BAC end | BAC-end 1 | BAC-end 2 |
---|
end name | MSMg01-365L19.T7 (MSMg01no365_l19.b1) | MSMg01-365L19.TJ (MSMg01no365_l19.g1) |
ACC | AG473621 | AG473622 |
length | 751 | 709 |
length of high quality (start - end) | 403 (59 - 461) | 565 (46 - 610) |
definition | CHROMAT_FILE: MSMg01no365_l19.b1 PHD_FILE: MSMg01no365_l19.b1.phd.1 CHEM: term DYE: big TIME: Tue May 17 23:02:19 2005 | CHROMAT_FILE: MSMg01no365_l19.g1 PHD_FILE: MSMg01no365_l19.g1.phd.1 CHEM: term DYE: big TIME: Tue May 17 23:02:19 2005 |
singlet/doublet | doublet | doublet |
---|
BLAST hit | unique | unique |
---|
Map location. | (34,487,474 - 34,487,876) | (34,656,612 - 34,657,176) |
---|
sequence | XXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXTTCCAGAGATCCGCGGAATTCAACAGT
TCCCGAATGTGGAGGCAGGAGCTGATGCAGAGGCTGTGAAGGGGTGCTAC
TTACTAGCTTGGCCATCGTGGCTTGTTCAGCCTGCTTTCTTATAGAACCC
AGGACCCCCAGCCTAGGGATGGCACCATTCACAATAGGTTGGGTCCTCCC
TTATCAATCACCAGTTAAAAATTCCCTACATACATGCAGCCCTGTCTTAG
GGAGGCATTTTCTCAGTTAAGGTTCCCTCCTCTCAAATGGCTTTAGTTAG
TGTCAAGTTTACATATAACTAGCCAGCATAGGGGACTTCCTTTGCCCCAG
GCCATAAATTTTCTACACCCTATTGCTTTGGATCTTTTCGATCACTTTTC
ATTGATAGACACAGAGGCTCAGAGAGGTTAAATAACTGGAGTTTCATGGA
CAGGAGGCTTCACAGACCAGACCTGAATCCTGCCTGATGAGATCCTAAAA
AGCCCAGAGGAAGAGAATCCTGCGATAAGCGCTGCATTGTTCTATGCCAG
GTGTTTGCCTATCACCAAGGCCAGTCTAGTCATCAAGTCTGCCTGGACAC
TGGTCTATAGGACACCTTGAGAAAGGTGCATTTCCAAATAATGCTTCCTG
ATTTACTACCCTTTCACTCTACATCCTCCACCAGTGTGGACACTTGGGAG
ATTTAATTCCGAGACTGTTTTCACCTTTCTATATAACACGGTTCCGTAAT
T
| GTTTCCXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXAACAT
CTCGTGTTTTGAAACTTGGTGTCTTTCCCAGAAATGATGTATTTAAAAAA
ATTTTCTTATGGCTGGCAGCACCTAAACTATTGTCCTGTCATTATGATAA
ATTGGCTCAGTCTTCAAATATTAATTGGAAACATATGCATGTCTTATCAA
TATGGCATTCTAATTAGTAGGGTCATCTCGAGGTTCCATGGACCAAGAGA
TGAGAGATGGGTGTGTGCGGTACTTGACTGATTAATCATCTCTGAGAAGA
TTAATGCAATACTCTGTGGAATTTTCTGTTTAATTGGTTACTGTGTAAGA
TCACAGGACAATTGATTGCTTAACTTCTCTCCCACCTCCTCATTACACAC
TTCGTAATATAGTACCCGTGCTGGGAACGATTATTTTAGTTTGTTTATTC
TTCCTGTGTTTATTTTTCTTATCTACAGAGATAGTGAAAACTGCCACTTG
TGCTTTGCAAATAGACACATGCTCAGTAGAAAAATATAACTCTAAATATA
AATACCCTTCTACTTAATAAGAACAATAAGACTTAATTCTCTTTCCCCAG
CTCTTCCCAGACCCTCATTCTCTGGCTTTGGCTTCTTGGCTCCTCTGGGT
CTCCAGCTTGCCAACTTTAGGTCTTGTGACTTCTCAGACTCCATTATCTT
GCAAGAGCA
|
quality values | Open.Hide.20 23 31 34 30 14 18 11 9 9 16 19 33 33 48 30 28 21 20 15 17 17 10 10 10 9 10 12 17 15 8 8 8 19 21 47 47 43 19 17 15 17 10 8 8 10 13 13 9 9
8 8 8 8 8 10 16 17 20 21 33 33 48 50 50 50 57 57 57 59 57 57 53 53 50 50 50 50 48 48 48 48 48 50 50 42 47 37 37 37 32 32 37 37 37 37 37 47 59 59
50 53 50 48 48 42 42 41 59 39 37 25 24 24 28 30 30 43 46 41 40 48 48 47 41 37 37 37 37 37 31 37 44 44 59 59 39 37 36 37 39 30 48 48 48 37 41 37 39 39
37 37 41 41 39 37 47 59 59 59 44 41 41 44 59 43 37 37 37 37 41 37 43 40 43 43 57 57 57 59 48 48 48 59 48 48 48 48 48 48 48 59 59 59 59 59 59 59 59 59
59 68 68 59 57 57 57 54 54 54 54 54 54 57 57 59 59 59 54 54 54 48 53 53 59 59 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 59 59 59 39 39 43 47 59 59 59 59 59 44 41
41 44 59 59 59 59 59 59 59 59 59 50 50 50 53 50 50 57 59 57 57 57 57 48 57 59 59 59 59 68 68 57 57 57 57 57 57 57 48 48 59 59 59 59 59 59 47 44 39 32
32 44 44 22 21 15 16 24 11 11 11 11 12 12 32 34 59 59 68 68 68 57 57 54 54 54 57 59 59 47 43 43 43 43 35 43 43 57 59 68 59 59 59 54 50 50 43 43 35 42
