BAC end | BAC-end 1 | BAC-end 2 |
---|
end name | MSMg01-540K13.T7 (MSMg01no540_k13.b1) | MSMg01-540K13.TJ (MSMg01no540_k13.g1) |
ACC | AG606858 | AG606859 |
length | 746 | 1,181 |
length of high quality (start - end) | 506 (52 - 557) | --- |
definition | CHROMAT_FILE: MSMg01no540_k13.b1 PHD_FILE: MSMg01no540_k13.b1.phd.1 CHEM: term DYE: big TIME: Wed May 18 21:20:00 2005 | CHROMAT_FILE: MSMg01no540_k13.g1 PHD_FILE: MSMg01no540_k13.g1.phd.1 CHEM: term DYE: big TIME: Wed May 18 21:20:00 2005 |
singlet/doublet | singlet | --- |
---|
BLAST hit | unique | no hit data |
---|
sequence | GTTTTACTTATXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXX
XCGCGGAATTCCTGGTGCAGCTCTTTGTGGATGCAGGTTATGAAGAAGTG
GTGAACGAGTATGTGTTTCGAGAGACAGTGAATAAAAAAGAGGGCCTGTG
TGTGCCTCGAGTTTTCCTTCAGAGCAAGTTCCGGAAGCCTCCGAAGGACC
CAGCCCCTACCAGTGACTCTGCTTCACTTTGAAGAAAAGGATGTTAAACT
ATTTTGTATTTTTTTTATATTCTGAATTTTTGAAAATTGCATGTGTTATT
TTTGTACTGAGAACAAGTGAAGACTGGGGAGTTGGCTCAGCAGGTAAAGG
TGCTAGCTGTGCAAGCTTAGCAACCTGGGTGGATCAGCAGTCTGTGTTGA
GCAGGAGAGATGGCTCAGTGATCAAGAGTGTTGGCTGCTCTTGGGCAGGG
CCTGGGTTCGGTTTCCAGCACCCACATGGCAGCTCACTTCCATCAGTAAT
TCCAGTCCCAGGGTATTGAGTGCCCTCTTCTGACCTCTGCAAGTGGTGCA
CAGACATACATGCAGGCTAACACCCCAATTACAAAAGAAAAAAATCCAGG
TTTGGCAATTTGAGGTTATCCTAGTACTCCTACCTCAGTACTCCTACCTC
ATTACTCCTACCTCTCAGATGAAAAACCGAGACCGGAAGAACCACTCTGG
TAGCCTCCTGAAGCAGCCCAGCCTGGGATTTACCCGGGTGGGGAAN
| TTGTAGTTTTTGAGCAGACATCCTAAGTCAGTAACTAACAAAGGCCTCTT
TCTACCCTACACTGNTACGGACACCGCGTAGCAAATATCGTATACAATGA
TATTTTCTGTATTAGGCGCGGCCATTAAACTAAATACCACCCATGAACGT
GAGTCCGCTCAAATAGTCCCGCGTCATCTTCGCGTGGCGGAGGTGGCGTC
ATGGCGGGAGTTCGAGTATTAGTTAGCGCGCGCGCACATATTCTATGAGC
TCTCGTTCGAGTAGCGCGAACTACTCTGTTGGTGTCTGACCCCGCTGCCG
CTAGCGCTCGCGTGCACGCGTAGCTGTTATATGCCGGCGTGTGCGCGCGC
GACAATTGAGGTTGTGTTAGGTCAGTGAATAACGGCGGAAGAGANTGTAC
TCGAGCTCTGCTTATTCCCGTGAAGTCGCGCGTGTGTATATAGAGTATAG
TGAGATCGCAGCAATTTTATTCTCTTCGTGTACGAGCCAGCGTATGTCAC
ATGGCATCGGTATGATTGTCTGCGATGTATCATCGTAGCCCGTCCTCGCG
AATTNTCACCTATATTGTGGACGCTGATGCCAGCCGCGTCGCCCCCGTCC
GTACTCACTGATAAGATTTAATATATCCGCAGCGATGCGATAGCCGCTCA
GCGTTCGCACTATTCCGCGTCATATATCTTATTGCGGTGCTTTGTGAGAC
TATGAGACGAGCAGAAGGGGAACAGCGACACAACACCTAATAGTAGATAA
ACATGCCACACACATACAGTAAGAGAAAGTAATAGGAGGCGCTGATAAAA
AGAACGACTAAGAGCTGAGTCTGACGAGCATACTGACAATGACGTGATAC
GATGTGATGATGACAGTTTATTACTAGATATGGTTAAGACGGTGCGTTAG
TAATGGAGAGTTAATAATATATTAGCAGCATGATTAAATATGTGCCCCCT
CTACCAAGATCACCTATATGAATAGCGAGGATGACGGAAGGCGGTAGAAG
TGACGAGAAATACATTCAGCGGCTGTCAGCGTAGTGCTATCTGCGACGTA
TTTATGAGNGACGCCGACGCCAGCATCAGCAGCTCTTTATAAATACAATA
AACACCACATCTCCTATAATCTTTATCAATGATCCATGTTTACAGTACAT
AAAATAGGATATCAGACATTCTAATCTATGT
|
