BAC end | BAC-end 1 | BAC-end 2 |
---|
end name | MSMg01-342K07.T7 (MSMg01no342_k07.b1) | MSMg01-342K07.TJ (MSMg01no342_k07.g1) |
ACC | AG456145 | AG456146 |
length | 743 | 1,037 |
length of high quality (start - end) | 393 (58 - 450) | --- |
definition | CHROMAT_FILE: MSMg01no342_k07.b1 PHD_FILE: MSMg01no342_k07.b1.phd.1 CHEM: term DYE: big TIME: Tue May 17 22:32:13 2005 | CHROMAT_FILE: MSMg01no342_k07.g1 PHD_FILE: MSMg01no342_k07.g1.phd.1 CHEM: term DYE: big TIME: Tue May 17 22:32:13 2005 |
singlet/doublet | singlet | --- |
---|
BLAST hit | unique | no hit data |
---|
sequence | CCGCTATACGACTCACTAAATGCAGAGAGAGCGCGGAATTCTCTGCNTTA
CCAACATAATCTCTACATTCTATTCCCAGAGCTTTATGGGTAAGAAAGCT
AACTGTCACTGGAAAAAGACAAAAAACAAATTTAACTGAAAGAGCCTACA
ATATGTCTCTACATTCTATTCCCAGAGCTTTATGGGTAGGGAAGCTAACT
GTCACTGGAAAAAAACACAAAAACAAATTTAACTGAAAGAGCCTACAATA
TGTCAAATATGGAGTACAGATAGGCATAAAAGTTAGGGGACTTGAATTGC
CAACTATGTATCAAGTATAATGTCATTATGTCCAAAGGCTAATAGTATAA
CCTCAGATTCAAGCAAAAACAATCTTGATTTTAAAAAGTACTCCTTCTTT
AAGAGATCATTATGCACAGTGTCTGTACTCCAGATGAACTGTATGACTCA
GTGATTGCAAAGCTCATTTCTTTTGTACTCAATTCTCCATGCAGTAGGAA
CAGGACATGGCTAGTCTCAGATCCAATGTTATTCTGATTCCCTTCTAAAG
GATGATTTTTTTTATATGTTCCTAACACCTTATTTTTCCTCATTTTTTTC
ACCCCAGGTTTATTTAATTATTTTTTTCCGCATACCCCGCTCCTTTTCTC
CCTTTTATTTGCGCCCTATTTTTGTTACTACGCTGTATCTCATTCTTCAT
ATATTTTAGCCAGTTCTTTCTATATCCACATTACTCCACACCC
| GCGTTATAGTAATGATAGCGCAGTATGTCCCTGTGTCGGTGTCCCGGCNC
CTCGAGGTTCTCGTTTTCGTTANAACAATCTCTCACAGGGTCGCAACCCC
TAAATTAAGAAAAGGGTGTTATCCCGGCGCGGGAAAAATCTCCATAGACA
CCTTTAAATAGGGGGCGCGTGGGGCGTTTTTTATTAAAACACTTGTGGGG
GGGTGTTAATTACAAAGCGCCTTAATAATAATAATGATCTCTCTTTCTAA
CAAGGCGCTACTTTTTGTTTCTATTCCTCGTGGCGTGGCGTGCGCCTTTC
CATATACCCCCTCCGTCGCCGGTGGCGCAAATAACACCCCTCTTTTTTGC
GAGCGGTGGCGCCGCATGAATAGAAAACAGGTGCGTTTGGGTCGCGCCCC
TCCCGTTCTTCCCTCTGTGGGTATACAATATACACTAAAAAAACCCCGCT
CGGTGGGTTGGTTCCCTATTTTTAGCCGGAGGGCGGCGCCTTTATTCCGC
CCTTGCGGGTTTTTGTTTTCCCCTTTCCTCTCCCTACTTCTCTCTTCAGT
TGTTTTTATTCGCACTCCACCTCTTTTATTGTTTTGTTCGTTTGTTGTCT
CCCCCCATCCCTCTTCGTTACCATAAATAATGATTCGCACGATGACACGG
CGCCGTATCGTGCTCCGCCCCCCAGCCCTTGTCGGTTATCTCTAGAATCC
GCCACCATTCTTTTCCCTTTATATATATATTTTNTCCTCTCCACTACCTC
TACCTCCACAACACTTATTCTTGCCTCGTTCTGTGGGGGCTGTGGGCCCT
CTTCTTCTCTTTCCCTCATCCCTACCATTCAGTTTTTTCTTATTCCTGTT
TCTTCCACCCCGTCTACCTCACTACAAATACTAATATTATTATCTCGCGT
CTGTGGCGCGAATGTCCCGCCCGCTCGCTATACCTTCCATCCTCTCTTTC
