BAC Information

Click to search

BAC

Clone NameB6Ng01-007P11
Chromosome15 (Build37)
Map Location 37,679,004 - 37,753,081
singlet/doubletdoublet
Overlap geneNcald
Upstream geneYwhaz, Zfp706, LOC670911, LOC667492, LOC100041288, Grhl2, LOC667498, 4930447A16Rik, LOC100041313
Downstream geneLOC667534, Rrm2b, LOC100041478, Edd1, Odf1, LOC382986, LOC667563, Klf10, Azin1, Siah1-ps2, Atp6v1c1
LinkOpen Mouse BAC browser



BAC End Information

BAC end BAC-end 1BAC-end 2
end nameB6Ng01-007P11.bB6Ng01-007P11.g
ACCDH844384DH844385
length866814
definitionDH844384|Mus musculus domesticus DNA, BAC clone: B6Ng01-007P11, 5' end.DH844385|Mus musculus domesticus DNA, BAC clone: B6Ng01-007P11, 3' end.
singlet/doubletdoubletdoublet
BLAST hituniqueunique
Map location.(37,679,004 - 37,679,873)(37,752,268 - 37,753,081)
sequence
gaattctttccagtctcatataagaaaggagacatgtattttataggaaa
atgggtgcgattggagatgactgaataatgagaattaagccagacccaga
actatgagtagatgctctctatttagactttaaacagacatgtaatgtca
tacatgcacatgacatgcatatagaagaaaactgcctagatgaacagtga
ggacagagcaggggctgggaggagagaggaggacctggaggcgtggccaa
agcacagtgtgcacttgagtgccagtgtcttctgtatcacaggacaatat
aaagtgcacgtcatcgcaaagtgtggaaaatggaaatgtctttactcctg
ctttgcatttgctggttttctgaagaatgtggaatacagaattccaagcc
aaaacaattgcccccaaatgctgcaggcagtaatctgctgcaggcaggga
tccgctgccgtccagactccagggctcccgccgagaagtcttgtgctgct
tggaaaactgatttctttctctccagcagctcagaagactttcttcactg
tggtataaaatttcatgatgacattaggtcatgagttcttgtcatatcca
ttggatctaatccgggtgaagaaccagcctgcctccatcttgggtttgaa
agccatcttagagtaaagacaaactaggctcatttcctggctatgataaa
acctctgtttctcaaggactgggctatgcttcacctgtgaccttaactac
aaatggttctgcctgttccagaaatggtaaccatgtagtcttagtatgat
ttaatgctgtgacagatgcccataaccaagacaagtcttataaggacacc
ttattagggctggcta
gaattcttacatggctggttggctttctctcctgcagctcttacatccac
ccttccctgagtcatggcgattctctgtcttccttctctcagttcctagc
ctacactaatccaaaggtcccacctcagtccacctgcccagccattagcc
attggctttttattgatcaatcaaaaaccaactggggacaaggaccttca
gtgtttggatatggagattctcaattttggcgtcctgattaattaaaaat
gtgaaacatttcgttcttcctatgagattgcttgtgctgacagaaaaatc
acttattaaggtaaatagagttgttggaagaagcattccatcaataggca
gaagtgacaaaagtgacaatgtggccaagagagtcttccattccccaagt
cagaatggaggcttctgaccaccatggaggacagctgtctgagacatttg
ctggaagccataggggatctcatgagagcatttgctacccagaaaacatg
gtatatccccaagccttacgaagcataaactgactaccttcatgaagaca
ttattttttagtagttcacagctttccagtgaagctgtttgtattatgaa
tgctaattatgtccccaagaaactgtttgcatgaggtctgcatgtagctt
ctgggaacctgccccccccaacctggttggttctgattggtaaataaaga
tgccaacagccaaatctggacagggcagaggtgagatttagggattcctg
ggcttgggaccaagaggaggagaagggagtgtgaaggagaggagagacgc
cattattgtgaaga
quality valuesOpen.Open.




