BAC end | BAC-end 1 | BAC-end 2 |
---|
end name | MSMg01-407I04.T7 (MSMg01no407_i04.b1) | MSMg01-407I04.TJ (MSMg01no407_i04.g1) |
ACC | AG505452 | AG505453 |
length | 751 | 770 |
length of high quality (start - end) | 568 (43 - 610) | 454 (74 - 527) |
definition | CHROMAT_FILE: MSMg01no407_i04.b1 PHD_FILE: MSMg01no407_i04.b1.phd.1 CHEM: term DYE: big TIME: Wed May 18 18:23:10 2005 | CHROMAT_FILE: MSMg01no407_i04.g1 PHD_FILE: MSMg01no407_i04.g1.phd.1 CHEM: term DYE: big TIME: Wed May 18 18:23:10 2005 |
singlet/doublet | --- | singlet |
---|
BLAST hit | no hit data | unique |
---|
sequence | ATXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXCGCGGAAT
TCCCAAATTTTCAGCAAGTTTTATTTTTGGTGTTTCGTTTTTTAAAGAAT
GTCCTGAGTGCTCTGTCACAGATGAAATATCTGTATCAACGCACCGCCAA
TTCAAGGTGTAGTAAACAGTGCCGAGCGGGGGAGGGAAGAGCTGCAGATG
AGGAATGCTAGGAACCCTCAGCTCTGGACAGGACATGGCTGTCACACACA
GGAACTCTACGGAGCCTGTAGTCACCTGTACAAGAGGAAGCTAGTCAGAC
ATGCCAGCATGTCTCACCCAGAGCTCACAGCTATTTGTGATGGATGGCTT
GCTGAGTGACGGTCACTTTTCTTTAAGGTGGAATGACCATTAGTAAGCTG
CCTAGCATTCCCTGGCAGATGACATCACACTCACGTGTGCAGGCATAATG
TTTTTGTACACTGCAAAGTTTACCCTGGTGGTACTCAAATGCTGATAGCT
CTGCCCTTATAGCTTGTTTCAATCTGGATACAACATTGTAATTTTATATA
TTTATATTAAGAATCTCCTGTCTCAAGTTTGTGTTAACAGTTCTTACCAT
TTATTCTCTGCCTTGCCAAAAAATGCTGATCACCCAATGGCTGGGCTGAA
CAGAGAACAAGGGGGGATGCTCCCCCCCTGAGAAAGCTACAGAGTGAGAC
AGAAGAAACCCTGATTCTGATCGGGCCAGAAGGATGGAAGAACTTGTTCC
C
| ATGAXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXX
XXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXAAAATGAAAGGTTAGAGGTATCTGAGG
TGTATCAGGTATAAGATACAGTCTGTGATCGTCCATTCAATAAGCAGACA
TGCATTGGTCTAGGTTCTTGAGATATATTGATAGCAAAACAATAATTATT
GCCCTTGTGTGGTTTAAGGGACAATATGCAAAAGAAAAGGGACATACTAA
ATAAGTGAGTTCATTATTTACTAAATGTTAAGTCAGGCAGCATAATGAAA
TAGGAAAATGGGGATAGCATAGGAGATCAGGGTGCAGAAGAATGACGACC
TAATGCTGAAAGCTCAGCAATGGTATCTCAGATCATTTGCATAGATGTGA
CCAAAACACACACACACTGGAGAGAACAACCTGAAGGAGAAAGATATATT
TTGTCTCCTAATTTCAGAGACCCACACACACACACACAGGCCATGCACTT
GAACTAAACCTCCAAGTGTGACTGTGTGGCAGAGGAGTGTGAATTTGACG
CCATGCAAGCAGATAAACCGACTCTGATGATCACCCTGACGCATCATGGA
TGTCCTCCCTTTTCCGTTTCTAACCGCTTCCCAACTCCTGCAAACTTTGT
ATCTACCCACCCTTTCTCTAAAGTCCCCCCTTTCTCTACTTCCTGTCTTT
TCTTCTCTCAGTAACGCCCACTTCCCCTGCATCCCCGGTTATTGTCTTCT
CACCTCGGCACACCTTCTCN
|
quality values | Open.Hide. 7 7 9 9 18 37 43 41 37 37 37 29 29 37 21 23 25 28 28 28 47 41 27 23 15 12 8 8 8 6 6 7 9 9 14 23 34 28 26 26 26 26 30 37 57 57 36 36 31 31
33 33 37 34 23 18 11 11 11 12 11 11 9 11 18 25 37 41 50 50 50 59 59 59 59 53 57 37 37 40 40 43 43 57 57 57 48 57 57 57 68 68 68 68 68 68 48 48 48 47
47 47 47 47 57 57 57 57 57 57 57 47 57 57 46 57 48 54 47 57 57 57 57 57 57 57 57 50 50 50 50 50 50 50 50 57 46 43 57 57 57 57 57 54 57 50 50 48 48 57
57 57 48 48 57 57 68 68 57 57 57 57 57 57 57 54 57 57 57 59 57 52 52 52 57 50 57 52 59 57 52 57 57 57 57 68 68 68 59 59 57 57 57 57 52 52 57 57 57 57
57 57 57 57 57 57 57 57 68 68 68 57 57 57 57 52 57 57 52 52 57 57 52 57 57 57 57 57 57 57 57 57 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62
62 62 68 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 39 43 43 52 62 62 62 62 62 52 52 62 62 68 68 68 68 68 68 68 62 62 62 62 62 62 62 62 62
62 62 62 62 62 52 62 62 62 62 62 62 62 62 62 52 52 43 43 35 47 59 62 62 62 62 62 62 62 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 62 62 62 62 62 62 62 68
