BAC Information

Click to search

BAC

Clone NameB6Ng01-059P07
Chromosome15 (Build37)
Map Location 69,663,229 - 69,742,989
singlet/doubletdoublet
Overlap genenone
Upstream geneEG633752, Khdrbs3
Downstream geneLOC383050
LinkOpen Mouse BAC browser



BAC End Information

BAC end BAC-end 1BAC-end 2
end nameB6Ng01-059P07.bB6Ng01-059P07.g
ACCDH881081DH881082
length1,1171,071
definitionDH881081|Mus musculus domesticus DNA, BAC clone: B6Ng01-059P07, 5' end.DH881082|Mus musculus domesticus DNA, BAC clone: B6Ng01-059P07, 3' end.
singlet/doubletdoubletdoublet
BLAST hituniqueunique
Map location.(69,663,229 - 69,664,358)(69,741,912 - 69,742,989)
sequence
gaattcaacttagtaaagaattagagagaagtctaatagcaatgatgagg
gttaatttgtgtcatttttaaggcattatttacagggatgcaatatattt
gtcctgaatacattttaaggcatccagatgctatgtgagatgtatgcttc
atcaaaagtgtttgatcctagagtttctgccttatccaggaatgctaaca
tgaacaattataaaaagatgaaatcatacttaatatctgaacacactatc
agttacagtaccaaatgaaggtgttaatatattgccattcttgtgaatta
ttcagaggttgtatgctcaataaattcatttccaagcctcaaactgattc
caacaaaatgaacatataaaaaggagtgtgtagcacacactttacaattg
cattgattataagcaccacaggctttaaaacagagcatggggcctgatat
agatgagtgtggttagtactgctgagtccactcagtgggaattaaatcgt
cagtggcatacgttacagtagggaacaccacactctaccacagagtagat
ataactaagcagctcaccagagaaacctaagaatataagaacttacactt
acacacagccaaatggcttgcatcaagacagtgagaaaatattaattcag
gccatgctatgactagcagaggcccccaacattggaaaaaatcattttac
agttgtatttgtttgaacatacattatagtcaggatgcttctggcttcaa
aaatataataagtatgcatgtggataagcacaattatatatttattcttt
ttttaaatttatttatttattttttaattaggtattttcctcatttacat
tttcaaagctatcccaaaagacccccatacccacccccccaatcccctac
ccaaccactccccattttggccctgggggttcacttgtactggagcatat
aaagtttgcaagtccaatgggctctctttgcagtgatggccgactaggcc
atcttgatacatatgcagctagagacagagctccgggtactggttagttc
atattgtgtccacctatagggtgcagatcccttagctccttgggtattct
ctgctcctccatggggg
gaattctcaccaggtagatgcagtctctcccaacttccagagaacacact
aagttacttaaggtaaattatcctgtatcctagagacaaaacttgagtgc
cttaagccagtcatcaaaaatgtcttcctttacactcttctgctctagaa
gatgacatgaccatgagcaggggcaggctgacacgctgcatgtatgcacc
aatctgggcctctcatggacccatatacaacatgctgatgcttcaggaaa
gaagtccatctcttggtggaagaacagctgctgagaaagtgtgagtggaa
cccactcaaagtcagttctgctaagacaaggcaacattctgagagatcca
ggaagatgttggaatcaacagtgtcaaactaatgttcagatcacaaaaaa
ttaaaataatcaaactgtcagatgacaattgcattaataaaccattaaga
agaaaatctcagacaattgatgatctatcttgtggcaatataaagctgga
ctcctgtttgatggagagatagtatccttctctagtaatgcttgttaata
ctgaatggcaatgttctggtgtagaggcacatttagtatgtcatcaaata
gctccacattgaagagtcatttctatcctgagacgtaattgccctctcaa
aaagaatgaagagggaaaagcattcactgaaacatcattgctaaggattc
caaggggcactgcaacaatgttgtatgcacagaaacagcaagagcacatc
ccctagccttaaaatccttatggcccagacaatgctaaagttatgaataa
gataacatttaatgtcagaagggtcaggattgaaatacaacctagggcag
atgcttgggtcatgctgtacagttagagaaagagagtatatgctggtctt
gcagataaccagagtttgttttccagcattcatgtcagttgctcagaact
acttgcattacacacagaacgtttgtcaccatcaaattgcatctgtttgt
actgcaccatatttcatacaccacatgcacaccaacgagtggggccagtg
gagaagaaagtggagatgggg
quality valuesOpen.Open.




