BAC end | BAC-end 1 | BAC-end 2 |
---|
end name | MSMg01-492G11.T7 (MSMg01no492_g11.b1) | MSMg01-492G11.TJ (MSMg01no492_g11.g1) |
ACC | AG570167 | AG570168 |
length | 711 | 713 |
length of high quality (start - end) | 389 (316 - 704) | 59 (236 - 294) |
definition | CHROMAT_FILE: MSMg01no492_g11.b1 PHD_FILE: MSMg01no492_g11.b1.phd.1 CHEM: term DYE: big TIME: Wed May 18 20:16:37 2005 | CHROMAT_FILE: MSMg01no492_g11.g1 PHD_FILE: MSMg01no492_g11.g1.phd.1 CHEM: term DYE: big TIME: Wed May 18 20:16:37 2005 |
singlet/doublet | singlet | --- |
---|
BLAST hit | unique | no hit data |
---|
sequence | TCTATXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXCGCGGA
ATTCATTCATTATCATGACTCACTGTGCTTCCCTTTTGCTAAAGTCATTT
CTTACTGATTTCTTAAATATTCACAACTTTTATTGCCCTGCCTTGGATAT
TGCCCAGTGGTAGAGCACTTGCCTAGCATGCATGAGACCACACCGTCCCC
CACTCTCTGTCTCTCTGTGAGTCTTTGTCTCGTCTCTCTTTGTCTCTTTG
TCTCTGTATCTCTCTCACATACACACTTCTTAATTTAATATGTAAACACA
CAATTTCATGTTTTAGTGAAAATATTTAGATTGATTAATCTTATTTTATG
TGCATGAGTATGTTGCCTGCACGTATGCATGTGCACCATGAGTGTGTTTG
ATGCCCTGGATGGCAGAAGAGGGGGTCAGATACCTTGGAACTGGAGTTAT
GGACAGTTGTGAGCTGCCACATTAGTGCTGGCAAACCAAGCCTGGGCCCT
CTGCAAAAGCAACAATTGCTCTTAACCGCTGAGCTATCTCTACAGCCCAT
TAAAACTGTTATCTATTAACGTACAGTCAGTTTTTCATGTTTGGCTAAAA
ATAATCAAGTAAACTAGATTTTCCATATTAGCCAAAATTTTTTCTCAAGA
AAGTATGAAGGAGTTGTTAGTGCTTTTCAAACAAGCAGCTACTGTGTTTG
CTCCCCTGTGT
| GATCGGGGAGGGCCGGAGGCGCCCGGTTTCGGACGGGGGNGAANNANAGA
AGTTTCCAGACGCGGGAGNNAGNGGGANGGAAGGAACNCCNNCAAANANT
TTATCCCCCGCCAAGCCNGAACANNAGACCAGGGACCGGCAGCCACTNNN
NGNGCCNGGGGGCCCCCCAGGCCCCAGAGACCCCGGCGAGGGNCNCNGCC
CCGAANCCCCAGGCCCCCACACCCGGGTGTTTGCCTACAACAAAATGGCC
TCTGCAGTGGCTCCATATCTAAATTACAGTTATTTGGATATTCCTTTTTT
TTTTAAAGAGCCACACCANCCAGCCCACAGGCCNGAGAATTTATTTCTAC
CATTGCACAGTATATAACTCTCTTGATAAGAAAACTAAGTTTGTGACTTG
TATATTTTGGTATTTTCATAGAACAATGGCTTTTCTTGGTTGATATCACA
GAGCATTGCCCACAGCACCACAATATTGGACATGCTGGATACAGATGGCT
GTGAGCGTTTTCTCAAGTATTAAGGGCTGATGTAACTGGACTTAGGGTAC
CACTTTCCATGCTTTGAAGGGCTTGAATGACCGGACAGGACCCTTTCTTC
CCTTTCTTTCTCTATTTGGTTCCTTCACCGGTCCAAAGAATAGGGATCTC
GACGTTCCACTTTGTTGAGTACTGGCGTATCTTAATCTCCGCCTATCTAC
CCTACCGTTCTTC
|
quality values | Open.Hide. 8 8 8 8 8 8 19 18 31 30 27 21 20 20 12 14 10 10 9 13 13 32 32 37 23 23 22 19 13 10 3 0 3 7 7 7 7 7 11 10 10 11 13 13 13 15 30 28 23 14
12 17 19 22 37 21 19 8 7 6 6 6 6 6 8 8 14 24 21 21 25 28 28 33 39 43 57 57 57 57 53 53 44 44 39 37 37 41 39 39 39 39 39 37 37 37 37 37 37 50
50 50 53 53 53 53 50 50 42 37 33 33 33 32 31 30 29 30 32 33 33 33 33 37 41 33 33 44 39 37 37 41 39 39 39 39 39 37 37 32 28 28 32 32 33 33 33 33 37 37
37 37 32 32 37 37 37 37 42 40 40 48 48 50 59 59 47 47 44 44 44 41 41 44 59 59 59 59 59 50 50 50 53 53 53 53 53 53 53 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57
57 68 68 68 68 68 68 68 68 43 43 30 30 37 41 41 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 59 59 48 48 48 57 59 59 59 68 68 68
68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 53 53 53 53 57 57 57 57 57 59 59 59 59 59 59 59 59 59
48 59 59 41 34 32 16 16 11 12 12 15 13 11 10 10 11 27 30 59 59 50 50 53 53 53 53 53 53 50 50 57 57 57 57 57 57 59 59 59 59 59 68 68 68 68 68 59 59 59
