BAC Information

Click to search

BAC

Clone NameB6Ng01-051H15
Chromosome15 (Build37)
Map Location 19,234,773 - 19,372,785
singlet/doubletdoublet
Overlap genenone
Upstream geneLOC666839, Cdh10, EG666857
Downstream geneEG666875, LOC621884, LOC100040265
LinkOpen Mouse BAC browser



BAC End Information

BAC end BAC-end 1BAC-end 2
end nameB6Ng01-051H15.bB6Ng01-051H15.g
ACCDH875107DH875108
length1,1681,123
definitionDH875107|Mus musculus domesticus DNA, BAC clone: B6Ng01-051H15, 5' end.DH875108|Mus musculus domesticus DNA, BAC clone: B6Ng01-051H15, 3' end.
singlet/doubletdoubletdoublet
BLAST hituniqueunique
Map location.(19,371,596 - 19,372,785)(19,234,773 - 19,235,924)
sequence
gaattcatagcaaaacagttagcttgttccaagctgacaagctgaattcc
ttactacaattatgctacactttaattaactatctattcttacaaatagt
ttgcaggtttcaattcctaaacaattgattggagtgaaggatagccttgg
ttcgtgatgccttgtaactccttcttggctagtagggattaatacaatct
ctagtatgaaaaaggagggaacttctcctgataatctaaggtccccagta
ttggcttccttgatatggactccctttgtaaactttgtatagtttttaaa
ctttgcaaaccctcaagtcaagaaagaagctaggcccctccctcaaacct
ctctacctgtcataaaagggtttccagcctctataactatcaccccaacc
ccttgatagtgttctcactagattatgctaattataggtgaaattcacgc
aggaaaactcaccaatccctaatcaggaaaacccaccaagccctgagctc
cccaagctcaggacttgaattcccacaaattctcattctggaaatctcta
ccctgagaagctccaccccataaaaatcttctatgatgcctgttctctgt
tcaattcactcctcttttctccagggagcagagacagtcacctcaggatt
cattccttccaataaatctcagaaatgaagaagtagagcagggctgaggt
ccaggagcttctcagctcagctagtgataccctctgttggagagctaaga
tgctgaagaagaggagctgtgcagtagagttgttacactctagtgttcga
actcagccagagatatattcttttagggctgcaaaacctctgctgaggag
gcttcctctcagagctctgtagtttatgtcttatgtctcatgatgccctt
ccgttaggacattgtcccacctcacagctgtgtggtttctgggctcctgg
acccaggactcctttccaccgaagcagaaatgccagacttagcttcagct
ggagttttccaaatggccttacatcaacttccactatttcagttctgttt
accatatgaccaatcatcccgtatatatatgtggatttgaattttattta
tcatgtacctcgtgatacagacatctctttgtgaggctatagtggtttag
aacggtcgttgtcttaaa
gaattcaatgaattaaatattctaaaccattcaagatttttgagtctgca
gcctcagcttcatcactgtccattttctttacaagggatatacagcaatt
gacatgtgttcaatatatagttgtgcatcaaaagaaaaggggtataatta
ttaatagtagtaatgatcatgatgaaaactccaaggtttggaacacatgt
caagtcacattaagtaatcaggagcaaacctttgatgatccattttgaat
attgatgttgttattaaagggcaatgtgggctggagagatggctcagctg
ttaaaggataggctcacaaccaaaaatataaagtgcaatgctccctgatt
caagtcttgctttaggttattgttttctccataacaaataaaacacaaca
tggaaacaaacaaaaatagacttttttaaaaaacttactagaatgtacat
ttgaataaatattttttcttttctattatcattattctcacaattcactg
agaaaaaaattatctgaacttctccactccaaataggtcaagaccaacat
ggatggctttctgtttgatttgtgcataatattctttgtaaacctaccaa
gacaattaaataaggaaaacactttgaattttgatgatgtatacttgagg
aaatgccttatcttattccctctttcacactctatagtcaaagactaata
atttgcttgtttggtacagaaaaataaaataagtagatcaaaagttcttg
catcaagaaacttttatcttccacagctcaatgcttgcctattggaagaa
accccaaatgcccttgcatctttcagcaaagcattaatacctgttgtgaa
aaacctttacgagtgctaactgctccagcaagcagtgaatggggagcagc
aggcctagggattgtatgttactatctacataaatgaagtctatacttca
tgggcttctagcatgccacaaacccttcagatgacaaagcacaaagtgca
ttaaaaggcaccaagttttcctgagacatataaaagcatatacatctgtt
ctcatcatggcaacgggggaaatggccccatgacatgctcacaccaagag
tcagctgggaagaaacaatgaaa
quality valuesOpen.Open.