Alignment Information

BAC End 1BAC End 2
seq1: chr15_69663229_69664358
seq2: B6Ng01-059P07.b_49_1165

seq1  GAATTCAACTTAGTAAAGAATTAGAGAGAAGTCTAATAGCAATGATGAGG  50
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAATTCAACTTAGTAAAGAATTAGAGAGAAGTCTAATAGCAATGATGAGG  50

seq1  GTTAATTTGTGTCATTTTTAAGGCATTATTTACAGGGATGCAATATATTT  100
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTTAATTTGTGTCATTTTTAAGGCATTATTTACAGGGATGCAATATATTT  100

seq1  GTCCTGAATACATTTTAAGGCATCCAGATGCTATGTGAGATGTATGCTTC  150
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTCCTGAATACATTTTAAGGCATCCAGATGCTATGTGAGATGTATGCTTC  150

seq1  ATCAAAAGTGTTTGATCCTAGAGTTTCTGCCTTATCCAGGAATGCTAACA  200
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATCAAAAGTGTTTGATCCTAGAGTTTCTGCCTTATCCAGGAATGCTAACA  200

seq1  TGAACAATTATAAAAAGATGAAATCATACTTAATATCTGAACACACTATC  250
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGAACAATTATAAAAAGATGAAATCATACTTAATATCTGAACACACTATC  250

seq1  AGTTACAGTACCAAATGAAGGTGTTAATATATTGCCATTCTTGTGAATTA  300
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGTTACAGTACCAAATGAAGGTGTTAATATATTGCCATTCTTGTGAATTA  300

seq1  TTCAGAGGTTGTATGCTCAATAAATTCATTTCCAAGCCTCAAACTGATTC  350
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTCAGAGGTTGTATGCTCAATAAATTCATTTCCAAGCCTCAAACTGATTC  350

seq1  CAACAAAATGAACATATAAAAAGGAGTGTGTAGCACACACTTTACAATTG  400
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CAACAAAATGAACATATAAAAAGGAGTGTGTAGCACACACTTTACAATTG  400

seq1  CATTGATTATAAGCACCACAGGCTTTAAAACAGAGCATGGGGCCTGATAT  450
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CATTGATTATAAGCACCACAGGCTTTAAAACAGAGCATGGGGCCTGATAT  450

seq1  AGATGAGTGTGGTTAGTACTGCTGAGTCCACTCAGTGGGAATTAAATCGT  500
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGATGAGTGTGGTTAGTACTGCTGAGTCCACTCAGTGGGAATTAAATCGT  500

seq1  CAGTGGCATACGTTACAGTAGGGAACACCACACTCTACCACAGAGTAGAT  550
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CAGTGGCATACGTTACAGTAGGGAACACCACACTCTACCACAGAGTAGAT  550

seq1  ATAACTAAGCAGCTCACCAGAGAAACCTAAGAATATAAGAACTTACACTT  600
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATAACTAAGCAGCTCACCAGAGAAACCTAAGAATATAAGAACTTACACTT  600

seq1  ACACACAGCCAAATGGCTTGCATCAAGACAGTGAGAAAATATTAATTCAG  650
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACACACAGCCAAATGGCTTGCATCAAGACAGTGAGAAAATATTAATTCAG  650

seq1  GCCATGCTATGACTAGCAGAGGCCCCCAACATTGGAAAAAATCATTTTAC  700
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GCCATGCTATGACTAGCAGAGGCCCCCAACATTGGAAAAAATCATTTTAC  700

