BAC Information

Click to search

BAC

Clone NameB6Ng01-026P23
Chromosome15 (Build37)
Map Location 69,275,237 - 69,396,772
singlet/doubletdoublet
Overlap genenone
Upstream geneEG665945, EG633752, Khdrbs3
Downstream geneLOC383050
LinkOpen Mouse BAC browser



BAC End Information

BAC end BAC-end 1BAC-end 2
end nameB6Ng01-026P23.bB6Ng01-026P23.g
ACCDH857867DH857868
length7051,097
definitionDH857867|Mus musculus domesticus DNA, BAC clone: B6Ng01-026P23, 5' end.DH857868|Mus musculus domesticus DNA, BAC clone: B6Ng01-026P23, 3' end.
singlet/doubletdoubletdoublet
BLAST hituniqueunique
Map location.(69,396,068 - 69,396,772)(69,275,237 - 69,276,348)
sequence
gaattctgtaccgccatgctttggtgaggatagaagagaaagcttaacct
gagctcacacagcagcagagactctacaacataacagaagcaggatgagc
aatgactcatcaggaggagctgtagtgtcaggattcccatatgttccccc
gatgctcaaacattacatgcttagtgtaaggacttaaggacatccttgga
gtccaaactctagatgatctgtgaaatgccagatcttcccatattatact
ttatatcaaaacaccacaagttgttggcctgaaggtgagggtggatgagg
tgaaaaaggtgggaacaaagattgtataaagtatctgtaccaactgactt
gacctctgtagccagaaaatgggttaaagaagaaactgggagtcaaaaca
ctccagggctatcaaaagaggcttaaatcaagttagatagaaggtacaac
tatgccagaaacaagaaaagtaaatgtcagcaaagactggaaggaggata
gcaaagatatagagggaaagggatctgtatctgacactgataagtgatgc
ctattcaagaagggttggtctaatatttattatattggtattgaatcttg
ttttcttccaagaaccaatcttgtcacctcagcaggatctaatcattgtg
tgacatgttgcatcatcatcatctctctctctctctctctctctctctct
ctctc
gaattccatgtgatctaaaccccagagaagagctactggtggccaatggc
ccactctgcagggatgaggtctcacacagattgtctaatccaatatgagc
acagcaggctaaacatacacatgatattataataattaaaaagataatta
tttgagggggagttagtaagaatgtagggacacggatgaaagatgtagat
gcagggatcatgcattgaaatgttcaaaaaaatgcttattttaaaaaaga
aaaccgctgggcgttgtggcacacacctttaatcccagcactcaggaggc
agaggcaggcagatttctgagtttgagtccagcctggtttacaatgtgag
ttccaggacagccatggctatacagagaaaccctgtctcgaaaaaaaacc
aaaaagaaacaaacaaacaaacaaacaaaaagaataccattaaaatgtgt
aattgttttgaaactctgagggagggtttgaaaggatgagacaaagtgat
ttttgttacttaaatactgtctttggttagcgtagaacccattcttttta
gacaatcagaaattcatcttaaaatgtcaacttggccatattctttctgc
ttctgctgaactcccaggataaaccttcaaatggtcataagcatgaccag
ttcagcccagcttgaaccagcctgttctctcatgtttgcacctcttgcaa
ttgtcctcctttaatttggatttcaacttttggatacactcaatgtctca
aacatttgtggggctttcacctggtgactggtctctgcctagtctcatct
tgaagatttcgtgctggaaaaattctaacacatctaaacatcccaaaaca
tttgtgctcctgtgcaaactctttagtgaaactttgtgtgagaatgtcca
gtcatttccccctcctgttctctacgatatttattgtttgaatgtttggg
gtattccatgaacatccttcccactgaagacagctcccattttgaaaatt
gtcttcatgaagcactgtctaggtgaagaacttgatcatactgatctgtg
ctataagcaattgatacaaagacacatttgtgttggtcccaatcatt
quality valuesOpen.Open.




