BAC end | BAC-end 1 | BAC-end 2 |
---|
end name | MSMg01-390I09.T7 (MSMg01no390_i09.b1) | MSMg01-390I09.TJ (MSMg01no390_i09.g1) |
ACC | AG492514 | AG492515 |
length | 741 | 770 |
length of high quality (start - end) | 519 (83 - 601) | 383 (81 - 463) |
definition | CHROMAT_FILE: MSMg01no390_i09.b1 PHD_FILE: MSMg01no390_i09.b1.phd.1 CHEM: term DYE: big TIME: Tue May 17 23:34:28 2005 | CHROMAT_FILE: MSMg01no390_i09.g1 PHD_FILE: MSMg01no390_i09.g1.phd.1 CHEM: term DYE: big TIME: Tue May 17 23:34:28 2005 |
singlet/doublet | singlet | --- |
---|
BLAST hit | unique | no hit data |
---|
sequence | NNCCATCATXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXTTTCGAAATCCGC
GGAATTCTTTCTGTTTACCTAACACCTATCAGTTATCAGTTTTATTCAAA
TATATGAACTTGTGACTGTGTAAAGAAATGAATTTTGTGCAATCTAAAAC
ATTTGTTTTCTGCTCTTATAGCTTTTGAAATTATTGTAAAGTATTCATTT
AAACACAATGTTGTTTGCCTTCATTGAAAATTTACTGTAATCTATTGTGA
CTTACATCTTTTCTAATGGATGTTTACATTAATTTTTATGAGTAATTTAA
CTACATTTTCTAAGTTTCCTAAATCTTTATTATGGGTTTTATAATGAAAA
AAATTATTGACTGACTGTCTATATTTAATGAACTTGAATTTCTTTAATTA
ATATTAAAATACAAGTAGAATTCTAAAATAATATTAATAATACAGTGGTA
TCTAACATAAATGGTGTTTCTTTAATGTGAATAGTTTACAATATACTTCA
AGATCTTTAATTTGCTTAATGACATGATATGGAATCCTGAATGTATAAGT
ATGGTAAAGTATCAAATTAATTTAAAAAATTAAACATTAGTTACTATTAC
TAATCACTACTCCAGTAATTATTGTATAGGAACTTATACAAGCTTGCCTC
CCATGAATTTCCTTTTAATATATGCCTGACTATCATATGCGTGCAAATAC
ATATTGTCATATGTACGCTAAATATGGACCCCCCCCAACTN
| NNAACTATGATAGTGGXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXX
XXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXACTTTGTTCAGTTTTGTTTTAATA
GGGTTATTTGGTTCTCTGGAGTCTAACTTCTTGAGTTCTTTGCATATATT
GGATATTAGCCATATATCAAGTGTAGGGTTGGTAAAGATCTTTCCCCATT
CTGTAGGTGGCTGTTTTGTCCTATTGAAAATGTCCTTTGACTTCCAGAAG
CTTTTCAATTTTGTGAGGTCCCATTTGTCAATTCTTTATCTTAGAACAGG
AACTATTGGTGTTCTGTTTATGAAGTTTTCTTTTGTGCTGATGTGTTAGA
GGCTCTTCCCTATATTCTCTTCTATTAGTTTCATTGCATCTAGTTTTATG
TGGAGGTTCTTGATCCACTTGGAATTAAGCTTTGTGCAAGGAGGTAAGAA
AGGTTCAGTTTGCAGTCTTCTACACGCTGACCACTAGTTGAACCAGAACC
ATTTGTTCGAAATGCTTTTTTTCCACAGGATGGTTTTATTTCCCTTGCCC
AATATGAAGTAACCATAGGACTGTTGGTTCTTTTCCTGGTTCTCCCCCTT
CCGGTCCCCCGGATCCACCTTCCCTTGTTTCTGCCACCTATCACCCTGCC
AATTTTGTTCTCCTACTTGCCCCTGTTTTTCTTTTTTTTGTTGGCCTTTT
GAAGCGCGATTTCCCCCTTGAAGATTTCCTTTCATTTTGTTTCACCCACC
CTCTCCTTTTACTTGGTTCN
|
quality values | Open.Hide. 0 0 3 6 6 6 8 9 8 8 10 8 8 15 21 23 30 25 17 11 21 21 37 37 20 20 14 19 17 3 0 3 10 16 16 10 10 7 7 6 6 6 6 10 8 8 8 10 11 11
9 9 13 21 27 32 22 28 32 34 30 22 22 15 10 8 8 8 11 11 9 9 9 9 9 10 12 13 18 16 11 11 23 25 32 30 20 13 11 26 28 59 59 39 27 25 12 12 12 26
33 59 42 50 50 50 37 37 35 28 37 37 37 37 43 29 30 30 40 43 46 43 43 43 43 42 42 42 42 42 42 48 68 43 43 48 48 42 42 36 33 27 32 21 24 16 35 35 57 43
43 47 57 57 68 57 57 57 57 48 42 42 35 35 42 42 44 44 44 44 42 37 35 42 42 44 44 44 47 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 68 68 57 57 44 44 37 37 37 44 44
68 57 57 42 42 37 37 37 50 43 57 57 57 57 52 52 43 57 52 43 43 43 43 43 57 57 68 68 68 68 68 68 57 57 57 57 43 57 57 50 50 44 44 48 48 59 59 57 57 59
57 57 57 44 33 33 28 33 36 44 44 57 54 54 54 57 57 68 68 68 68 68 68 68 48 48 39 39 39 46 46 68 68 68 68 68 68 68 57 57 59 59 68 68 57 57 57 57 59 59
48 43 43 35 35 35 39 59 57 48 43 43 47 47 59 59 59 59 43 30 23 10 8 8 8 8 9 6 8 8 8 8 10 23 20 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59
