BAC Information

Click to search

BAC

Clone NameB6Ng01-016O20
Chromosome15 (Build37)
Map Location 60,509,098 - 60,646,452
singlet/doubletdoublet
Overlap geneEG632412, LOC100040311
Upstream geneLOC665602, EG632248, LOC665613, 4933412E24Rik, LOC100040266, LOC623048, LOC211832, LOC623094
Downstream geneD330050I23Rik, 9930014A18Rik, A1bg, LOC100040323
LinkOpen Mouse BAC browser



BAC End Information

BAC end BAC-end 1BAC-end 2
end nameB6Ng01-016O20.bB6Ng01-016O20.g
ACCDH850753DH850754
length1,026816
definitionDH850753|Mus musculus domesticus DNA, BAC clone: B6Ng01-016O20, 5' end.DH850754|Mus musculus domesticus DNA, BAC clone: B6Ng01-016O20, 3' end.
singlet/doubletdoubletdoublet
BLAST hituniqueunique
Map location.(60,645,430 - 60,646,452)(60,509,098 - 60,509,908)
sequence
gaattcttgtgtaccacagagcctagctttgagcatcactgtggtgcctt
gtgttgtcactcggatgcatcattatctctttggcccacagtttgcatca
tgactcactcagtttggtgctttctacaaacattgacagctgtacccacc
attacagctttcaccacagcctctcttcctgcatctctgggctgaggctg
aactgttttcagctgtccttatccagtcttaagagtaacttccctgtacg
ccaccctgcttccctctgtgggcccaatgacattgctagcaagagcggct
ttcatccattctttaggaattcatgaggcctgccaggctggagatagcag
gaggatagagagaggatggtctaggtgcatgcccacattccatgcaagaa
gacaggcaggctataccaagtgataaaggccagacagactccaggcatag
gaggagcagtaccacccttgttgggggaagattcctggagaagcttttta
gggagggtttaaggagtggagatcttatcagttaacagctcagttctggt
ctgttctctttaatcctgagtaataattttgtgtggctagtgaagaagga
agatggacataacaaataagcactatgattccttgtaactcccccccccc
accatatggatatgctgatatggatattagccacctggggttatatatta
ttatgtataacccacattataggtcatctcacacacttatattcatgcac
acccatacttagacattatgacaaactgcactggtcttcattttactaca
ctagaagcatctcttttctgaagaccttaactcagcttgccttgaaaata
tcactgttggtccagtacagtgaggattccaggccttctctgtcttgaag
gagctgagaggtattacagaaggtgcagcttggtggtggtcacctcagta
cccccactttgttggtccacgtaggcacatgagtcatcatttgcaaaatg
taagtaacagatcagcttgcaagcaa
gaattctttttaccgaagtctatgactcaaattaaaccttcaatcaccag
aagttgtaaatcagccattggagggttttatcagatcagctgagatttaa
ctacaggtgcaaagataaggctgagagacttagctctgggcagctcctga
ctgaatgtgagagacttgtgtataaacaaacagtggcagtgggctttgat
gagaccacagtccccagaataactcccctctgtacccaaggaggccatga
cagagttgagtctggaaaaagaaaaaaagtagacagctgccacgcaccta
tactgaaaggagaaacactggcagatggcaaagtgggtacagttctggct
caaggtgaacaaggatgtctgatttgaagcgtagtaggggaagtgggaga
acgtgagataaataagtgtgagtcctgggtatgtagtgtgagatcaaacc
aggaaaaattatctttcaggttaagagttctgttggcaattaaaaagaag
tccctgtttgtcctatgtttgtttgacccatctatattggatgtacttga
tcaattgtaggtgggaggtacatgggcaggaaatacatccggaagtacac
ttgtccctgattggatgtaggcaggagatacataggcaggaaacaggtca
ggatatatgcttgcctttgactgaccggatgaaaaatactgtgggctttg
tggggttgtctttttaggcctctgtatggtgtgactcatggtttcttggg
aattcagagatgggactagagatggacgtggtcagtatttaaattaaagc
ttggcttcaaatttgg
quality valuesOpen.Open.