TCGTTTCGCCGCCGCCCTACGGGCTCTCTGGTCACTCTGACGTCACACGC
CGCCCCCCCTCTTTCGCGTCTGTGTTTATCCTCTTCG
|
quality values | Open.Hide. 9 9 23 11 9 9 14 14 19 29 41 27 20 16 16 14 7 7 6 6 6 10 9 9 9 8 10 8 8 8 8 12 11 20 18 34 34 37 37 37 37 59 59 29 22 3 0 3 6 6
6 6 6 6 9 9 9 10 17 29 36 36 35 21 21 29 28 30 35 57 57 57 57 57 53 47 47 47 48 48 59 59 57 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 59 59 59 59 59 54
57 46 46 43 37 37 36 36 22 33 25 36 44 46 57 59 68 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 54 54 54 57 57 57 54 54 57 57 57 57 57 48 57 57 59 59 68 57 57 57 57
57 57 57 68 68 68 68 68 68 57 57 68 68 68 68 68 68 68 68 68 59 59 57 57 57 54 54 54 59 57 57 57 57 57 52 57 59 52 57 54 57 54 57 57 57 57 57 57 52 52
43 52 59 59 59 57 57 57 54 54 54 54 57 57 68 59 57 57 59 59 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 59 59 57 57 44 44 33 33 35 42 42 48 48 44 57 43 43 44 46 46
57 59 59 59 59 59 59 59 59 59 54 54 54 48 48 47 43 43 43 47 46 48 43 43 46 46 43 47 43 43 43 39 37 43 43 43 43 43 43 43 43 43 43 43 43 43 48 48 48 59
47 28 16 9 9 9 9 13 12 12 12 18 16 24 31 41 41 37 37 37 37 39 43 36 43 43 59 59 59 48 47 47 43 43 43 47 47 47 43 43 39 35 43 41 43 41 41 41 32 30
30 41 41 30 28 36 37 42 44 37 43 43 39 37 32 25 25 28 28 30 42 42 48 57 57 57 57 54 54 57 59 59 47 43 43 37 43 41 43 43 47 47 54 54 54 54 54 48 46 37
32 23 23 23 28 31 37 33 32 32 32 32 29 24 17 25 25 20 18 20 28 32 43 39 37 30 30 34 30 24 12 11 11 10 10 10 13 23 32 39 39 37 37 26 26 17 12 12 12 9
9 9 15 16 14 14 15 18 15 18 19 24 32 41 34 32 32 26 18 13 12 12 8 8 6 6 8 17 12 11 10 11 12 20 20 25 23 19 19 12 12 10 11 11 12 11 11 11 12 12
18 21 24 15 14 14 14 14 18 18 22 28 13 13 13 15 20 12 11 11 11 12 10 10 14 19 25 24 21 10 8 8 8 8 8 10 9 9 9 11 10 9 9 6 10 10 8 9 9 10
10 11 10 10 10 10 10 12 14 24 18 23 15 13 8 8 8 8 15 15 17 19 12 8 8 8 8 8 8 9 9 9 10 15 19 28 19 19 15 19 15 12 13 13 18 24 23 13 8 8
8 8 13 16 21 14 14 14 13 13 11 11 11 11 10 11 11 11 22 12 13 10 12 12 12 12 8 10 6 6 8 8 9 9 10 10 10 8 8 10 13 9 9 9 9 15 9 11 10 12
12 15 19 19 16 13 8 8 10 8 8 8 10 10 9 8 8 8 8 12 13 12 9 10 10 10 8 8 6 6 8 8 8 8 8 6 6 6 10 8 9 8 13 8 8 8 8 8 8 8
10 11 9 9 8 10 8 8 6 6 6 6 8 8 11 11 14 15 10 12 13 10 10 12 10 9 8 10 6 6 8 10 8 10 10 11 10 11 10 14 13 15 14 | Open.Hide. 6 6 6 6 8 8 8 9 9 6 6 6 6 6 6 9 9 12 9 6 6 6 8 13 8 8 6 6 7 8 8 8 7 6 6 8 8 8 6 6 6 8 8 9 10 10 11 3 0 3