quality values | Open.Hide. 7 7 7 6 6 8 6 6 8 8 8 10 13 19 23 37 37 37 37 32 28 28 19 23 23 25 28 28 41 41 41 26 22 18 14 13 9 9 9 9 9 13 19 30 39 40 31 31 31 31
36 36 59 57 57 36 36 37 37 50 50 59 41 24 19 15 13 13 12 12 19 34 37 57 57 59 59 59 51 51 50 50 50 51 54 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68
68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 57 59 57 48 48 57 57 57 68 68 57 57 51 51 51 51 51 51 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68
68 68 68 68 57 57 57 57 57 57 57 68 68 57 59 68 68 57 57 57 57 57 57 68 68 68 68 68 59 59 57 57 57 57 57 68 68 57 57 57 57 52 45 57 57 57 57 57 57 57
57 59 59 68 68 68 68 68 68 57 57 57 57 62 62 62 62 62 62 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 57 57 57 57 57 57 57 68 68 68 68 68
68 68 68 59 59 59 59 59 59 59 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 57 57 57 59 59 59 59 68 59 59 59 68 68 68
68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 59 59 57 57 54 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 36 40 25 41 44 59 59 54 57 57 59 59 59 59
57 48 48 48 48 48 59 59 59 54 54 54 57 57 57 59 59 47 39 39 36 43 43 57 57 57 59 59 59 59 57 57 57 40 39 35 39 39 57 57 57 48 59 48 48 48 59 59 59 47
59 43 36 31 28 36 37 32 32 24 34 37 37 37 31 32 20 20 32 34 37 48 43 43 39 39 35 39 39 39 39 39 59 59 39 39 35 35 36 37 37 37 31 31 40 39 37 35 31 31
31 28 39 31 31 35 37 36 28 28 28 20 20 30 30 28 33 34 37 41 32 31 31 35 35 39 34 40 36 43 37 39 37 34 34 39 37 39 28 24 20 28 19 19 12 17 21 28 28 30
30 28 25 28 28 30 28 32 28 20 18 26 24 32 23 28 28 37 30 32 32 32 26 25 32 37 32 32 28 30 24 28 24 20 21 19 15 15 24 21 24 24 28 24 25 18 19 19 24 24
31 24 24 14 14 14 21 23 19 24 16 15 12 16 16 16 12 12 12 22 22 30 14 10 9 10 13 19 13 13 14 14 19 18 21 23 23 24 20 25 24 24 23 20 16 14 10 11 11 13
14 25 25 21 12 12 12 13 16 17 21 11 10 9 9 13 17 16 17 17 14 15 9 9 10 10 12 13 20 20 24 19 16 17 11 11 11 13 10 17 8 8 8 8 10 12 10 18 15 18
14 15 15 10 11 11 14 11 13 13 12 8 8 6 6 6 10 10 8 6 6 6 6 10 10 8 8 8 8 8 10 11 12 9 9 6 11 6 6 6 7 10 6 6 6 8 8 9 10 9
10 10 10 10 12 10 11 10 12 10 10 8 8 8 10 12 10 9 8 8 8 8 10 13 12 8 8 8 8 11 10 10 10 10 10 10 10 10 11 14 15 8 8 10 3 0 | Open.Hide. 8 8 8 8 8 8 8 9 9 9 11 10 10 6 6 6 6 6 6 6 8 8 8 8 8 8 8 11 11 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 6 8 6 6 8 8 8 8 8 8 8
8 8 8 8 8 10 9 9 10 11 6 6 6 3 0 3 6 6 6 6 6 8 8 8 8 8 11 12 11 6 6 6 6 8 8 6 6 8 6 8 8 8 8 8 8 8 8 6 6 6
8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 9 8 8 8 8 8 8 10 10 10 8 8 9 9 9 9 9 9 9 9 9 9 9 9 9 9 8 8 8 10 10 8 8
