BAC end | BAC-end 1 | BAC-end 2 |
---|
end name | MSMg01-323D03.T7 (MSMg01no323_d03.b1) | MSMg01-323D03.TJ (MSMg01no323_d03.g1) |
ACC | AG441685 | AG441686 |
length | 1,246 | 1,290 |
length of high quality (start - end) | 296 (137 - 432) | 621 (132 - 752) |
definition | CHROMAT_FILE: MSMg01no323_d03.b1 PHD_FILE: MSMg01no323_d03.b1.phd.1 CHEM: term DYE: big TIME: Tue May 17 22:06:28 2005 | CHROMAT_FILE: MSMg01no323_d03.g1 PHD_FILE: MSMg01no323_d03.g1.phd.1 CHEM: term DYE: big TIME: Tue May 17 22:06:28 2005 |
singlet/doublet | --- | singlet |
---|
BLAST hit | no hit data | unique |
---|
sequence | NCCATTCTNNNNNNNATCAGTGGGCGCTATAGACTCCTATAGGGAGAGGA
TCCGCGGAATTCTTTGTTTAGCTCTGTACCCCTTTAAGTACCAGGGNTAT
TTAATTTCTGGAATCCAACTCCTTGAACTCTTTGCATATATCAGATATTA
GTCCCCTATCAGATTTAAAATTGGTAAAAATCCTTTCCCAATCTGTTGGT
GGCTTTTTGGTCTTATTGACAATATCTTTTGCCTTACAGAAGCTTTGCAA
TTTTATGAGGTCCCATTTGTCGATTCTTGATCTTACACCACAAGCCATTG
CTGTTCTGTTCAGGAATTTTACCCTGTGCCCATATCTTCAAGGCTTTCCC
CCACTTACTCCTTTATACATTTCAATGTCTCTGGTTCTATGTGGAGGAGT
TTGATCCACTTCTTTTTGAGCTTTGTACAAGGAGAGAAGAATGGATCAAT
TTGCATTCTTCTACATGATAACCACCAGTTGTGCCAGCACCATTTGTGAA
AATGCTCTTTTTTCTATTGGACGGCTTTAGCTCCCTTGTCAAAGATCAAG
TGACCATAGGTATGTGGGTTCATTTCTGGGTCTTCAGTTCTATTCCATTG
ATCTACCTGTCTGTCACTGTACCAGTACCATGCAGTTTTTATCACAATTG
CTCTGTAGTAGAGCTTGAGGTTAGGCATGGTAATTCTACCAGAGGTTCTT
TTATTGTTGAGAATAGTTTTTTCTATCCTAGGTTTTTTGTTATAACAGAT
GCNNNCCGCTTTTTGTTTTACCCCCCCCAGAGAAGAAATGACTTGGAATT
TTGATGGGGATTGCATTTAATCTGTAAATTGCTTTCAGCAGCCTCACCAT
TTTAACTATATTAATCCTGCCCATCCATGAGCATGGAACATCTTTCCATC
TTCTGAGATCTTCCCTAACTTCTTTCTTCAAAAAACTGAAGTTCTTGTCA
TACAGATCTTTCATTTCCTTAATAAAAGCCCCCCAGCTATTTATATTTTT
GTGAACAATTGGCAAGTGGTTGTTTCCCCCAATTTTTTTTCCCTCCCGGT
TATCCTTTTCCTAAAAAAGGCCCACTATATTTTTTGATTTTTTTTTTACT
TACCCCTTTATTCTATTTTTTTTATTCCTTTAAAAATTTTCTGGTGCGAT
TTTTGGAACCCCTCAACTATTCAATTATATCTCGCTTCGATCAATTCAAA
ATTCAGCTCTCCCCTTTTTTTTGTCACCACATAAATAATTTTAATT
| NCCGATATTNNNNNATAGATGGCAGGCTGGXXXXXXXXXXXXXXXXXXXX
XXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXCCTTTAAAGCCTCATGAGAAA
TGCGAAACCACAGAAATACAACTTTTAAATATGCCCCAATTCCTGTATTC
CTATGTTTTAAAATATCCTACAATATAATAATAGGTAAATATTTCTAATT
TTTCTAAAGTTTTCTTTTCAGTGCAAAAACCTTTTAATTCCATAGGTTGT
ACGTTTGATTTGAATCTTATTTCCGCGTGACCAAGCTCCTATTCTGAGTA
TTTATTCTGTGCCTGTGCCGGAGTGAGCTCCCCACGCCTCCCTCTGTATG
GTTCTGCTCTACTAGTGCGGCTTTTGACCCGCTTGGAATTCTTTTTAATT
CTGACAGAGAATTTTTTTCATTTTCATTCTTCCACCCCTAGATGTCAGTT
TTCCCAGCACTGTTTGTTGACAATGCTGTTTTGTTTTGCTTTTCCTCAGT
GGGTATTTTTGGCATCTTTGGGTTGTAAGGCTTATATCTGGGTCCCCAGT
CTTATTCAGTGTTTCAGCCTTTGTGCCAATACCATGCTGCTCTTCCTGCG
ATGACTCAGCAGGATAACTTGAAAGCTGGTTTGTTGATATCCTCCAGCAA
