BAC end | BAC-end 1 | BAC-end 2 |
---|
end name | MSMg01-487E14.T7 (MSMg01no487_e14.b1) | MSMg01-487E14.TJ (MSMg01no487_e14.g1) |
ACC | AG566286 | AG566287 |
length | 1,186 | 755 |
length of high quality (start - end) | --- | 680 (76 - 755) |
definition | CHROMAT_FILE: MSMg01no487_e14.b1 PHD_FILE: MSMg01no487_e14.b1.phd.1 CHEM: term DYE: big TIME: Wed May 18 20:09:51 2005 | CHROMAT_FILE: MSMg01no487_e14.g1 PHD_FILE: MSMg01no487_e14.g1.phd.1 CHEM: term DYE: big TIME: Wed May 18 20:09:51 2005 |
singlet/doublet | --- | singlet |
---|
BLAST hit | no hit data | unique |
---|
sequence | TCTTATCCCTCTGTCTTGTGTCACGGGCGAANTGTTGGAGTTTTTTTCTT
ATAATAAGGAGGGTGGGAGGGAAAGTCTTTTTTTCTCCATAAAGAAGGGA
GGTAGGGGTGTGATTAGGGATTTGTTGTTATTTTCTACTCACAACAATAT
TAACCGCAACATAACTTTGTTAGATCCAGAAGTTGTTCTATCCAGTATAA
TCGCTTACAGTGGCTCCCACATAGGCGTGCTGTAGCGCGGACGTGGTGTA
GGTGCGTAGAGGAGACGCCCTTTTATTACTTTTGTATTCCCCGATGTACT
TTGTCTTCCTTTGGCACGTATTATCTTATAAGAGAGGCGGTTATAGTCTT
CTGAGACGTAGGTGTTATGTTTCTCTATTCTTTTGGTCAAGAACTGCGCA
TATTAATATATTCCACGTATCTGATACGGCCGTTGTCTGCGGAGAAGTCC
GCATGCCTATAGCTTTCCGAGAGGGTATTAGTATTGCCACGACATTATTT
GTGCATCGCGCGGGTCCACAGTCGCTTTGCTGTTATGTGATTTTATTGCT
CCAATCGCACGATAGTGAGGAGTGTGTCTAATGATTACGTGTAGTGGGTG
CGTTTTCAATCTATCGAGCGGCCTGTATCTATTACGTACCGGATTTATTG
GCAGACTCCATTATATTCCACCTTTTTCTCTATTACCTATATACCCCCCG
TTTTGTTTCAGCGCGTACATCAGCGTTAAAATTATCTTTATTAATATATT
GTTAGATATATATTGTTTACCACACCGTTTTATGACCCAAATTCTCTAGT
CATTTTCTTAAATGCACTCCCACTCTTGTTTGACTACTCCTAGAATCCTC
CGCACACTATTGCCCCCATTCATAATAGTCGCATATAGGAATGATCTACA
ATTATATTCTCATACGCATTTAGCTTGTATCTATTTGTTCCGTGTCGTCA
TGCATGCCCAGGTTGTATACCGATATGTGCGCCTCTAGTTTAAATCTTTT
TATATTACAACTTATTTATTATTCACAAAGCGTATGTGATATTTCTACAC
TTTTCCCGGCGTGTCGTTAGTTTCTTCACCGTGATTGAATGTAGCGAACA
CCAGATAGACAATGTAATGTGCCGAGGCGTGCATTTGATCGTAGATATAT
CATAGAAAGTGAGACGCGACANCTGCATGATAGCAA
| NCAGTGATXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXX
XXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXTCTTTAAAATAATTTATTTTTCATT
TTGTTTTGTTTGTTTGTTTGTTTGTTTGTTTGTTTTTTATAGTCTAACTT
CTTGAGTTCTTTATATATTTTGGATACTAGCTCTCTGTCATATGAATGAT
TAGGATTCTGTGGAACCCTGAGACTCTGAGTCATCAACCAAAGAGCATGC
AGTGGCTGGACTAAGGCCCTCAGCATACATGAAGCAGAGAGCTGCTAAGT
CTGGCCTCAGTGGGACTAGTATGGGCCTAATCCTCCAAAAACGTGATGCA
CAGGGGTGGTGGAAATACAAGGCAGAGGGAAGGTGACCTCTTAGAGGAGA
AGTAGAGGGTGGAAGAAAATTTTGATGGGAAACTAGTAAGAAGGGCAGGA
TTTGAGATATAAATAAATACATAAATAAATAAATATTGAAAGGAATAACA
AAAAAGTACATTTTTGCAGGTTTTCACAATAAATGTGCAATGATCATGGA
GCATATTGAAGAGCTCCCAAAATGTATATTTTCTTGAGACAAACTTAAAC
TTGAGAAAATGATGGTAATGATGCTTATCATTATGAAAGCATATTTGGTG
TGATTATTTGAATATGCTTGGCCCAGGAAGTGGCAGAAGTAGGAGTTGTG
GACTTGTTGGAGTAGGTGTGGCTCTGTGGGTGTGGGCTTTAATATCCTTG
TTCTA
|
