGATAAGTGGATATTA
ACCCAAAACCTAGGATACCCAAGATATAAGATACAATTTCCTAAACACAT
GAAACTCAAGAAAAATGAAGACTGAAGTGTGGACACTATGCCCCTCCTTA
GAAGTGGGAACAAAACACCCTTGGGAGGAGTTACAGAGTCAAAGTTTGGA
GCTGAGATAAAAGGATGGACCATGTAGAGACTGCCATATCCAGGGATCCA
CCCCACAATCAGCATCCAAACGTTGACACCATTGCATACACTAGCAAGAT
TTTGCTGAAAGGACCCAAATGTACCTGTCTCTTGTGAAACTATGCCGGGG
CCTAACAAAACAGAAAGGGATGCTCACAGTCCGTTAATGGATGGATCCAC
AGGCTTCCCAATGGAAGAACTAAAAAAAAGACCCAAGAAGCTAAAGGGAT
CTGCACCCTTATAGTGGAACAACAATATGAATTTACCGGTACCCCCGAAG
TCTTTGACTCTAATTGGAAATAAATCAAAAAAGGGCCCACCCCCCCTCTC
TGGAAAGAAAGACCCCTTTGGAATTGCAACTTTATTTTCCCCCTCATGGG
GTAAACCACTGCCTAAAAAGGGTATGTGGGGTTTTATTAAAATGTGCTTC
ATACTATTCTCATATTATCACTTTATCCAATTATTTTATATATTTTTCTT
CG
|
quality values | Open.Hide. 6 6 6 6 6 6 3 0 0 0 0 0 0 3 6 6 6 7 7 9 9 9 10 13 10 8 8 8 8 8 8 11 12 8 8 8 12 15 20 24 25 31 24 20 24 24 29 34 34 34
34 33 35 35 42 40 57 47 47 50 50 50 53 53 57 53 38 36 48 48 31 29 33 33 30 15 18 13 10 10 9 9 9 9 13 9 21 21 28 30 37 37 47 47 47 47 57 57 57 57
57 57 57 50 50 50 50 50 36 36 31 31 30 34 28 16 16 11 21 14 19 14 22 10 10 15 10 10 10 11 17 18 17 15 15 25 26 41 44 53 53 57 57 59 59 59 59 57 43 43
43 37 37 48 53 47 47 47 43 43 43 48 47 48 48 50 50 50 57 57 57 57 57 53 53 47 47 50 48 50 50 50 42 50 42 36 31 18 12 9 9 9 9 16 15 28 36 59 47 37
37 28 34 25 25 25 37 37 44 57 57 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 57 57 59 57 57 68 68 57 57 57 57 59 59 68 54 54 54 54 54 54 57 57 68 68 68 68 68 68 68
68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 59 59 59 59 59 59 57 54 54 57 59 59 59 59 59 57 57 57 57 57 57 59 59 68 68 59 57 57 52 52 52 57 57 57 54 54
57 57 57 57 54 57 59 59 59 59 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 57 59 57 57 57 57 57 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68
68 68 59 59 59 59 59 59 59 59 59 68 59 57 54 54 54 57 57 59 59 59 54 54 59 59 68 68 68 68 50 50 57 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 53 50 50
50 50 41 59 30 30 20 17 10 10 10 10 10 11 12 20 28 34 43 50 59 59 48 53 48 57 57 57 59 59 59 59 59 57 57 59 43 43 43 48 59 48 48 48 48 48 57 57 57 57
59 59 59 59 46 48 48 59 59 30 41 18 20 15 27 12 11 11 12 16 15 13 14 14 14 15 18 21 23 32 39 59 59 59 59 59 59 48 48 43 43 43 43 43 47 36 30 22 15 15
12 12 14 15 18 12 12 18 26 34 25 34 34 48 57 57 57 57 57 59 48 48 48 48 50 50 50 57 59 59 59 59 41 40 25 28 28 37 41 57 57 54 54 48 48 48 48 54 48 50
50 68 68 68 68 68 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 68 68 59 59 48 48 48 48 57 57 57 57 59 57 59 59 59 59 59 57 57 57 59 59 59 59 59 59 59 59 59
52 52 52 57 57 50 50 43 35 32 44 43 50 46 54 50 57 57 57 57 54 57 57 57 57 57 47 47 47 47 57 59 59 59 59 48 48 48 57 57 57 57 57 57 47 47 47 57 57 57
