BAC Information

Click to search

BAC

Clone NameB6Ng01-057L21
Chromosome15 (Build37)
Map Location 58,353,169 - 58,469,371
singlet/doubletdoublet
Overlap geneEG631797
Upstream geneZhx2, Derl1, Wdr67, BC030396, 9130401M01Rik, Zhx1, Atad2, LOC665244, 2410187C16Rik, Fbxo32, 8230402K04Rik, Anxa13, LOC100040231, D15Ertd621e
Downstream geneTmem65, EG546638, Trmt12, Rnf139, Tatdn1, Ndufb9, Mtss1, LOC100040330, EG268809, LOC665565, Sqle, E430025E21Rik, Nsmce2
LinkOpen Mouse BAC browser



BAC End Information

BAC end BAC-end 1BAC-end 2
end nameB6Ng01-057L21.bB6Ng01-057L21.g
ACCDH879522DH879523
length1,0301,025
definitionDH879522|Mus musculus domesticus DNA, BAC clone: B6Ng01-057L21, 5' end.DH879523|Mus musculus domesticus DNA, BAC clone: B6Ng01-057L21, 3' end.
singlet/doubletdoubletdoublet
BLAST hituniqueunique
Map location.(58,353,169 - 58,354,200)(58,468,338 - 58,469,371)
sequence
gaattcttttcacttgaaaacctccccaaccctattccattcatcaagaa
cagacacaggctggcataaaagttgcagtagaatggcgggcgggactctt
ggacttcactctgagtttgatctgagtttgaccttgatgcttcggggcta
atctggtgtgtagtctatctactaagtgaaatagctgaactgaatgacca
agctttctccagcatagtcttcattattgaaggtcttagtgtctgatctc
caatatttattgaatgcttgatgtcggaggcaagaagaatggaataagtg
gtgtttctctcttctaggagctttcggcatgcgtggctagacaccaagag
tggcggtgatggtgatgggtctgaacaccttctcagttgatcagcatgct
tcagcacaagcaatttcaacatccactgctcactttataccaataattgg
attgcagcatggtattattttatagaaagacgtgcctgcttgccaatttc
agtgatagttcccttgggttgggtagcataaggatgctttgggtttaggt
tgcacaggaaaacaatgcacaggccaccttccatggtggaattttgttca
atggatatgctaaatactagcactaaagtataaagtataaagtataaagt
ataaagtttaagagataaggatttagaatagtgtcttgactttatcacct
aaagctgattgagtctggacaagtagcttgaatgcttatctatctatcat
ctatctatctatctatctatctatctatctatctatctatcatctatcat
ctaactatcatctatctatcatacatatatcaatctatcatttatcaatt
atctatcatctaactatcatctacctatcatctatcatctaactatcatc
tctctgtcatctaactatcatctatctatcatacatatatcaatctatca
tttatcattatctatcatctaactatcatctatctatcatctatcatcta
actatcatctccctgtcatctaacatcatc
gaattcagttagcgctgacagggatctgtgtagtttattatccaagtaca
agcattgacttctgatttatttatcaattttcaatagacaatgattcgcc
ctttcacgtcatattttagagttgttggtctgatttccagtctgatttca
gacctgaattctgtgtctgttaaatattgtggatcttacttaatctcttc
caccctccatgtatgacatttttttaaataacatggtggggcagttggtc
acataaaacacacatgcctcttccaggttttcagctcatacacagtgata
atactttctgtcactgctttgttgaggaacaccagctggagttttcaaaa
agaaaacctcgctgatggaaacagaatttcagggatgaaatgctgtctcc
ccatggctgagccccttgaggacagaatcattcttatttccaccccactg
gagcttgcacttggccatcagaaaatatatatttagtggctaattctttg
aactacaaaacatgtcagaaatctatatccaatacctctattttgtggac
aagggaaccaaaatcctgagaatataaatgaaggatcatgaatcaagctt
tcctgaagcactcaagggtatcctaagactagtatggccataattaaccc
tccccagtgagaaaaaggcagttttatagcagcaattattatagttgata
gagcaggctctaaaaggtcccccttggggctgaacaggggagaaatctat
gtgcccttcatctgtcaagcatggtggtgcctttcttagctcagtatttg
gatcctagttgtaatggctattctggggtttcattggaaggaagcaccca
acattccatcactggactttgctatcagcatattagccaaacaggacaga
cttgatatggcttcactgtccctggtaacaatgacagagacatggtgctc
tggccttctcatcaactgtgctgaaatgatgtggtctgaattttactgag
ctgtcaagagtttgccaaaccctgg
quality valuesOpen.Open.