Alignment Information

BAC End 1BAC End 2
seq1: chr15_37679004_37679873
seq2: B6Ng01-007P11.b_47_911

seq1  GAATTCTTTCCAGTCTCATATAAGAAAGGAGACATGTATTTTATAGGAAA  50
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAATTCTTTCCAGTCTCATATAAGAAAGGAGACATGTATTTTATAGGAAA  50

seq1  ATGGGTGCGATTGGAGATGACTGAATAATGAGAATTAAGCCAGACCCAGA  100
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATGGGTGCGATTGGAGATGACTGAATAATGAGAATTAAGCCAGACCCAGA  100

seq1  ACTATGAGTAGATGCTCTCTATTTAGACTTTAAACAGACATGTAATGTCA  150
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACTATGAGTAGATGCTCTCTATTTAGACTTTAAACAGACATGTAATGTCA  150

seq1  TACATGCACATGACATGCATATAGAAGAAAACTGCCTAGATGAACAGTGA  200
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TACATGCACATGACATGCATATAGAAGAAAACTGCCTAGATGAACAGTGA  200

seq1  GGACAGAGCAGGGGCTGGGAGGAGAGAGGAGGACCTGGAGGCGTGGCCAA  250
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGACAGAGCAGGGGCTGGGAGGAGAGAGGAGGACCTGGAGGCGTGGCCAA  250

seq1  AGCACAGTGTGCACTTGAGTGCCAGTGTCTTCTGTATCACAGGACAATAT  300
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGCACAGTGTGCACTTGAGTGCCAGTGTCTTCTGTATCACAGGACAATAT  300

seq1  AAAGTGCACGTCATCGCAAAGTGTGGAAAATGGAAATGTCTTTACTCCTG  350
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAAGTGCACGTCATCGCAAAGTGTGGAAAATGGAAATGTCTTTACTCCTG  350

seq1  CTTTGCATTTGCTGGTTTTCTGAAGAATGTGGAATACAGAATTCCAAGCC  400
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTTTGCATTTGCTGGTTTTCTGAAGAATGTGGAATACAGAATTCCAAGCC  400

seq1  AAAACAATTGCCCCCAAATGCTGCAGGCAGTAATCTGCTGCAGGCAGGGA  450
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAAACAATTGCCCCCAAATGCTGCAGGCAGTAATCTGCTGCAGGCAGGGA  450

seq1  TCCGCTGCCGTCCAGACTCCAGGGCTCCCGCCGAGAAGTCTTGTGCTGCT  500
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCCGCTGCCGTCCAGACTCCAGGGCTCCCGCCGAGAAGTCTTGTGCTGCT  500

seq1  TGGAAAACTGATTTCTTTCTCTCCAGCAGCTCAGAAGACTTTCTTCACTG  550
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGGAAAACTGATTTCTTTCTCTCCAGCAGCTCAGAAGACTTTCTTCACTG  550

seq1  TGGTATAAAATTTCATGATGACATTAGGTCATGAGTTCTTGTCATATCCA  600
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGGTATAAAATTTCATGATGACATTAGGTCATGAGTTCTTGTCATATCCA  600

seq1  TTGGATCTAATCCGGGTGAAGAACCAGCCTGCCTCCATCTTGGGTTTGAA  650
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTGGATCTAATCCGGGTGAAGAACCAGCCTGCCTCCATCTTGGGTTTGAA  650

seq1  AGCCATCTTAGAGTAAAGACAAACTAGGCTCA-TTCCTGGCTATGATAAA  699
      |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||
seq2  AGCCATCTTAGAGTAAAGACAAACTAGGCTCATTTCCTGGCTATGATAAA  700

seq1  ACCTCTGTTTCTCAAGGACTGGGCTATGCTTCACCTGTGACCTTAACTAC  749
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACCTCTGTTTCTCAAGGACTGGGCTATGCTTCACCTGTGACCTTAACTAC  750

seq1  AAATGGTTCTGCCTGTTCCAGGAAATGGTAACCATGTAGTCTTAGGTATG  799
      |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||
seq2  AAATGGTTCTGCCTGTTCCA-GAAATGGTAACCATGTAGTCTTA-GTATG  798

seq1  ATTTTAATGCTGTGAACAGATG-CCATAACCAAGACAAGTCTTATAAGGA  848
      | |||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||
seq2  A-TTTAATGCTGTG-ACAGATGCCCATAACCAAGACAAGTCTTATAAGGA  846

seq1  CAACCTTTAGTTAGGGCTGGCT  870
      | |||||   ||||||||||||
seq2  C-ACCTT--ATTAGGGCTGGCT  865

seq1: chr15_37752268_37753081
seq2: B6Ng01-007P11.g_73_886 (reverse)

