BAC Information

Click to search

BAC

Clone NameB6Ng01-059A03
Chromosome15 (Build37)
Map Location 70,091,819 - 70,250,891
singlet/doubletdoublet
Overlap genenone
Upstream geneLOC383050
Downstream geneLOC383051
LinkOpen Mouse BAC browser



BAC End Information

BAC end BAC-end 1BAC-end 2
end nameB6Ng01-059A03.bB6Ng01-059A03.g
ACCDH880430DH880431
length1,0641,211
definitionDH880430|Mus musculus domesticus DNA, BAC clone: B6Ng01-059A03, 5' end.DH880431|Mus musculus domesticus DNA, BAC clone: B6Ng01-059A03, 3' end.
singlet/doubletdoubletdoublet
BLAST hituniqueunique
Map location.(70,091,819 - 70,092,897)(70,249,636 - 70,250,891)
sequence
gaattccacataaaatttatattctaagttagttttgagaagtgaatcat
tttctaatttgtgttctcaaaaataatcattgaaagaatgaatgcaagtt
ataaaagcatgacatggactattaactgatgctactggttttacacaata
caacacagactatgtcttaatttgagagaaaattttcactaactctcctg
gtcgggatagtgatcctgcagagcagtggttatcaatccccctaatgctg
tgatccatagcacagttcctcatatggtggtgaccccaaccataaaatta
ttttgtttctctttcagaactctagtttactactgttatgaattgtaaag
taagtacttgatatgctgacaatcactgttgcagaatgaccatagctgta
ctaaaataatgtttttgataattttatcatttaaaagtacatataacaat
actcatttttttaaaatgttttatttgctcaattaacaaaaccaggaagt
aggaagtaggggaatgatggataagtctatggatgatgaattttatcaag
tttgttgtgaaactcatcaactctgttggaaatcaaaaggacctcgtggt
cttttttgtcagttaactcttaattctgctctactttaaaatttgaagac
aacaaagatatttcagatgtgtcaaattcacagtgaagagacagctggac
aaactttattcttcctccttacagaactgactaaaggatggatcatccat
gagctgtgactactaattaagatgcaaattttagagccagagctcaagct
gttaatcctcaccttatcactgagtgaccttggcaggcctcttaagcaat
aggatccaagagtcaacctgtgaaatgatggttctaacaactataactgg
aagatcttgcgaagataaattaactatgtcatgtatggatactgttttaa
cagtgctcttttggtgccagagatcataaatagtgatgttgtcttaagaa
aatcctaagttctaaagttgtactgaaagcataactagattgtcctcttt
tacttacattgatc
gaattcagaaaaaaaaaatatatatatatatacacttaaagtgctgatac
ataataatattgtttcaaagcacatttgacagtaaaatagaatcaagagt
ctcattaattatactgttagattttatctgcagtgaccctatcctcgtga
gttaaaggtttgggccaagacctttgattctatggacaggttatagagct
attgaagggaaggtctagttgaagagattatgtcagtagggcatgccttt
ttagatgattggtgcagatcttgctcagtatctttatatcccaatcatga
gatacagggtatgcttcactacaagtttctaacatggtgatgactcctta
caagttccagtgcagtggataatatctgtcacagagcaagaagtccaaag
ctataatttactaaagccaatatttgattatgacaattaagaactaacat
aataactaatatatcaatgatgggagccctaaaacaagaaggtactatca
aaacagggaaaggactatttaaataattaatacctgagaatttccatatt
atggaaatgtgaatgcttccaggaacatgaacttcaaagatctttaaaca
gcttcaacttaacaggccatcctactttatctgtgattattttaaatgta
aatagattaaattctacaaccaaagataaaaggcaaatgagtaggttata
aaggaaaagaaaagacacttgtactctgcctacatgaaattcactggttc
tttaaggacacaaggctgaatattgatgaataaaagtttttttaattaga
tattttttatatacatttcaaatttcaaatgctatcctgaaagctcccta
tacactctccccactctgcttcctaaccacccactcttacttctggctct
ggcattccctgtactgggcatataagtttgcatatcaagggtctctcttc
cagtgttggcctactaggccatcttctgctacatatgcagctagagtcac
agctctggggtactgggtagttcatattgttccacttataggctgcgaca
cttcagctctttggggatttcctaagcttccgatgagcgccctggtcatc
ttaagtgactatgagcactcactttgatttcaggactgcatattcctatt
gagacgctaacaggtcctctacaattctcgctatcataggtcggggtttt
gacttatttat
quality valuesOpen.Open.




