BAC Information

Click to search

BAC

Clone NameB6Ng01-033A06
Chromosome15 (Build37)
Map Location 29,921,068 - 30,082,019
singlet/doubletdoublet
Overlap geneLOC382975
Upstream genenone
Downstream geneCtnnd2, 9630009A06Rik
LinkOpen Mouse BAC browser



BAC End Information

BAC end BAC-end 1BAC-end 2
end nameB6Ng01-033A06.bB6Ng01-033A06.g
ACCDH862185DH862186
length7331,026
definitionDH862185|Mus musculus domesticus DNA, BAC clone: B6Ng01-033A06, 5' end.DH862186|Mus musculus domesticus DNA, BAC clone: B6Ng01-033A06, 3' end.
singlet/doubletdoubletdoublet
BLAST hituniqueunique
Map location.(30,081,287 - 30,082,019)(29,921,068 - 29,922,097)
sequence
gaattcctgttcacagaaagaagaaaggtgtagatatggaagacagattt
ctgatcaatgattacatcttaaaccttaatctgctattttaatagatcca
acacatgcatatttgatgataatgtatatttattatttttgaaaggggag
agacttcaaatttaaaatcctattttggctggggatgccattaagtagaa
gactttttatatgagtctgattaaaatgtttgttgcctgaaggaaattag
tttttaatttcataagattatcctagattgtttcatctaaaaggatgtta
taaatcacttatgtgatctcctttattttgcatctgaaagcataaaggag
ataaattatttgtccaaggtcgaaagagttagggtagacttcagtcccca
agccatgcattaatcataacttatttttaactacatacttctatacaata
caaccacagcactgctatcaaggtagtcctgttatttgatagatctacta
ctgaacaatacagggagctagtgcaataacatgacctgccttcagtcaaa
aggattatgcagtttactttgaatgtggtgataatagcaggttactatga
aaatgagagtggagtgctgatagcattgcaagtttcccaagccatttgat
agaggcacatactacttaaaattcatgatatcacaggaagctattgcccc
cagcctacattagctgaaaaggaagcttgtgtg
gaattcattgtttaattgcttggggatcttggcttcagttggtatatctg
attcattaatattgactttgtaacaacaacgcaaagcacatgtgtatttg
ttaccttaaaataaagcatctcatttttctttattgggcaaattttttct
ttagatttcaaagatagattgaaatcagggaaatagtgaggcggtacttt
atcaaatttagaatgttagtttctgtaaaaaagaaaagagtaatttctta
acttgaaacatatattctaatgcacggcgaacacatgatttacaaagagg
ctctaagcaaaagagagtaccagtgtgcttgatgaagcaaaataaatggt
agatttgattcagacttttagaatcagaaagagcttcaaataaaggtata
ttctaaaatcaagaatcagaacaaatgcttactacaatgaaaagggtaat
gcaaaataaatcccaggtagcaatgtgtggtatcctttgatttgcacaga
cagagacagtatagaagaaaacaaaacaataacaacaacaaaggcatttt
cttctgttgctataacaaaagcaatttaagggggggaggtttattttttt
tcttttattggatattttctttatttacatttcaaatgttatcccctttc
caagcctcccctatggaaaccccctataccttccccactccccattcctc
tatgagggtgctccccaacccacctacccactcctgccctggcattttcc
taccctcgggtatcaaaccaccacaggaccaagcactgctcctcccactg
gtgtccaatgtggccagagccatgggtccctccatgtgtactctctggtt
gatggtccagttcccaagagctctgggggtctggctgttgacactgttgc
tcacacacacacacacagggctgcaaaccccctcagttccttcagtccct
tctccaactcctccatcctggaaaaggtttattttgacttagattcgagg
acaaaatctatgcaaaaaactcaggg
quality valuesOpen.Open.




