BAC Information

Click to search

BAC

Clone NameB6Ng01-001N24
Chromosome15 (Build37)
Map Location 63,601,700 - 63,693,690
singlet/doubletdoublet
Overlap geneMlze, AI987692, Gsdmdc2, 9930109F21Rik
Upstream geneLOC100040430, Tsg101-ps, EG239502, EG432959, LOC672194
Downstream geneLOC665769, 9030605I04Rik, 4933426G20Rik, 0910001A06Rik, Ddef1, Adcy8
LinkOpen Mouse BAC browser



BAC End Information

BAC end BAC-end 1BAC-end 2
end nameB6Ng01-001N24.bB6Ng01-001N24.g
ACCDH840073DH840074
length1,105587
definitionDH840073|Mus musculus domesticus DNA, BAC clone: B6Ng01-001N24, 5' end.DH840074|Mus musculus domesticus DNA, BAC clone: B6Ng01-001N24, 3' end.
singlet/doubletdoubletdoublet
BLAST hituniqueunique
Map location.(63,601,700 - 63,602,820)(63,693,104 - 63,693,690)
sequence
gaattcctactagaattcccactaccctcctccttactgaagcaggtaga
aattagacaggttcccgggtagacagaaagacagggagaggctaaggaag
aagccggccatcctgctgtgtctcttagtctctgtcctagtctctcagag
ctacagctaaaggaactcaaggccttaacctctgaaaactcaggacagct
ggcagagaccctgcttctcagcagactaggaatcacaagatggtaaggca
tgacaatcctacttgggatcacttagaaattgtcactgtggcaacattgt
cagcccaactcagcttcacaaacaaacgctgaccaggcagcctcaggacc
tttccgacagacactcatcccggcctcgtgtctccactgtctgcttcagg
actggttgcatacacatcctcacatactgaacagtgaaccaagtagcaag
ccaaggcaaagcccagagttcttctagcagatagtgtatgccttctgtat
gctgtgatacatacatacatacaggtaaagtgggatctagctaggaatgt
cacttatcacccctcctgagggaaagacatttctttaaagtgtgttcaac
tgcccaaggataccttttaaaaaaattaaccttaacaaaacacacactca
actaaattcaatgccccagaaatgaagcaagtctgtcttctacccattgc
ttctgcatctccctgttagcattgacattaggttcataacaagcctcagg
ttcgtccgtgcttagtgatcctcagcagcactaggtgctgtgctgggttc
tcctgggtgctatgctgggttatctatgcctttttacttatcttacttaa
tttaatctagtagatcaatgggctaggatgtagttcagtggtaaagcatt
gatctagcatgcatagagcttgagttgagagagagacagacagacagaga
gacagagatagatggagagggacgagggagagtaaaaggagagagatgga
gactgatcttgaaactcagaaatttgactcatttaaacctgtctcaacca
tccaatccagtcttcagctcactcatgggaagcagctttcagtattgacc
actct
gaattctgattctttgtaagagctgcaagactctctccagctctcatgga
gtaattcttgaatgtcagagggtgtaatgtcacctaaagtgctcatttaa
gatgccagtttcaggcaagtgagatggattagctggggaaggtgcctgct
accaggcctcatgacgagctctctctccatgcccctcatgttggaagaaa
ataactgacttccaacgttggccctggcctctgtatgtgtccaaggcaca
cacgcatgtgtacacagtaagtaagcaaacataatacaatgcaggtttca
gggcacctgtgaaaggatctggtttacagactggtgctcaggttgacagt
tgtccctggtgtttggcttgggagtcactacatggcatgtgggaagaact
ctagcaggtgtaacctcacctcacctcacttgagtttcttttctgtccag
tcattctcccttctgctactaagaagaagatgacctttccaggcacacct
aagtacgcttctgcttccgaacccactgagatttatagaacagaattaca
aggtgaaaagcaaggatggatagaggggggaggggta
quality valuesOpen.Open.




