BAC Information

Click to search

BAC

Clone NameB6Ng01-010B07
Chromosome15 (Build37)
Map Location 66,814,886 - 66,977,354
singlet/doubletdoublet
Overlap geneLOC100040667, St3gal1
Upstream geneKcnq3, Lrrc6, LOC100040860, Tmem71, LOC100040881, Phf20l1, Tg, Sla, Wisp1, Ndrg1
Downstream geneZfat1
LinkOpen Mouse BAC browser



BAC End Information

BAC end BAC-end 1BAC-end 2
end nameB6Ng01-010B07.bB6Ng01-010B07.g
ACCDH845853DH845854
length1,0051,121
definitionDH845853|Mus musculus domesticus DNA, BAC clone: B6Ng01-010B07, 5' end.DH845854|Mus musculus domesticus DNA, BAC clone: B6Ng01-010B07, 3' end.
singlet/doubletdoubletdoublet
BLAST hituniqueunique
Map location.(66,814,886 - 66,815,904)(66,976,240 - 66,977,354)
sequence
gaattctatctagactgactcagagtgattccttagtaagctcttcaggg
tgggaaggcagatcaaaacaaaatactttatcccgttaaacagaggtgaa
gggcagttcctgattcaggggcagttttatttccagccagttaaggttga
agaagaagcctatagaagatgagatgggtacatgagggaaggaagtgtat
ggaaatcacttcctggagtaggaggtctagaccactgtgttctcagagat
cgttccttccttccttccatagggacattattatgggtggagtctctgct
gtccaggggtctctgaaggctttctgggacatcgcatggtcagttcattt
tctgttctaaggtctgctctgccagaaggaggctcttggagaaaaacctc
ctggtcaggagaatgtccctacaccctccttggccagcgtgtttggtagc
tctgtcagcttgagtcatcagcctcgagtcacctgagaatagcctcaaag
agggattgtttatattgtgttgacttgtgggcatgtctgggaggatctta
actaagttaattgatgtgatgtaggaggacccagtccactatgggaggcc
tcactccctagatagaaggtcctaaactctagaaacgtggagaaattgag
caacgcataggcaaacaggcaagcaacatacctgtgttcatttctctctg
atcttgactgtggatgttatgaacagctgtctcagctttctgcagctgtg
acttctcccagtgatacagaagtgggaactgtgacctggaaaagggagtt
gaaataaactctttctcccttaagttgcttgctgtctggatattttatca
tggcagcagactgtatcagtcagactacatgtcatagagtcttagtaatg
tggcttgaaatggctgcctctagcctccagatggctatggaaaaaccatc
ttttctgggacccccagatttgacgcatcctctcccaatttcagatggcc
tctta
gaattcaggggcttccaagattccagcatctggtggaatccaaatagctt
tggctcttctaaatgtcctgaagtccagaagaacttcctagcataagcca
cacttcatcagctacccatgacttagatgtgagaatgagccagggaaggg
agggtcatacacacacacacacacacacacacacacacacacacagagag
agagagagagtgccccagggatgggtttgcatgtggcaggaaaggcatct
tcggggaaattcctcacccagctgcaatgtacacacccagctgctgaagt
ttttcctatgcctcacttcctttttctataaactgacataacaagaccta
catgaaggatgattttaagagttaacaagttaatagaataaaactccaag
gggcaagtagatcagaaaggctacagaacatgcatgtgtgcatgtatttc
tatacacatattcaccttgtatgcatgcatagatgtgcatgtacttactt
cattcatgtgatgcatatatgtatgtccacaaaagcactgggtcatatgc
actgcattttaccattgtgttatgtgtatcatatgcatttataaatacat
taaatgtcctgtgcacatactaaagccattttaaacaaaccccactggtc
actccagcaattcacttgcttcttatttctgagacttagagtatttagta
accagttcctcctgcctctgtacccagattgagagacacaggggacagaa
ccaccagtatgttccgaggtacaaaatgtacagaatgtaattgcaaaggt
ggggtacacatgagtgacccagctgctaagagccacctgctctcctctga
tttcctgaagtctcctcttttaggctggtgacagctgtgagtttgtctcc
tgcattgtgctgctgtttctgcagcaccaggatacctaagaaatcaatct
caggaaatcccaggtccagctcagagcctcacgggagtctcagctaggaa
catttcctcaggactctctgcctgaatggccagagtgtggagctgaccaa
ggtgcaagtgtttctacctatgagactcttaagacttgaacatcaatctg
gccttcctgtttcagaacata
quality valuesOpen.Open.




