BAC Information

Click to search

BAC

Clone NameB6Ng01-027H15
Chromosome15 (Build37)
Map Location 27,080,515 - 27,195,930
singlet/doubletdoublet
Overlap genenone
Upstream geneAK162044, Fbxl7, LOC622531, LOC625311
Downstream geneAnk, BC087945, LOC100040622, BC052328, Trio, LOC667126, Dnahc5
LinkOpen Mouse BAC browser



BAC End Information

BAC end BAC-end 1BAC-end 2
end nameB6Ng01-027H15.bB6Ng01-027H15.g
ACCDH858209DH858210
length964863
definitionDH858209|Mus musculus domesticus DNA, BAC clone: B6Ng01-027H15, 5' end.DH858210|Mus musculus domesticus DNA, BAC clone: B6Ng01-027H15, 3' end.
singlet/doubletdoubletdoublet
BLAST hituniqueunique
Map location.(27,080,515 - 27,081,487)(27,195,076 - 27,195,930)
sequence
gaattctttagaaagcatgaatagacagctagcttcctccaacccaaaag
ctaaggatgttgccaggtagcatctaatgtctatagcagagagtcccctg
ctctgctcgccccacctacctacctgatgcacctaccaatgtaccttaaa
tgtgctcaattaatgactttctttgttctgtggtaggaaacaaataaagt
catgagtgagtgtgtatgtttcacatgagcatgtctacatcaaggactaa
tgccttagatacatggaaggggcaatgccttccccagatgagactcagag
gggatagcaaagccttcttctcatccaagtgtgccatgacagtgcatgca
gcaaaggttaaccatagctttcccctgatgaatgttcatggccaggagat
tgttctcttacagagacagctcctaccaagattagctaaaccctccttct
tgtttcctgcatgtaataatcccaccaccttgtttgtatgtaataaccct
gcctccagctacatgcaaaccccccatgtttaactatttataataaacat
gttgagcttctggggtgctgcaactttctttacctggagcaatggtgatg
caccattgctataaggactttataaaactgtgagcacatgggaatatgaa
atttgggatagcctacacccatgatcctgagctatgctcatttatattag
gctccagaataagctatctctatctggtgagatgagagctgtgtttttgc
actgatgctgtagagatgcagagtaaatgtgattctgagaggagcatctc
aaggggcatcaactcttactcttttcccattatcattgattctagtttta
acattaacatcagctatgctctgaatcctgtatccccatggcccttctta
gccatgaaacatttctgtagccacaaaaggtggactacccaatcgtcagg
ccaattgggaatca
gaattctggtaggactccggttatctcccactccctttattcccccagcg
cgcactgccccacatgtagctacttatggctggtaaatgccatgcaggta
cacttctgaagccgtcttggttctcctccaacccctcagaggctctctgt
ctctgcaactcttagctccgcctcctttttctctgtccaatcacaggcct
cctctgcactaatgtaattggacagggaaaatcctacaacagtagacaaa
gacacaggataaataaggtgtcaagcagccagagcagtgacaaataggga
gaaagatctcaggggagttagatagcacaaggatccaggaagccatgttt
ctcataacgtaagaagtagagccagtaatgggagtgaaggcatgaagcca
ggaacgggagggcccaaataaaggggaggaattccacactgtgaaccaag
actctgcagacagagaagatggaatcaccgttttacagatgggccatatt
gatacaagaagcacatctcttgtttcaaacaggataagagatagtttatt
caggagttacatatgaatgaccatgactttggtgacacagatttaggcta
ccccacattttcctattcccatgggggtaatagcctgataaggttttact
gtaacaaacaaagaaaacaaccaatcagggtgctttttcaaattcagtgg
tgaaaaactgcagtttgtgagctaaagccaagtagagtggactctcaggg
gcagatctcagatgctacctggcaagtgggcacattttaagatattctac
ctattaccctcagggcccatttttcaagggttgccttattagggatactt
aaggtgggcaagg
quality valuesOpen.Open.