Alignment Information

BAC End 1BAC End 2
seq1: chr15_63601700_63602820
seq2: B6Ng01-001N24.b_47_1151

seq1  GAATTCCTACTAGAATTCCCACTACCCTCCTCCTTACTGAAGCAGGTAGA  50
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAATTCCTACTAGAATTCCCACTACCCTCCTCCTTACTGAAGCAGGTAGA  50

seq1  AATTAGACAGGTTCCCGGGTAGACAGAAAGACAGGGAGAGGCTAAGGAAG  100
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AATTAGACAGGTTCCCGGGTAGACAGAAAGACAGGGAGAGGCTAAGGAAG  100

seq1  AAGCCGGCCATCCTGCTGTGTCTCTTAGTCTCTGTCCTAGTCTCTCAGAG  150
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAGCCGGCCATCCTGCTGTGTCTCTTAGTCTCTGTCCTAGTCTCTCAGAG  150

seq1  CTACAGCTAAAGGAACTCAAGGCCTTAACCTCTGAAAACTCAGGACAGCT  200
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTACAGCTAAAGGAACTCAAGGCCTTAACCTCTGAAAACTCAGGACAGCT  200

seq1  GGCAGAGACCCTGCTTCTCAGCAGACTAGGAATCACAAGATGGTAAGGCA  250
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGCAGAGACCCTGCTTCTCAGCAGACTAGGAATCACAAGATGGTAAGGCA  250

seq1  TGACAATCCTACTTGGGATCACTTAGAAATTGTCACTGTGGCAACATTGT  300
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGACAATCCTACTTGGGATCACTTAGAAATTGTCACTGTGGCAACATTGT  300

seq1  CAGCCCAACTCAGCTTCACAAACAAACGCTGACCAGGCAGCCTCAGGACC  350
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CAGCCCAACTCAGCTTCACAAACAAACGCTGACCAGGCAGCCTCAGGACC  350

seq1  TTTCCGACAGACACTCATCCCGGCCTCGTGTCTCCACTGTCTGCTTCAGG  400
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTTCCGACAGACACTCATCCCGGCCTCGTGTCTCCACTGTCTGCTTCAGG  400

seq1  ACTGGTTGCATACACATCCTCACATACTGAACAGTGAACCAAGTAGCAAG  450
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACTGGTTGCATACACATCCTCACATACTGAACAGTGAACCAAGTAGCAAG  450

seq1  CCAAGGCAAAGCCCAGAGTTCTTCTAGCAGATAGTGTATGCCTTCTGTAT  500
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCAAGGCAAAGCCCAGAGTTCTTCTAGCAGATAGTGTATGCCTTCTGTAT  500

seq1  GCTGTGATACATACATACATACAGGTAAAGTGGGATCTAGCTAGGAATGT  550
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GCTGTGATACATACATACATACAGGTAAAGTGGGATCTAGCTAGGAATGT  550

seq1  CACTTATCACCCCTCCTGAGGGAAAGACATTTCTTTAAAGTGTGTTCAAC  600
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CACTTATCACCCCTCCTGAGGGAAAGACATTTCTTTAAAGTGTGTTCAAC  600

seq1  TGCCCAAGGATACCTTTTAAAAAAATTAACCTTAACAAAACACACACTCA  650
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGCCCAAGGATACCTTTTAAAAAAATTAACCTTAACAAAACACACACTCA  650

seq1  ACTAAATTCAATGCCCCAGAAATGAAGCAAGTCTGTCTTCTACCCATTGC  700
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACTAAATTCAATGCCCCAGAAATGAAGCAAGTCTGTCTTCTACCCATTGC  700

seq1  TTCTGCATCTCCCTGTTAGCATTGACATTAGGTTCATAACAAGCCTCAGG  750
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTCTGCATCTCCCTGTTAGCATTGACATTAGGTTCATAACAAGCCTCAGG  750

seq1  TTCGTCCGTGCTTAGTGATCCTCAGCAGCACTAGGTGCTGTGCTGGGTTC  800
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTCGTCCGTGCTTAGTGATCCTCAGCAGCACTAGGTGCTGTGCTGGGTTC  800

seq1  TCCTGGGTGCTATGCTGGGTTATCTATGCCTTTTTACTTATCTTACTTAA  850
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCCTGGGTGCTATGCTGGGTTATCTATGCCTTTTTACTTATCTTACTTAA  850

seq1  TTTAATCTAGTAGATCAATGGGCTAGGATGTAGTTCAGTGGTAAAGCATT  900
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTTAATCTAGTAGATCAATGGGCTAGGATGTAGTTCAGTGGTAAAGCATT  900

