BAC end | BAC-end 1 | BAC-end 2 |
---|
end name | MSMg01-440D12.T7 (MSMg01no440_d12.b1) | MSMg01-440D12.TJ (MSMg01no440_d12.g1) |
ACC | AG530387 | AG530388 |
length | 1,807 | 740 |
length of high quality (start - end) | --- | 555 (80 - 634) |
definition | CHROMAT_FILE: MSMg01no440_d12.b1 PHD_FILE: MSMg01no440_d12.b1.phd.1 CHEM: term DYE: big TIME: Wed May 18 19:06:35 2005 | CHROMAT_FILE: MSMg01no440_d12.g1 PHD_FILE: MSMg01no440_d12.g1.phd.1 CHEM: term DYE: big TIME: Wed May 18 19:06:35 2005 |
singlet/doublet | --- | singlet |
---|
BLAST hit | no hit data | unique |
---|
sequence | AAACCCGACACCATAGTTGATGATCNTNTTTCNTCTCTGCTCTTATCTCT
CGTGCTACANNANCACCTATTCTANATACNNAGNTCATAGTNAGATGTGT
GAATNCTGGTGTCATACACTTACCCCAGACTCNTCCNTCGGTCTCGCTCT
ACTCTTCTCGCGCGCTACTAACTCACCCGGATANCTACCATGTCCTCTAT
GACACTGTAGCGCACACGTAGATCATCAGATAGACCAGAAGTAGAGCGAT
ATAACTACANATAATATAGCACTGATCAGAGTATATGTAGAAGGGATGTG
TACAGTGTGCATGTGCGACATATGAGATGCGTGGCCTATATGACGCTTAG
TCAATATCNAACTGATGACAGCATCAGCTACTGCAAGTAANGACCTGCAC
ACGTGCATGATCACTANATCTGTGATGGTAGTTGTGTGTATGGAGTGGTG
GGCGGAGTGCAGCGGCTAGCGCAGACAGTGGGTGCGCGGTGATGCGCGCT
GTCGACGTGAGTGCTGATGATGCGCGCAGAGATGTGGGTGTGGAGGGAGG
CAGGTGTGTGCGCGAGTGAGTGGGTGCGCGNCAGGAGAGAGATATACTAG
AGTTGACAGATGTATGATGGATATCATGGTACTGCATGACTGTGAGTATG
TGAGNTGCCGAGTGAGTGCAGTGTGTGCATCNCGATCTAGCTCATACACG
TCNATCTAGTGGATAATGACAGTGCTGCCGATTCAGACGCGTCGCAGAGC
TGACGATAAAGTCGAGTGTGCGTGTNACGAGACACTGATGTCGTGTGATG
AGCACGNATCTAGCGCGTCGTGTGAGGCTGCAAGCTTGCTGCCGATCAAC
TGATGCATCTCGACACAGCATGCACTANCATACTCTCACTAGTACCGCTA
CNACTCTATGACGATGTCNCTGCATCACAGAGCTGCCTAGTGCTGCTCGG
CGTCCTCGCTCATACACTATGATCGACGANTAACGTGACAGTCCATACTG
CTAACGTGCGCTGATCACGCATGTCCTGCTTGCGAACTNGCACATCACGA
ATGACTCTCGCGAACGATAGCTATGTATGTGACGTGACGNTCGCATCGCC
GTCACAGTTAATCATCAACTATCTANCGATGTATGAGCATTNATCANCAG
TATATACTAGCGATAGTATTGATGATACGACGTATNGCGCAGNCATCNNG
CGTGTGCATCTGNCTTATCATACGACATATANAGCTCGTATAGATCCGAT
TGTACACAAACTATGCACTATACACTATCCAGCCANCACTCGACATTNCG
CGCTCATCTCTCGTGTAGAGGCTGAAGCGTATACTCGNTCCATACGAGTG
ACGTNATGCACAGTACTAGACAGACTATGAGCANCGACTGAGAGCACAGC
TAGTACGAATCTGGANACANGCTAGTGTAGGTGGTCGTCGATCATCGTCG
AGTCGTATTGCTTCCTGNACGATGATGNCTGCACGCGNGTGAGTCTACAT
ACGACGACTGACGACGTGATCATGAGTATGGCACATCATACGACCGACGA
GAGCGATANTCNCGANTACGCGATATCTCCTCGCANTACTCNATTGTTAC
TCATGATGATGCTNCAGCCATCNATCGANTAATAAGTAGNATNGAACAAC
AGCGTACGCTACTCTTACTGATACTGAAGTCACCGNCTCATGTNATCGCA