Alignment Information

BAC End 1BAC End 2
seq1: chr15_30081287_30082019
seq2: B6Ng01-033A06.b_50_782 (reverse)

seq1  CACACAAGCTTCCTTTTCAGCTAATGTAGGCTGGGGGCAATAGCTTCCTG  50
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CACACAAGCTTCCTTTTCAGCTAATGTAGGCTGGGGGCAATAGCTTCCTG  50

seq1  TGATATCATGAATTTTAAGTAGTATGTGCCTCTATCAAATGGCTTGGGAA  100
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGATATCATGAATTTTAAGTAGTATGTGCCTCTATCAAATGGCTTGGGAA  100

seq1  ACTTGCAATGCTATCAGCACTCCACTCTCATTTTCATAGTAACCTGCTAT  150
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACTTGCAATGCTATCAGCACTCCACTCTCATTTTCATAGTAACCTGCTAT  150

seq1  TATCACCACATTCAAAGTAAACTGCATAATCCTTTTGACTGAAGGCAGGT  200
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TATCACCACATTCAAAGTAAACTGCATAATCCTTTTGACTGAAGGCAGGT  200

seq1  CATGTTATTGCACTAGCTCCCTGTATTGTTCAGTAGTAGATCTATCAAAT  250
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CATGTTATTGCACTAGCTCCCTGTATTGTTCAGTAGTAGATCTATCAAAT  250

seq1  AACAGGACTACCTTGATAGCAGTGCTGTGGTTGTATTGTATAGAAGTATG  300
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AACAGGACTACCTTGATAGCAGTGCTGTGGTTGTATTGTATAGAAGTATG  300

seq1  TAGTTAAAAATAAGTTATGATTAATGCATGGCTTGGGGACTGAAGTCTAC  350
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TAGTTAAAAATAAGTTATGATTAATGCATGGCTTGGGGACTGAAGTCTAC  350

seq1  CCTAACTCTTTCGACCTTGGACAAATAATTTATCTCCTTTATGCTTTCAG  400
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCTAACTCTTTCGACCTTGGACAAATAATTTATCTCCTTTATGCTTTCAG  400

seq1  ATGCAAAATAAAGGAGATCACATAAGTGATTTATAACATCCTTTTAGATG  450
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATGCAAAATAAAGGAGATCACATAAGTGATTTATAACATCCTTTTAGATG  450

seq1  AAACAATCTAGGATAATCTTATGAAATTAAAAACTAATTTCCTTCAGGCA  500
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAACAATCTAGGATAATCTTATGAAATTAAAAACTAATTTCCTTCAGGCA  500

seq1  ACAAACATTTTAATCAGACTCATATAAAAAGTCTTCTACTTAATGGCATC  550
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACAAACATTTTAATCAGACTCATATAAAAAGTCTTCTACTTAATGGCATC  550

seq1  CCCAGCCAAAATAGGATTTTAAATTTGAAGTCTCTCCCCTTTCAAAAATA  600
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCCAGCCAAAATAGGATTTTAAATTTGAAGTCTCTCCCCTTTCAAAAATA  600

seq1  ATAAATATACATTATCATCAAATATGCATGTGTTGGATCTATTAAAATAG  650
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATAAATATACATTATCATCAAATATGCATGTGTTGGATCTATTAAAATAG  650

seq1  CAGATTAAGGTTTAAGATGTAATCATTGATCAGAAATCTGTCTTCCATAT  700
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CAGATTAAGGTTTAAGATGTAATCATTGATCAGAAATCTGTCTTCCATAT  700

seq1  CTACACCTTTCTTCTTTCTGTGAACAGGAATTC  733
      |||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTACACCTTTCTTCTTTCTGTGAACAGGAATTC  733

seq1: chr15_29921068_29922097
seq2: B6Ng01-033A06.g_69_1094

seq1  GAATTCATTGTTCAATTGCTTGGGGATCTTGGCTTCAGTTGGTATATCTG  50
      |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAATTCATTGTTTAATTGCTTGGGGATCTTGGCTTCAGTTGGTATATCTG  50

seq1  ATTCATTAATATTGACTTTGTAACAACAACGCAAAGCACATGTGTATTTG  100
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATTCATTAATATTGACTTTGTAACAACAACGCAAAGCACATGTGTATTTG  100

seq1  TTACCTTAAAATAAAGCATCTCATTTTTCTTTATTGGGCAAATTTTTTCT  150
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTACCTTAAAATAAAGCATCTCATTTTTCTTTATTGGGCAAATTTTTTCT  150

seq1  TTAGATTTCAAAGATAGATTGAAATCAGGGAAATAGTGAGGCGGTACTTT  200
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTAGATTTCAAAGATAGATTGAAATCAGGGAAATAGTGAGGCGGTACTTT  200

