BAC Information

Click to search

BAC

Clone NameB6Ng01-067B19
Chromosome15 (Build37)
Map Location 50,511,155 - 50,647,040
singlet/doubletdoublet
Overlap geneTrps1
Upstream geneLOC665160
Downstream geneLOC100039644, LOC100039662, Eif3s3
LinkOpen Mouse BAC browser



BAC End Information

BAC end BAC-end 1BAC-end 2
end nameB6Ng01-067B19.bB6Ng01-067B19.g
ACCDH886101DH886102
length1,1931,111
definitionDH886101|Mus musculus domesticus DNA, BAC clone: B6Ng01-067B19, 5' end.DH886102|Mus musculus domesticus DNA, BAC clone: B6Ng01-067B19, 3' end.
singlet/doubletdoubletdoublet
BLAST hituniqueunique
Map location.(50,645,832 - 50,647,040)(50,511,155 - 50,512,297)
sequence
gaattctcactgaagaagacaaaaactgcaatactacttcaggaaaaaaa
aaaccacactcaggaaggcattaaaaatgaaggaactgttaaaacatagg
cagctatttataattaatgactaagcaattgaaactttaacatttcaatt
tctattaccttttgggtaatttattagggcattaatgccatcatattaat
taatccaaaatccttgaagttcaaattatttctgtttcttttatttagat
gaggaaatgaaggcagtggttttacttaggttgccagaagtcatactgca
tgtcaaggcagaggtgacatgctgccttggctgtcagattagagtccctg
cgtagcctctcctgcctaactttgattgctaataagtgcttgggggacta
cactcactttcagggtgagtttgctcttctgcacacccagcaacttatgt
gtatatgaataatattgaaaatcagagttctgaagttttgaaagtgacac
atgtctgttacaaagagaactgtacagaaaatgaaaaccatgacggtact
ccaatggactccagtgcacaattttctgttcatattttggcgtcagatat
atcttttagatacactcacatatttattttattgaaacataggactatgt
accctatcatgcaatagtttgcttttaaatttaacaatgtgatgtggaag
tttttacttgttcataaaggcatgtcacaatatttgttttaaggccttat
tattatagctacctacatcatatgcttaatgaatttactgatgaacgttt
agactatttccagttttacttataaagaatacttaaaagctaggcctcaa
cattcatatcagtaacaccagcactcaaaatgttggggcagattaattcc
tatggagctcaaggacagcttgatctacacagtaagttccaggctagcct
aggctacaaagtggtgagattctgtctcaaaactaactaactcatcacaa
aaacaaaacaatcatataagatgcataatcccctgtatctatcacttcat
ttctatgatatagttttaaataatcataagttgatgagaaaaatgtctaa
ttcctaatattatttttgcctcactgtttttaaaatgtccctttctaacg
aattccagtcctaatagacatgagaatatatgcggtaaatcct
gaattcagacaacccaaccgtttctagagtcttgaggataatggttccct
ttctttctctttaacattaaaagctcgcagcctctgttttgctcagtgca
gctgtttaaaagcttatgctgcctgaatcctttcaacttggagatttagg
attatgtaaaaataattattgcattccaccaagcctgccattgctgcaaa
tgcccatatgcagcagcatgacagagaacactgagtgaggccctgtgttc
agactcaccttcatgtgcacataaacacatgggtgtatctacttaataga
cttataaaaatgattagagaaaattttaataatcagtggtctgacttata
ataattattaaaagggagccatgtaagtttaaaaaattaatattcaaaat
aaattctgaaaagaaatttcactttaaatagacttctagatatagataga
tgtcttcttatttttctgtaggatctgctatagtcctaaaatccctgact
atttacagagagactttgtttctacaacctaaagaggaatgccacaatga
aatatcataaaactgcaatgttcttaatattttgttaaaaatgacctctt
ccattgaggtaaagctcataaaatgaactaaaatcaatatttgagaaaca
gatctttgaattcaaaatttcagctttgagatgtgctcactttcctaaat
gagagtgtgatgtttaatatgatcctattggtgcaagtttgcactaacac
tacaattaacatgtgttgcagtcctcatcataaacatgggtttccttaag
ctgccttctcagttgatttaaattttccttagcaaccaatgcagagcctt
ctccacccctttatttctttgaatgtttattacctgttgaaatcttcttg
gcttgcaaaagtagcagccaggaaaggtataaacttacaacttaatgctg
atattcatcagtagcagaggattttctctttctttagaaaagtatgaaga
ctcagctttcagaaaacacatctgggcatgatagcatatggaaagaacat
gatctggtaacttgtatataatgtaatatatatctctagacacatagctt
ctgctatttag
quality valuesOpen.Open.