Alignment Information

BAC End 1BAC End 2
seq1: chr15_66814886_66815904
seq2: B6Ng01-010B07.b_44_1048

seq1  GAATTCTATCTAGACTGACTCAGAGTGATTCCTTAGTAAGCTCTTCAGGG  50
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAATTCTATCTAGACTGACTCAGAGTGATTCCTTAGTAAGCTCTTCAGGG  50

seq1  TGGGAAGGCAGATCAAAACAAAATACTTTATCCCGTTAAACAGAGGTGAA  100
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGGGAAGGCAGATCAAAACAAAATACTTTATCCCGTTAAACAGAGGTGAA  100

seq1  GGGCAGTTCCTGATTCAGGGGCAGTTTTATTTCCAGCCAGTTAAGGTTGA  150
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGGCAGTTCCTGATTCAGGGGCAGTTTTATTTCCAGCCAGTTAAGGTTGA  150

seq1  AGAAGAAGCCTATAGAAGATGAGATGGGTACATGAGGGAAGGAAGTGTAT  200
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGAAGAAGCCTATAGAAGATGAGATGGGTACATGAGGGAAGGAAGTGTAT  200

seq1  GGAAATCACTTCCTGGAGTAGGAGGTCTAGACCACTGTGTTCTCAGAGAT  250
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGAAATCACTTCCTGGAGTAGGAGGTCTAGACCACTGTGTTCTCAGAGAT  250

seq1  CGTTCCTTCCTTCCTTCCATAGGGACATTATTATGGGTGGAGTCTCTGCT  300
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CGTTCCTTCCTTCCTTCCATAGGGACATTATTATGGGTGGAGTCTCTGCT  300

seq1  GTCCAGGGGTCTCTGAAGGCTTTCTGGGACATCGCATGGTCAGTTCATTT  350
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTCCAGGGGTCTCTGAAGGCTTTCTGGGACATCGCATGGTCAGTTCATTT  350

seq1  TCTGTTCTAAGGTCTGCTCTGCCAGAAGGAGGCTCTTGGAGAAAAACCTC  400
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCTGTTCTAAGGTCTGCTCTGCCAGAAGGAGGCTCTTGGAGAAAAACCTC  400

seq1  CTGGTCAGGAGAATGTCCCTACACCCTCCTTGGCCAGCGTGTTTGGTAGC  450
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTGGTCAGGAGAATGTCCCTACACCCTCCTTGGCCAGCGTGTTTGGTAGC  450

seq1  TCTGTCAGCTTGAGTCATCAGCCTCGAGTCACCTGAGAATAGCCTCAAAG  500
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCTGTCAGCTTGAGTCATCAGCCTCGAGTCACCTGAGAATAGCCTCAAAG  500

seq1  AGGGATTGTTTATATTGTGTTGACTTGTGGGCATGTCTGGGAGGATCTTA  550
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGGGATTGTTTATATTGTGTTGACTTGTGGGCATGTCTGGGAGGATCTTA  550

seq1  ACTAAGTTAATTGATGTGATGTAGGAGGACCCAGTCCACTATGGGAGGCC  600
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACTAAGTTAATTGATGTGATGTAGGAGGACCCAGTCCACTATGGGAGGCC  600

seq1  TCACTCCCTAGATAGAAGGTCCTAAACTCTAGAAACGTGGAGAAATTGAG  650
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCACTCCCTAGATAGAAGGTCCTAAACTCTAGAAACGTGGAGAAATTGAG  650