Alignment Information

BAC End 1BAC End 2
seq1: chr15_60645430_60646452
seq2: B6Ng01-016O20.b_46_1071 (reverse)

seq1  TTGCTTGGCAGCTGATCTGTTACTTACATTTTGCAAATGATGACTCATGT  50
      |||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTGCTTGCAAGCTGATCTGTTACTTACATTTTGCAAATGATGACTCATGT  50

seq1  GCCTACGTGGACCAACAAAGT-GGGGTACTGAGGTGA-CACC-CCAAGCT  97
      ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||| |||||||
seq2  GCCTACGTGGACCAACAAAGTGGGGGTACTGAGGTGACCACCACCAAGCT  100

seq1  GCACCTTCTGTAATACCTCTCAGCTCCTTCAAGACAGAGAAGGCCTGGAA  147
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GCACCTTCTGTAATACCTCTCAGCTCCTTCAAGACAGAGAAGGCCTGGAA  150

seq1  TCCTCACTGTACTGGACCAACAGTGATATTTTCAAGGCAAGCTGAGTTAA  197
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCCTCACTGTACTGGACCAACAGTGATATTTTCAAGGCAAGCTGAGTTAA  200

seq1  GGTCTTCAGAAAAGAGATTGCTTCTAGTGTAGTAAAATGAAGACCAGTGC  247
      ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGTCTTCAGAAAAGAGA-TGCTTCTAGTGTAGTAAAATGAAGACCAGTGC  249

seq1  AGTTTGTCATAATGTCTAAGTATGGGTGTGCATGAATATAAGTGTGTGAG  297
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGTTTGTCATAATGTCTAAGTATGGGTGTGCATGAATATAAGTGTGTGAG  299

seq1  ATGACCTATAATGTGGGTTATACATAATAATATATAA-CCCAGGTGGCTA  346
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||
seq2  ATGACCTATAATGTGGGTTATACATAATAATATATAACCCCAGGTGGCTA  349

seq1  ATATCCATATCAGCATATCCATATGGTGGGGGGGGGGAGTTACAAGGAAT  396
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATATCCATATCAGCATATCCATATGGTGGGGGGGGGGAGTTACAAGGAAT  399

seq1  CATAGTGCTTATTTGTTATGTCCATCTTCCTTCTTCACTAGCCACACAAA  446
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CATAGTGCTTATTTGTTATGTCCATCTTCCTTCTTCACTAGCCACACAAA  449

seq1  ATTATTACTCAGGATTAAAGAGAACAGACCAGAACTGAGCTGTTAACTGA  496
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATTATTACTCAGGATTAAAGAGAACAGACCAGAACTGAGCTGTTAACTGA  499

seq1  TAAGATCTCCACTCCTTAAACCCTCCCTAAAAAGCTTCTCCAGGAATCTT  546
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TAAGATCTCCACTCCTTAAACCCTCCCTAAAAAGCTTCTCCAGGAATCTT  549

seq1  CCCCCAACAAGGGTGGTACTGCTCCTCCTATGCCTGGAGTCTGTCTGGCC  596
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCCCCAACAAGGGTGGTACTGCTCCTCCTATGCCTGGAGTCTGTCTGGCC  599

seq1  TTTATCACTTGGTATAGCCTGCCTGTCTTCTTGCATGGAATGTGGGCATG  646
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTTATCACTTGGTATAGCCTGCCTGTCTTCTTGCATGGAATGTGGGCATG  649

seq1  CACCTAGACCATCCTCTCTCTATCCTCCTGCTATCTCCAGCCTGGCAGGC  696
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CACCTAGACCATCCTCTCTCTATCCTCCTGCTATCTCCAGCCTGGCAGGC  699

seq1  CTCATGAATTCCTAAAGAATGGATGAAAGCCGCTCTTGCTAGCAATGTCA  746
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTCATGAATTCCTAAAGAATGGATGAAAGCCGCTCTTGCTAGCAATGTCA  749

seq1  TTGGGCCCACAGAGGGAAGCAGGGTGGCGTACAGGGAAGTTACTCTTAAG  796
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTGGGCCCACAGAGGGAAGCAGGGTGGCGTACAGGGAAGTTACTCTTAAG  799

seq1  ACTGGATAAGGACAGCTGAAAACAGTTCAGCCTCAGCCCAGAGATGCAGG  846
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACTGGATAAGGACAGCTGAAAACAGTTCAGCCTCAGCCCAGAGATGCAGG  849

seq1  AAGAGAGGCTGTGGTGAAAGCTGTAATGGTGGGTACAGCTGTCAATGTTT  896
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAGAGAGGCTGTGGTGAAAGCTGTAATGGTGGGTACAGCTGTCAATGTTT  899

seq1  GTAGAAAGCACCAAACTGAGTGAGTCATGATGCAAACTGTGGGCCAAAGA  946
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTAGAAAGCACCAAACTGAGTGAGTCATGATGCAAACTGTGGGCCAAAGA  949

seq1  GATAATGATGCATCCGAGTGACAACACAAGGCACCACAGTGATGCTCAAA  996
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GATAATGATGCATCCGAGTGACAACACAAGGCACCACAGTGATGCTCAAA  999