Alignment Information

BAC End 1BAC End 2
seq1: chr15_50645832_50647040
seq2: B6Ng01-067B19.b_45_1237 (reverse)

seq1  AGGATTTACTGCATATTATTCTCCATGCTTATTATGACTGGAATTTCTGT  50
      ||||||||| ||||| |||||| ||||  ||||| ||||||||||  |  
seq2  AGGATTTACCGCATA-TATTCT-CATGTCTATTAGGACTGGAATTCGT--  46

seq1  ATGAAAAGGGACCATTTTAAAAAACAGTGAG--CAAAATAATATTAGGTA  98
       |  ||||||| |||||| ||||||||||||   |||||||||||||| |
seq2  -TAGAAAGGGA-CATTTT-AAAAACAGTGAGGCAAAAATAATATTAGGAA  93

seq1  TTAGACATATTTTCTCATACAACTTATGAATTATATAAAAACTATATCAT  148
      |||||||| ||||||||| ||||||||| ||||| | |||||||||||||
seq2  TTAGACAT-TTTTCTCAT-CAACTTATG-ATTAT-TTAAAACTATATCAT  139

seq1  AGAAATGAAAAGTGATAGATACAGGGGAATTATGCATCCTTTTATATGAT  198
      |||||||  |||||||||||||||||| ||||||||||   |||||||||
seq2  AGAAATG--AAGTGATAGATACAGGGG-ATTATGCATC---TTATATGAT  183

seq1  TGTTTTGTTTTTGTGATGGGTTAGTTAGTTTTTGAGACAGAATCTCACCA  248
      |||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||
seq2  TGTTTTGTTTTTGTGATGAGTTAGTTAG-TTTTGAGACAGAATCTCACCA  232

seq1  CTTTGTAGCCTAGGCTAGCCTGGAACTTACTGTGTAGATCAAGCTGTCCT  298
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTTTGTAGCCTAGGCTAGCCTGGAACTTACTGTGTAGATCAAGCTGTCCT  282

seq1  TGAGCTCCATAGGAATTAATCTGCCCCAACATTTTGAGTGCTGGTGTTAC  348
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGAGCTCCATAGGAATTAATCTGCCCCAACATTTTGAGTGCTGGTGTTAC  332

seq1  TGATATGAATGTTGAGGCCTAGCTTTTAAGTATTCTTTATAAGTAAAACT  398
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGATATGAATGTTGAGGCCTAGCTTTTAAGTATTCTTTATAAGTAAAACT  382

seq1  GGAAATAGTCTAAACGTTCATCAGTAAATTCATTAAGCATATGATGTAGG  448
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGAAATAGTCTAAACGTTCATCAGTAAATTCATTAAGCATATGATGTAGG  432

seq1  TAGCTATAATAATAAGGCCTTAAAACAAATATTGTGACATGCCTTTATGA  498
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TAGCTATAATAATAAGGCCTTAAAACAAATATTGTGACATGCCTTTATGA  482

seq1  ACAAGTAAAAACTTCCACATCACATTGTTAAATTTAAAAGCAAACTATTG  548
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACAAGTAAAAACTTCCACATCACATTGTTAAATTTAAAAGCAAACTATTG  532

seq1  CATGATAGGGTACATAGTCCTATGTTTCAATAAAATAAATATGTGAGTGT  598
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CATGATAGGGTACATAGTCCTATGTTTCAATAAAATAAATATGTGAGTGT  582

seq1  ATCTAAAAGATATATCTGACGCCAAAATATGAACAGAAAATTGTGCACTG  648
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATCTAAAAGATATATCTGACGCCAAAATATGAACAGAAAATTGTGCACTG  632

seq1  GAGTCCATTGGAGTACCGTCATGGTTTTCATTTTCTGTACAGTTCTCTTT  698
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAGTCCATTGGAGTACCGTCATGGTTTTCATTTTCTGTACAGTTCTCTTT  682