GCGANTATCGAATAGAACGTAGCATCGTACGTCGTAGACGAGACCCNACG
ATCACGACGAGTNCCGTTATATCTCTATACGATCTNGCAATCTGCATTGC
ATCGTGN
| NNNNNACGATGATAGTXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXX
XXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXAATCTATGGAGCTTTTATTAA
ATGTGATGCTTTTGAAGGGAGACCAGATTAATGTAATTCTGATTAGCAAT
CAGCAACTGAAGACTTCAGATTCTCAAAGCCATGACAGGCTTGGAAAGCA
TCCTTGGGTAAAAGTATCAGTAAATGGTAATTTCTCTAGAGAAGAAAATA
ATTATGATTCAAGAGGAGTATTTATGGATCTAGGGAATTCTGTATTGGCA
CTTGCATCCAAGGTGATTCCATTTATTTTGTTTGATATACCCATGCTTGT
TAAAGGTACTGAGTAACTGGCTGTAGCAGTACTGGGTGCAAGAATATTGT
TTCATGAGGAAATAAATGGGTGGACTACACATTACATATCCTGACATGAT
ATTTAGAAAGAAATTTGAGTTATTTATTTATTGTTCTTGAAAGATATAGG
ATCCCCTCTAGGTACAAAAATTAAATAAAATTGTAAATTGCTTTATTAGC
CAGTCTTTTGTTTCTCTTTCACATTGTTGTGCTGTATATTGAAGAAGATG
GGTATTCCACCTAATTCCATTTTATAAATATTGGGCCAGTTTCTAGATTA
ATAACTGCTTAAAGTTTCTTATTATTGAAATACAATGTCCTACTCACAAG
AAAAGAGCTAACTATGTTTTAACCGTGAAAGCATTTATGT
|
quality values | Open.Hide. 8 8 8 8 11 6 6 6 8 6 6 6 6 6 6 6 6 6 6 6 6 9 9 11 3 0 3 0 3 6 6 3 0 3 6 6 6 8 8 10 10 10 15 12 10 8 8 7 6 6
6 9 9 10 10 9 9 9 3 0 0 3 0 3 8 8 8 6 10 8 6 6 6 3 0 3 10 10 3 0 0 3 3 0 3 10 8 6 6 8 3 0 3 8 10 10 11 9 8 8
8 8 17 3 0 3 6 6 6 6 8 9 9 9 10 9 6 7 8 8 8 6 6 7 7 6 6 8 6 6 8 3 0 3 9 3 0 3 8 8 8 8 8 8 8 9 9 6 6 6
8 10 6 8 10 8 8 8 8 11 11 11 11 11 12 9 8 8 8 8 8 9 10 9 6 6 6 6 6 6 6 6 3 0 3 8 6 6 6 6 6 9 7 8 8 8 8 8 9 8
8 8 8 8 8 9 8 8 8 8 8 8 10 8 8 6 6 6 6 8 10 8 8 8 8 8 8 8 8 9 10 12 8 8 6 6 6 8 8 8 8 6 6 6 6 8 8 8 6 7
8 8 7 6 6 6 6 6 3 0 3 10 10 7 6 6 6 6 6 8 8 12 15 8 6 6 7 10 6 6 6 6 8 8 13 10 8 8 8 6 6 6 6 8 8 10 13 15 13 13
10 10 9 9 9 10 6 6 6 6 6 6 6 8 6 8 6 7 6 6 6 6 6 8 8 8 6 6 8 6 9 9 9 9 8 6 6 6 7 6 6 6 6 6 9 6 6 6 6 6
8 10 10 11 11 7 7 3 0 3 6 6 6 6 8 8 6 6 8 8 6 6 6 8 8 6 7 6 6 6 6 6 6 8 8 10 8 8 6 3 0 3 6 6 6 8 8 8 8 8
8 8 8 8 8 9 9 9 11 11 10 6 6 6 6 3 0 3 8 8 8 8 11 10 10 8 8 6 6 6 6 6 6 6 8 6 6 8 8 11 7 7 6 6 6 7 7 12 8 11
8 8 8 8 8 8 7 9 9 9 9 8 8 8 7 7 7 9 9 9 9 8 8 7 8 8 8 10 9 10 9 8 8 8 8 11 9 10 8 8 8 8 8 7 8 8 10 10 10 9
9 9 9 9 9 9 9 8 6 6 6 7 10 8 6 6 6 6 6 6 6 6 6 6 7 6 6 6 10 8 8 8 8 8 8 11 11 11 11 11 10 8 8 8 8 8 8 8 8 8
6 6 6 7 6 6 8 8 8 8 8 7 7 7 8 8 9 9 8 8 9 7 8 6 6 6 6 9 9 3 0 3 6 6 8 8 8 9 9 6 6 6 6 8 8 6 6 8 6 6
6 6 6 6 17 15 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 9 9 9 9 9 9 9 10 10 8 6 6 6 6 6 6 10 8 8 8 8 10 10 8 6 8 6 6 6 6 8