seq1  GCTAGGCTCTGTGGTACACAAGAATTC  1023
      |||||||||||||||||||||||||||
seq2  GCTAGGCTCTGTGGTACACAAGAATTC  1026

seq1: chr15_60509098_60509908
seq2: B6Ng01-016O20.g_69_884

seq1  GAATTCTTTTTACCGAAGTCTATGACTCAAATTAAACCTTCAATCACCAG  50
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAATTCTTTTTACCGAAGTCTATGACTCAAATTAAACCTTCAATCACCAG  50

seq1  AAGTTGTAAATCAGCCATTGGAGGGTTTTATCAGATCAGCTGAGATTTAA  100
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAGTTGTAAATCAGCCATTGGAGGGTTTTATCAGATCAGCTGAGATTTAA  100

seq1  CTACAGGTGCAAAGATAAGGCTGAGAGACTTAGCTCTGGGCAGCTCCTGA  150
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTACAGGTGCAAAGATAAGGCTGAGAGACTTAGCTCTGGGCAGCTCCTGA  150

seq1  CTGAATGTGAGAGACTTGTGTATAAACAAACAGTGGCAGTGGGCTTTGAT  200
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTGAATGTGAGAGACTTGTGTATAAACAAACAGTGGCAGTGGGCTTTGAT  200

seq1  GAGACCACAGTCCCCAGAATAACTCCCCTCTGTACCCAAGGAGGCCATGA  250
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAGACCACAGTCCCCAGAATAACTCCCCTCTGTACCCAAGGAGGCCATGA  250

seq1  CAGAGTTGAGTCTGGAAAAAGAAAAAAAGTAGACAGCTGCCACGCACCTA  300
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CAGAGTTGAGTCTGGAAAAAGAAAAAAAGTAGACAGCTGCCACGCACCTA  300

seq1  TACTGAAAGGAGAAACACTGGCAGATGGCAAAGTGGGTACAGTTCTGGCT  350
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TACTGAAAGGAGAAACACTGGCAGATGGCAAAGTGGGTACAGTTCTGGCT  350

seq1  CAAGGTGAACAAGGATGTCTGATTTGAAGCGTAGTAGGGGAAGTGGGAGA  400
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CAAGGTGAACAAGGATGTCTGATTTGAAGCGTAGTAGGGGAAGTGGGAGA  400

seq1  ACGTGAGATAAATAAGTGTGAGTCCTGGGTATGTAGTGTGAGATCAAACC  450
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACGTGAGATAAATAAGTGTGAGTCCTGGGTATGTAGTGTGAGATCAAACC  450

seq1  AGGAAAAATTATCTTTCAGGTTAAGAGTTCTGTTGGCAATTAAAAAGAAG  500
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGGAAAAATTATCTTTCAGGTTAAGAGTTCTGTTGGCAATTAAAAAGAAG  500

seq1  TCCCTGTTTGTCCTATGTTTGTTTGACCCATCTATATTGGATGTACTTGA  550
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCCCTGTTTGTCCTATGTTTGTTTGACCCATCTATATTGGATGTACTTGA  550

seq1  TCAATTGTAGGTGGGAGGTACATGGGCAGGAAATACATCCGGAAGTACAC  600
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCAATTGTAGGTGGGAGGTACATGGGCAGGAAATACATCCGGAAGTACAC  600

seq1  TTGTCCCTGATTGGATGTAGGCAGGAGATACATAGGCAGGAAACAGGTCA  650
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTGTCCCTGATTGGATGTAGGCAGGAGATACATAGGCAGGAAACAGGTCA  650

seq1  GGATATATGCTTGCCTTTGACTGACCGGATGAAAAATACTGT-GGCTTTG  699
      |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||
seq2  GGATATATGCTTGCCTTTGACTGACCGGATGAAAAATACTGTGGGCTTTG  700

seq1  TGGGGTTGTCTTTTTAGGCCTCTGTATGGTGTGACTCATGGTTTC-TGGG  748
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||
seq2  TGGGGTTGTCTTTTTAGGCCTCTGTATGGTGTGACTCATGGTTTCTTGGG  750

seq1  AATTCAGAGAT-GGACTAGAGATGGACGTGGTCAGTATTT-AATTAAAGC  796
      ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||
seq2  AATTCAGAGATGGGACTAGAGATGGACGTGGTCAGTATTTAAATTAAAGC  800

seq1  TT-GCTTCAAATTTGG  811
      || |||||||||||||
seq2  TTGGCTTCAAATTTGG  816