Alignment Information

BAC End 1BAC End 2
seq1: chr15_27080515_27081487
seq2: B6Ng01-027H15.b_31_994

seq1  GAATTCTTTAGAAAGCATGAATAGACAGCTAGCTTCCTCCAACCCAAAAG  50
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAATTCTTTAGAAAGCATGAATAGACAGCTAGCTTCCTCCAACCCAAAAG  50

seq1  CTAAGGATGTTGCCAGGTAGCATCTAATGTCTATAGCAGAGAGTCCCCTG  100
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTAAGGATGTTGCCAGGTAGCATCTAATGTCTATAGCAGAGAGTCCCCTG  100

seq1  CTCTGCTCGCCCCACCTACCTACCTGATGCACCTACCAATGTACCTTAAA  150
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTCTGCTCGCCCCACCTACCTACCTGATGCACCTACCAATGTACCTTAAA  150

seq1  TGTGCTCAATTAATGACTTTCTTTGTTCTGTGGTAGGAAACAAATAAAGT  200
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGTGCTCAATTAATGACTTTCTTTGTTCTGTGGTAGGAAACAAATAAAGT  200

seq1  CATGAGTGAGTGTGTATGTTTCACATGAGCATGTCTACATCAAGGACTAA  250
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CATGAGTGAGTGTGTATGTTTCACATGAGCATGTCTACATCAAGGACTAA  250

seq1  TGCCTTAGATACATGGAAGGGGCAATGCCTTCCCCAGATGAGACTCAGAG  300
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGCCTTAGATACATGGAAGGGGCAATGCCTTCCCCAGATGAGACTCAGAG  300

seq1  GGGATAGCAAAGCCTTCTTCTCATCCAAGTGTGCCATGACAGTGCATGCA  350
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGGATAGCAAAGCCTTCTTCTCATCCAAGTGTGCCATGACAGTGCATGCA  350

seq1  GCAAAGGTTAACCATAGCTTTCCCCTGATGAATGTTCATGGCCAGGAGAT  400
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GCAAAGGTTAACCATAGCTTTCCCCTGATGAATGTTCATGGCCAGGAGAT  400

seq1  TGTTCTCTTACAGAGACAGCTCCTACCAAGATTAGCTAAACCCTCCTTCT  450
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGTTCTCTTACAGAGACAGCTCCTACCAAGATTAGCTAAACCCTCCTTCT  450

seq1  TGTTTCCTGCATGTAATAATCCCACCACCTTGTTTGTATGTAATAACCCT  500
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGTTTCCTGCATGTAATAATCCCACCACCTTGTTTGTATGTAATAACCCT  500

seq1  GCCTCCAGCTACATGCAAACCCCCCATGTTTAACTATTTATAATAAACAT  550
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GCCTCCAGCTACATGCAAACCCCCCATGTTTAACTATTTATAATAAACAT  550

seq1  GTTGAGCTTCTGGGGTGCTGCAACTTTCTTTACCTGGAGCAATGGTGATG  600
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTTGAGCTTCTGGGGTGCTGCAACTTTCTTTACCTGGAGCAATGGTGATG  600

seq1  CACCATTGCTATAAGGACTTTATAAAACTGTGAGCACATGGGAATATGAA  650
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CACCATTGCTATAAGGACTTTATAAAACTGTGAGCACATGGGAATATGAA  650

seq1  ATTTGGGATAGCCTACACCCATGATCCTGAGCTATGCTCATTTATATTAG  700
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATTTGGGATAGCCTACACCCATGATCCTGAGCTATGCTCATTTATATTAG  700

seq1  GCTCCAGAATAAGCTATCTCTATCTGGTGAGATGAGAGCTGTGTTTTTGC  750
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GCTCCAGAATAAGCTATCTCTATCTGGTGAGATGAGAGCTGTGTTTTTGC  750

seq1  ACTGATGCTGTAGAGATGCAGAGTTAAATGTGATTCTGAGAGGAGCATCT  800
      ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACTGATGCTGTAGAGATGCAGAG-TAAATGTGATTCTGAGAGGAGCATCT  799

seq1  CAAGGGGCATCAACTCTTTACTCTTTTCCCATTATCATTGATTCTTAGTT  850
      |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||
seq2  CAAGGGGCATCAACTC-TTACTCTTTTCCCATTATCATTGATTC-TAGTT  847

seq1  TTAACATTAACATCAGCTATGCTCTGAATCCTGTATCCCCAT-GCCCTTC  899
      |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||
seq2  TTAACATTAACATCAGCTATGCTCTGAATCCTGTATCCCCATGGCCCTTC  897

seq1  TTAGCCCATGAAAACATTTCTGTAGCCACAAAGAGGTGGGACTACCCAGT  949
      |||| ||||| ||||||||||||||||||||| |||| |||||||||| |
seq2  TTAG-CCATG-AAACATTTCTGTAGCCACAAA-AGGT-GGACTACCCAAT  943

seq1  CAGTCAGGCCAATTTGGGATATCA  973
      | |||||||||| |||||| ||||
seq2  C-GTCAGGCCAA-TTGGGA-ATCA  964

seq1: chr15_27195076_27195930
seq2: B6Ng01-027H15.g_69_931 (reverse)

