BAC Information

Click to search

BAC

Clone NameB6Ng01-056L08
Chromosome15 (Build37)
Map Location 64,543,049 - 64,689,942
singlet/doubletdoublet
Overlap geneAdcy8
Upstream geneLOC672194, Mlze, AI987692, Gsdmdc2, 9930109F21Rik, LOC665769, 9030605I04Rik, 4933426G20Rik, 0910001A06Rik, Ddef1
Downstream geneLOC268812, LOC100040790, LOC665836, C920006C10Rik
LinkOpen Mouse BAC browser



BAC End Information

BAC end BAC-end 1BAC-end 2
end nameB6Ng01-056L08.bB6Ng01-056L08.g
ACCDH878784DH878785
length1,0501,063
definitionDH878784|Mus musculus domesticus DNA, BAC clone: B6Ng01-056L08, 5' end.DH878785|Mus musculus domesticus DNA, BAC clone: B6Ng01-056L08, 3' end.
singlet/doubletdoubletdoublet
BLAST hituniqueunique
Map location.(64,688,889 - 64,689,942)(64,543,049 - 64,544,113)
sequence
gaattccctgcacaacccacaaccaacatgctatctgttccactggaggg
tttttgtttgtttttgtttttgttttcttttttttttttctattttacaa
ccttgggtaaggatcttatggatctggtaagtgttataagcatgagcttc
ttgaagccttgcaagtttcattagctttctgagtcttaggactttccttc
tctctccaagtgaagatgattcaatttggaagaaatggcttccccacaac
agatcagcacaatgattccttctagctgctaggaaagtgttgagctatgg
atgaacaaagactgagacttagtgctcattgatttccatgtctcagctgt
ctttgctctagagaactgttgttaccccacagaggcagtcctccacccct
cattccagcttgccgatatttccacgtatgatttgcatttgggggggatg
gcaaagtgaggagtggctttaaatgaaagacaaacatggatttgagtcta
gcattagcttcctatcctttaggtgcccccgagttcaacatctaagatga
aacttcatatatcttgaggctatcaccagataatcaagctacctatagaa
agtacctagtcgattggttggcttagtggggcatgaagaggtgttagtta
agaataatggttgattaataatggaccattttgagttatatcctgagttt
gacaacagtacacactcagagtctcatagtgcaggttttcatgttatttg
tgttcctattcagatctcatcctcgagcagtatttcactttaaatactcc
ttattcacagaaaggccatcaccctgtactcatttgcatacaattaacat
ttccagaggcattcaagaaggaagaaatcaatcaccatgacaggtctcca
cacctttgttcaatctcagagttaggggaaccacatgggaatattttatc
tcatgaatctaaacagacctagcatttgatgtttaaacagcccacctaag
aaaactgacagaaagtcttgttctgttaccttgattaactgtaaacactt

gaattctctgttacccacatcttgctttttcctagctgcagcgcagggaa
gtaaacagctctgctctaccatgtgtctcttccatgatcctctctgtcac
cacaggcctggaaatcatggtgccaatcagcatgtactgaaaatcttgaa
tgcataggcaaaacgagcctgtcctcccttaagaggcttgcttgctaagg
cattcctctacagtagtgaaaaacaaaacaaaacaaaaaagccccaaacc
aaaaccaaaatccaatgcactaactcaagaggtcttgttgtctattcttt
cattcctattgctttagttaggggcacagacgactggaggtggcttcttc
aaagtgagacaattcaagttaatatacaatgggcttaactaaaaagataa
agggagaaataggagaccctagtaatccccctgggaacaaagcagcagag
ctctcaggcccctttagattaggagacattagaacagctcaggaatttta
cacaggaacagtatggcagtcgcattgaagagctgtggaggaacacggcc
agcatcacgtgattcccaggcaatacatatcctggcctctctgcttctcc
tcactgagataacctagcaccccctcccctattggcagtccccagtctgg
gtgccagagcccatgggaagtcattgatgctatgcactcagtttgtcccc
aaccctaccctgggccaagtagaaaagaggatgaaggggcttggagaatc
acacggaagagacttatgtaacctacccaccacctttcagagagggccac
tttatttaactcactccaattaactgcttttcagggctccatctgtttcc
tccctattctgggatgaagaaaactaaaagcgtgctgtaaactgtagaag
gaaagatggattatagaaaagctataatcgttttattgtcatctttctgt
gttgggttggagcagaggtttggagcccgtagggaactgtgaagctcacg
cttcccttctcacttcacttgaggatgcagcggagaaactgttcctctct
cttctggggaacc
quality valuesOpen.Open.