seq1  AGTTGTATTTGTTTGAACATACATTATAGTCAGGATGCTTCTGGCTTCAA  750
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGTTGTATTTGTTTGAACATACATTATAGTCAGGATGCTTCTGGCTTCAA  750

seq1  AAATATAATAAGTATGCATGTGGATAAGCACAATTATATATTTATTCTTT  800
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAATATAATAAGTATGCATGTGGATAAGCACAATTATATATTTATTCTTT  800

seq1  TTTTAAATTTATTTATTTATTTTTTAATTAGGTATTTTCCTCATTTACAT  850
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTTTAAATTTATTTATTTATTTTTTAATTAGGTATTTTCCTCATTTACAT  850

seq1  TTTCAAAGCTATCCCAAAAGACCCCCATACCCACCCCCCCAATCCCCTAC  900
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTTCAAAGCTATCCCAAAAGACCCCCATACCCACCCCCCCAATCCCCTAC  900

seq1  CCAACCACTCCCCATTTTTGGCCCTGGGGGTTCACTTGTACTGGAGCATA  950
      |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCAACCACTCCCCA-TTTTGGCCCTGGGGGTTCACTTGTACTGGAGCATA  949

seq1  TAAAGTTTGCAAGTCCAATGGGCCTCTCTTTGCAGTGATGGCCGACTAGG  1000
      |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||
seq2  TAAAGTTTGCAAGTCCAATGGG-CTCTCTTTGCAGTGATGGCCGACTAGG  998

seq1  CCATCTTTTGATACATATGCAGCTAGAGACAAGAGCTCCGGGGTACTGGT  1050
      |||||  ||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||
seq2  CCATC--TTGATACATATGCAGCTAGAGAC-AGAGCTCC-GGGTACTGGT  1044

seq1  TAGTTCATATTGTTGTTCCACCTATAGGGTTGCAGATCCCTTTAGCTCCT  1100
      |||||||||||||   ||||||||||||| |||||||||| |||||||||
seq2  TAGTTCATATTGT--GTCCACCTATAGGG-TGCAGATCCC-TTAGCTCCT  1090

seq1  TGGGTATTTTCTCTGGCTCCTCCATTGGGG  1130
      |||||||| |||   |||||||||| ||||
seq2  TGGGTATTCTCT---GCTCCTCCATGGGGG  1117

seq1: chr15_69741912_69742989
seq2: B6Ng01-059P07.g_68_1138 (reverse)

seq1  CCCCATCCTCCACTTCTCTCTCCACT-GCCCCACTCTGTGTGTGTGCATG  49
      |||||| ||||||||   |||||||| ||||||||| ||  |||||||||
seq2  CCCCAT-CTCCACTTTCTTCTCCACTGGCCCCACTC-GTTGGTGTGCATG  48

seq1  TGTGTGTATGATATATGTGTGCAGGTACAAACAGATGCAATTTGATGGTG  99
      || |||||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||
seq2  TG-GTGTATGAAATATG-GTGCA-GTACAAACAGATGCAATTTGATGGTG  95

seq1  ACAAACGTTCTGTGTGTAATTGCAGGTAGTTCTGAGCCACCTGACATGAA  149
      ||||||||||||||||||| |||| ||||||||||| || ||||||||||
seq2  ACAAACGTTCTGTGTGTAA-TGCAAGTAGTTCTGAG-CAACTGACATGAA  143

seq1  TGCTGGAAAACAAACTCTGGTATTCTGCAAGACCAGCATATACTCTCTTT  199
      |||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGCTGGAAAACAAACTCTGGTTATCTGCAAGACCAGCATATACTCTCTTT  193

seq1  CTCTAACTGTACAGCATGACCCAAGCATCTGCCCTAGGTTGTATTTCAAT  249
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTCTAACTGTACAGCATGACCCAAGCATCTGCCCTAGGTTGTATTTCAAT  243