Alignment Information

BAC End 1BAC End 2
seq1: chr15_19371596_19372785
seq2: B6Ng01-051H15.b_43_1210 (reverse)

seq1  TTTATAGACAACAGACTACGGTTTCTAAAACACAAACCTATAGCCTCACC  50
      |||| ||||||| |||  ||  ||||||| ||     ||||||||||| |
seq2  TTTA-AGACAAC-GAC--CG--TTCTAAACCA-----CTATAGCCTCA-C  38

seq1  AAAGAG-TGTCTGTATCACGAGGTACATAGGATAAATATAAATATCAAAA  99
      |||||| |||||||||||||||||||||  |||||||| |||| ||||| 
seq2  AAAGAGATGTCTGTATCACGAGGTACAT--GATAAATA-AAAT-TCAAAT  84

seq1  TCACATATATATACGGGATGATTGTGTCATTAATTGGTTAAAACAGAACT  149
       ||||||||||||||||||||||| |||||    ||||  ||||||||||
seq2  CCACATATATATACGGGATGATTG-GTCAT---ATGGT--AAACAGAACT  128

seq1  GAAATAGTGGAAGTTGATGTAAGGCCATTTGGAAAAACTCAGCTGAAGCT  199
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||   |||||||||||
seq2  GAAATAGTGGAAGTTGATGTAAGGCCATTTGGAAAACTCCAGCTGAAGCT  178

seq1  AAGTCTTGGCATTTCTGCTTCGGTGGAAAGGAGTCCTGGGTCCAGGAGCC  249
      ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAGTC-TGGCATTTCTGCTTCGGTGGAAAGGAGTCCTGGGTCCAGGAGCC  227

seq1  CAGAAACCACACAGCTGTGAGGTGGGACAATGTCCTAACGGAAGGGCATC  299
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CAGAAACCACACAGCTGTGAGGTGGGACAATGTCCTAACGGAAGGGCATC  277

seq1  ATGAGACATAAGACATAAACTACAGAGCTCTGAGAGGAAGCCTCCTCAGC  349
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATGAGACATAAGACATAAACTACAGAGCTCTGAGAGGAAGCCTCCTCAGC  327

seq1  AGAGGTTTTGCAGCCCTAAAAGAATATATCTCTGGCTGAGTTCGAACACT  399
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGAGGTTTTGCAGCCCTAAAAGAATATATCTCTGGCTGAGTTCGAACACT  377

seq1  AGAGTGTAACAACTCTACTGCACAGCTCCTCTTCTTCAGCATCTTAGCTC  449
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGAGTGTAACAACTCTACTGCACAGCTCCTCTTCTTCAGCATCTTAGCTC  427

seq1  TCCAACAGAGGGTATCACTAGCTGAGCTGAGAAGCTCCTGGACCTCAGCC  499
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCCAACAGAGGGTATCACTAGCTGAGCTGAGAAGCTCCTGGACCTCAGCC  477

seq1  CTGCTCTACTTCTTCATTTCTGAGATTTATTGGAAGGAATGAATCCTGAG  549
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTGCTCTACTTCTTCATTTCTGAGATTTATTGGAAGGAATGAATCCTGAG  527

seq1  GTGACTGTCTCTGCTCCCTGGAGAAAAGAGGAGTGAATTGAACAGAGAAC  599
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTGACTGTCTCTGCTCCCTGGAGAAAAGAGGAGTGAATTGAACAGAGAAC  577

seq1  AGGCATCATAGAAGATTTTTATGGGGTGGAGCTTCTCAGGGTAGAGATTT  649
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGGCATCATAGAAGATTTTTATGGGGTGGAGCTTCTCAGGGTAGAGATTT  627

seq1  CCAGAATGAGAATTTGTGGGAATTCAAGTCCTGAGCTTGGGGAGCTCAGG  699
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCAGAATGAGAATTTGTGGGAATTCAAGTCCTGAGCTTGGGGAGCTCAGG  677