seq1  TCTTCACAGTTATGGCGTCTCTCCTCTCCTTCACACTCCCTTCTCCTCCT  50
      |||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCTTCACAATAATGGCGTCTCTCCTCTCCTTCACACTCCCTTCTCCTCCT  50

seq1  CTTGGTCCCAAGCCCAGGAATCCTAAAATCTCACCTCTGCCCTGTCCAGA  100
      |||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||
seq2  CTTGGTCCCAAGCCCAGGAATCCCTAAATCTCACCTCTGCCCTGTCCAGA  100

seq1  TTTGGCTGTTGGCATCTTTATTTACCAATCAGAACCAACCAGGTTGGGGG  150
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTTGGCTGTTGGCATCTTTATTTACCAATCAGAACCAACCAGGTTGGGGG  150

seq1  GGGCAGGTTCCCAGAAGCTACATGCAGACCTCATGCAAACAGTTTCTTGG  200
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGGCAGGTTCCCAGAAGCTACATGCAGACCTCATGCAAACAGTTTCTTGG  200

seq1  GGACATAATTAGCATTCATAATACAAACAGCTTCACTGGAAAGCTGTGAA  250
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGACATAATTAGCATTCATAATACAAACAGCTTCACTGGAAAGCTGTGAA  250

seq1  CTACTAAAAAATAATGTCTTCATGAAGGTAGTCAGTTTATGCTTCGTAAG  300
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTACTAAAAAATAATGTCTTCATGAAGGTAGTCAGTTTATGCTTCGTAAG  300

seq1  GCTTGGGGATATACCATGTTTTCTGGGTAGCAAATGCTCTCATGAGATCC  350
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GCTTGGGGATATACCATGTTTTCTGGGTAGCAAATGCTCTCATGAGATCC  350

seq1  CCTATGGCTTCCAGCAAATGTCTCAGACAGCTGTCCTCCATGGTGGTCAG  400
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCTATGGCTTCCAGCAAATGTCTCAGACAGCTGTCCTCCATGGTGGTCAG  400

seq1  AAGCCTCCATTCTGACTTGGGGAATGGAAGACTCTCTTGGCCACATTGTC  450
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAGCCTCCATTCTGACTTGGGGAATGGAAGACTCTCTTGGCCACATTGTC  450

seq1  ACTTTTGTCACTTCTGCCTATTGATGGAATGCTTCTTCCAACAACTCTAT  500
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACTTTTGTCACTTCTGCCTATTGATGGAATGCTTCTTCCAACAACTCTAT  500

seq1  TTACCTTAATAAGTGATTTTTCTGTCAGCACAAGCAATCTCATAGGAAGA  550
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTACCTTAATAAGTGATTTTTCTGTCAGCACAAGCAATCTCATAGGAAGA  550

seq1  ACGAAATGTTTCACATTTTTAATTAATCAGGACGCCAAAATTGAGAATCT  600
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACGAAATGTTTCACATTTTTAATTAATCAGGACGCCAAAATTGAGAATCT  600

seq1  CCATATCCAAACACTGAAGGTCCTTGTCCCCAGTTGGTTTTTGATTGATC  650
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCATATCCAAACACTGAAGGTCCTTGTCCCCAGTTGGTTTTTGATTGATC  650

seq1  AATAAAAAGCCAATGGCTAATGGCTGGGCAGGTGGACTGAGGTGGGACCT  700
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AATAAAAAGCCAATGGCTAATGGCTGGGCAGGTGGACTGAGGTGGGACCT  700

seq1  TTGGATTAGTGTAGGCTAGGAACTGAGAGAAGGAAGACAGAGAATCGCCA  750
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTGGATTAGTGTAGGCTAGGAACTGAGAGAAGGAAGACAGAGAATCGCCA  750

seq1  TGACTCAGGGAAGGGTGGATGTAAGAGCTGCAGGAGAGAAAGCCAACCAG  800
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGACTCAGGGAAGGGTGGATGTAAGAGCTGCAGGAGAGAAAGCCAACCAG  800

seq1  CCATGTAAGAATTC  814
      ||||||||||||||
seq2  CCATGTAAGAATTC  814