Alignment Information

BAC End 1BAC End 2
seq1: chr15_64688889_64689942
seq2: B6Ng01-056L08.b_47_1096 (reverse)

seq1  ATGTGTCTACAGTTATATCAAGGTAACAGAACAGGACTTTCTGTCAGTAT  50
      | |||| |||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| |
seq2  AAGTGTTTACAGTTA-ATCAAGGTAACAGAACAAGACTTTCTGTCAGT-T  48

seq1  TTCTTAGGTGGGCTGTATTAAACATCAAATGCTAGGTCTGTTTAGATTCA  100
      |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTCTTAGGTGGGCTGT-TTAAACATCAAATGCTAGGTCTGTTTAGATTCA  97

seq1  TGAGATAAAATATTCCCATGTGGTTCCCCTAACTCTTGAGACTGGATCAA  150
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| | || |||
seq2  TGAGATAAAATATTCCCATGTGGTTCCCCTAACTC-TGAGA-TTGAACAA  145

seq1  AGGTGTGGAGACCTGTCATGGTGATTGATTTCTTCCTTCTTGAATGCCTC  200
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGGTGTGGAGACCTGTCATGGTGATTGATTTCTTCCTTCTTGAATGCCTC  195

seq1  TGGAAATGTTAATTGTATGCAAATGAGTACAGGGTGATGGCCTTTCTGTG  250
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGGAAATGTTAATTGTATGCAAATGAGTACAGGGTGATGGCCTTTCTGTG  245

seq1  AATAAGGAGTATTTAAAGTG-AATACTGCTCGAGGATGAGATCTGAATAG  299
      |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AATAAGGAGTATTTAAAGTGAAATACTGCTCGAGGATGAGATCTGAATAG  295

seq1  GAACACAAATAACATGAAAACCTGCACTATGAGACTCTGAGTGTGTACTG  349
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAACACAAATAACATGAAAACCTGCACTATGAGACTCTGAGTGTGTACTG  345

seq1  TTGTCAAACTCAGGATATAACTCAAAATGGTCCATTATTAATCAACCATT  399
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTGTCAAACTCAGGATATAACTCAAAATGGTCCATTATTAATCAACCATT  395

seq1  ATTCTTAACTAACACCTCTTCATGCCCCACTAAGCCAACCAATCGACTAG  449
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATTCTTAACTAACACCTCTTCATGCCCCACTAAGCCAACCAATCGACTAG  445

seq1  GTACTTTCTATAGGTAGCTTGATTATCTGGTGATAGCCTCAAGATATATG  499
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTACTTTCTATAGGTAGCTTGATTATCTGGTGATAGCCTCAAGATATATG  495

seq1  AAGTTTCATCTTAGATGTTGAACTCGGGGGCACCTAAAGGATAGGAAGCT  549
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAGTTTCATCTTAGATGTTGAACTCGGGGGCACCTAAAGGATAGGAAGCT  545

seq1  AATGCTAGACTCAAATCCATGTTTGTCTTTCATTTAAAGCCACTCCTCAC  599
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AATGCTAGACTCAAATCCATGTTTGTCTTTCATTTAAAGCCACTCCTCAC  595

seq1  TTTGCCATCCCCCCCAAATGCAAATCATACGTGGAAATATCGGCAAGCTG  649
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTTGCCATCCCCCCCAAATGCAAATCATACGTGGAAATATCGGCAAGCTG  645