Alignment Information

BAC End 1BAC End 2
seq1: chr15_70091819_70092897
seq2: B6Ng01-059A03.b_47_1110

seq1  GAATTCCACATAAAATTTATATTCTAAGTTAGTTTTGAGAAGTGAATCAT  50
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAATTCCACATAAAATTTATATTCTAAGTTAGTTTTGAGAAGTGAATCAT  50

seq1  TTTCTAATTTGTGTTCTCAAAAATAATCATTGAAAGAATGAATGCAAGTT  100
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTTCTAATTTGTGTTCTCAAAAATAATCATTGAAAGAATGAATGCAAGTT  100

seq1  ATAAAAGCATGACATGGACTATTAACTGATGCTACTGGTTTTACACAATA  150
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATAAAAGCATGACATGGACTATTAACTGATGCTACTGGTTTTACACAATA  150

seq1  CAACACAGACTATGTCTTAATTTGAGAGAAAATTTTCACTAACTCTCCTG  200
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CAACACAGACTATGTCTTAATTTGAGAGAAAATTTTCACTAACTCTCCTG  200

seq1  GTCGGGATAGTGATCCTGCAGAGCAGTGGTTATCAATCCCCCTAATGCTG  250
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTCGGGATAGTGATCCTGCAGAGCAGTGGTTATCAATCCCCCTAATGCTG  250

seq1  TGATCCATAGCACAGTTCCTCATATGGTGGTGACCCCAACCATAAAATTA  300
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGATCCATAGCACAGTTCCTCATATGGTGGTGACCCCAACCATAAAATTA  300

seq1  TTTTGTTTCTCTTTCAGAACTCTAGTTTACTACTGTTATGAATTGTAAAG  350
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTTTGTTTCTCTTTCAGAACTCTAGTTTACTACTGTTATGAATTGTAAAG  350

seq1  TAAGTACTTGATATGCTGACAATCACTGTTGCAGAATGACCATAGCTGTA  400
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TAAGTACTTGATATGCTGACAATCACTGTTGCAGAATGACCATAGCTGTA  400

seq1  CTAAAATAATGTTTTTGATAATTTTATCATTTAAAAGTACATATAACAAT  450
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTAAAATAATGTTTTTGATAATTTTATCATTTAAAAGTACATATAACAAT  450

seq1  ACTCATTTTTTTAAAATGTTTTATTTGCTCAATTAACAAAACCAGGAAGT  500
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACTCATTTTTTTAAAATGTTTTATTTGCTCAATTAACAAAACCAGGAAGT  500

seq1  AGGAAGTAGGGGAATGATGGATAAGTCTATGGATGATGAATTTTATCAAG  550
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGGAAGTAGGGGAATGATGGATAAGTCTATGGATGATGAATTTTATCAAG  550

seq1  TTTGTTGTGAAACTCATCAACTCTGTTGGAAATCAAAAGGACCTCGTGGT  600
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTTGTTGTGAAACTCATCAACTCTGTTGGAAATCAAAAGGACCTCGTGGT  600

seq1  CTTTTTTGTCAGTTAACTCTTAATTCTGCTCTACTTTAAAATTTGAAGAC  650
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTTTTTTGTCAGTTAACTCTTAATTCTGCTCTACTTTAAAATTTGAAGAC  650

seq1  AACAAAGATATTTCAGATGTGTCAAATTCACAGTGAAGAGACAGCTGGAC  700
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AACAAAGATATTTCAGATGTGTCAAATTCACAGTGAAGAGACAGCTGGAC  700

seq1  AAACTTTATTCTTCCTCCTTACAGAACTGACTAAAGGATGGATCATCCAT  750
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAACTTTATTCTTCCTCCTTACAGAACTGACTAAAGGATGGATCATCCAT  750

seq1  GAGCTGTGACTACTAATTAAGATGCAAATTTTAGAGCCAGAGCTCAAGCT  800
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAGCTGTGACTACTAATTAAGATGCAAATTTTAGAGCCAGAGCTCAAGCT  800