8 6 6 3 0 3 8 8 8 8 8 10 8 9 9 6 7 8 9 9 9 9 9 6 6 6 6 6 6 6 3 0 3 8 8 9 9 9 12 12 11 8 8 8 8 8 8 10 11 11
12 3 0 3 11 11 11 11 12 12 12 12 11 9 9 9 9 9 10 15 10 9 9 9 6 8 8 8 8 6 6 6 6 6 6 6 8 11 6 6 6 6 6 6 9 9 10 9 9 9
6 6 6 6 8 7 7 7 6 6 6 6 6 6 6 6 8 6 6 6 6 6 8 8 3 0 3 8 8 8 7 9 6 6 6 6 6 6 6 6 6 11 11 11 8 8 8 8 8 6
6 6 8 8 8 3 0 3 6 6 6 8 8 8 8 9 10 9 9 6 6 6 6 6 6 6 6 6 8 12 6 6 6 6 6 6 8 8 8 6 6 6 6 6 6 6 8 6 6 6
6 6 8 10 19 14 14 16 16 15 8 8 8 8 8 8 8 10 10 10 10 10 10 10 10 17 3 0 3 8 8 8 8 8 8 8 7 9 9 9 9 9 9 6 6 6 6 8 6 6
3 0 3 9 9 10 10 10 12 10 10 6 6 6 7 7 8 3 0 3 8 8 8 8 8 8 11 8 8 8 8 8 8 8 7 7 8 8 8 8 8 8 8 6 6 6 8 9 11 8
8 6 6 6 6 6 8 8 6 6 6 6 6 6 8 9 9 9 9 6 6 6 6 6 6 6 6 6 3 0 3 6 6 6 6 6 9 8 8 6 6 8 8 11 11 11 8 8 8 8
8 6 6 6 6 6 8 8 7 7 7 6 6 6 6 10 8 9 9 7 8 8 8 6 6 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 3 0 3 8 8 8 8 8 8 8 10 8 8
8 8 10 9 11 13 9 10 9 8 8 6 6 6 6 6 6 6 8 8 8 9 11 9 8 7 8 8 8 8 9 9 9 6 6 6 6 8 3 0 3 8 8 8 9 9 10 7 7 6
6 8 8 8 10 6 6 6 7 10 7 6 6 6 9 9 9 9 9 9 9 10 9 9 3 0 3 9 9 9 9 9 9 9 8 10 8 8 8 8 3 0 3 9 8 3 0 3 6 6
6 8 8 8 6 6 6 6 6 6 6 8 6 6 6 6 8 8 10 8 8 8 8 8 8 9 10 14 15 13 10 9 9 8 3 0 3 7 8 6 6 3 0 3 6 8 3 0 0 3
9 9 10 8 10 8 8 8 10 9 9 3 0 3 10 10 12 11 11 10 9 9 9 10 9 9 11 8 8 8 3 0 3 8 6 6 6 6 8 6 8 8 6 6 6 6 6 8 8 8
8 8 8 9 9 8 8 6 6 6 6 8 8 8 8 10 10 12 8 8 8 8 8 8 8 8 8 6 6 6 6 6 6 8 3 0 3 10 8 8 8 8 10 10 10 6 3 0 3 8
7 8 9 10 10 8 8 8 10 10 12 8 8 6 6 6 6 6 6 6 6 6 6 6 6 6 6 6 8 11 6 6 6 6 6 6 3 0 3 10 11 11 10 8 8 8 8 6 6 6
6 6 6 3 0 3 8 8 8 8 9 11 6 6 6 6 6 8 8 6 6 6 8 8 9 9 9 11 11 6 6 6 3 0 3 11 11 11 9 9 9 9 10 9 8 8 8 8 8 10
8 10 8 8 8 8 8 8 8 6 6 6 6 6 3 0 3 9 3 0 3 6 6 6 6 6 6 6 6 6 6 6 7 7 10 10 10 10 8 8 8 8 10 6 6 6 6 6 6 8
8 8 6 6 6 6 7 6 8 6 6 6 6 6 6 6 3 0 3 6 8 11 6 6 6 6 3 0 3 9 9 9 9 9 9 9 3 0 3 8 6 7 6 8 8 8 8 6 6 6
6 8 7 8 6 6 6 6 6 6 6 6 6 6 7 8 8 8 8 8 8 6 6 6 10 8 8 8 8 8 8 8 7 6 6 6 6 8 10 8 6 6 6 6 6 8 8 8 8 8
8 8 6 6 6 6 6 3 0 3 3 0 3 9 3 0 3 8 8 8 6 6 8 8 8 8 8 6 6 6 6 6 6 6 3 0 3 8 6 6 3 0 3 6 6 6 6 6 6 8
8 6 6 6 6 6 6 10 9 9 10 9 3 0 3 6 6 6 6 6 9 3 0 3 6 6 6 3 0 3 8 8 8 7 6 6 6 6 3 0 3 3 0 3 7 7 8 8 6 6
6 6 6 6 6 10 6 8 8 8 8 8 10 7 7 6 6 8 6 8 6 7 6 6 8 8 10 10 10 8 8 8 8 7 3 0 3 8 8 8 10 10 3 0 3 6 6 6 9 9
6 6 8 3 0 3 8 8 8 8 8 8 8 6 6 6 8 8 6 8 6 6 6 6 6 6 6 6 6 6 6 6 6 6 6 6 9 8 8 8 8 6 6 6 8 3 0 3 8 8