seq1  CCTGACCCTTCTGACATTAAATGTTATCTTATTCATTAACTTTAGCATTG  299
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||
seq2  CCTGACCCTTCTGACATTAAATGTTATCTTATTCA-TAACTTTAGCATTG  292

seq1  TCTGGGCCATAAGGATTTTAAGGCTAGGGGATGTGCTCTTGCTGTTTCTG  349
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCTGGGCCATAAGGATTTTAAGGCTAGGGGATGTGCTCTTGCTGTTTCTG  342

seq1  TGCATACAACATTGTTGCAGTGCCCCTTGGAATCCTTAGCAATGATGTTT  399
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGCATACAACATTGTTGCAGTGCCCCTTGGAATCCTTAGCAATGATGTTT  392

seq1  CAGTGAATGCTTTTCCCTCTTCATTCTTTTTGAGAGGGCAATTACGTCTC  449
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CAGTGAATGCTTTTCCCTCTTCATTCTTTTTGAGAGGGCAATTACGTCTC  442

seq1  AGGATAGAAATGACTCTTCAATGTGGAGCTATTTGATGACATACTAAATG  499
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGGATAGAAATGACTCTTCAATGTGGAGCTATTTGATGACATACTAAATG  492

seq1  TGCCTCTACACCAGAACATTGCCATTCAGTATTAACAAGCATTACTAGAG  549
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGCCTCTACACCAGAACATTGCCATTCAGTATTAACAAGCATTACTAGAG  542

seq1  AAGGATACTATCTCTCCATCAAACAGGAGTCCAGCTTTATATTGCCACAA  599
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAGGATACTATCTCTCCATCAAACAGGAGTCCAGCTTTATATTGCCACAA  592

seq1  GATAGATCATCAATTGTCTGAGATTTTCTTCTTAATGGTTTATTAATGCA  649
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GATAGATCATCAATTGTCTGAGATTTTCTTCTTAATGGTTTATTAATGCA  642

seq1  ATTGTCATCTGACAGTTTGATTATTTTAATTTTTTGTGATCTGAACATTA  699
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATTGTCATCTGACAGTTTGATTATTTTAATTTTTTGTGATCTGAACATTA  692

seq1  GTTTGACACTGTTGATTCCAACATCTTCCTGGATCTCTCAGAATGTTGCC  749
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTTTGACACTGTTGATTCCAACATCTTCCTGGATCTCTCAGAATGTTGCC  742

seq1  TTGTCTTAGCAGAACTGACTTTGAGTGGGTTCCACTCACACTTTCTCAGC  799
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTGTCTTAGCAGAACTGACTTTGAGTGGGTTCCACTCACACTTTCTCAGC  792

seq1  AGCTGTTCTTCCACCAAGAGATGGACTTCTTTCCTGAAGCATCAGCATGT  849
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGCTGTTCTTCCACCAAGAGATGGACTTCTTTCCTGAAGCATCAGCATGT  842

seq1  TGTATATGGGTCCATGAGAGGCCCAGATTGGTGCATACATGCAGCGTGTC  899
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGTATATGGGTCCATGAGAGGCCCAGATTGGTGCATACATGCAGCGTGTC  892

seq1  AGCCTGCCCCTGCTCATGGTCATGTCATCTTCTAGAGCAGAAGAGTGTAA  949
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGCCTGCCCCTGCTCATGGTCATGTCATCTTCTAGAGCAGAAGAGTGTAA  942

seq1  AGGAAGACATTTTTGATGACTGGCTTAAGGCACTCAAGTTTTGTCTCTAG  999
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGGAAGACATTTTTGATGACTGGCTTAAGGCACTCAAGTTTTGTCTCTAG  992

seq1  GATACAGGATAATTTACCTTAAGTAACTTAGTGTGTTCTCTGGAAGTTGG  1049
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GATACAGGATAATTTACCTTAAGTAACTTAGTGTGTTCTCTGGAAGTTGG  1042

seq1  GAGAGACTGCATCTACCTGGTGAGAATTC  1078
      |||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAGAGACTGCATCTACCTGGTGAGAATTC  1071