59 68 68 59 59 48 48 48 48 48 54 54 54 57 57 59 68 59 59 59 59 59 59 59 68 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 57 50 50 50 50 50 48 59 59 59 59 59 47 59
41 37 37 30 30 32 37 41 41 43 47 46 48 48 48 48 59 59 59 48 48 48 59 59 59 59 59 59 59 57 57 57 48 42 48 42 42 42 47 48 57 47 47 47 47 47 47 48 48 48
48 48 47 47 47 59 59 44 39 31 25 30 30 30 30 32 30 27 31 30 32 30 28 31 36 31 35 37 29 22 22 18 14 20 21 21 14 19 18 29 37 37 28 28 28 32 34 37 24 25
25 32 27 25 18 18 24 30 17 17 8 8 8 13 12 30 25 26 14 21 21 23 21 15 14 14 22 16 15 14 14 14 12 12 14 15 19 18 17 15 12 11 10 14 14 15 15 19 19 13
8 8 11 10 12 10 11 10 19 14 16 16 14 18 13 17 13 12 12 19 23 29 23 23 12 14 13 17 13 12 13 15 9 9 10 10 10 8 11 8 9 11 10 10 11 12 15 8 8 11
12 11 9 9 12 9 9 10 10 10 9 9 9 9 9 9 9 9 9 8 8 8 7 7 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 6 6 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 7 7 8
8 6 6 8 12 19 13 11 11 11 11 11 11 11 11 13 11 10 10 11 13 13 15 21 19 24 19 14 13 10 10 10 10 10 11 17 12 9 9 8 8 11 11 11 11 12 11 10 10 8
8 10 12 12 8 10 10 11 8 8 7 6 8 8 10 8 8 8 10 11 12 12 11 11 11 11 9 8 8 8 10 14 9 9 10 10 10 10 10 10 8 8 12 12 12 12 11 17 18 15
15 12 11 11 12 12 8 12 12 14 12 10 9 9 8 8 8 8 8 8 19 19 15 13 18 15 11 11 11 10 10 12 8 8 9 9 10 8 8 8 8 8 8 10 19 24 13 15 10 10
10 11 13 15 18 10 8 7 7 8 8 10 13 10 8 8 8 8 8 9 8 8 10 13 12 8 11 11 12 12 12 9 12 8 9 8 10 9 11 11 11 12 18 10 10 10 8 10 10 10
10 10 10 8 8 8 7 6 8 8 10 12 12 9 9 9 11 12 12 12 9 9 9 15 11 12 12 11 10 10 11 11 9 9 10 10 10 10 11 11 12 11 12 12 11 11 11 11 11 11
11 11 11 8 8 7 7 10 10 8 6 9 13 15 9 10 10 8 8 6 6 10 8 9 9 6 6 6 6 8 8 10 8 8 10 12 11 12 10 9 9 10 8 7 6 8 8 8 8 8
8 8 8 9 9 9 8 8 8 8 8 8 8 10 10 9 9 9 9 10 16 17 12 12 11 12 13 13 10 10 8 11 8 8 13 8 8 | Open.Hide. 0 0 0 0 3 6 6 6 7 7 6 6 6 7 6 7 7 6 10 6 6 6 8 10 10 13 8 8 9 8 15 9 15 16 15 15 9 9 9 23 22 33 28 28 30 33 30 36 36 36
36 36 34 34 34 34 39 43 40 48 48 48 48 57 48 48 47 47 42 32 32 43 39 39 42 36 41 41 41 41 42 50 51 51 50 51 54 47 47 57 47 50 47 47 44 42 57 57 57 57
57 57 68 68 50 51 48 48 36 28 28 23 28 28 40 44 44 48 57 57 57 47 43 43 33 33 28 28 28 38 42 51 68 68 54 57 57 68 68 68 57 57 57 68 59 59 54 54 54 57
57 54 54 54 57 57 59 59 53 50 50 47 47 42 48 48 50 53 53 53 38 36 36 50 50 50 59 59 59 37 37 24 9 8 8 8 8 15 22 32 28 28 22 28 13 13 13 26 19 36
36 48 59 59 59 59 59 57 57 57 57 57 57 57 68 68 59 59 59 43 36 36 35 39 44 57 48 54 48 48 48 59 59 68 68 68 68 68 68 59 59 59 59 59 57 68 68 57 57 57
57 57 57 57 68 57 57 57 57 59 57 57 57 59 59 68 68 59 57 57 57 57 57 57 68 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 68 68 68 68 68 59 57 57 57 43 52 57 59 59