Alignment Information

BAC End 1BAC End 2
seq1: chr15_69396068_69396772
seq2: B6Ng01-026P23.b_48_752 (reverse)

seq1  GAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGATGATGATGATGCAACA  50
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGATGATGATGATGCAACA  50

seq1  TGTCACACAATGATTAGATCCTGCTGAGGTGACAAGATTGGTTCTTGGAA  100
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGTCACACAATGATTAGATCCTGCTGAGGTGACAAGATTGGTTCTTGGAA  100

seq1  GAAAACAAGATTCAATACCAATATAATAAATATTAGACCAACCCTTCTTG  150
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAAAACAAGATTCAATACCAATATAATAAATATTAGACCAACCCTTCTTG  150

seq1  AATAGGCATCACTTATCAGTGTCAGATACAGATCCCTTTCCCTCTATATC  200
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AATAGGCATCACTTATCAGTGTCAGATACAGATCCCTTTCCCTCTATATC  200

seq1  TTTGCTATCCTCCTTCCAGTCTTTGCTGACATTTACTTTTCTTGTTTCTG  250
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTTGCTATCCTCCTTCCAGTCTTTGCTGACATTTACTTTTCTTGTTTCTG  250

seq1  GCATAGTTGTACCTTCTATCTAACTTGATTTAAGCCTCTTTTGATAGCCC  300
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GCATAGTTGTACCTTCTATCTAACTTGATTTAAGCCTCTTTTGATAGCCC  300

seq1  TGGAGTGTTTTGACTCCCAGTTTCTTCTTTAACCCATTTTCTGGCTACAG  350
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGGAGTGTTTTGACTCCCAGTTTCTTCTTTAACCCATTTTCTGGCTACAG  350

seq1  AGGTCAAGTCAGTTGGTACAGATACTTTATACAATCTTTGTTCCCACCTT  400
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGGTCAAGTCAGTTGGTACAGATACTTTATACAATCTTTGTTCCCACCTT  400

seq1  TTTCACCTCATCCACCCTCACCTTCAGGCCAACAACTTGTGGTGTTTTGA  450
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTTCACCTCATCCACCCTCACCTTCAGGCCAACAACTTGTGGTGTTTTGA  450

seq1  TATAAAGTATAATATGGGAAGATCTGGCATTTCACAGATCATCTAGAGTT  500
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TATAAAGTATAATATGGGAAGATCTGGCATTTCACAGATCATCTAGAGTT  500

seq1  TGGACTCCAAGGATGTCCTTAAGTCCTTACACTAAGCATGTAATGTTTGA  550
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGGACTCCAAGGATGTCCTTAAGTCCTTACACTAAGCATGTAATGTTTGA  550

seq1  GCATCGGGGGAACATATGGGAATCCTGACACTACAGCTCCTCCTGATGAG  600
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GCATCGGGGGAACATATGGGAATCCTGACACTACAGCTCCTCCTGATGAG  600

seq1  TCATTGCTCATCCTGCTTCTGTTATGTTGTAGAGTCTCTGCTGCTGTGTG  650
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCATTGCTCATCCTGCTTCTGTTATGTTGTAGAGTCTCTGCTGCTGTGTG  650

seq1  AGCTCAGGTTAAGCTTTCTCTTCTATCCTCACCAAAGCATGGCGGTACAG  700
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGCTCAGGTTAAGCTTTCTCTTCTATCCTCACCAAAGCATGGCGGTACAG  700

seq1  AATTC  705
      |||||
seq2  AATTC  705

seq1: chr15_69275237_69276348
seq2: B6Ng01-026P23.g_68_1164

seq1  GAATTCCATGTGATCTAAACCCCAGAGAAGAGCTACTGGTGGCCAATGGC  50
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAATTCCATGTGATCTAAACCCCAGAGAAGAGCTACTGGTGGCCAATGGC  50

seq1  CCACTCTGCAGGGATGAGGTCTCACACAGATTGTCTAATCCAATATGAGC  100
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCACTCTGCAGGGATGAGGTCTCACACAGATTGTCTAATCCAATATGAGC  100

seq1  ACAGCAGGCTAAACATACACATGATATTATAATAATTAAAAAGATAATTA  150
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACAGCAGGCTAAACATACACATGATATTATAATAATTAAAAAGATAATTA  150

seq1  TTTGAGGGGGAGTTAGTAAGAATGTAGGGACACGGATGAAAGATGTAGAT  200
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTTGAGGGGGAGTTAGTAAGAATGTAGGGACACGGATGAAAGATGTAGAT  200

seq1  GCAGGGATCATGCATTGAAATGTTCAAAAAAATGCTTATTTTAAAAAAGA  250
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GCAGGGATCATGCATTGAAATGTTCAAAAAAATGCTTATTTTAAAAAAGA  250

seq1  AAACCGCTGGGCGTTGTGGCACACACCTTTAATCCCAGCACTCAGGAGGC  300
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAACCGCTGGGCGTTGTGGCACACACCTTTAATCCCAGCACTCAGGAGGC  300

