BAC end | BAC-end 1 | BAC-end 2 |
---|
end name | MSMg01-469P10.T7 (MSMg01no469_p10.b1) | MSMg01-469P10.TJ (MSMg01no469_p10.g1) |
ACC | AG553076 | AG553077 |
length | 752 | 774 |
length of high quality (start - end) | 528 (76 - 603) | 470 (82 - 551) |
definition | CHROMAT_FILE: MSMg01no469_p10.b1 PHD_FILE: MSMg01no469_p10.b1.phd.1 CHEM: term DYE: big TIME: Wed May 18 19:46:43 2005 | CHROMAT_FILE: MSMg01no469_p10.g1 PHD_FILE: MSMg01no469_p10.g1.phd.1 CHEM: term DYE: big TIME: Wed May 18 19:46:43 2005 |
singlet/doublet | --- | singlet |
---|
BLAST hit | no hit data | unique |
---|
sequence | NCCTCAAAATTTGCGGCCGCTATACGAACCCTTTTCAAATCGATCCGNGG
NAANCACATATCACAAATCGACCATTTTACCAAAGGCAGATTACAATTTA
CAATTGGCAGATTCAATGCAATCCCCATCAAAATCCTAACACAATTCTTC
AAAGACATGGAAAGAGTAATTCTCAATTTAATATGGAAAAACAAAAAAAC
CCAAGATAACGAAAACAATTCTTAACAATAAAAGATCTTCTGGAGGAATC
ATCATCCCTGACCTCAACCTATACTACAGAGCAATAGTAATAAAAACTGC
ATGGTATTAGTACAGATATCATAGTTTGATCAATGGAATAGAATTGAAGA
CTCAGAAATAAAACCACACATTTATGGACACTTGATCTTTGATAAAGAAG
CCAAAAATATACAATGGGGGAAAAAGCATCTTCAATAAATGGTGCTGGTC
TAACTGGCAGTCTGTATGTCGAAAAATGAAAATAGACCCATATTTGTCAC
TTTGCACAAAGCTCAAGTCCAAGTGGATCAAGGAGCTCAACATAAAACCA
GACACCCTGAATTTAATAGAAAAAAAAGTGGGAAAGATCCTTGAACTCAT
TGGGACTGGGCAGGGGCAGGGGTCAGGGGTCAGGGAGCAACTTCTTTCCT
TTTCTTTTTTTTTCAATACATTTTTTAATACGCATTTTTCCTCATTTATA
TTTCCAATGCTATTCCCAAAGTTCCTCTTACCCTCCCCCCCCAATTCCCC
TN
| NCCCGATGXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXX
XXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXCTTCAATCGTACACCCCATAGCT
GATCTCTTATACATCTGTGGAACTTTGGGAAATGCCTAGAGCACCTCCCT
TAATTCTTCAGAACATAATCAGAATTTCACAGGAACTAAGAACGAAAAGG
AAAATAGTTTGATTTGTTCACTCACTGCTAAAATACTGCTGAAAAATCAG
GCAGGCCCGGTTCTGTTTTAGATTTTTGTTTAATTCAACATTAACAAATA
CTGGGAGAATGTGGTAAAAAGAGGAACAGCATCTCTTAGTTGGGACAGAG
CCCTGTGTACATACCGTAGCTTGGTCATGAGTTTAAACTATTATCAGAGC
AACAGACCTAATTCTGTCAGGCGATGTTGGAGATCTTGGGCAATAAGATA
TAGGTCTTCAGTTGGCAAGGGCAGTGCTGGAGATGTCAACTGAGGTAAAA
GAAAGCCCACCAGTCTGCATGATGTCTTGGGAAGTTTCAATGGAGCTTGG
CCTAAACTCAAGAAGAATCGATCCACCATAGTGGTTATTTTCAACTACAT
GGGCTTGTCAGATTCAGGGGAGAAACTGGGGACCCTTGCTGGTTAATGAG
CACCCCCTTATAATCAGGGGGACCATTGGTTAAAAACCCCTTTGGTTTGG
AATTCCTAACAATCCCCTTTTTGTCCGCTGGGAAAAAAAAGCCTCACTAA
GGGTGGGGTTTATTTCAACCCTGG
|
quality values | Open.Hide. 0 3 7 6 6 8 9 28 34 30 11 11 11 11 10 19 14 13 14 8 9 10 10 9 15 9 7 7 7 6 6 6 7 6 6 6 6 6 6 6 6 6 8 8 11 14 3 0 3 3
0 3 3 0 3 11 11 13 7 7 7 7 7 9 9 9 10 10 8 8 8 8 8 8 13 14 23 27 37 37 37 37 35 35 44 39 39 41 42 42 41 41 37 32 29 29 37 59 29 30
31 31 31 30 47 36 36 38 38 53 39 36 37 37 29 29 18 19 22 20 31 31 42 42 42 42 39 39 42 43 42 42 42 41 41 41 48 50 48 48 48 50 50 54 54 57 57 57 57 47
47 47 57 57 57 57 57 50 50 50 57 57 57 57 57 57 57 57 42 42 44 44 44 57 46 54 57 59 57 57 57 57 57 57 57 57 54 57 57 57 50 52 52 57 57 59 57 57 57 52
52 52 52 57 57 57 57 57 57 57 57 59 59 59 57 59 59 59 59 52 52 50 59 57 57 57 57 57 57 68 68 68 68 57 57 47 47 47 57 57 57 57 57 68 68 68 48 48 39 28
28 13 14 14 14 18 19 32 30 43 57 57 57 57 48 48 57 57 59 59 59 68 68 59 57 57 54 54 54 54 54 54 54 54 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59
48 39 43 43 59 59 53 50 50 47 47 41 31 23 14 9 7 7 6 6 6 6 7 7 9 15 27 27 47 59 59 59 48 48 48 59 59 59 59 59 47 47 47 47 48 59 59 48 48 48
57 43 43 43 42 43 32 30 32 32 30 30 32 37 39 48 48 48 48 48 48 57 59 68 68 59 59 59 59 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 59 59 68 68 68 68 57 57 44