Alignment Information

BAC End 1BAC End 2
seq1: chr15_58353169_58354200
seq2: B6Ng01-057L21.b_46_1075

seq1  GAATTCTTTTCACTTGAAAACCTCCCCAACCCTATTCCATTCATCAAGAA  50
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAATTCTTTTCACTTGAAAACCTCCCCAACCCTATTCCATTCATCAAGAA  50

seq1  CAGACACAGGCTGGCATAAAAGTTGCAGTAGAATGGCGGGCGGGACTCTT  100
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CAGACACAGGCTGGCATAAAAGTTGCAGTAGAATGGCGGGCGGGACTCTT  100

seq1  GGACTTCACTCTGAGTTTGATCTGAGTTTGACCTTGATGCTTCGGGGCTA  150
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGACTTCACTCTGAGTTTGATCTGAGTTTGACCTTGATGCTTCGGGGCTA  150

seq1  ATCTGGTGTGTAGTCTATCTACTAAGTGAAATAGCTGAACTGAATGACCA  200
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATCTGGTGTGTAGTCTATCTACTAAGTGAAATAGCTGAACTGAATGACCA  200

seq1  AGCTTTCTCCAGCATAGTCTTCATTATTGAAGGTCTTAGTGTCTGATCTC  250
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGCTTTCTCCAGCATAGTCTTCATTATTGAAGGTCTTAGTGTCTGATCTC  250

seq1  CAATATTTATTGAATGCTTGATGTCGGAGGCAAGAAGAATGGAATAAGTG  300
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CAATATTTATTGAATGCTTGATGTCGGAGGCAAGAAGAATGGAATAAGTG  300

seq1  GTGTTTCTCTCTTCTAGGAGCTTTCGGCATGCGTGGCTAGACACCAAGAG  350
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTGTTTCTCTCTTCTAGGAGCTTTCGGCATGCGTGGCTAGACACCAAGAG  350

seq1  TGGCGGTGATGGTGATGGGTCTGAACACCTTCTCAGTTGATCAGCATGCT  400
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGGCGGTGATGGTGATGGGTCTGAACACCTTCTCAGTTGATCAGCATGCT  400

seq1  TCAGCACAAGCAATTTCAACATCCACTGCTCACTTTATACCAATAATTGG  450
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCAGCACAAGCAATTTCAACATCCACTGCTCACTTTATACCAATAATTGG  450

seq1  ATTGCAGCATGGTATTATTTTATAGAAAGACGTGCCTGCTTGCCAATTTC  500
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATTGCAGCATGGTATTATTTTATAGAAAGACGTGCCTGCTTGCCAATTTC  500

seq1  AGTGATAGTTCCCTTGGGTTGGGTAGCATAAGGATGCTTTGGGTTTAGGT  550
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGTGATAGTTCCCTTGGGTTGGGTAGCATAAGGATGCTTTGGGTTTAGGT  550

seq1  TGCACAGGAAAACAATGCACAGGCCACCTTCCATGGTGGAATTTTGTTCA  600
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGCACAGGAAAACAATGCACAGGCCACCTTCCATGGTGGAATTTTGTTCA  600

seq1  ATGGATATGCTAAATACTAGCACTAAAGTATAAAGTATAAAGTATAAAGT  650
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATGGATATGCTAAATACTAGCACTAAAGTATAAAGTATAAAGTATAAAGT  650

seq1  ATAAAGTTTAAGAGATAAGGATTTAGAATAGTGTCTTGACTTTATCACCT  700
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATAAAGTTTAAGAGATAAGGATTTAGAATAGTGTCTTGACTTTATCACCT  700

seq1  AAAGCTGATTGAGTCTGGACAAGTAGCTTGAATGCTTATCTATCTATCAT  750
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAAGCTGATTGAGTCTGGACAAGTAGCTTGAATGCTTATCTATCTATCAT  750

seq1  CTATCTATCTATCTATCTATCTATCTATCTATCTATCTATCATCTATCAT  800
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTATCTATCTATCTATCTATCTATCTATCTATCTATCTATCATCTATCAT  800

seq1  CTAACTATCATCTATCTATCATACATATATCAATCTATCATTTATCAATT  850
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTAACTATCATCTATCTATCATACATATATCAATCTATCATTTATCAATT  850

seq1  ATCTATCATCTAACTATCATCTACCTATCATCTATCATCTAACTATCATC  900
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATCTATCATCTAACTATCATCTACCTATCATCTATCATCTAACTATCATC  900

seq1  TCTCTGTCATCTAACTATCATCTATCTATCATACATATATCAATCTATCA  950
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCTCTGTCATCTAACTATCATCTATCTATCATACATATATCAATCTATCA  950

seq1  TTTATCAATTATCTATCATCTAACTATCATCTATCTATCATCTATCATCT  1000
      |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTTATC-ATTATCTATCATCTAACTATCATCTATCTATCATCTATCATCT  999

seq1  AACTATCATCTCTCTGTCATCTAACTATCATC  1032
      |||||||||||| |||||||||||| ||||||
seq2  AACTATCATCTCCCTGTCATCTAAC-ATCATC  1030

seq1: chr15_58468338_58469371
seq2: B6Ng01-057L21.g_70_1094 (reverse)

seq1  CCAGGGTTTTGCAAACTCTTTGACAGCTCCAGTTAAAATTCAGACACCAT  50
      ||||||||| |||||||| ||||||||| ||| ||||||||||||  |||
seq2  CCAGGGTTTGGCAAACTC-TTGACAGCT-CAG-TAAAATTCAGACCACAT  47