seq1  GCTTGGTGGGTTTTCCTGATTAGGGATTGGTGAGTTTTCCTGCGTGAATT  749
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GCTTGGTGGGTTTTCCTGATTAGGGATTGGTGAGTTTTCCTGCGTGAATT  727

seq1  TCACCTATAATTAGCATAATCTAGTGAGAACACTATCAAGGGGTTGGGGT  799
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCACCTATAATTAGCATAATCTAGTGAGAACACTATCAAGGGGTTGGGGT  777

seq1  GATAGTTATAGAGGCTGGAAACCCTTTTATGACAGGTAGAGAGGTTTGAG  849
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GATAGTTATAGAGGCTGGAAACCCTTTTATGACAGGTAGAGAGGTTTGAG  827

seq1  GGAGGGGCCTAGCTTCTTTCTTGACTTGAGGGTTTGCAAAGTTTAAAAAC  899
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGAGGGGCCTAGCTTCTTTCTTGACTTGAGGGTTTGCAAAGTTTAAAAAC  877

seq1  TATACAAAGTTTACAAAGGGAGTCCATATCAAGGAAGCCAATACTGGGGA  949
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TATACAAAGTTTACAAAGGGAGTCCATATCAAGGAAGCCAATACTGGGGA  927

seq1  CCTTAGATTATCAGGAGAAGTTCCCTCCTTTTTCATACTAGAGATTGTAT  999
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCTTAGATTATCAGGAGAAGTTCCCTCCTTTTTCATACTAGAGATTGTAT  977

seq1  TAATCCCTACTAGCCAAGAAGGAGTTACAAGGCATCACGAACCAAGGCTA  1049
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TAATCCCTACTAGCCAAGAAGGAGTTACAAGGCATCACGAACCAAGGCTA  1027

seq1  TCCTTCACTCCAATCAATTGTTTAGGAATTGAAACCTGCAAACTATTTGT  1099
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCCTTCACTCCAATCAATTGTTTAGGAATTGAAACCTGCAAACTATTTGT  1077

seq1  AAGAATAGATAGTTAATTAAAGTGTAGCATAATTGTAGTAAGGAATTCAG  1149
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAGAATAGATAGTTAATTAAAGTGTAGCATAATTGTAGTAAGGAATTCAG  1127

seq1  CTTGTCAGCTTGGAACAAGCTAACTGTTTTGCTATGAATTC  1190
      |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTTGTCAGCTTGGAACAAGCTAACTGTTTTGCTATGAATTC  1168

seq1: chr15_19234773_19235924
seq2: B6Ng01-051H15.g_66_1188

seq1  GAATTCAATGAATTAAATATTCTAAACCATTCAAGATTTTTGAGTCTGCA  50
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAATTCAATGAATTAAATATTCTAAACCATTCAAGATTTTTGAGTCTGCA  50

seq1  GCCTCAGCTTCATCACTGTCCATTTTCTTTACAAGGGATATACAGCAATT  100
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GCCTCAGCTTCATCACTGTCCATTTTCTTTACAAGGGATATACAGCAATT  100

seq1  GACATGTGTTCAATATATAGTTGTGCATCAAAAGAAAAGGGGTATAATTA  150
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GACATGTGTTCAATATATAGTTGTGCATCAAAAGAAAAGGGGTATAATTA  150

seq1  TTAATAGTAGTAATGATCATGATGAAAACTCCAAGGTTTGGAACACATGT  200
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTAATAGTAGTAATGATCATGATGAAAACTCCAAGGTTTGGAACACATGT  200

seq1  CAAGTCACATTAAGTAATCAGGAGCAAACCTTTGATGATCCATTTTGAAT  250
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CAAGTCACATTAAGTAATCAGGAGCAAACCTTTGATGATCCATTTTGAAT  250

seq1  ATTGATGTTGTTATTAAAGGGCAATGTGGGCTGGAGAGATGGCTCAGCTG  300
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATTGATGTTGTTATTAAAGGGCAATGTGGGCTGGAGAGATGGCTCAGCTG  300

seq1  TTAAAGGATAGGCTCACAACCAAAAATATAAAGTGCAATGCTCCCTGATT  350
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTAAAGGATAGGCTCACAACCAAAAATATAAAGTGCAATGCTCCCTGATT  350