42 43 35 38 38 43 43 52 59 59 68 59 59 57 57 52 57 57 68 59 59 57 57 57 59 59 68 68 68 57 57 57 57 57 68 68 59 59 54 54 54 59 59 68 68 68 68 57 57 54
54 54 57 59 57 57 43 37 37 36 36 28 35 32 42 42 44 42 36 32 23 23 32 36 47 48 43 43 43 43 46 48 57 59 59 57 59 54 54 54 54 54 43 42 37 35 35 37 39 39
43 43 33 37 28 28 28 28 23 16 11 11 12 11 13 13 19 24 12 14 14 28 30 32 32 18 18 19 29 29 37 30 24 24 24 24 19 24 27 15 17 13 18 13 12 16 12 11 18 17
23 12 14 12 19 21 13 12 15 15 19 28 28 32 14 14 12 12 12 17 15 8 8 8 10 17 16 17 28 28 20 32 31 30 28 34 30 39 30 24 24 26 26 35 37 32 26 15 11 10
12 18 10 10 11 15 25 15 14 14 14 24 22 19 19 15 15 19 22 22 24 19 22 16 16 11 11 11 15 11 11 11 11 10 12 12 12 12 15 15 10 10 15 19 22 25 22 18 14 13
17 11 11 11 12 16 16 18 13 8 8 8 8 8 10 13 15 21 16 11 13 13 15 13 13 15 13 11 10 10 8 8 15 9 9 8 8 8 8 8 8 6 6 6 8 10 22 14 14 13
13 15 10 8 10 8 8 8 9 12 11 13 13 8 6 8 8 8 8 10 8 10 13 10 10 10 10 11 11 10 11 11 13 13 11 15 12 10 8 8 8 6 7 6 14 13 16 13 10 8
6 6 8 8 8 8 8 6 7 8 8 9 9 10 14 12 10 10 10 9 11 10 8 8 12 16 11 9 10 13 15 8 10 8 12 8 8 8 9 9 8 12 10 10 13 15 8 8 8 8
7 | Open.Hide. 8 8 9 8 8 8 8 8 8 8 8 8 19 21 22 18 18 27 17 20 18 22 18 28 27 37 25 19 8 11 8 8 10 14 15 22 25 39 39 25 22 19 17 12 8 8 10 17 30 30
30 59 59 50 50 50 50 50 53 53 53 53 53 57 50 50 47 43 43 43 43 43 50 50 57 57 42 36 36 23 23 36 42 42 42 50 50 50 50 50 50 54 54 68 68 68 59 59 57 48
50 50 50 51 57 68 68 68 57 57 57 68 57 57 57 57 57 57 57 57 59 59 59 59 57 57 57 59 57 68 68 68 68 68 68 68 68 57 57 54 54 54 57 57 68 68 68 68 51 50
50 50 50 50 57 68 68 68 68 68 57 57 57 68 68 68 68 57 57 57 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 57 57 57 57 57
57 57 68 68 57 57 59 59 59 68 68 68 57 57 57 52 52 59 59 68 68 68 68 68 68 68 62 62 62 62 62 62 62 62 68 68 68 62 62 62 62 68 68 62 62 62 62 62 62 62
62 62 43 43 39 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 68 68 68 68 68 68 68 68 62 62 43 39 39 35 39 39 43 62 62 62 44 44 39 39 39 43 43 62
62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 68 68 68 62 62 62 68 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 52 52 52 62
62 62 68 68 68 68 57 57 57 57 57 57 57 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 59 59 57 57 57 57 57 57 57 57 57 59
59 59 44 44 33 33 42 44 44 57 43 43 59 59 59 59 68 68 68 68 59 59 59 57 57 57 57 52 54 54 57 57 57 57 57 57 57 59 54 54 59 59 50 48 48 57 57 57 57 59
59 57 57 57 57 57 57 57 57 57 59 59 59 68 68 68 68 68 68 68 57 51 50 50 50 47 57 43 43 43 48 48 48 47 57 43 47 47 48 48 54 54 54 54 54 54 54 54 43 43
43 43 43 59 57 57 57 48 48 39 30 29 17 17 19 25 25 28 33 28 37 37 32 32 23 18 18 12 12 12 23 19 36 36 36 37 36 59 43 43 33 32 24 24 20 23 23 34 31 40
39 39 41 41 36 36 35 35 32 31 28 28 31 41 32 40 39 32 32 20 20 18 24 28 32 32 29 29 29 22 23 34 34 39 31 31 32 37 37 39 46 46 39 44 41 47 34 27 18 12
12 12 25 25 37 37 28 27 25 22 22 19 19 24 21 29 13 13 12 13 21 30 25 17 14 14 12 23 19 14 14 24 26 39 37 39 39 34 34 38 32 21 24 22 19 17 12 12 12 12
12 15 13 12 14 15 15 20 25 23 12 12 12 12 17 17 14 11 9 9 9 10 10 10 10 6 6 6 10 10 9 12 17 23 15 11 11 13 17 31 37 37 34 30 24 14 17 17 19 15
8 11 11 13 19 13 13 13 13 |