8 8 10 10 10 8 8 6 6 6 6 8 8 8 8 8 8 10 10 8 8 8 8 8 8 10 8 8 8 13 10 16 16 15 14 8 8 8 8 8 8 8 9 9 9 8 8 8 6 6
6 6 8 6 10 10 8 8 8 8 8 8 8 6 6 8 8 8 8 6 6 6 8 8 8 8 8 8 8 10 10 12 6 6 6 8 8 7 7 7 8 8 6 8 8 8 8 8 10 12
10 10 9 10 10 8 8 8 8 6 8 6 6 8 8 10 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 6 7 8 8 8 8 8 8 6 6 6 7 10 8 8 8 8 10 8 8 8 8 8 8
8 8 8 8 8 8 8 8 8 15 8 8 8 8 8 10 10 9 10 10 10 8 8 8 8 8 8 8 8 10 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 10 10 10 10 8 8 8 8 8 8
8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 6 6 6 6 6 6 8 10 10 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 6 6 6 6 6 8 8 9 8 8 8 3 0 3 9 9 10 10
10 10 8 9 8 8 11 10 12 10 8 8 8 8 10 6 6 8 8 11 11 10 10 10 8 8 6 6 6 7 11 12 11 11 12 21 21 8 8 8 6 6 8 8 8 8 8 7 7 9
8 8 8 8 8 8 8 8 8 10 13 8 9 9 9 6 8 8 8 9 12 12 8 8 8 8 10 9 10 8 8 8 8 6 6 6 6 10 8 6 6 6 6 6 6 11 11 11 11 11
17 22 22 11 11 11 11 11 11 11 11 19 8 6 6 6 8 6 7 6 6 8 8 8 10 6 6 8 6 8 8 8 10 8 8 10 10 10 10 8 8 8 8 10 8 9 8 8 8 8
8 8 8 3 0 3 9 9 15 17 24 22 13 11 8 8 8 8 8 8 8 8 10 8 8 8 6 7 8 8 8 8 8 8 10 10 8 8 9 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8
8 8 8 8 10 15 15 13 8 8 11 8 8 7 7 7 8 11 11 10 15 10 10 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 9 8 8 6 6 10 6 6 8 8 9 8 8 8 8
8 8 8 6 6 6 6 6 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 11 11 10 10 12 8 8 6 7 7 9 7 6 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 6 6 6 6 8 8
8 8 8 8 8 8 6 6 6 8 6 9 10 10 10 8 8 8 8 8 8 8 10 8 8 8 8 8 9 9 10 10 10 10 8 8 8 10 10 10 8 8 8 8 8 8 8 8 8 10
10 9 9 8 8 8 8 6 6 8 8 8 10 10 12 12 10 9 10 8 8 7 8 8 8 8 8 8 8 8 9 6 10 6 6 8 8 8 8 8 8 8 9 8 8 6 6 8 8 10
10 13 10 10 8 8 8 8 8 6 6 6 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 9 8 8 6 6 7 6 10 8 10 10 10 8 8 7 7 8 6 6 6 6 6 6 8 9 10 10 10
10 8 8 8 8 6 6 6 6 8 8 10 8 6 6 6 8 10 10 8 8 8 8 8 8 8 8 6 6 8 8 8 8 8 8 8 8 8 10 10 10 8 8 8 8 8 8 10 10 8
8 8 8 8 8 8 8 8 15 8 8 8 8 8 8 8 8 10 9 9 8 8 10 11 8 8 7 7 8 10 8 8 8 8 10 8 8 8 8 8 8 8 9 9 9 9 9 9 10 10
10 8 8 9 10 10 10 10 8 8 9 9 9 9 9 10 9 9 8 8 8 7 9 9 9 10 10 10 10 8 8 6 6 6 6 9 10 8 8 8 8 8 8 8 8 8 10 8 8 6
6 8 8 8 10 8 8 8 8 6 6 8 8 8 6 6 6 6 6 8 8 8 8 8 8 8 9 9 9 11 11 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 10 8 8 8 8 8 8 8
8 8 8 8 8 8 8 3 0 3 8 6 6 8 6 6 8 8 6 6 6 6 6 8 6 8 8 8 8 8 8 8 10 9 11 9 14 6 6 6 6 10 8 10 8 8 8 8 10 6
6 6 7 12 8 6 6 6 6 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 10 10 12 11 8 8 8 8 8 9 10 10 10 8 8 8 8 6 6 6 8 8 9 9 9 8 8 8 8 8 8
10 10 9 8 8 8 8 8 8 8 6 8 8 6 6 6 6 6 6 8 10 6 6 6 6 8 8 11 8 8 8 |