seq1  GAATGAGGGGTGGAGGACTGCCTCTGTGGGGTAACAACAGTTCTCTAGAG  699
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAATGAGGGGTGGAGGACTGCCTCTGTGGGGTAACAACAGTTCTCTAGAG  695

seq1  CAAAGACAGCTGAGACATGGAAATCAATGAGCACTAAGTCTCAGTCTTTG  749
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CAAAGACAGCTGAGACATGGAAATCAATGAGCACTAAGTCTCAGTCTTTG  745

seq1  TTCATCCATAGCTCAACACTTTCCTAGCAGCTAGAAGGAATCATTGTGCT  799
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTCATCCATAGCTCAACACTTTCCTAGCAGCTAGAAGGAATCATTGTGCT  795

seq1  GATCTGTTGTGGGGAAGCCATTTCTTCCAAATTGAATCATCTTCACTTGG  849
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GATCTGTTGTGGGGAAGCCATTTCTTCCAAATTGAATCATCTTCACTTGG  845

seq1  AGAGAGAAGGAAAGTCCTAAGACTCAGAAAGCTAATGAAACTTGCAAGGC  899
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGAGAGAAGGAAAGTCCTAAGACTCAGAAAGCTAATGAAACTTGCAAGGC  895

seq1  TTCAAGAAGCTCATGCTTATAACACTTACCAGATCCATAAGATCCTTACC  949
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTCAAGAAGCTCATGCTTATAACACTTACCAGATCCATAAGATCCTTACC  945

seq1  CAAGGTTGTAAAATAGAAAAAAAAAAAAGAAAACAAAAACAAAAACAAAC  999
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CAAGGTTGTAAAATAGAAAAAAAAAAAAGAAAACAAAAACAAAAACAAAC  995

seq1  AAAAACCCTCCAGTGGAACAGATAGCATGTTGGTTGTGGGTTGTGCAGGG  1049
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAAAACCCTCCAGTGGAACAGATAGCATGTTGGTTGTGGGTTGTGCAGGG  1045

seq1  AATTC  1054
      |||||
seq2  AATTC  1050

seq1: chr15_64543049_64544113
seq2: B6Ng01-056L08.g_69_1131

seq1  GAATTCTCTGTTACCCACATCTTGCTTTTTCCTAGCTGCAGCGCAGGGAA  50
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAATTCTCTGTTACCCACATCTTGCTTTTTCCTAGCTGCAGCGCAGGGAA  50

seq1  GTAAACAGCTCTGCTCTACCATGTGTCTCTTCCATGATCCTCTCTGTCAC  100
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTAAACAGCTCTGCTCTACCATGTGTCTCTTCCATGATCCTCTCTGTCAC  100

seq1  CACAGGCCTGGAAATCATGGTGCCAATCAGCATGTACTGAAAATCTTGAA  150
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CACAGGCCTGGAAATCATGGTGCCAATCAGCATGTACTGAAAATCTTGAA  150

seq1  TGCATAGGCAAAACGAGCCTGTCCTCCCTTAAGAGGCTTGCTTGCTAAGG  200
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGCATAGGCAAAACGAGCCTGTCCTCCCTTAAGAGGCTTGCTTGCTAAGG  200

seq1  CATTCCTCTACAGTAGTGAAAAACAAAACAAAACAAAAAAGCCCCAAACC  250
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CATTCCTCTACAGTAGTGAAAAACAAAACAAAACAAAAAAGCCCCAAACC  250

seq1  AAAACCAAAATCCAATGCACTAACTCAAGAGGTCTTGTTGTCTATTCTTT  300
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAAACCAAAATCCAATGCACTAACTCAAGAGGTCTTGTTGTCTATTCTTT  300

seq1  CATTCCTATTGCTTTAGTTAGGGGCACAGACGACTGGAGGTGGCTTCTTC  350
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CATTCCTATTGCTTTAGTTAGGGGCACAGACGACTGGAGGTGGCTTCTTC  350