seq1  CCTTGCCCACCTT-AGTATACCTAAT-AGGCAACCCTTGAAAAATGGCCC  48
      ||||||||||||| ||||| |||||| |||||||||||||||||||| ||
seq2  CCTTGCCCACCTTAAGTATCCCTAATAAGGCAACCCTTGAAAAATGGGCC  50

seq1  TTGAGGGTAATAGGTAGAATATCTT-AAATGTGCCCACTTGCCAGGTAGC  97
       |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||
seq2  CTGAGGGTAATAGGTAGAATATCTTAAAATGTGCCCACTTGCCAGGTAGC  100

seq1  ATCTGAGATCTGCCCCTGAGAGTCC-CTCTACTTGGCTTTAGCTCACAAA  146
      ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||
seq2  ATCTGAGATCTGCCCCTGAGAGTCCACTCTACTTGGCTTTAGCTCACAAA  150

seq1  CTGCAGTTTTTCACCACTGAATTTG-AAAAGCACCCTGATTGGTTGTTTT  195
      ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||
seq2  CTGCAGTTTTTCACCACTGAATTTGAAAAAGCACCCTGATTGGTTGTTTT  200

seq1  CTTTG-TTGTTACAGTAAAACCTTATCAGGCTATTACCCCCATGGGAATA  244
      ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTTTGTTTGTTACAGTAAAACCTTATCAGGCTATTACCCCCATGGGAATA  250

seq1  GG-AAATGTGGGGTAGCCTAAATCTGTGTCACC-AAGTCATGGTCATTCA  292
      || |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||
seq2  GGAAAATGTGGGGTAGCCTAAATCTGTGTCACCAAAGTCATGGTCATTCA  300

seq1  TATGTAACTCCTGAATAAACTATCTCTTATCCTGTTTGAAACAAGAGATG  342
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TATGTAACTCCTGAATAAACTATCTCTTATCCTGTTTGAAACAAGAGATG  350

seq1  TGCTTCTTGTATCAATATGGCCCATCTGTAAAACGGTGATTCCATCTTCT  392
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGCTTCTTGTATCAATATGGCCCATCTGTAAAACGGTGATTCCATCTTCT  400

seq1  CTGTCTGCAGAGTCTTGGTTCACAGTGTGGAATTCCTCCCCTTTATTTGG  442
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTGTCTGCAGAGTCTTGGTTCACAGTGTGGAATTCCTCCCCTTTATTTGG  450

seq1  GCCCTCCCGTTCCTGGCTTCATGCCTTCACTCCCATTACTGGCTCTACTT  492
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GCCCTCCCGTTCCTGGCTTCATGCCTTCACTCCCATTACTGGCTCTACTT  500

seq1  CTTACGTTATGAGAAACATGGCTTCCTGGATCCTTGTGCTATCTAACTCC  542
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTTACGTTATGAGAAACATGGCTTCCTGGATCCTTGTGCTATCTAACTCC  550

seq1  CCTGAGATCTTTCTCCCTATTTGTCACTGCTCTGGCTGCTTGACACCTTA  592
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCTGAGATCTTTCTCCCTATTTGTCACTGCTCTGGCTGCTTGACACCTTA  600

seq1  TTTATCCTGTGTCTTTGTCTACTGTTGTAGGATTTTCCCTGTCCAATTAC  642
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTTATCCTGTGTCTTTGTCTACTGTTGTAGGATTTTCCCTGTCCAATTAC  650

seq1  ATTAGTGCAGAGGAGGCCTGTGATTGGACAGAGAAAAAGGAGGCGGAGCT  692
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATTAGTGCAGAGGAGGCCTGTGATTGGACAGAGAAAAAGGAGGCGGAGCT  700

seq1  AAGAGTTGCAGAGACAGAGAGCCTCTGAGGGGTTGGAGGAGAACCAAGAC  742
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAGAGTTGCAGAGACAGAGAGCCTCTGAGGGGTTGGAGGAGAACCAAGAC  750

seq1  GGCTTCAGAAGTGTACCTGCATGGCATTTACCAGCCATAAGTAGCTACAT  792
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGCTTCAGAAGTGTACCTGCATGGCATTTACCAGCCATAAGTAGCTACAT  800

seq1  GTGGGGCAGTGCGCGCTGGGGGAATAAAGGGAGTGGGAGATAACCGGAGT  842
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTGGGGCAGTGCGCGCTGGGGGAATAAAGGGAGTGGGAGATAACCGGAGT  850

seq1  CCTGCCAGAATTC  855
      ||| |||||||||
seq2  CCTACCAGAATTC  863