BAC Information

Click to search

BAC

Clone NameB6Ng01-019J05
Chromosome15 (Build37)
Map Location 61,577,105 - 61,712,866
singlet/doubletdoublet
Overlap genenone
Upstream geneEG632412, LOC100040311, D330050I23Rik, 9930014A18Rik, A1bg, LOC100040323
Downstream geneMyc, Pvt1, LOC100040584, H2afy3
LinkOpen Mouse BAC browser



BAC End Information

BAC end BAC-end 1BAC-end 2
end nameB6Ng01-019J05.bB6Ng01-019J05.g
ACCDH852623DH852624
length1,104871
definitionDH852623|Mus musculus domesticus DNA, BAC clone: B6Ng01-019J05, 5' end.DH852624|Mus musculus domesticus DNA, BAC clone: B6Ng01-019J05, 3' end.
singlet/doubletdoubletdoublet
BLAST hituniqueunique
Map location.(61,711,855 - 61,712,866)(61,577,105 - 61,577,976)
sequence
gaattccacaacctctccaccccgctcactaggttcccactggcagatgt
taccacgctaactccgtgcttcaaatgcctcactgcctttgtggtgcaca
tcaggcaaacccatgctttgttgttgtacctttctctcttgaacccagac
tagctgccatgtgaaggaaaatgcaacacaaacttagttcagaaacaatg
gtaactcaatagctgggcacaacaactaaaaacctgagttgtaagcccta
ttaaatctaaatcctggtggatccaccattgaaactgggagacacttgta
agtacatcttgttctcacgctatccctgtccaaaaggacctaattctctc
ctgcttcctctcttccactctcaacctggaagtcctgcctacttgcccag
tgattggctcctttattcattaggggattcgatcacaagaagtcacctga
atatgactcactccttgtcagcaacccctcccaggagagtggaattagca
tcaacaaacacagtaccaggcccatccataacagtctagcccctattgta
taatccatttaataaatcccttttaatagcatatattcattctatcagtt
cctatacatagccctaatcctgagtctaagacaaagataatatacgcgac
acccaaggtccctctctccaagactcgtagccttaaatagaataattcat
tgcttagcaaagcagtggttggtggttgacattcaaagcatacatttaag
tgttgaaaatcatatagcatgttacaatcacacagaaccctagcatttta
acatcacaactctaatgctttatgtgtgattattcctgtcatttttcccc
tccctgtcatgttttcaagggcaattttaactgtgatgccaatcaaattg
cacataatttatgagcacatgtgtgtagaatcagatattaatcataatat
caatccatactacactctcattgttgtcatgccacaggacttgtggtctg
ggctttgcatttcaaattcaatgctacagaaatgctagaacggctgctta
tttttatagatgctttaaagtcatcatgtggtagcatgaatgagctatca
ggtt
gaattcaagcagggctggaacctggaggcaggagctgaggcagaggccat
gggggtggtgtgtgcgtgctgcttactggcttccttcccatggcttgttc
agcctgctttcctataggaccaccagcctatggatggcaccacccactgt
gggcaaaacccttccccattgatcgctaattgagaaaatgccttatggct
ggatctcatggagacatttcctcaactgaggctcctttctctctgatgac
tccagcttgggtcaagttgacacacaaaaccagccactagagtaggcaga
gatgggactgattaatggaaccacatgggtgctaaagggggaactgctac
tctaagagaaatcagaagcattttgaagtatttgtacccataaccaccaa
tctgtgctgatctcggcattggtcacagcagctcctttattcagcagaca
gcagttgctgcagagacacataactggtcgacattctgagaataagtgcc
catgagtggacagccatagataggaaatctacatgagtcctgtacccaac
ttcaaggctcaaggaacatccaggaagaaggagtaaaaagaacctaagag
gtgaaatatgggggagacaactgtgccatcctgttttctgaaaatgacat
agctgttgcactcacaggctcacagccatggtggttacctacacagatca
agtcagccaaaatcccagcatcagtggggaaagtgggcactaaacaccat
agtttgctaaggaactatgagcagttgatctagactgggaagggagaatc
tgttgtggccatgctccatgctacagtgaaaggctccagccctttgtcat
gcacatgcagagagtgctaaa
quality valuesOpen.Open.