seq1  AAAGTGAGACAATTCAAGTTAATATACAATGGGCTTAACTAAAAAGATAA  400
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAAGTGAGACAATTCAAGTTAATATACAATGGGCTTAACTAAAAAGATAA  400

seq1  AGGGAGAAATAGGAGACCCTAGTAATCCCCCTGGGAACAAAGCAGCAGAG  450
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGGGAGAAATAGGAGACCCTAGTAATCCCCCTGGGAACAAAGCAGCAGAG  450

seq1  CTCTCAGGCCCCTTTAGATTAGGAGACATTAGAACAGCTCAGGAATTTTA  500
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTCTCAGGCCCCTTTAGATTAGGAGACATTAGAACAGCTCAGGAATTTTA  500

seq1  CACAGGAACAGTATGGCAGTCGCATTGAAGAGCTGTGGAGGAACACGGCC  550
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CACAGGAACAGTATGGCAGTCGCATTGAAGAGCTGTGGAGGAACACGGCC  550

seq1  AGCATCACGTGATTCCCAGGCAATACATATCCTGGCCTCTCTGCTTCTCC  600
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGCATCACGTGATTCCCAGGCAATACATATCCTGGCCTCTCTGCTTCTCC  600

seq1  TCACTGAGATAACCTAGCACCCCCTCCCCTATTGGCAGTCCCCAGTCTGG  650
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCACTGAGATAACCTAGCACCCCCTCCCCTATTGGCAGTCCCCAGTCTGG  650

seq1  GTGCCAGAGCCCATGGGAAGTCATTGATGCTATGCACTCAGTTTGTCCCC  700
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTGCCAGAGCCCATGGGAAGTCATTGATGCTATGCACTCAGTTTGTCCCC  700

seq1  AACCCTACCCTGGGCCAAGTAGAAAAGAGGATGAAGGGGCTTGGAGAATC  750
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AACCCTACCCTGGGCCAAGTAGAAAAGAGGATGAAGGGGCTTGGAGAATC  750

seq1  ACACGGAAGAGACTCATGTAACCTACCCACCACC-TTCAGAGAGGGCCAC  799
      |||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||
seq2  ACACGGAAGAGACTTATGTAACCTACCCACCACCTTTCAGAGAGGGCCAC  800

seq1  TTTATTTAACTCACTCCAATTAACTGC-TTTCAGGGCTCCATCTGTTT-C  847
      ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |
seq2  TTTATTTAACTCACTCCAATTAACTGCTTTTCAGGGCTCCATCTGTTTCC  850

seq1  TCCCTATTCTGGGATGAAGAAAACTAAAAGCGTGCTGTAAACTGTAGAAG  897
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCCCTATTCTGGGATGAAGAAAACTAAAAGCGTGCTGTAAACTGTAGAAG  900

seq1  GATAGATGGA-TATAGAAAAGCTATAATCGTTTTATTGTCATCTTTCTGT  946
      || ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAAAGATGGATTATAGAAAAGCTATAATCGTTTTATTGTCATCTTTCTGT  950

seq1  G-TGGGTTGGAAGCAGAGGTTTGGAGCCCGTAGGGAACTGTGAAGGCTCA  995
      | |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||
seq2  GTTGGGTTGG-AGCAGAGGTTTGGAGCCCGTAGGGAACTGTGAA-GCTCA  998

seq1  CGCTTCCCCCTCCTCCACTCCACTTGAGGATGCAGGCGGAGAAACTGCTC  1045
      |||||  |||| || |||| |||||||||||||| |||||||||||| ||
seq2  CGCTT--CCCTTCT-CACTTCACTTGAGGATGCA-GCGGAGAAACTGTTC  1044

seq1  TCCTCTCTTCTGGGGGAACC  1065
        ||||||||| ||||||||
seq2  CTCTCTCTTCT-GGGGAACC  1063