57 53 53 53 53 53 57 57 48 48 43 43 43 47 47 36 36 36 43 43 48 57 59 59 68 68 68 68 68 68 57 57 57 57 57 48 48 48 48 48 48 48 57 57 57 57 57 57 57 59
59 68 68 68 68 68 57 57 57 32 32 20 20 20 30 32 41 32 24 32 27 36 32 32 32 43 44 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 57 43 43 24 24 19 32 32 54 57 34
34 27 35 35 44 42 44 44 57 47 54 57 57 44 48 57 59 32 44 39 43 43 48 44 44 36 28 28 37 43 57 48 48 48 48 68 34 34 32 32 32 43 59 41 41 23 21 21 19 19
24 32 32 31 22 28 28 34 34 50 50 50 41 59 39 39 37 36 36 39 39 39 35 30 30 37 32 39 35 39 26 31 32 37 30 32 24 28 24 22 21 27 32 32 28 32 31 20 20 23
28 34 27 20 25 28 32 21 28 20 15 14 8 9 9 9 9 11 32 32 35 35 31 29 29 29 32 37 37 29 16 19 11 11 15 16 17 19 12 11 10 8 12 17 33 32 37 25 25 17
12 12 21 22 11 11 11 19 19 22 14 11 9 9 19 19 34 31 31 34 32 25 20 15 15 17 30 24 23 25 25 25 24 22 18 22 18 19 12 12 13 15 15 17 17 15 12 10 10 10
10 9 9 11 17 20 24 17 15 13 13 14 14 16 20 18 14 14 15 14 18 23 30 12 10 8 8 8 8 10 10 10 10 10 10 10 10 12 12 12 12 12 12 12 12 13 11 8 8 8
8 8 10 16 17 6 6 6 8 8 8 23 18 13 8 6 6 6 8 8 8 8 8 8 10 11 10 10 8 12 10 10 10 8 12 8 8 8 8 3 0 | Open.Hide. 0 0 3 6 6 6 7 10 8 8 8 8 8 15 8 8 8 10 11 31 22 23 19 3 0 3 3 0 3 23 27 39 25 25 8 6 6 6 7 7 8 9 8 8 8 8 8 8 15 14
16 17 19 18 32 32 50 50 50 47 47 27 23 9 11 8 7 6 6 6 6 6 8 10 9 10 9 9 14 14 30 18 29 32 39 44 44 53 59 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57
57 57 57 57 57 57 68 68 68 68 68 54 54 57 59 59 57 54 54 54 54 54 57 57 57 57 48 48 48 48 48 47 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 68 68 68 68 68 68 68 68
50 51 50 50 50 51 51 50 59 57 57 57 57 57 57 57 57 46 43 43 59 59 43 52 52 38 41 18 17 13 24 27 27 43 59 57 68 68 68 68 68 68 68 68 59 59 59 59 59 57
57 68 68 68 68 68 68 68 59 59 59 59 59 59 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 57 57 57 57 57 57 57 68 68 68 68 68 68 68 57 57 50 48 48 57 59 68
68 68 68 57 57 57 43 43 43 41 41 42 35 33 44 34 59 59 59 59 59 57 68 68 68 68 57 57 57 57 57 57 59 68 68 68 68 68 68 68 59 59 59 57 47 44 43 57 57 57
59 57 57 57 57 48 43 43 43 43 48 48 48 57 59 48 48 53 48 48 47 34 34 28 28 28 27 21 9 9 9 17 18 21 12 12 28 28 59 59 59 59 48 48 48 59 59 43 43 43
59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 68 68 68 59 59 28 28 18 20 20 28 28 28 37 23 25 15 15 15 20 23 28 35 32 34 28 22 14 14 15 15 15 11 12 12 24 26 32 34 39
43 46 46 43 43 39 37 37 37 37 48 48 48 39 37 37 37 37 37 36 27 19 24 26 26 31 32 31 39 30 30 30 39 32 32 32 30 30 30 30 33 33 34 32 37 37 34 34 22 24
28 32 37 37 37 37 36 36 36 22 17 9 9 8 15 10 13 18 25 34 14 12 10 12 12 18 36 37 39 39 43 36 36 25 28 19 17 17 24 25 30 23 17 17 15 15 11 12 10 10
10 13 19 21 12 11 10 8 8 17 19 30 27 28 28 28 33 33 39 37 37 22 16 8 8 7 7 11 12 16 11 7 7 8 7 7 13 14 19 18 16 16 10 9 9 8 8 8 8 8
9 9 10 9 9 9 9 9 11 11 10 10 10 11 11 11 11 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 10 11 10 9 9 8 8 10 10 8 8 8 8 8 9 8 11 19
15 14 9 9 12 12 16 15 9 9 8 8 8 8 8 8 10 16 8 10 8 8 8 8 11 10 10 11 12 24 21 21 8 8 6 7 8 11 8 10 8 8 8 8 19 12 10 8 6 6
7 10 12 14 14 10 9 8 8 8 10 10 13 15 9 6 8 8 8 8 8 8 11 10 11 11 15 13 19 18 16 16 10 12 12 12 10 8 8 8 8 10 12 12 11 11 15 8 8 6
6 8 8 10 8 8 8 8 8 8 11 11 12 13 8 7 7 10 8 8 8 8 8 8 8 10 11 8 8 11 12 8 8 8 8 19 15 14 14 12 16 8 8 8 8 8 8 8 8 8
8 8 8 8 8 8 8 8 8 10 10 8 6 6 6 10 8 11 3 0 |