quality values | Open.Hide.10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 11 8 8 8 6 6 6 6 8 8 8 8 8 8 8 10 6 6 6 8 3 0 3 9 9 10 8 8 9 8 8 7 11 10 10 8 8 6 6 8
8 10 10 8 8 8 10 10 8 8 6 10 6 6 8 6 10 10 10 10 10 8 8 8 8 8 8 8 8 8 18 23 18 13 13 12 11 9 9 9 9 10 9 6 6 7 7 10 7 8
8 8 10 9 9 10 7 8 6 6 8 8 10 10 10 7 9 6 6 8 6 6 6 6 8 6 8 10 10 10 9 9 10 8 8 6 6 6 8 9 9 11 12 11 6 6 10 8 9 9
8 8 6 6 8 8 6 6 6 6 8 10 10 9 10 10 11 11 9 9 9 9 9 9 10 6 6 6 6 8 10 10 8 10 6 7 8 8 10 13 10 10 12 8 8 8 8 6 8 6
6 8 8 8 8 8 8 8 8 8 10 10 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 6 6 6 8 8 9 9 12 11 11 11 12 8 8 8 8 10 10 10 8 8 8 8 8
8 10 8 8 8 8 8 8 12 8 8 8 8 8 8 10 12 12 12 13 15 19 8 8 7 6 8 8 8 9 8 8 8 8 8 8 11 13 13 11 12 11 9 9 9 9 8 8 8 10
10 8 10 8 8 8 10 10 15 13 14 9 10 8 8 6 8 6 6 8 8 9 10 10 11 11 11 13 10 10 8 8 8 8 10 8 8 6 6 8 6 6 6 6 6 6 8 10 10 8
8 8 8 6 6 8 8 8 10 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 9 10 11 11 9 10 10 10 10 9 9 11 13 15 13 13 12 12 12 8 8 6 6 8 8 8 8 6 6 6 8
8 8 10 8 8 8 8 6 6 8 8 10 8 8 8 8 8 8 8 8 8 9 9 9 9 9 9 9 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 10 8 8 8 8 8 8 8
8 9 9 10 9 9 10 17 19 10 9 8 8 8 10 8 8 8 8 8 10 10 10 10 13 13 9 10 11 8 6 6 8 8 6 6 8 6 9 9 9 8 8 8 12 10 10 12 9 8
8 8 8 8 8 9 10 9 8 8 8 8 8 8 9 9 9 8 8 6 8 6 6 8 8 12 8 8 8 8 8 8 8 8 6 6 6 6 10 12 12 10 8 12 8 8 8 6 6 8
8 8 12 10 8 6 6 6 6 8 8 8 10 8 10 8 8 8 8 9 9 11 11 11 11 9 8 8 8 8 10 10 8 10 8 8 6 6 8 8 10 9 9 9 10 8 8 8 8 8
8 8 8 8 8 10 11 10 10 9 9 9 8 8 8 8 8 8 8 10 8 8 8 8 8 8 13 8 8 8 8 10 7 6 8 8 8 9 10 8 8 8 8 8 8 11 11 10 8 8
6 6 8 8 10 10 13 9 9 9 11 12 8 8 6 6 8 6 8 8 9 11 12 17 14 12 8 8 8 10 10 10 13 10 8 8 8 8 8 8 8 8 13 15 16 12 8 8 8 8
13 13 11 9 9 13 10 10 11 6 8 6 6 8 8 10 9 8 8 6 6 8 8 8 6 6 11 10 10 8 10 10 8 8 8 8 10 10 8 8 8 8 8 10 6 6 8 8 10 15
8 8 8 8 8 8 8 6 6 12 10 22 18 20 21 12 12 9 9 8 8 8 8 8 8 8 8 10 13 10 10 8 7 7 7 7 8 8 8 8 8 8 8 8 8 10 13 10 10 8
6 6 6 8 8 9 9 9 9 12 7 6 6 8 8 8 10 10 10 10 10 13 15 17 10 10 6 6 6 8 9 10 8 8 10 8 8 8 8 10 8 10 10 13 9 6 6 6 7 10
6 6 8 8 10 10 10 10 13 12 11 10 10 10 12 10 13 15 12 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 7 6 10 10 11 11 8 8 10 10 10 12
12 9 9 8 8 7 7 6 6 6 6 8 8 6 6 6 6 6 8 6 9 8 8 8 8 8 11 11 10 10 8 8 8 8 8 9 10 9 9 9 10 11 9 8 8 8 8 8 8 8
8 6 6 6 6 8 8 10 16 9 9 9 10 6 6 6 6 8 6 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 7 8 8 8 8 11 11 12 8 8 8 8 8 8 8 8 8
6 6 6 6 6 8 12 10 10 8 8 8 6 6 6 8 8 10 11 19 13 9 8 6 8 6 6 8 8 13 10 13 8 8 6 6 8 6 8 8 8 10 11 15 10 8 6 6 6 8
10 12 6 6 6 6 7 6 6 6 8 9 9 9 9 9 9 9 10 10 10 10 8 8 10 13 8 6 6 8 8 8 6 6 6 8 8 8 10 6 9 10 10 10 11 13 10 9 7 6