seq1  AGAGGCAGGCAGATTTCTGAGTTTGAGTCCAGCCTGGTTTACAATGTGAG  350
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGAGGCAGGCAGATTTCTGAGTTTGAGTCCAGCCTGGTTTACAATGTGAG  350

seq1  TTCCAGGACAGCCATGGCTATACAGAGAAACCCTGTCTCGAAAAAAAACC  400
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTCCAGGACAGCCATGGCTATACAGAGAAACCCTGTCTCGAAAAAAAACC  400

seq1  AAAAAGAAACAAACAAACAAACAAACAAAAAGAATACCATTAAAATGTGT  450
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAAAAGAAACAAACAAACAAACAAACAAAAAGAATACCATTAAAATGTGT  450

seq1  AATTGTTTTGAAACTCTGAGGGAGGGTTTGAAAGGATGAGACAAAGTGAT  500
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AATTGTTTTGAAACTCTGAGGGAGGGTTTGAAAGGATGAGACAAAGTGAT  500

seq1  TTTTGTTACTTAAATACTGTCTTTGGTTAGCGTAGAACCCATTCTTTTTA  550
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTTTGTTACTTAAATACTGTCTTTGGTTAGCGTAGAACCCATTCTTTTTA  550

seq1  GACAATCAGAAATTCATCTTAAAATGTCAACTTGGCCATATTCTTTCTGC  600
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GACAATCAGAAATTCATCTTAAAATGTCAACTTGGCCATATTCTTTCTGC  600

seq1  TTCTGCTGAACTCCCAGGATAAACCTTCAAATGGTCATAAGCATGACCAG  650
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTCTGCTGAACTCCCAGGATAAACCTTCAAATGGTCATAAGCATGACCAG  650

seq1  TTCAGCCCAGCTTGAACCAGCCTGTTCTCTCATGTTTGCACCTCTTGCAA  700
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTCAGCCCAGCTTGAACCAGCCTGTTCTCTCATGTTTGCACCTCTTGCAA  700

seq1  TTGTCCTCCTTTAATTTGGATTTCAACTTTTGGATACACTCAATGTCTCA  750
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTGTCCTCCTTTAATTTGGATTTCAACTTTTGGATACACTCAATGTCTCA  750

seq1  AACATTTGTGGGGCTTTCACCTGGTGACTGGTCTCTGCCTAGTCTCATCT  800
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AACATTTGTGGGGCTTTCACCTGGTGACTGGTCTCTGCCTAGTCTCATCT  800

seq1  TGAAGATTTCGTGCTGGAAAAATTCTAACACATCTAAACATCCCAAAACA  850
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGAAGATTTCGTGCTGGAAAAATTCTAACACATCTAAACATCCCAAAACA  850

seq1  TTTGTGCTCCTGTGCAAACTCTTTTAGTGAAACTTTGTGTGAGAATGTCC  900
      ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTTGTGCTCCTGTGCAAACTC-TTTAGTGAAACTTTGTGTGAGAATGTCC  899

seq1  AGTCATTTCCCCCTCCTGTTCTCCTACGATATTTTATTGTTTGAATGTTT  950
      |||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||
seq2  AGTCATTTCCCCCTCCTGTTCT-CTACGATA-TTTATTGTTTGAATGTTT  947

seq1  GGGGTATTCCATGACATTCCTTCCCACTGAAGACAAGCTCCCATTTTGAA  1000
      ||||||||||||||   ||||||||||||||||| |||||||||||||||
seq2  GGGGTATTCCATGAACATCCTTCCCACTGAAGAC-AGCTCCCATTTTGAA  996

seq1  AAATGTCTTCATGAAGCACTGTCTAGGTGAAGAACATGGATCATTACTGA  1050
      || |||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||| ||||| 
seq2  AATTGTCTTCATGAAGCACTGTCTAGGTGAAGAAC-TTGATCA-TACTG-  1043

seq1  ATCTGTGGCTAATAAGCAAATTGAATTACAAAGACACAATTTTGTGTTTG  1100
      |||||| ||| |||||| ||||||  ||||||||||||  |||||| |||
seq2  ATCTGT-GCT-ATAAGC-AATTGA--TACAAAGACACA--TTTGTG-TTG  1085

seq1  TTCCTAATCATT  1112
       ||| |||||||
seq2  GTCCCAATCATT  1097