seq1  CAACGCATAGGCAAACAGGCAAGCAACATACCTGTGTTCATTTCTCTCTG  700
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CAACGCATAGGCAAACAGGCAAGCAACATACCTGTGTTCATTTCTCTCTG  700

seq1  ATCTTGACTGTGGATGTTATGAACAGCTGTCTCAGCTTTCTGCAGCTGTG  750
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATCTTGACTGTGGATGTTATGAACAGCTGTCTCAGCTTTCTGCAGCTGTG  750

seq1  ACTTCTCCCAGTGATACAGAAGTGGGAACTGTGACCTGGAAAAGGGAGTT  800
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACTTCTCCCAGTGATACAGAAGTGGGAACTGTGACCTGGAAAAGGGAGTT  800

seq1  GAAATAAACTCTTTCTCCCTTAAGTTGCTTGCTGTCTGGATATTTTATCA  850
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAAATAAACTCTTTCTCCCTTAAGTTGCTTGCTGTCTGGATATTTTATCA  850

seq1  TGGCAGCAGACTGTATCAGTCAGACTACATGTCATAGAGTCTTAGTAAAT  900
      |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||
seq2  TGGCAGCAGACTGTATCAGTCAGACTACATGTCATAGAGTCTTAGT-AAT  899

seq1  GTTGGCTTGAAATGGCTGCCTCTAGCCTCCAGCATGGCTCATGGCAAAAA  950
      | |||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||  ||||
seq2  G-TGGCTTGAAATGGCTGCCTCTAGCCTCCAG-ATGGCT-ATGG--AAAA  944

seq1  CCCATCTTCTCTGGGAACCCCCCAGATTTGGACGCAATCCTCTTCCACGA  1000
       ||||||| |||||||  ||||||||||| ||||| ||||||| |||  |
seq2  ACCATCTTTTCTGGGA--CCCCCAGATTT-GACGC-ATCCTCTCCCA--A  988

seq1  TTTCCAGATGGCCCTCTTA  1019
      ||| ||||||| |||||||
seq2  TTT-CAGATGG-CCTCTTA  1005

seq1: chr15_66976240_66977354
seq2: B6Ng01-010B07.g_66_1186 (reverse)

seq1  TATG-TCTG-AACAGGAAGGCCAGATTGGTG-TCAGGTCCTAAAGAGTCT  47
      |||| |||| |||||||||||||||||| || ||| || || ||||||||
seq2  TATGTTCTGAAACAGGAAGGCCAGATTGATGTTCAAGT-CTTAAGAGTCT  49

seq1  CATGGGTAGAGACACTTGCACCTTGGTTCAGCT-CACACTCTGGGCATTC  96
      ||| |||||| ||||||||||||||| |||||| |||||||||| |||||
seq2  CATAGGTAGAAACACTTGCACCTTGG-TCAGCTCCACACTCTGGCCATTC  98

seq1  AGGCAGAGAGTCCTGAGGGAAAATGTTCCTAGCTGAGACT-CCGTG-GGC  144
      ||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||| ||||| |||
seq2  AGGCAGAGAGTCCTGAGG--AAATGTTCCTAGCTGAGACTCCCGTGAGGC  146

seq1  TCTGGGCTGGACCTGGGGTTTCCTGAG-TTGATTTC-TAGGTATCCTGGT  192
      |||| |||||||||||| ||||||||| |||||||| |||||||||||||
seq2  TCTGAGCTGGACCTGGGATTTCCTGAGATTGATTTCTTAGGTATCCTGGT  196

seq1  GCTGCAGAAACAGCAGCACAATGCAGGAGACAAACTCACAGCTGTCACCA  242
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GCTGCAGAAACAGCAGCACAATGCAGGAGACAAACTCACAGCTGTCACCA  246

seq1  GCCT-AAAGAGG-GACTTCAGGAAATCAGAGGAGAGCAGGTGGCTCTTAG  290
      |||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GCCTAAAAGAGGAGACTTCAGGAAATCAGAGGAGAGCAGGTGGCTCTTAG  296