seq1  ATCAAATTTAGAATGTTAGTTTCTGTAAAAAAGAAAAGAGTAATTTCTTA  250
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATCAAATTTAGAATGTTAGTTTCTGTAAAAAAGAAAAGAGTAATTTCTTA  250

seq1  ACTTGAAACATATATTCTAATGCACGGCGAACACATGATTTACAAAGAGG  300
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACTTGAAACATATATTCTAATGCACGGCGAACACATGATTTACAAAGAGG  300

seq1  CTCTAAGCAAAAGAGAGTACCAGTGTGCTTGATGAAGCAAAATAAATGGT  350
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTCTAAGCAAAAGAGAGTACCAGTGTGCTTGATGAAGCAAAATAAATGGT  350

seq1  AGATTTGATTCAGACTTTTAGAATCAGAAAGAGCTTCAAATAAAGGTATA  400
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGATTTGATTCAGACTTTTAGAATCAGAAAGAGCTTCAAATAAAGGTATA  400

seq1  TTCTAAAATCAAGAATCAGAACAAATGCTTACTACAATGAAAAGGGTAAT  450
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTCTAAAATCAAGAATCAGAACAAATGCTTACTACAATGAAAAGGGTAAT  450

seq1  GCAAAATAAATCCCAGGTAGCAATGTGTGGTATCCTTTGATTTGCACAGA  500
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GCAAAATAAATCCCAGGTAGCAATGTGTGGTATCCTTTGATTTGCACAGA  500

seq1  CAGAGACAGTATAGAAGAAAACAAAACAATAACAACAACAAAGGCATTTT  550
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CAGAGACAGTATAGAAGAAAACAAAACAATAACAACAACAAAGGCATTTT  550

seq1  CTTCTGTTGCTATAACAAAAGCAATTTAAGGGGGGGAGGTTTATTTTTTT  600
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTTCTGTTGCTATAACAAAAGCAATTTAAGGGGGGGAGGTTTATTTTTTT  600

seq1  TCTTTTATTGGATATTTTCTTTATTTACATTTCAAATGTTATCCCCTTTC  650
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCTTTTATTGGATATTTTCTTTATTTACATTTCAAATGTTATCCCCTTTC  650

seq1  CAAGCCTCCCCTATGGAAACCCCCTATACCTTCCCCACTCCCCATTCCTC  700
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CAAGCCTCCCCTATGGAAACCCCCTATACCTTCCCCACTCCCCATTCCTC  700

seq1  TATGAGGGTGCTCCCCAACCCACCTACCCACTCCTGCCCTGGCATTTCCC  750
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||
seq2  TATGAGGGTGCTCCCCAACCCACCTACCCACTCCTGCCCTGGCATTTTCC  750

seq1  TACCCTCGGGTATCAAACCACCACAGGACCAAGCACTGCTCCTCCCACTG  800
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TACCCTCGGGTATCAAACCACCACAGGACCAAGCACTGCTCCTCCCACTG  800

seq1  GTGTCCAATGTGGCCAGAGCCATGGGTCCCTCCATGTGTACTCTCTGGTT  850
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTGTCCAATGTGGCCAGAGCCATGGGTCCCTCCATGTGTACTCTCTGGTT  850

seq1  GATGGTCCAGTTCCCAGGAGCTCTGGGGGTCTGGCCTGTTGACACTGTTG  900
      |||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||
seq2  GATGGTCCAGTTCCCAAGAGCTCTGGGGGTCTGG-CTGTTGACACTGTTG  899

seq1  CTCACACACACACACACAGGGCTGCAAACCCCCTCAGTTCCTTCAGTCCC  950
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTCACACACACACACACAGGGCTGCAAACCCCCTCAGTTCCTTCAGTCCC  949

seq1  TTCTCCAACTCCTCCATCCGGGAAAAGGTTTATTTTGACTTAGAATTCGA  1000
      ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||
seq2  TTCTCCAACTCCTCCATCCTGGAAAAGGTTTATTTTGACTTAG-ATTCGA  998

seq1  GGACACAATCTCATGCAGATAAACTCAGGG  1030
      ||||| ||||| ||||| | ||||||||||
seq2  GGACAAAATCT-ATGCA-AAAAACTCAGGG  1026