43 37 37 44 48 57 57 57 57 50 43 39 39 43 43 43 43 44 43 47 52 57 57 57 59 52 52 52 59 57 57 57 52 52 52 57 57 59 54 50 43 38 29 29 43 44 43 41 43 43
59 57 59 57 57 52 52 57 57 54 54 59 59 59 59 52 52 41 43 29 29 29 44 44 68 68 57 57 57 57 57 59 59 59 57 57 54 54 54 57 57 59 57 57 57 48 48 48 48 48
57 59 57 57 43 43 43 57 57 57 59 44 36 36 20 20 34 32 32 32 29 29 37 42 47 50 48 48 48 42 48 48 48 48 57 48 44 43 43 43 43 43 57 57 57 57 57 48 48 48
48 48 39 39 35 39 39 46 33 33 33 30 37 32 31 27 32 36 36 39 39 46 46 47 47 41 39 37 31 25 25 31 37 59 39 41 39 39 33 37 32 32 32 29 29 32 39 30 30 30
25 24 18 15 15 12 12 12 13 16 20 24 19 25 24 28 28 28 23 18 18 15 15 12 12 12 13 12 16 12 15 15 13 11 14 14 18 16 17 13 19 19 28 34 28 23 23 23 41 34
39 30 20 8 7 7 9 9 18 17 14 9 8 8 8 8 8 8 8 8 10 13 32 32 24 18 14 14 11 15 8 8 7 8 8 9 15 19 15 15 14 11 10 8 10 10 15 10 9 8
8 8 8 15 9 9 8 8 12 9 14 10 9 9 10 9 10 10 8 10 10 10 9 10 10 9 9 9 9 11 11 11 9 10 10 14 11 15 14 13 14 10 12 8 8 8 8 9 8 11
3 0 | Open.Hide. 0 3 7 6 6 8 15 8 8 6 8 8 13 12 18 8 10 10 11 26 22 39 36 31 32 27 39 31 34 25 17 11 9 11 11 12 9 6 6 6 6 6 7 15 16 24 24 23 28 34
34 28 24 28 34 35 41 30 25 12 9 9 7 8 7 8 8 9 23 37 36 15 12 12 19 19 23 37 23 19 12 12 13 22 34 44 37 42 37 39 37 28 30 30 30 30 36 57 57 53
53 50 50 50 50 57 57 53 57 48 48 36 36 36 42 57 68 68 68 68 54 54 54 54 54 48 59 57 68 51 51 50 50 50 50 68 68 68 68 68 68 68 68 57 57 57 59 59 59 59
57 57 57 57 57 57 57 57 57 54 57 57 57 57 68 68 57 57 57 57 57 57 57 68 57 57 57 48 52 52 57 57 57 68 68 68 68 68 68 57 57 57 57 59 59 59 59 57 57 57
68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 57 57 57 57 57 57 57 59 59 59 57 57 68 57 57 57 68 68 68 68 68 68 68 68 68 57 57 57 57 57 57
52 52 52 57 52 52 52 62 62 62 62 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 62 62 62 62 52 62 62 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68
68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 62 62 62 62 44 33 28 24 15 14 14 14 14 13 15 21 32 38 44 57 59 59 59 68 59 59 59 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 59 59
52 52 57 59 59 57 57 57 52 52 52 57 59 59 59 57 59 59 59 59 68 59 59 57 52 52 57 57 57 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 59 59 59 57 57 59 57 68 68
68 68 68 68 57 57 57 57 57 59 59 59 57 57 57 48 48 57 47 54 54 59 59 59 59 59 57 59 59 59 57 57 57 57 57 57 59 59 59 68 59 59 59 59 59 59 59 47 47 46
59 59 59 54 59 47 59 43 39 39 39 42 43 50 50 48 48 48 48 48 57 57 57 39 39 35 39 39 46 46 40 40 39 39 35 37 31 25 25 37 43 43 37 32 31 27 25 28 22 22
24 34 36 40 32 28 28 31 35 36 32 32 37 35 35 39 37 47 39 37 37 28 28 23 28 28 31 31 37 37 39 36 34 37 31 31 37 31 25 25 32 29 29 32 36 35 12 10 10 8
8 8 13 11 14 28 25 19 12 12 12 23 17 11 8 8 10 11 11 13 12 10 9 9 11 11 11 16 16 16 9 9 9 11 12 13 10 10 15 13 15 15 18 18 20 16 16 12 10 9
9 11 9 12 10 15 11 11 11 11 12 11 11 11 13 13 14 17 11 9 9 9 9 8 8 8 7 8 8 9 11 14 14 12 11 9 8 8 8 8 7 9 9 8 10 10 12 10 10 11
11 12 12 10 8 8 8 8 8 8 8 8 11 8 8 10 10 14 11 9 9 8 8 8 8 6 6 8 8 10 12 23 20 14 18 18 14 13 10 10 11 14 10 9 8 8 8 12 9 6
6 10 10 8 8 15 14 13 7 6 6 6 6 8 8 14 14 15 19 15 14 12 9 7 7 8 8 8 8 8 8 6 11 11 17 15 15 14 13 8 8 8 10 10 10 9 9 9 9 9
10 10 10 9 9 11 12 12 12 13 11 11 11 13 11 10 10 9 8 9 13 8 8 8 |