seq1  CAAGTCTTGCTTTAGGTTATTGTTTTCTCCATAACAAATAAAACACAACA  400
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CAAGTCTTGCTTTAGGTTATTGTTTTCTCCATAACAAATAAAACACAACA  400

seq1  TGGAAACAAACAAAAATAGACTTTTTTAAAAAACTTACTAGAATGTACAT  450
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGGAAACAAACAAAAATAGACTTTTTTAAAAAACTTACTAGAATGTACAT  450

seq1  TTGAATAAATATTTTTTCTTTTCTATTATCATTATTCTCACAATTCACTG  500
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTGAATAAATATTTTTTCTTTTCTATTATCATTATTCTCACAATTCACTG  500

seq1  AGAAAAAAATTATCTGAACTTCTCCACTCCAAATAGGTCAAGACCAACAT  550
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGAAAAAAATTATCTGAACTTCTCCACTCCAAATAGGTCAAGACCAACAT  550

seq1  GGATGGCTTTCTGTTTGATTTGTGCATAATATTCTTTGTAAACCTACCAA  600
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGATGGCTTTCTGTTTGATTTGTGCATAATATTCTTTGTAAACCTACCAA  600

seq1  GACAATTAAATAAGGAAAACACTTTGAATTTTGATGATGTATACTTGAGG  650
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GACAATTAAATAAGGAAAACACTTTGAATTTTGATGATGTATACTTGAGG  650

seq1  AAATGCCTTATCTTATTCCCTCTTTCACACTCTATAGTCAAAGACTAATA  700
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAATGCCTTATCTTATTCCCTCTTTCACACTCTATAGTCAAAGACTAATA  700

seq1  ATTTGCTTGTTTGGTACAGAAAAATAAAATAAGTAGATCAAAAGTTCTTG  750
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATTTGCTTGTTTGGTACAGAAAAATAAAATAAGTAGATCAAAAGTTCTTG  750

seq1  CATCAAGAAACTTTTATCTTCCACAGCTCAATGCTTGCCTATTGGAAGAA  800
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CATCAAGAAACTTTTATCTTCCACAGCTCAATGCTTGCCTATTGGAAGAA  800

seq1  ACCCCAAATGCCCTTGCATCTTTCAGCAAAGCATTAATACCTGTTGTGAA  850
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACCCCAAATGCCCTTGCATCTTTCAGCAAAGCATTAATACCTGTTGTGAA  850

seq1  AAACCTTTACGAGTGCTAACTGCTCCAGCAAGCAGTGAATGGGGAGCAGC  900
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAACCTTTACGAGTGCTAACTGCTCCAGCAAGCAGTGAATGGGGAGCAGC  900

seq1  AGGCCTAGGGATTGTATGTTACTATCTACAATAAAATGAAGTTCTATACT  950
      ||||||||||||||||||||||||||||||   |||||||| ||||||||
seq2  AGGCCTAGGGATTGTATGTTACTATCTACA--TAAATGAAG-TCTATACT  947

seq1  TCATGGGCTTCTAAGCATGCCACAAACCCTTCAGATGACAAAAGGCACAA  1000
      |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  ||||||
seq2  TCATGGGCTTCT-AGCATGCCACAAACCCTTCAGATGACAAA--GCACAA  994

seq1  AGTGCCATTAAAAGGCACCAAGTTTTCCTGAAGACAATTATAAAAGCATA  1050
      |||| ||||||||||||||||||||||||| |||||  ||||||||||||
seq2  AGTG-CATTAAAAGGCACCAAGTTTTCCTG-AGACA--TATAAAAGCATA  1040

seq1  TACCATCTGTTCTCAATCATGGGCAACAGGGGAGAAAATGTGCACCACAT  1100
      || ||||||||||| ||||| |||||| ||||   |||||    || |||
seq2  TA-CATCTGTTCTC-ATCAT-GGCAACGGGGG---AAATG---GCCCCAT  1081

seq1  GACATGCTACACACACAGAGAAGTCAAGCTGGGAGAAGAAAAGCATATGA  1150
      ||||||||   |||||  || |||| ||||||  |||||||  || ||||
seq2  GACATGCT---CACACCAAG-AGTC-AGCTGG--GAAGAAA--CA-ATGA  1121

seq1  AA  1152
      ||
seq2  AA  1123