8 8 6 9 9 8 6 6 6 6 6 3 0 3 8 8 8 8 8 8 10 10 10 10 10 18 19 11 6 6 6 6 6 6 3 0 3 8 8 8 8 10 11 9 9 8 8 8 8 9
9 9 9 9 9 3 0 | Open.Hide. 0 0 0 0 0 3 3 6 8 8 8 9 9 9 8 19 21 19 19 12 22 25 30 24 29 37 37 15 9 8 8 8 22 22 33 25 16 9 7 7 8 8 3 0 3 10 13 11 18 16
18 30 27 12 12 12 27 27 59 50 47 41 25 21 9 6 6 6 6 6 7 12 11 9 9 13 13 15 19 23 25 31 48 48 48 48 57 57 57 57 57 57 53 53 53 53 53 53 50 50
50 53 53 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 50 50 57 54 47 57 44 46 46 47 46 57 57 57 57 57 57 50 50 50 51 51 51 68 68 59 57 57 57 57
57 57 68 59 59 59 68 68 68 68 50 50 68 68 57 57 50 48 48 57 57 57 57 59 59 57 57 59 59 59 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68
68 68 68 59 59 59 59 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 68 57 57 57 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68
68 68 68 57 57 68 57 44 42 28 28 28 42 44 57 57 57 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 59 59 57 57 57 57 68 68 68 68 68 68 68 68 68 59 59 59
59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 57 53 53 53 50 50 50 50 47 34 31 16 13 9 9 8 8 8 10 11 12 27 24 37 37 47 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59
59 59 59 57 57 57 57 57 50 53 54 57 43 43 43 42 43 39 37 35 35 39 37 39 35 35 42 47 48 59 59 59 68 68 68 68 68 59 59 59 59 57 57 57 57 57 68 68 68 68
68 57 57 57 57 57 59 59 68 68 57 57 57 57 57 59 59 59 59 57 43 37 43 43 57 57 57 59 59 57 68 68 57 57 54 54 54 57 59 59 59 68 68 68 68 68 68 68 68 68
68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 57 57 57 57 59 59 59 57 57 57 57 57 68 68 68 68 68 68 57 57 54 57 57 57 59 57 57 57 59 68 68 68 68 57 57 57 57 57
57 57 68 68 68 68 68 68 68 59 68 68 68 59 59 57 57 59 59 59 59 59 59 59 59 57 57 57 57 57 68 57 57 57 59 59 57 57 57 68 68 68 68 68 68 57 44 43 37 37
43 44 59 68 68 68 68 57 57 54 54 54 57 57 57 57 59 57 57 57 48 48 48 43 43 36 32 32 37 37 36 43 43 43 43 32 33 33 37 37 34 34 36 35 31 29 34 30 37 24
18 21 14 14 21 23 20 16 17 13 14 19 29 31 35 37 37 36 32 26 26 28 31 28 30 30 39 39 39 43 18 9 9 9 6 8 8 22 22 25 20 20 15 13 10 15 13 14 8 10
6 6 6 8 13 25 25 39 37 27 21 18 14 11 12 18 18 15 12 14 19 15 16 10 10 10 15 12 19 24 24 24 15 17 12 19 17 18 16 20 19 24 14 10 6 6 6 8 8 9
8 8 8 8 8 9 13 13 8 8 8 8 10 12 10 23 18 12 10 8 8 6 6 10 12 13 13 18 18 18 19 11 11 10 11 8 10 10 14 11 |