6 8 6 8 6 6 8 8 10 8 9 10 10 9 10 8 8 6 6 6 8 8 6 7 10 7 8 6 6 6 6 6 6 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 10 8 8 8 8 8 8
8 8 8 8 8 8 8 13 13 10 9 9 9 9 9 9 10 9 9 9 3 0 3 8 8 6 6 11 8 8 8 8 8 8 8 8 | Open.Hide. 0 3 9 9 11 11 11 9 8 6 8 8 10 16 17 29 29 39 32 37 37 37 37 37 39 31 37 41 23 15 9 10 9 10 9 7 7 10 10 15 15 27 23 23 18 15 26 25 21 10
10 10 26 22 41 25 23 9 9 6 7 6 6 6 7 12 14 32 30 22 22 29 33 33 33 48 53 53 53 53 53 57 57 47 50 47 53 53 53 53 59 59 59 59 51 50 48 48 48 51
57 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 57 57 57 57 57 57 59 59 59 57 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68
68 68 68 68 68 57 57 57 59 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 57 59 59 59 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 57 57 57 57 57
57 57 57 54 57 57 57 57 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 57 57 57 57 57 57 57 68 68 68 57 57 57 57 57 54 54 54 59 59 68 68 68 68 68 68 68 68 57 57 43 43
39 43 43 59 59 68 68 68 68 68 68 68 68 68 59 59 44 43 57 59 48 48 48 48 59 59 59 54 54 57 57 57 57 57 59 54 59 59 57 57 57 57 57 57 59 59 59 59 59 59
59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 41 41 28 25 15 9 9 9 9 10 12 12 21 28 41 59 59 59 59 59 59 57 57 57 57 57 57 59 59 59 57 53 50 53 53 53 68 68
68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 59 57 57 54 54 57 57 59 59 57 59 59 59 59 68 68 68 68 68 57 57 57 57 57 57 57 44 44 42 48 57 59 59 68 68 68
59 59 59 59 59 59 59 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 57 59 68 68 59 59 59 57 57 57 57 57 57 59 68 68 68 59 59 57 57 57 57 57 68
68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 59 59 57 57 57 57 59 59 68 68 68 68 68 68 68 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 57 57 57 57 57 57 57 57
57 57 59 57 68 57 68 68 68 68 68 68 59 59 59 57 57 57 57 57 57 57 57 57 52 52 57 57 57 57 57 68 59 59 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 59 57
57 57 59 57 57 57 57 57 59 59 59 52 57 57 57 44 44 32 32 32 43 44 59 54 54 54 57 59 59 59 59 48 48 48 44 44 57 57 48 48 48 57 59 59 59 48 48 48 59 57
57 57 57 48 48 57 44 44 48 48 48 48 44 48 43 43 43 48 57 59 59 59 57 57 57 59 57 48 48 48 48 48 48 48 59 59 59 48 48 48 48 48 57 59 59 41 41 28 28 28
28 28 37 37 41 41 41 41 41 41 36 36 41 41 41 41 47 37 21 18 14 14 11 19 11 11 13 21 28 41 41 37 31 36 35 30 28 17 15 15 15 17 19 30 30 29 29 37 41 34
36 35 39 39 39 41 31 37 32 32 28 19 19 14 14 17 30 26 35 31 32 33 23 34 32 30 28 28 28 31 36 35 35 31 36 32 32 31 31 32 29 26 35 35 35 31 31 31 31 35
31 31 39 35 31 |