GGGTTTTATTATCCAGGGTTGTTTTTGAGATCTAGAGCCTTTCATGCCTC
CATATGAATTTTAGGTTTTTCTTTTCAATTTCTAGGAAGAATTGCTTCAG
AATTTGCTGGGAAAATCCCACTGAACCTATAGATTATTTTTTATATAATA
ACTATTTTCACAACATTAATACTACCAATGCATGTGCACAGGAGGTCTCT
CCATCTTCTGGTGTCTTCCTTGGTTTCTTCCTTCACGACTTTAAAGTTTT
CCTTCTTTCTTTCCTTCCTTCTTTCTTCCTTCCTTCCTTCCTTCCTTTCT
TTCTTTCTTCCATTCCTTCCTTCCCTTCCTTCCTTTCCTTCCTAATTAAT
AAATTAAATTAATTAATTTAATAGGCAAAAATCTCGTGGTATTTCTAATC
TGGGCCCTCAACTTTCTAAATTATGCCAAGGAGGAACCCTATAAACCTCG
GATCTTTCCTTGTCCCCCCGCGGAGGGTATTATAAGACAAAGGATATCTG
CCACGTCCTCTTTTTATTATACCTCTCGGGAAACCACTTATATAAACAGG
GGCGAGAAATACAAAGATTATTCTTCTGAATAATCTAATCTCCTAATACC
TCAATATATCTAACATCTATTCATTATTAATACCACCCTT
|
quality values | Open.Hide. 0 3 8 8 9 11 9 3 0 0 0 0 0 0 0 3 10 9 6 6 6 8 8 9 10 8 8 8 8 8 8 8 13 15 9 8 8 12 13 16 19 19 35 28 24 28 28 33 36 37
47 47 47 47 47 47 47 47 37 37 47 50 53 36 38 36 35 30 35 28 28 30 37 28 25 25 24 19 16 10 14 16 9 9 6 6 6 6 6 6 6 6 6 9 12 3 0 3 21 21
37 37 37 37 37 44 44 53 53 53 53 50 50 50 50 47 21 23 11 9 12 12 21 11 11 13 10 10 10 19 16 18 21 13 11 10 13 23 27 31 33 33 44 44 53 53 53 53 42 42
42 43 53 50 50 50 50 50 50 53 57 57 57 51 51 51 51 47 47 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 57 68 68 68
68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 57 57 57 57 57 57 57 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 57 57 52 52 52 59 59 68 68 68 68 68 68 68 68
68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 57 57 57 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68
68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 59 48 44 39 39 43 44 59 59 59 59 59 68 68 68
68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 59 59 59 59 59 59 59 68 68 68 68 68 59 59 57 57 59 59 59 68 59 59 57 48 48 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 57 57 57 39 36
28 28 28 33 37 59 41 37 20 22 12 11 11 12 21 22 22 22 14 17 21 34 41 59 40 40 40 41 41 24 21 15 21 21 21 15 18 13 11 23 23 31 36 28 32 39 42 43 43 43
43 59 57 44 44 40 43 43 43 43 48 43 47 32 28 23 34 31 39 39 30 29 13 12 12 12 12 13 15 18 20 20 41 41 59 59 48 48 48 48 48 57 59 57 57 43 46 46 48 48
57 43 40 33 36 43 42 42 42 42 43 43 57 59 57 57 44 40 23 19 14 14 14 27 27 32 37 37 48 48 57 57 57 68 68 59 59 34 30 14 16 15 22 24 44 44 57 48 47 47
47 47 57 57 47 48 48 48 50 59 59 68 68 68 68 68 44 44 23 28 32 44 44 59 68 68 68 68 68 44 44 29 43 43 44 43 43 43 57 57 68 59 59 59 59 57 59 57 68 68
68 68 68 68 68 68 57 48 38 38 38 48 57 68 57 44 44 42 32 35 44 44 68 68 68 68 44 44 28 30 30 44 41 68 68 68 68 59 57 68 54 54 42 42 32 35 35 59 59 59