seq1  CAGCT-GGTCACTCATGTGTACCCCACCTTTGCAATTACATTCTGTACAT  339
      ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CAGCTGGGTCACTCATGTGTACCCCACCTTTGCAATTACATTCTGTACAT  346

seq1  TTTGTACCTCGGAACATACTGGTGGTTCTGTCCCCCTGTGTCTCTCAATC  389
      ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||
seq2  TTTGTACCTCGGAACATACTGGTGGTTCTGT-CCCCTGTGTCTCTCAATC  395

seq1  TGGGTACAGAGGCAGGAGGAACTGGTTACTAAATACTCTAAGTCTCAGAA  439
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGGGTACAGAGGCAGGAGGAACTGGTTACTAAATACTCTAAGTCTCAGAA  445

seq1  ATAAGAAGCAAGTGAATTGCTGGAGTGACCAGTGGGGTTTGTTTAAAATG  489
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATAAGAAGCAAGTGAATTGCTGGAGTGACCAGTGGGGTTTGTTTAAAATG  495

seq1  GCTTTAGTATGTGCACAGGACATTTAATGTATTTATAAATGCATATGATA  539
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GCTTTAGTATGTGCACAGGACATTTAATGTATTTATAAATGCATATGATA  545

seq1  CACATAACACAATGGTAAAATGCAGTGCATATGACCCAGTGCTTTTGTGG  589
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CACATAACACAATGGTAAAATGCAGTGCATATGACCCAGTGCTTTTGTGG  595

seq1  ACATACATATATGCATCACATGAATGAAGTAAGTACATGCACATCTATGC  639
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACATACATATATGCATCACATGAATGAAGTAAGTACATGCACATCTATGC  645

seq1  ATGCATACAAGGTGAATATGTGTATAGAAATACATGCACACATGCATGTT  689
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATGCATACAAGGTGAATATGTGTATAGAAATACATGCACACATGCATGTT  695

seq1  CTGTAGCCTTTCTGATCTACTTGCCCCTTGGAGTTTTATTCTATTAACTT  739
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTGTAGCCTTTCTGATCTACTTGCCCCTTGGAGTTTTATTCTATTAACTT  745

seq1  GTTAACTCTTAAAATCATCCTTCATGTAGGTCTTGTTATGTCAGTTTATA  789
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTTAACTCTTAAAATCATCCTTCATGTAGGTCTTGTTATGTCAGTTTATA  795

seq1  GAAAAAGGAAGTGAGGCATAGGAAAAACTTCAGCAGCTGGGTGTGTACAT  839
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAAAAAGGAAGTGAGGCATAGGAAAAACTTCAGCAGCTGGGTGTGTACAT  845

seq1  TGCAGCTGGGTGAGGAATTTCCCCGAAGATGCCTTTCCTGCCACATGCAA  889
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGCAGCTGGGTGAGGAATTTCCCCGAAGATGCCTTTCCTGCCACATGCAA  895

seq1  ACCCATCCCTGGGGCACTCTCTCTCTCTCTCTGTGTGTGTGTGTGTGTGT  939
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACCCATCCCTGGGGCACTCTCTCTCTCTCTCTGTGTGTGTGTGTGTGTGT  945

seq1  GTGTGTGTGTGTGTGTGTATGACCCTCCCTTCCCTGGCTCATTCTCACAT  989
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTGTGTGTGTGTGTGTGTATGACCCTCCCTTCCCTGGCTCATTCTCACAT  995

seq1  CTAAGTCATGGGTAGCTGATGAAGTGTGGCTTATGCTAGGAAGTTCTTCT  1039
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTAAGTCATGGGTAGCTGATGAAGTGTGGCTTATGCTAGGAAGTTCTTCT  1045

seq1  GGACTTCAGGACATTTAGAAGAGCCAAAGCTATTTGGATTCCACCAGATG  1089
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGACTTCAGGACATTTAGAAGAGCCAAAGCTATTTGGATTCCACCAGATG  1095

seq1  CTGGAATCTTGGAAGCCCCTGAATTC  1115
      ||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTGGAATCTTGGAAGCCCCTGAATTC  1121