seq1  GATCTAGCATGCATAGAGCTTGAGTTGAGAGAGAGACAGACAGACAGAGA  950
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GATCTAGCATGCATAGAGCTTGAGTTGAGAGAGAGACAGACAGACAGAGA  950

seq1  GACAGAGACAGAGGGAGAGGGGACGAGGGAGAGGAAAAGGGAGAAGAAGA  1000
      |||||||| ||| ||||| |||||||||||||| |||| |||||   |||
seq2  GACAGAGATAGATGGAGA-GGGACGAGGGAGAGTAAAA-GGAGA--GAGA  996

seq1  GGGAGACTGATTTTGAAACTCAGAAAATTTGACTCATTTAAAACCTGTCT  1050
       |||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||
seq2  TGGAGACTGATCTTGAAACTCAG-AAATTTGACTCATTT-AAACCTGTCT  1044

seq1  CAAACCCATTCCCAAACCCAGGTCCTTCCAGCTCACTCATGGGAGGCAGC  1100
      |||  ||||  |||| ||   |||  | |||||||||||||||| |||||
seq2  CAA--CCAT--CCAATCC--AGTC--TTCAGCTCACTCATGGGAAGCAGC  1086

seq1  TTTTCAGTATTTGAACACTCT  1121
       |||||||| |||| ||||||
seq2  -TTTCAGTA-TTGACCACTCT  1105

seq1: chr15_63693104_63693690
seq2: B6Ng01-001N24.g_67_653 (reverse)

seq1  TACCCCTCCCCCCTCTATCCATCCTTGCTTTTCACCTTGTAATTCTGTTC  50
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TACCCCTCCCCCCTCTATCCATCCTTGCTTTTCACCTTGTAATTCTGTTC  50

seq1  TATAAATCTCAGTGGGTTCGGAAGCAGAAGCGTACTTAGGTGTGCCTGGA  100
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TATAAATCTCAGTGGGTTCGGAAGCAGAAGCGTACTTAGGTGTGCCTGGA  100

seq1  AAGGTCATCTTCTTCTTAGTAGCAGAAGGGAGAATGACTGGACAGAAAAG  150
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAGGTCATCTTCTTCTTAGTAGCAGAAGGGAGAATGACTGGACAGAAAAG  150

seq1  AAACTCAAGTGAGGTGAGGTGAGGTTACACCTGCTAGAGTTCTTCCCACA  200
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAACTCAAGTGAGGTGAGGTGAGGTTACACCTGCTAGAGTTCTTCCCACA  200

seq1  TGCCATGTAGTGACTCCCAAGCCAAACACCAGGGACAACTGTCAACCTGA  250
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGCCATGTAGTGACTCCCAAGCCAAACACCAGGGACAACTGTCAACCTGA  250

seq1  GCACCAGTCTGTAAACCAGATCCTTTCACAGGTGCCCTGAAACCTGCATT  300
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GCACCAGTCTGTAAACCAGATCCTTTCACAGGTGCCCTGAAACCTGCATT  300

seq1  GTATTATGTTTGCTTACTTACTGTGTACACATGCGTGTGTGCCTTGGACA  350
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTATTATGTTTGCTTACTTACTGTGTACACATGCGTGTGTGCCTTGGACA  350

seq1  CATACAGAGGCCAGGGCCAACGTTGGAAGTCAGTTATTTTCTTCCAACAT  400
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CATACAGAGGCCAGGGCCAACGTTGGAAGTCAGTTATTTTCTTCCAACAT  400

seq1  GAGGGGCATGGAGAGAGAGCTCGTCATGAGGCCTGGTAGCAGGCACCTTC  450
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAGGGGCATGGAGAGAGAGCTCGTCATGAGGCCTGGTAGCAGGCACCTTC  450

seq1  CCCAGCTAATCCATCTCACTTGCCTGAAACTGGCATCTTAAATGAGCACT  500
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCCAGCTAATCCATCTCACTTGCCTGAAACTGGCATCTTAAATGAGCACT  500

seq1  TTAGGTGACATTACACCCTCTGACATTCAAGAATTACTCCATGAGAGCTG  550
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTAGGTGACATTACACCCTCTGACATTCAAGAATTACTCCATGAGAGCTG  550

seq1  GAGAGAGTCTTGCAGCTCTTACAAAGAATCAGAATTC  587
      |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAGAGAGTCTTGCAGCTCTTACAAAGAATCAGAATTC  587