seq1  GTTAATCCTCACCTTATCACTGAGTGACCTTGGCAGGCCTCTTAAGCAAT  850
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTTAATCCTCACCTTATCACTGAGTGACCTTGGCAGGCCTCTTAAGCAAT  850

seq1  AGGATCCAAGAGTCAACCTGTGAAATGATGGTTCTAACAACTATAACTGG  900
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGGATCCAAGAGTCAACCTGTGAAATGATGGTTCTAACAACTATAACTGG  900

seq1  AAGAATCTTGCGAAGATTAAATTAACTATGTCATGTAATGGAATAACTGT  950
      ||| |||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||   |||| 
seq2  AAG-ATCTTGCGAAGA-TAAATTAACTATGTCATGT-ATGGA--TACTG-  944

seq1  TTTTAACAGGTGCTCTTTTGGTGCCAAGAGATCATTAAATAGTGATGGTT  1000
      |||||||| |||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| |||
seq2  TTTTAACA-GTGCTCTTTTGGTGCC-AGAGATCA-TAAATAGTGAT-GTT  990

seq1  GGTTCTTAAGAAAATCCTAAGTTCTAAAGTTTGTACTGGAAAGCATAACT  1050
      |  |||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||
seq2  G--TCTTAAGAAAATCCTAAGTTCTAAAG-TTGTACT-GAAAGCATAACT  1036

seq1  AGATGTCCCTCTTTTACCTACAATTGATC  1079
      ||||   |||||||||| ||| |||||||
seq2  AGATTGTCCTCTTTTACTTAC-ATTGATC  1064

seq1: chr15_70249636_70250891
seq2: B6Ng01-059A03.g_66_1276 (reverse)

seq1  ATAAATAAGTCACAAAACCCAGACACTATTGTATATGCCAGCAAGATTTT  50
      ||||||||||  |||||||| |||         ||||  ||| ||| |  
seq2  ATAAATAAGT--CAAAACCCCGAC--------CTATGATAGCGAGAAT--  38

seq1  GATGAAGGGACCCTGTTATAGCTGTCTCATATGAGGATATGCCAGTGCCT  100
        || || |  |||||  |||| |||||| ||  | ||||| |||| |||
seq2  --TGTAGAGGACCTGT--TAGC-GTCTCA-ATAGGAATATG-CAGT-CCT  80

seq1  GGAAAATACAGAAGTGGATGCTCATAGTCAACTATAAGATGGAACACAGG  150
      |  |||| || |||||  ||||||||||| ||| |||||||  || ||||
seq2  G--AAAT-CA-AAGTGAGTGCTCATAGTC-ACT-TAAGATG--AC-CAGG  121

seq1  GCGCTCAATGGGGAAGCTAGAGAAATCACCCAAAGAGCTGAAGTGGTCTG  200
      |||||||    |||||||   |||||| |||||||||||||||| ||| |
seq2  GCGCTCA--TCGGAAGCTTAGGAAATC-CCCAAAGAGCTGAAGT-GTC-G  166

seq1  CAGCCCTATAGGTGGAACAATATGAACTACCCAGTACCCCCAGAGCTTGT  250
      ||| |||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||
seq2  CAG-CCTATAAGTGGAACAATATGAACTACCCAGTA-CCCCAGAGC-TGT  213

seq1  GACTCTAGCTGCATATGTAGCAGAAGATGGCCTAGTAGGCCAACACTGGG  300
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||
seq2  GACTCTAGCTGCATATGTAGCAGAAGATGGCCTAGTAGGCCAACACT-GG  262

seq1  AAGAGAGACCCCTTGATATTGCAAACCTTATATGCCCCAGTACAGGGGAA  350
      |||||||| ||||||||| |||||| |||||||| ||||||||| |||||
seq2  AAGAGAGA-CCCTTGATA-TGCAAA-CTTATATG-CCCAGTACA-GGGAA  307

seq1  TGCCAGAGCCAAGAAGTAAGAGTGGGTGGTTAAGGAAGCAGAGTGGGGAG  400
      |||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||
seq2  TGCCAGAGCC-AGAAGTAAGAGTGGGTGGTT-AGGAAGCAGAGTGGGGAG  355