68 68 68 68 68 68 62 62 57 57 57 57 52 52 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 59 59 59 57 57 57 57 57 57 57 57 57 44 44 68 59 59 57 57 57 57 57 57
57 57 57 59 59 68 59 59 59 57 57 57 57 52 57 57 57 57 57 57 57 68 57 57 57 54 54 57 57 57 52 52 52 52 52 59 59 59 57 57 57 59 59 68 68 59 59 50 50 48
57 59 59 68 68 68 68 59 59 57 57 57 57 54 57 57 57 57 57 47 59 47 54 54 57 59 43 47 44 48 48 59 37 44 36 30 26 44 36 48 48 54 54 59 59 59 57 57 57 48
43 43 43 43 43 43 47 57 57 57 48 48 48 47 47 48 48 43 59 43 39 36 43 39 47 37 37 37 26 25 14 14 14 22 22 28 34 31 23 12 13 13 29 30 39 48 48 48 57 48
50 48 48 48 47 47 46 43 43 44 39 36 30 25 27 27 30 22 29 19 19 17 19 11 9 9 14 19 20 43 31 31 30 26 17 14 14 10 10 15 11 17 19 30 32 27 25 22 27 28
30 32 32 31 31 27 25 11 12 11 21 16 18 19 21 17 11 9 9 9 10 16 15 19 27 23 23 16 15 19 17 17 15 21 13 15 10 8 8 8 10 10 10 8 8 8 8 8 9 16
24 15 13 12 12 8 9 13 10 8 8 8 12 11 17 21 16 13 10 6 6 6 10 7 9 12 12 25 19 22 14 10 8 8 7 8 6 6 8 8 9 8 15 8 8 8 10 8 6 6
10 8 9 8 8 8 10 10 8 9 9 8 8 8 8 8 8 9 8 8 10 9 9 9 6 6 6 6 6 6 9 11 11 15 16 12 13 8 8 10 8 8 8 9 9 11 11 11 11 12
12 | Open.Hide. 8 8 8 8 8 9 15 17 20 19 20 24 24 26 31 31 37 41 43 43 44 44 41 41 44 30 31 19 16 9 8 8 8 8 8 10 10 19 19 28 28 39 39 39 43 47 47 47 47 41
44 39 50 47 41 29 22 8 6 8 6 8 10 15 15 22 24 25 30 31 36 36 38 36 42 36 53 53 53 50 57 57 50 50 50 53 50 59 59 59 57 54 54 48 48 48 57 57 57 54
54 54 54 50 50 50 47 47 47 48 57 57 57 68 68 57 57 57 54 47 57 47 54 57 57 50 50 50 50 50 57 48 48 48 48 57 57 48 48 57 57 59 59 57 57 57 57 50 57 50
54 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 59 57 57 52 57 57 57 57 57 57 57 57 57 68 68 68 57 57 57 57 57 68 68 68 57 57 57 57 68 68 68 68 68 68 68 68 57 57
57 57 57 57 57 59 59 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 59 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 59 59 57 62 52 62 62 62 62 62 62 52 62 62 62 62 62 68 68 68
68 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 68 68 62 62 62 62 62 62 62 68 68 68 68 62 62 62 62 52 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 68 68 68 68 68 62
62 62 52 52 62 62 62 62 62 62 52 52 52 44 38 38 18 18 17 17 18 26 28 32 43 43 62 62 52 59 59 59 59 43 57 35 43 43 52 57 57 57 57 57 57 52 52 57 57 57
57 59 59 57 57 57 57 59 59 57 57 57 57 57 57 39 39 57 59 57 68 68 68 57 57 59 59 57 57 52 52 52 57 52 54 59 59 59 59 59 59 59 52 52 52 59 59 57 57 50
43 35 35 43 44 52 57 57 57 57 57 57 54 54 54 57 59 59 59 47 43 43 57 57 57 48 43 43 37 39 37 44 44 46 43 43 43 43 59 59 59 57 57 57 57 57 57 68 68 68
68 59 59 43 39 39 37 32 32 44 44 54 54 30 28 14 14 14 28 28 43 43 48 48 48 39 39 32 28 23 23 23 28 24 23 23 28 32 34 28 25 25 34 31 37 30 30 28 34 34
23 18 18 23 25 28 28 28 24 24 25 22 11 11 22 25 30 41 31 24 31 31 34 28 32 25 17 11 9 9 9 9 11 11 11 13 14 8 10 10 10 10 14 15 9 8 8 8 8 8
8 10 22 18 15 11 11 11 11 15 11 9 9 9 10 10 10 10 10 12 10 10 10 10 12 18 16 12 23 11 11 10 15 10 12 12 14 14 12 13 9 9 8 6 6 10 8 6 8 8
10 8 8 8 8 10 8 10 8 8 8 8 10 8 8 8 8 8 8 7 7 8 6 6 10 8 9 9 7 8 9 9 7 7 8 8 10 10 8 8 10 8 10 8 9 9 10 12 16 10
8 8 8 8 7 7 10 7 8 8 8 11 11 9 8 8 7 8 10 8 10 11 12 12 15 15 12 12 12 12 9 9 13 10 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 6 6 8 8 8 8
6 6 11 8 6 6 6 8 8 8 8 7 8 8 10 11 11 16 11 11 11 13 16 19 13 8 8 8 10 8 8 6 6 8 8 6 6 8 8 8 8 8 6 6 8 6 6 8 8 10
10 10 19 8 8 6 6 6 6 8 6 6 8 8 8 8 8 8 3 0 |