59 59 59 59 48 59 48 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 59 57 57 57 59 59 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 59 59 59 57 57 57 59 68 68 68 68 68 68 68 68 68
68 68 68 68 68 68 59 57 57 57 57 57 57 57 43 43 38 43 43 43 43 43 52 59 59 59 59 59 59 57 57 57 57 57 57 59 59 57 68 57 57 57 57 57 57 57 57 68 68 68
68 68 68 68 68 68 59 59 57 57 57 59 59 68 68 57 57 54 54 54 57 57 57 57 57 59 59 59 68 68 59 59 57 57 57 57 57 57 47 47 43 43 50 59 50 44 44 43 57 57
59 59 57 54 54 54 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 59 59 57 57 57 57 57 46 48 43 43 43 57 57 57 57 57 57 59 59 43 37 37 32 32 37 43 43
48 48 48 59 59 59 48 42 42 32 35 26 30 28 34 29 36 36 35 39 48 48 37 30 17 12 12 12 16 21 25 34 37 35 39 31 31 35 33 33 33 33 33 33 37 35 36 24 22 22
25 25 30 30 36 28 28 22 30 17 20 19 30 25 33 33 28 30 37 37 43 37 37 23 23 14 21 17 21 14 17 13 16 19 39 47 39 33 33 33 33 33 36 32 32 23 23 23 28 28
37 34 28 28 28 34 32 32 23 20 20 28 34 16 18 15 15 13 17 28 30 30 37 27 28 16 21 12 12 17 27 26 36 33 23 19 14 14 23 23 23 32 28 19 19 18 21 24 37 28
32 17 9 8 8 8 15 9 10 10 10 | Open.Hide. 6 6 8 8 6 6 8 9 16 9 11 9 9 7 15 9 9 9 15 22 19 16 18 9 9 9 9 12 9 6 6 6 6 8 8 8 9 13 3 0 3 17 3 0 0 3 0 3 25 9
9 9 6 7 7 7 6 6 6 6 6 6 6 6 6 8 15 3 0 0 3 3 0 3 17 18 3 0 3 21 23 40 41 37 23 15 3 0 3 3 0 0 3 14 8 3 0 3 0 3
7 7 16 28 30 29 27 12 12 9 9 9 19 17 9 9 3 0 3 23 19 17 3 0 0 3 14 15 10 9 6 7 9 9 9 19 9 9 9 9 17 25 15 12 12 12 3 0 0 0
0 3 0 3 6 3 0 3 9 8 8 8 6 7 7 6 6 8 15 6 6 6 7 7 19 23 37 33 33 25 21 17 8 8 7 17 7 9 9 15 23 3 0 3 0 3 0 3 6 6
6 6 8 13 3 0 3 9 9 9 9 23 23 9 9 9 19 6 6 6 6 6 6 6 6 7 7 8 8 10 15 13 12 12 18 20 24 23 34 34 23 23 28 37 37 43 43 36 36 39
40 43 43 43 39 39 35 35 35 39 43 43 43 35 35 35 43 43 57 59 48 39 39 39 39 43 39 39 30 32 39 47 47 43 43 43 43 28 26 12 12 9 9 9 9 11 15 17 19 35
27 19 17 12 15 21 11 9 9 11 11 15 10 6 6 6 8 3 0 3 23 18 18 18 16 16 14 12 8 13 8 7 3 0 3 6 6 6 7 7 10 10 10 10 16 28 24 30 28 34
28 28 28 26 24 14 14 14 28 28 30 30 13 12 14 14 19 21 42 42 37 37 40 36 29 28 28 27 20 20 20 21 21 16 13 10 10 10 17 20 20 11 11 11 15 21 24 28 23 19
15 22 12 12 17 30 30 19 16 11 11 10 15 18 30 28 28 28 32 25 18 18 12 12 14 28 23 19 10 10 10 14 21 24 32 17 12 11 17 16 23 19 17 14 14 15 18 13 14 14
24 19 11 10 10 10 10 11 15 12 12 15 15 13 13 13 12 12 12 11 11 11 11 12 12 25 30 32 32 28 32 16 10 8 8 8 13 13 7 7 7 8 8 9 15 13 13 11 15 13
13 12 19 18 18 14 15 13 16 16 14 14 10 9 9 12 16 22 22 16 13 15 11 11 13 12 12 11 10 10 13 10 10 10 8 8 8 8 8 10 15 15 12 11 8 8 8 8 8 10
11 13 13 14 11 8 9 10 10 9 10 13 27 27 23 24 16 17 14 14 15 13 12 19 12 10 10 13 11 10 12 9 8 8 8 8 8 8 11 12 8 8 8 8 14 15 12 9 9 9
11 12 16 10 10 9 8 8 8 17 15 15 8 8 9 11 14 16 13 8 8 8 10 8 10 9 9 9 10 10 9 9 9 9 11 11 11 11 11 15 13 10 10 10 10 10 10 10 10 11
11 11 11 11 10 8 11 8 8 8 16 21 22 16 15 8 8 8 8 10 9 12 12 14 8 8 8 8 8 11 23 22 8 8 6 6 8 8 9 9 8 8 8 8 8 8 11 11 10 10
8 10 11 10 6 9 7 7 7 8 8 10 8 |