seq1  AGTGTATAGGGAGCTTTCAGGATAGCATTTGAAATTTGAAATGTATATAA  450
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGTGTATAGGGAGCTTTCAGGATAGCATTTGAAATTTGAAATGTATATAA  405

seq1  AAAATATCTAATTAAAAAAACTTTTATTCATCAATATTCAGCCTTGTGTC  500
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAAATATCTAATTAAAAAAACTTTTATTCATCAATATTCAGCCTTGTGTC  455

seq1  CTTAAAGAACCAGTGAATTTCATGTAGGCAGAGTACAAGTGTCTTTTCTT  550
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTTAAAGAACCAGTGAATTTCATGTAGGCAGAGTACAAGTGTCTTTTCTT  505

seq1  TTCCTTTATAACCTACTCATTTGCCTTTTATCTTTGGTTGTAGAATTTAA  600
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTCCTTTATAACCTACTCATTTGCCTTTTATCTTTGGTTGTAGAATTTAA  555

seq1  TCTATTTACATTTAAAATAATCACAGATAAAGTAGGATGGCCTGTTAAGT  650
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCTATTTACATTTAAAATAATCACAGATAAAGTAGGATGGCCTGTTAAGT  605

seq1  TGAAGCTGTTTAAAGATCTTTGAAGTTCATGTTCCTGGAAGCATTCACAT  700
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGAAGCTGTTTAAAGATCTTTGAAGTTCATGTTCCTGGAAGCATTCACAT  655

seq1  TTCCATAATATGGAAATTCTCAGGTATTAATTATTTAAATAGTCCTTTCC  750
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTCCATAATATGGAAATTCTCAGGTATTAATTATTTAAATAGTCCTTTCC  705

seq1  CTGTTTTGATAGTACCTTCTTGTTTTAGGGCTCCCATCATTGATATATTA  800
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTGTTTTGATAGTACCTTCTTGTTTTAGGGCTCCCATCATTGATATATTA  755

seq1  GTTATTATGTTAGTTCTTAATTGTCATAATCAAATATTGGCTTTAGTAAA  850
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTTATTATGTTAGTTCTTAATTGTCATAATCAAATATTGGCTTTAGTAAA  805

seq1  TTATAGCTTTGGACTTCTTGCTCTGTGACAGATATTATCCACTGCACTGG  900
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTATAGCTTTGGACTTCTTGCTCTGTGACAGATATTATCCACTGCACTGG  855

seq1  AACTTGTAAGGAGTCATCACCATGTTAGAAACTTGTAGTGAAGCATACCC  950
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AACTTGTAAGGAGTCATCACCATGTTAGAAACTTGTAGTGAAGCATACCC  905

seq1  TGTATCTCATGATTGGGATATAAAGATACTGAGCAAGATCTGCACCAATC  1000
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGTATCTCATGATTGGGATATAAAGATACTGAGCAAGATCTGCACCAATC  955

seq1  ATCTAAAAAGGCATGCCCTACTGACATAATCTCTTCAACTAGACCTTCCC  1050
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATCTAAAAAGGCATGCCCTACTGACATAATCTCTTCAACTAGACCTTCCC  1005

seq1  TTCAATAGCTCTATAACCTGTCCATAGAATCAAAGGTCTTGGCCCAAACC  1100
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTCAATAGCTCTATAACCTGTCCATAGAATCAAAGGTCTTGGCCCAAACC  1055

seq1  TTTAACTCACGAGGATAGGGTCACTGCAGATAAAATCTAACAGTATAATT  1150
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTTAACTCACGAGGATAGGGTCACTGCAGATAAAATCTAACAGTATAATT  1105

seq1  AATGAGACTCTTGATTCTATTTTACTGTCAAATGTGCTTTGAAACAATAT  1200
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AATGAGACTCTTGATTCTATTTTACTGTCAAATGTGCTTTGAAACAATAT  1155

seq1  TATTATGTATCAGCACTTTAAGTGTATATATATATATATTTTTTTTTTCT  1250
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TATTATGTATCAGCACTTTAAGTGTATATATATATATATTTTTTTTTTCT  1205

seq1  GAATTC  1256
      ||||||
seq2  GAATTC  1211