59 68 68 68 59 59 57 57 57 57 57 57 59 59 68 68 68 68 68 68 68 68 68 59 59 57 43 57 57 57 57 57 57 57 57 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 59 59 59 59
59 59 59 59 59 59 54 59 59 68 68 68 59 68 68 59 59 57 57 54 54 54 54 48 48 48 48 48 57 57 48 59 59 59 59 59 59 59 46 43 48 48 48 50 41 36 39 24 24 12
12 12 13 19 15 23 34 34 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 57 57 57 57 57 59 59 59 57 57 53 53 50 50 59 59 59 33 27
13 11 12 12 18 15 25 15 12 11 15 15 32 32 23 10 7 7 7 8 8 11 18 27 34 47 50 47 39 36 31 32 25 14 12 12 12 20 20 11 11 9 9 9 8 8 8 8 8 8
8 9 9 9 9 3 0 3 27 27 44 47 47 50 59 59 59 59 59 59 59 59 57 57 59 59 59 59 59 59 59 59 48 48 48 48 54 54 54 57 57 68 68 68 68 68 68 68 59 59
59 54 47 47 47 47 54 59 59 59 59 57 54 54 54 54 54 68 68 68 54 54 54 54 54 54 57 54 54 54 59 59 59 48 48 48 48 48 48 50 50 50 50 50 50 50 50 57 57 57
48 48 48 48 48 46 47 59 59 59 44 37 31 31 37 37 37 47 47 47 46 48 59 59 59 59 59 48 48 57 57 59 59 48 57 57 57 48 48 48 57 48 54 54 57 54 54 54 54 48
48 48 48 48 59 57 57 57 57 57 48 48 48 54 54 48 50 57 57 57 48 43 43 39 39 39 43 43 57 57 39 39 39 43 43 43 59 59 47 41 41 34 36 22 22 28 34 34 39 39
39 37 37 39 59 37 37 30 37 37 42 42 47 59 44 44 30 24 18 22 22 28 34 31 31 31 30 29 28 37 32 26 29 27 33 36 37 59 43 41 37 41 43 43 47 47 39 28 28 13
13 13 30 26 35 28 34 39 39 39 39 42 41 41 39 39 28 24 15 21 19 25 17 15 19 12 19 15 24 25 22 22 25 28 28 25 30 31 16 17 14 14 19 19 26 24 24 21 24 27
30 30 24 28 12 12 11 14 14 23 23 19 20 17 22 22 25 25 32 27 27 27 37 22 25 11 11 10 16 16 30 34 35 31 32 34 33 32 30 28 15 9 9 9 9 8 12 15 11 18
18 22 28 17 12 10 10 10 15 17 14 23 23 30 15 11 11 10 8 8 12 25 21 19 17 9 9 9 9 9 10 10 11 10 8 8 8 9 9 9 10 14 9 9 9 10 9 9 9 9
14 16 22 20 17 17 16 17 16 20 20 20 23 22 22 25 32 35 18 13 12 10 8 8 8 9 10 10 10 18 12 9 9 10 10 10 8 9 10 9 11 13 14 14 24 21 30 26 22 9
9 9 10 9 9 10 9 10 9 9 10 9 11 11 9 8 8 9 9 9 21 20 19 12 11 11 12 12 12 12 9 9 9 8 8 10 11 13 10 8 8 8 9 10 10 10 9 9 13 14
12 9 8 10 10 10 11 19 25 10 10 8 8 8 8 9 9 10 7 12 9 9 12 9 13 15 12 10 9 9 10 11 13 11 18 16 20 12 12 9 9 9 13 11 18 11 11 10 8 8
8 8 8 8 19 7 9 8 8 8 10 10 8 8 8 8 10 8 6 6 6 8 8 15 8 10 9 9 8 8 8 8 8 8 9 10 8 8 8 8 11 21 26 15 10 10 9 9 9 7
6 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 10 10 8 8 6 6 8 8 10 11 10 15 8 8 8 8 8 14 17 21 18 17 17 16 12 8 8 8 8 8 15 18 18 12 6 6 6 6 8
10 8 9 9 9 9 9 9 9 9 9 9 10 12 10 10 7 7 7 7 6 8 10 10 9 9 9 10 12 14 12 10 10 10 10 11 11 12 10 11 9 9 10 10 7 7 10 9 8 8
6 6 6 8 8 8 8 8 8 10 10 6 9 9 15 15 8 8 6 6 10 8 13 10 11 7 7 6 6 12 14 15 16 12 11 11 12 10 10 8 12 12 6 6 6 8 8 13 8 8
10 8 8 10 10 11 11 10 8 8 6 6 8 6 6 10 12 8 8 8 6 6 8 8 8 8 8 8 10 10 11 18 18 12 12 9 8 6 8 6 6 7 7 6 8 9 9 9 14 9
9 9 |