8 6 6 6 6 9 10 13 9 10 9 10 11 8 8 8 8 8 6 6 6 3 0 3 8 8 8 8 7 6 6 6 6 6 6 7 7 10 9 7 7 7 8 9 10 12 12 14 13 13
11 8 8 8 8 8 8 11 12 17 13 9 13 8 8 9 8 6 6 6 6 6 6 9 8 9 9 8 8 8 8 8 8 11 13 13 13 7 7 6 6 6 7 8 8 6 6 6 8 8
8 8 8 10 9 11 11 6 6 6 6 8 7 11 7 6 6 6 6 6 6 11 8 6 6 6 8 8 9 9 9 8 8 8 8 8 15 13 10 10 10 10 9 9 8 8 8 11 16 18
18 20 8 8 8 8 6 6 6 6 8 8 11 7 9 6 6 6 6 6 6 12 19 8 8 8 8 8 8 8 8 8 6 6 6 6 6 8 8 10 6 8 8 10 10 8 8 8 8 8
8 10 11 10 10 8 6 6 6 6 6 10 8 8 8 6 6 8 8 10 10 8 8 7 7 7 11 11 8 8 8 8 12 10 10 10 8 8 8 8 8 8 8 8 12 11 12 11 11 11
15 16 11 10 10 10 10 8 9 9 8 8 8 8 8 8 8 6 6 7 7 8 8 8 8 8 8 8 13 9 9 10 8 8 8 8 8 8 9 18 20 20 19 24 20 18 17 14 8 8
6 6 8 6 6 8 8 8 6 6 8 8 6 6 8 6 8 8 8 9 10 10 10 9 10 10 6 6 8 8 8 9 9 9 8 8 8 8 10 13 10 10 10 8 8 8 10 10 11 11
11 10 12 10 9 9 10 10 10 8 10 10 10 9 9 6 6 6 6 8 8 8 6 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 6 6 6 7 8 7 15 6 8 6 6 6 7 8 8 8 8
8 8 8 7 8 10 8 10 8 8 8 8 9 10 8 8 8 10 10 10 14 17 10 9 9 8 8 6 6 6 6 8 6 8 8 8 10 10 10 10 11 9 12 9 9 10 10 8 8 8
8 8 8 6 6 6 6 8 6 6 10 10 16 18 21 15 9 10 9 9 8 10 9 10 10 10 9 15 15 14 14 19 16 18 15 14 10 15 9 9 9 9 8 8 8 8 6 9 9 8
6 6 6 11 10 12 8 8 7 10 7 8 8 8 9 8 6 7 7 9 10 8 8 8 8 8 9 9 9 9 9 9 9 8 8 8 6 6 6 6 8 10 7 7 6 6 6 8 8 8
8 8 23 13 14 6 6 6 6 8 8 8 10 11 11 8 8 8 13 10 8 8 8 8 8 8 8 10 8 11 8 8 8 8 8 10 12 8 8 8 8 8 8 8 10 10 10 8 8 8
8 8 8 6 6 8 8 8 8 10 9 9 8 8 8 8 8 8 13 11 12 13 9 9 9 10 9 9 11 8 8 7 8 8 8 8 8 8 9 10 10 10 8 8 8 8 8 8 8 8
8 7 7 9 7 8 8 8 6 6 6 6 6 10 14 12 12 7 6 6 6 8 6 8 8 8 8 8 6 6 8 8 3 0 3 9 9 10 8 8 8 8 8 9 9 8 8 8 8 8
8 8 8 8 8 11 8 8 8 10 8 10 10 6 6 6 6 6 6 8 8 8 8 8 6 6 6 6 8 8 8 8 6 6 6 8 8 10 6 6 6 8 8 8 10 11 21 23 19 20
10 10 8 8 10 10 10 8 10 8 8 9 10 10 8 8 8 8 8 8 12 8 6 6 8 8 8 8 10 8 8 8 8 8 8 11 13 10 10 9 8 8 8 8 8 10 9 9 9 10
10 9 9 8 10 9 9 9 8 8 8 8 8 8 8 10 10 13 11 10 9 6 6 6 9 11 11 12 11 12 9 8 8 6 6 8 8 8 6 6 8 8 13 8 8 8 9 8 8 8
8 8 8 9 7 6 6 6 6 6 8 8 12 7 6 8 6 6 6 6 6 8 8 8 8 8 6 8 6 6 6 6 8 8 8 7 7 7 7 9 9 15 13 13 13 8 8 8 8 8
12 10 10 10 8 8 8 8 10 10 10 10 10 11 10 9 9 9 10 10 10 10 10 13 15 19 16 12 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 6 6 8 10 12 9 9 11 10 10 6 6
6 6 6 11 13 9 9 7 7 7 8 8 13 10 8 8 6 6 6 6 8 6 8 6 6 7 7 9 8 9 10 11 10 8 8 7 7 |