Alignment Information

BAC End 1BAC End 2
seq1: chr15_61711855_61712866
seq2: B6Ng01-019J05.b_146_1146 (reverse)

seq1  AACCTAGATAGCTCATTCATGCATACAACAATGATGACTCTAAAAGCATC  50
      ||||| |||||||||||||||| ||| || ||||||||| | ||||||||
seq2  AACCT-GATAGCTCATTCATGC-TACCAC-ATGATGACT-TTAAAGCATC  46

seq1  TATTAAAAATAAGCAGCCGTTCTGAGCATTTCTGTAGCATTGAATTTGAA  100
      || |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||
seq2  TA-TAAAAATAAGCAGCCGTTCT-AGCATTTCTGTAGCATTGAATTTGAA  94

seq1  ATGCAGAGCACAAGGACACAAGGTCCTGTGGGCATGGAACAACAATGAGA  150
      ||||| ||| | ||  ||||| ||||||| ||||||  ||||||||||||
seq2  ATGCAAAGC-CCAGACCACAA-GTCCTGT-GGCATG--ACAACAATGAGA  139

seq1  GTGTAGTATGGATTGATATTATGATTAATATCTGATTCTACACACATGTG  200
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTGTAGTATGGATTGATATTATGATTAATATCTGATTCTACACACATGTG  189

seq1  CTCATAAATTATGTGCAATTTGATTGGCATCACAGTTAAAATTGCCCTTG  250
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTCATAAATTATGTGCAATTTGATTGGCATCACAGTTAAAATTGCCCTTG  239

seq1  AAAACATGACAGGGAGGGGAAAAATGACAGGAATAATCACACATAAAGCA  300
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAAACATGACAGGGAGGGGAAAAATGACAGGAATAATCACACATAAAGCA  289

seq1  TTAGAGTTGTGATGTTAAAATGCTAGGGTTCTGTGTGATTGTAACATGCT  350
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTAGAGTTGTGATGTTAAAATGCTAGGGTTCTGTGTGATTGTAACATGCT  339

seq1  ATATGATTTTCAACACTTAAATGTATGCTTTGAATGTCAACCACCAACCA  400
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATATGATTTTCAACACTTAAATGTATGCTTTGAATGTCAACCACCAACCA  389

seq1  CTGCTTTGCTAAGCAATGAATTATTCTATTTAAGGCTACGAGTCTTGGAG  450
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTGCTTTGCTAAGCAATGAATTATTCTATTTAAGGCTACGAGTCTTGGAG  439

seq1  AGAGGGACCTTGGGTGTCGCGTATATTATCTTTGTCTTAGACTCAGGATT  500
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGAGGGACCTTGGGTGTCGCGTATATTATCTTTGTCTTAGACTCAGGATT  489

seq1  AGGGCTATGTATAGGAACTGATAGAATGAATATATGCTATTAAAAGGGAT  550
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGGGCTATGTATAGGAACTGATAGAATGAATATATGCTATTAAAAGGGAT  539

seq1  TTATTAAATGGATTATACAATAGGGGCTAGACTGTTATGGATGGGCCTGG  600
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTATTAAATGGATTATACAATAGGGGCTAGACTGTTATGGATGGGCCTGG  589

seq1  TACTGTGTTTGTTGATGCTAATTCCACTCTCCTGGGAGGGGTTGCTGACA  650
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TACTGTGTTTGTTGATGCTAATTCCACTCTCCTGGGAGGGGTTGCTGACA  639

seq1  AGGAGTGAGTCATATTCAGGTGACTTCTTGTGATCGAATCCCCTAATGAA  700
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGGAGTGAGTCATATTCAGGTGACTTCTTGTGATCGAATCCCCTAATGAA  689

seq1  TAAAGGAGCCAATCACTGGGCAAGTAGGCAGGACTTCCAGGTTGAGAGTG  750
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TAAAGGAGCCAATCACTGGGCAAGTAGGCAGGACTTCCAGGTTGAGAGTG  739

seq1  GAAGAGAGGAAGCAGGAGAGAATTAGGTCCTTTTGGACAGGGATAGCGTG  800
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAAGAGAGGAAGCAGGAGAGAATTAGGTCCTTTTGGACAGGGATAGCGTG  789

seq1  AGAACAAGATGTACTTACAAGTGTCTCCCAGTTTCAATGGTGGATCCACC  850
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGAACAAGATGTACTTACAAGTGTCTCCCAGTTTCAATGGTGGATCCACC  839

seq1  AGGATTTAGATTTAATAGGGCTTACAACTCAGGTTTTTAGTTGTTGTGCC  900
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGGATTTAGATTTAATAGGGCTTACAACTCAGGTTTTTAGTTGTTGTGCC  889

seq1  CAGCTATTGAGTTACCATTGTTTCTGAACTAAGTTTGTGTTGCATTTTCC  950
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CAGCTATTGAGTTACCATTGTTTCTGAACTAAGTTTGTGTTGCATTTTCC  939

seq1  TTCACATGGCAGCTAGTCTGGGTTCAAGAGAGAAAGGTACAACAACAAAG  1000
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTCACATGGCAGCTAGTCTGGGTTCAAGAGAGAAAGGTACAACAACAAAG  989