seq1  GTAACAGACATGTGTCACTTTCAAAACTTCAGAACTCTGATTTTCAATAT  748
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTAACAGACATGTGTCACTTTCAAAACTTCAGAACTCTGATTTTCAATAT  732

seq1  TATTCATATACACATAAGTTGCTGGGTGTGCAGAAGAGCAAACTCACCCT  798
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TATTCATATACACATAAGTTGCTGGGTGTGCAGAAGAGCAAACTCACCCT  782

seq1  GAAAGTGAGTGTAGTCCCCCAAGCACTTATTAGCAATCAAAGTTAGGCAG  848
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAAAGTGAGTGTAGTCCCCCAAGCACTTATTAGCAATCAAAGTTAGGCAG  832

seq1  GAGAGGCTACGCAGGGACTCTAATCTGACAGCCAAGGCAGCATGTCACCT  898
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAGAGGCTACGCAGGGACTCTAATCTGACAGCCAAGGCAGCATGTCACCT  882

seq1  CTGCCTTGACATGCAGTATGACTTCTGGCAACCTAAGTAAAACCACTGCC  948
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTGCCTTGACATGCAGTATGACTTCTGGCAACCTAAGTAAAACCACTGCC  932

seq1  TTCATTTCCTCATCTAAATAAAAGAAACAGAAATAATTTGAACTTCAAGG  998
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTCATTTCCTCATCTAAATAAAAGAAACAGAAATAATTTGAACTTCAAGG  982

seq1  ATTTTGGATTAATTAATATGATGGCATTAATGCCCTAATAAATTACCCAA  1048
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATTTTGGATTAATTAATATGATGGCATTAATGCCCTAATAAATTACCCAA  1032

seq1  AAGGTAATAGAAATTGAAATGTTAAAGTTTCAATTGCTTAGTCATTAATT  1098
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAGGTAATAGAAATTGAAATGTTAAAGTTTCAATTGCTTAGTCATTAATT  1082

seq1  ATAAATAGCTGCCTATGTTTTAACAGTTCCTTCATTTTTAATGCCTTCCT  1148
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATAAATAGCTGCCTATGTTTTAACAGTTCCTTCATTTTTAATGCCTTCCT  1132

seq1  GAGTGTGGTTTTTTTTTTCCTGAAGTAGTATTGCAGTTTTTGTCTTCTTC  1198
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAGTGTGGTTTTTTTTTTCCTGAAGTAGTATTGCAGTTTTTGTCTTCTTC  1182

seq1  AGTGAGAATTC  1209
      |||||||||||
seq2  AGTGAGAATTC  1193

seq1: chr15_50511155_50512297
seq2: B6Ng01-067B19.g_67_1177

seq1  GAATTCAGACAACCCAACCGTTTCTAGAGTCTTGAGGATAATGGTTCCCT  50
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAATTCAGACAACCCAACCGTTTCTAGAGTCTTGAGGATAATGGTTCCCT  50

seq1  TTCTTTCTCTTTAACATTAAAAGCTCGCAGCCTCTGTTTTGCTCAGTGCA  100
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTCTTTCTCTTTAACATTAAAAGCTCGCAGCCTCTGTTTTGCTCAGTGCA  100

seq1  GCTGTTTAAAAGCTTATGCTGCCTGAATCCTTTCAACTTGGAGATTTAGG  150
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GCTGTTTAAAAGCTTATGCTGCCTGAATCCTTTCAACTTGGAGATTTAGG  150

seq1  ATTATGTAAAAATAATTATTGCATTCCACCAAGCCTGCCATTGCTGCAAA  200
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATTATGTAAAAATAATTATTGCATTCCACCAAGCCTGCCATTGCTGCAAA  200

seq1  TGCCCATATGCAGCAGCATGACAGAGAACACTGAGTGAGGCCCTGTGTTC  250
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGCCCATATGCAGCAGCATGACAGAGAACACTGAGTGAGGCCCTGTGTTC  250

seq1  AGACTCACCTTCATGTGCACATAAACACATGGGTGTATCTACTTAATAGA  300
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGACTCACCTTCATGTGCACATAAACACATGGGTGTATCTACTTAATAGA  300

seq1  CTTATAAAAATGATTAGAGAAAATTTTAATAATCAGTGGTCTGACTTATA  350
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTTATAAAAATGATTAGAGAAAATTTTAATAATCAGTGGTCTGACTTATA  350