43 31 27 27 16 26 27 48 28 23 10 10 15 16 29 37 32 32 20 20 20 32 32 42 41 39 39 34 26 18 19 19 25 19 23 16 19 18 23 23 24 18 18 22 21 36 39 50 48 59
47 47 47 37 32 32 28 28 32 37 47 47 47 39 37 37 31 32 37 37 39 41 41 59 59 44 37 31 37 30 25 14 19 11 12 12 23 21 24 20 12 14 10 10 8 8 9 9 9 11
8 3 0 0 0 3 6 6 6 8 12 11 11 9 9 9 15 12 9 7 8 8 8 8 12 15 23 12 9 9 9 9 21 13 11 11 12 12 18 19 20 28 27 28 22 25 27 27 29 31
39 39 43 41 39 27 27 14 18 9 9 9 9 10 18 10 10 10 12 16 20 15 19 15 13 8 6 7 7 13 10 13 13 16 20 11 11 11 13 15 10 11 11 9 9 13 13 16 16 32
28 20 22 18 18 15 18 18 14 10 9 9 9 9 13 18 19 21 16 15 11 11 11 13 16 19 24 15 15 7 7 6 8 8 10 13 12 8 12 8 8 8 8 9 10 13 10 10 11 10
12 12 10 10 10 10 10 10 10 10 17 17 10 11 12 15 8 8 11 11 13 13 15 22 12 14 9 10 9 11 9 10 11 9 8 8 8 10 11 10 10 10 14 15 17 11 10 10 8 8
8 10 10 8 8 8 9 9 11 13 9 9 8 8 9 9 9 9 9 9 9 12 10 9 9 8 8 8 8 8 10 13 8 7 8 6 6 8 8 9 13 12 10 12 12 12 20 23 10 7
6 6 8 6 8 10 8 9 8 6 8 6 6 8 8 10 10 10 13 9 10 10 9 10 15 18 37 27 18 14 16 10 10 11 15 10 10 10 13 10 10 10 8 9 9 10 19 15 10 10
10 10 10 10 16 15 13 12 10 10 10 9 9 9 10 22 17 11 11 10 8 8 6 6 8 8 6 6 8 8 12 15 13 13 10 10 9 12 10 10 10 10 16 13 13 13 8 8 6 6
8 6 6 8 8 8 11 14 11 11 8 12 7 7 8 8 10 15 16 16 16 12 8 8 8 8 8 10 8 8 10 8 8 8 11 11 11 9 10 8 13 10 10 8 8 8 8 9 9 9
11 10 10 6 6 6 6 8 8 16 15 6 6 6 6 8 8 10 11 12 10 10 10 8 8 12 12 8 8 11 8 8 8 8 8 8 8 8 10 10 9 8 8 11 13 14 14 14 12 11
6 6 8 8 8 8 10 10 9 13 11 10 9 9 13 14 9 9 9 7 10 8 8 6 6 6 10 10 6 6 8 8 12 19 15 12 12 12 15 12 18 12 9 9 11 11 | Open.Hide. 0 3 8 8 6 6 6 6 3 0 0 0 0 0 3 6 6 6 6 6 6 6 6 6 6 6 8 6 6 7 7 14 10 10 11 7 7 9 8 10 9 15 19 19 8 9 11 19 19 19
10 10 19 24 28 35 35 28 28 28 25 26 26 35 36 36 36 53 41 50 50 50 42 41 37 27 11 7 7 7 8 8 10 8 8 8 8 8 8 6 6 6 8 13 17 25 34 50 50 50
50 53 53 57 53 53 53 57 57 50 50 50 50 50 33 33 37 23 23 11 11 12 11 10 10 10 10 14 16 18 19 17 17 28 30 41 32 28 28 37 37 47 47 47 50 50 50 53 53 53
53 53 53 53 50 53 51 51 68 68 51 47 47 47 47 47 50 50 68 68 50 50 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68
68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68
68 68 68 57 57 57 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 57 68 57 57 57 57 57 68 68 68 68 68 68 59 59 57 57 57 68
68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 57 57 57 57 57 57 54 57 57 57 59 68 68 68 68 68 68 59 59 48 47 47 44 48 48 48 59 59 57 57 68 57 68
68 59 59 59 59 68 68 68 57 57 68 57 57 57 59 59 68 68 68 68 68 68 59 59 57 57 57 57 57 68 68 68 57 57 57 57 57 57 57 57 57 59 59 59 59 59 59 59 59 59