seq1  CATGGGTTTGCC  1012
      ||||||||||||
seq2  CATGGGTTTGCC  1001

seq1: chr15_61577105_61577976
seq2: B6Ng01-019J05.g_67_937

seq1  GAATTCAAGCAGGGCTGGAACCTGGAGGCAGGAGCTGAGGCAGAGGCCAT  50
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAATTCAAGCAGGGCTGGAACCTGGAGGCAGGAGCTGAGGCAGAGGCCAT  50

seq1  GGGGGTGGTGTGTGCGTGCTGCTTACTGGCTTCCTTCCCATGGCTTGTTC  100
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGGGGTGGTGTGTGCGTGCTGCTTACTGGCTTCCTTCCCATGGCTTGTTC  100

seq1  AGCCTGCTTTCCTATAGGACCACCAGCCTATGGATGGCACCACCCACTGT  150
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGCCTGCTTTCCTATAGGACCACCAGCCTATGGATGGCACCACCCACTGT  150

seq1  GGGCAAAACCCTTCCCCATTGATCGCTAATTGAGAAAATGCCTTATGGCT  200
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGGCAAAACCCTTCCCCATTGATCGCTAATTGAGAAAATGCCTTATGGCT  200

seq1  GGATCTCATGGAGACATTTCCTCAACTGAGGCTCCTTTCTCTCTGATGAC  250
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGATCTCATGGAGACATTTCCTCAACTGAGGCTCCTTTCTCTCTGATGAC  250

seq1  TCCAGCTTGGGTCAAGTTGACACACAAAACCAGCCACTAGAGTAGGCAGA  300
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCCAGCTTGGGTCAAGTTGACACACAAAACCAGCCACTAGAGTAGGCAGA  300

seq1  GATGGGACTGATTAATGGAACCACATGGGTGCTAAAGGGGGAACTGCTAC  350
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GATGGGACTGATTAATGGAACCACATGGGTGCTAAAGGGGGAACTGCTAC  350

seq1  TCTAAGAGAAATCAGAAGCATTTTGAAGTATTTGTACCCATAACCACCAA  400
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCTAAGAGAAATCAGAAGCATTTTGAAGTATTTGTACCCATAACCACCAA  400

seq1  TCTGTGCTGATCTCGGCATTGGTCACAGCAGCTCCTTTATTCAGCAGACA  450
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCTGTGCTGATCTCGGCATTGGTCACAGCAGCTCCTTTATTCAGCAGACA  450

seq1  GCAGTTGCTGCAGAGACACATAACTGGTCGACATTCTGAGAATAAGTGCC  500
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GCAGTTGCTGCAGAGACACATAACTGGTCGACATTCTGAGAATAAGTGCC  500

seq1  CATGAGTGGACAGCCATAGATAGGAAATCTACATGAGTCCTGTACCCAAC  550
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CATGAGTGGACAGCCATAGATAGGAAATCTACATGAGTCCTGTACCCAAC  550

seq1  TTCAAGGCTCAAGGAACATCCAGGAAGAAGGAGTAAAAAGAACCTAAGAG  600
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTCAAGGCTCAAGGAACATCCAGGAAGAAGGAGTAAAAAGAACCTAAGAG  600

seq1  GTGAAATATGGGGGAGACAACTGTGCCATCCTGTTTTCTGAAAATGACAT  650
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTGAAATATGGGGGAGACAACTGTGCCATCCTGTTTTCTGAAAATGACAT  650

seq1  AGCTGTTGCACTCACAGGCTCACAGCCATGGTGGTTACCTACACAGATCA  700
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGCTGTTGCACTCACAGGCTCACAGCCATGGTGGTTACCTACACAGATCA  700

seq1  AGTCAGCCAAAATCCCAGCATCAGTGGGGAAAGTGGGCACTAAACACCAT  750
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGTCAGCCAAAATCCCAGCATCAGTGGGGAAAGTGGGCACTAAACACCAT  750

seq1  AGTTTGCTAAGGAACTATGAGCAGTTGATCTAGACTGGGAAGGGAGAATC  800
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGTTTGCTAAGGAACTATGAGCAGTTGATCTAGACTGGGAAGGGAGAATC  800

seq1  TGTTGTGGCCATGCTCCATGCTACAGTGGAAGGCTCCAGCCCCTTTGTCA  850
      |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||
seq2  TGTTGTGGCCATGCTCCATGCTACAGTGAAAGGCTCCAG-CCCTTTGTCA  849

seq1  TGCACATGCAGAGAGTGCTAAA  872
      ||||||||||||||||||||||
seq2  TGCACATGCAGAGAGTGCTAAA  871