seq1  ATAATTATTAAAAGGGAGCCATGTAAGTTTAAAAAATTAATATTCAAAAT  400
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATAATTATTAAAAGGGAGCCATGTAAGTTTAAAAAATTAATATTCAAAAT  400

seq1  AAATTCTGAAAAGAAATTTCACTTTAAATAGACTTCTAGATATAGATAGA  450
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAATTCTGAAAAGAAATTTCACTTTAAATAGACTTCTAGATATAGATAGA  450

seq1  TGTCTTCTTATTTTTCTGTAGGATCTGCTATAGTCCTAAAATCCCTGACT  500
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGTCTTCTTATTTTTCTGTAGGATCTGCTATAGTCCTAAAATCCCTGACT  500

seq1  ATTTACAGAGAGACTTTGTTTCTACAACCTAAAGAGGAATGCCACAATGA  550
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATTTACAGAGAGACTTTGTTTCTACAACCTAAAGAGGAATGCCACAATGA  550

seq1  AATATCATAAAACTGCAATGTTCTTAATATTTTGTTAAAAATGACCTCTT  600
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AATATCATAAAACTGCAATGTTCTTAATATTTTGTTAAAAATGACCTCTT  600

seq1  CCATTGAGGTAAAGCTCATAAAATGAACTAAAATCAATATTTGAGAAACA  650
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCATTGAGGTAAAGCTCATAAAATGAACTAAAATCAATATTTGAGAAACA  650

seq1  GATCTTTGAATTCAAAATTTCAGCTTTGAGATGTGCTCACTTTCCTAAAT  700
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GATCTTTGAATTCAAAATTTCAGCTTTGAGATGTGCTCACTTTCCTAAAT  700

seq1  GAGAGTGTGATGTTTAATATGATCCTATTGGTGCAAGTTTGCACTAACAC  750
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAGAGTGTGATGTTTAATATGATCCTATTGGTGCAAGTTTGCACTAACAC  750

seq1  TACAATTAACATGTGTTGCAGTCCTCATCATAAACATGGGTTTCCTTAAG  800
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TACAATTAACATGTGTTGCAGTCCTCATCATAAACATGGGTTTCCTTAAG  800

seq1  CTGCCTTCTCAGTTGATTTAAATTTTCCTTAGCAACCAATGCAGAGCCTT  850
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTGCCTTCTCAGTTGATTTAAATTTTCCTTAGCAACCAATGCAGAGCCTT  850

seq1  CTCCACCCCTTTATTTCTTTGAATGTTTATTACCTGTTGAAATCTTCTTG  900
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTCCACCCCTTTATTTCTTTGAATGTTTATTACCTGTTGAAATCTTCTTG  900

seq1  GCTTGCAAAAGTAGCAGCCAGGAAAGGTATAAACTTACAACTTAAATGCT  950
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| 
seq2  GCTTGCAAAAGTAGCAGCCAGGAAAGGTATAAACTTACAACTT-AATGC-  948

seq1  TGATATTTCATCAGTAAGCAGAGGATTTTTCTCTTTCCTTTAGAAAAAGT  1000
      ||||| ||||||||| ||||||||| |||||||||| |||||| ||||||
seq2  TGATA-TTCATCAGT-AGCAGAGGA-TTTTCTCTTT-CTTTAG-AAAAGT  993

seq1  AATGAAAAGACTCAGCTTTCCAGAAAAACAACATTCTTGGGCCATGATAG  1050
       |||  ||||||||||||| |||||||   ||| |||  || ||||||||
seq2  -ATG--AAGACTCAGCTTT-CAGAAAA--CACA-TCT--GGGCATGATAG  1034

seq1  CATATGGAAAAGAAACATGATCTGTGTTACTTGTTTATTATAAATTGTTA  1100
      ||||||||||   ||||||||||| || |||||| ||| ||       ||
seq2  CATATGGAAA--GAACATGATCTG-GTAACTTGTATATAAT------GTA  1075

seq1  ATATATTATCTCTAAAGACAACAATTTAGCTTCTGCTACTTAG  1143
      ||||| |||||||| | |||      |||||||||||| ||||
seq2  ATATA-TATCTCTAGACACA------TAGCTTCTGCTATTTAG  1111