seq1  CAATTTCAGCACAGTTTGATGAGAAGGGCCAGAGCCACCATGTCTTCTGT  100
      | |||||||||||| |||||||||| |||||||| ||||||||| |||||
seq2  C-ATTTCAGCACAG-TTGATGAGAA-GGCCAGAG-CACCATGTC-TCTGT  92

seq1  CATTGTTACCAGGGACAGTGAAGCCATTATCAAGTCTGTCCTGTTTGGCT  150
      |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||
seq2  CATTGTTACCAGGGACAGTGAAGCCA-TATCAAGTCTGTCCTGTTTGGCT  141

seq1  AATATGCTGATAGCAAAGTCCAGTGATGG-ATGTTGGGTGCTTCCTTCCA  199
      ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||
seq2  AATATGCTGATAGCAAAGTCCAGTGATGGAATGTTGGGTGCTTCCTTCCA  191

seq1  ATGAAACCCCAGAATAGCCATTACAACCTAGGATCCAAATACTGAAGCTA  249
      |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||
seq2  ATGAAACCCCAGAATAGCCATTACAA-CTAGGATCCAAATACTG-AGCTA  239

seq1  AGAAAGGCACCACCATGCTTGACAGATGAAGGGCACATAGATTTCTCCCC  299
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGAAAGGCACCACCATGCTTGACAGATGAAGGGCACATAGATTTCTCCCC  289

seq1  TGTTCAGCCCCAAGGGGGACCTTTTAGAGCCTGCTCTATCAACTATAATA  349
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGTTCAGCCCCAAGGGGGACCTTTTAGAGCCTGCTCTATCAACTATAATA  339

seq1  ATTGCTGCTAT-AAACTGCCTTTTTCTCACTGGGGAGGGTTAATTATGGC  398
      ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATTGCTGCTATAAAACTGCCTTTTTCTCACTGGGGAGGGTTAATTATGGC  389

seq1  CATACTAGTCTTAGGATACCCTTGAGTGCTTCAGGAAAGCTTGATTCATG  448
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CATACTAGTCTTAGGATACCCTTGAGTGCTTCAGGAAAGCTTGATTCATG  439

seq1  ATCCTTCATTTATATTCTCAGGATTTTGGTTCCCTTGTCCACAAAATAGA  498
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATCCTTCATTTATATTCTCAGGATTTTGGTTCCCTTGTCCACAAAATAGA  489

seq1  GGTATTGGATATAGATTTCTGACATGTTTTGTAGTTCAAAGAATTAGCCA  548
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGTATTGGATATAGATTTCTGACATGTTTTGTAGTTCAAAGAATTAGCCA  539

seq1  CTAAATATATATTTTCTGATGGCCAAGTGCAAGCTCCAGTGGGGTGGAAA  598
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTAAATATATATTTTCTGATGGCCAAGTGCAAGCTCCAGTGGGGTGGAAA  589

seq1  TAAGAATGATTCTGTCCTCAAGGGGCTCAGCCATGGGGAGACAGCATTTC  648
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TAAGAATGATTCTGTCCTCAAGGGGCTCAGCCATGGGGAGACAGCATTTC  639

seq1  ATCCCTGAAATTCTGTTTCCATCAGCGAGGTTTTCTTTTTGAAAACTCCA  698
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATCCCTGAAATTCTGTTTCCATCAGCGAGGTTTTCTTTTTGAAAACTCCA  689

seq1  GCTGGTGTTCCTCAACAAAGCAGTGACAGAAAGTATTATCACTGTGTATG  748
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GCTGGTGTTCCTCAACAAAGCAGTGACAGAAAGTATTATCACTGTGTATG  739

seq1  AGCTGAAAACCTGGAAGAGGCATGTGTGTTTTATGTGACCAACTGCCCCA  798
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGCTGAAAACCTGGAAGAGGCATGTGTGTTTTATGTGACCAACTGCCCCA  789

seq1  CCATGTTATTTAAAAAAATGTCATACATGGAGGGTGGAAGAGATTAAGTA  848
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCATGTTATTTAAAAAAATGTCATACATGGAGGGTGGAAGAGATTAAGTA  839

seq1  AGATCCACAATATTTAACAGACACAGAATTCAGGTCTGAAATCAGACTGG  898
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGATCCACAATATTTAACAGACACAGAATTCAGGTCTGAAATCAGACTGG  889

seq1  AAATCAGACCAACAACTCTAAAATATGACGTGAAAGGGCGAATCATTGTC  948
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAATCAGACCAACAACTCTAAAATATGACGTGAAAGGGCGAATCATTGTC  939

seq1  TATTGAAAATTGATAAATAAATCAGAAGTCAATGCTTGTACTTGGATAAT  998
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TATTGAAAATTGATAAATAAATCAGAAGTCAATGCTTGTACTTGGATAAT  989

seq1  AAACTACACAGATCCCTGTCAGCGCTAACTGAATTC  1034
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAACTACACAGATCCCTGTCAGCGCTAACTGAATTC  1025