59 59 59 59 50 50 41 28 17 12 15 11 11 12 12 12 12 27 25 47 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 57 57 48 48 57 57 59 59 59 59 59 59
68 68 68 68 59 59 59 48 48 48 48 54 48 48 46 42 44 41 41 30 30 41 42 42 42 42 42 35 42 42 57 59 59 68 68 68 68 68 59 59 59 59 59 59 59 59 59 57 44 44
43 43 29 29 35 43 43 54 50 44 44 52 59 38 38 27 42 38 38 38 68 59 59 59 59 59 59 44 43 31 31 43 41 41 52 52 52 59 44 59 59 59 57 57 59 59 57 57 57 57
57 59 44 59 43 43 39 44 44 59 68 59 59 59 59 59 59 52 57 59 59 59 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 50 46 46 46 46 46 50 59 57 57 57 57 57 57
68 57 57 57 57 57 57 52 57 57 68 57 57 57 57 57 57 59 59 59 57 68 57 57 57 57 57 59 59 59 68 68 59 59 59 59 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 43 44
32 28 28 44 44 57 57 68 68 57 57 54 48 48 48 48 54 54 54 54 54 57 68 59 59 57 57 43 43 43 34 34 24 13 13 28 34 59 57 57 57 50 50 50 57 48 48 48 48 47
59 47 41 41 41 37 31 31 26 26 16 18 11 25 22 28 28 32 32 37 59 59 59 59 59 44 37 37 41 41 44 47 41 41 41 39 31 28 32 26 29 25 37 30 30 28 27 25 30 14
11 13 13 14 19 21 12 12 21 21 30 19 24 20 30 30 34 31 37 41 37 37 30 25 25 27 39 41 41 37 37 37 37 33 32 32 19 19 10 12 12 23 25 40 40 37 39 37 37 30
32 32 37 37 37 32 27 15 17 22 23 22 21 12 11 11 13 25 27 26 28 15 15 15 15 15 14 14 18 30 35 29 25 20 20 17 25 25 20 20 15 21 11 10 10 10 12 19 18 22
19 30 24 16 16 10 9 9 13 12 11 11 11 11 11 19 18 24 20 15 11 11 11 13 9 9 11 10 18 15 13 13 21 17 19 17 16 19 21 27 18 18 15 14 14 14 14 20 22 13
8 9 11 11 10 21 21 37 24 26 14 15 13 15 14 8 8 8 6 6 13 23 27 30 19 19 14 13 13 21 19 11 10 10 10 16 16 15 10 10 10 13 10 9 8 13 10 14 13 19
10 12 14 17 11 14 10 11 8 9 7 7 6 6 6 10 9 18 24 25 25 16 12 10 11 10 10 11 13 11 11 11 22 22 24 24 15 11 11 13 10 10 11 11 16 17 25 18 19 10
10 9 19 9 9 9 11 9 13 8 8 8 10 8 9 10 8 13 12 10 9 9 12 12 11 15 22 18 13 14 9 9 9 9 9 9 11 11 16 12 12 10 8 8 8 8 8 15 12 12
9 6 6 6 6 11 10 10 10 10 13 13 20 20 11 12 9 8 6 6 6 8 10 10 10 10 10 10 12 8 8 8 8 8 8 10 12 11 8 8 6 6 10 8 10 13 10 8 8 8
8 6 8 6 6 7 8 17 11 11 10 10 8 10 8 8 10 10 12 11 9 9 9 9 9 9 10 10 8 9 9 9 8 8 8 8 10 8 8 15 12 11 10 8 8 8 8 8 8 9
8 12 10 8 8 8 10 8 13 12 12 12 8 15 8 8 8 8 8 7 8 10 10 15 14 24 19 13 13 12 11 11 11 16 11 8 8 8 8 8 10 8 8 8 8 8 9 9 8 8
8 11 6 6 6 6 8 8 7 6 8 8 10 8 8 8 8 8 8 9 10 10 9 10 11 8 6 6 6 8 6 6 8 6 6 8 8 8 8 7 7 11 7 7 6 6 8 8 8 8
8 12 10 11 8 8 8 6 8 12 10 10 8 10 8 8 6 6 8 8 8 8 6 10 8 7 10 7 7 8 10 8 8 6 6 8 13 11 13 12 |