BAC Information

Click to search

BAC

Clone NameB6Ng01-069A17
Chromosome15 (Build37)
Map Location 58,306,352 - 58,462,263
singlet/doubletdoublet
Overlap geneEG631797
Upstream geneBC026439, Zhx2, Derl1, Wdr67, BC030396, 9130401M01Rik, Zhx1, Atad2, LOC665244, 2410187C16Rik, Fbxo32, 8230402K04Rik, Anxa13, LOC100040231, D15Ertd621e
Downstream geneTmem65, EG546638, Trmt12, Rnf139, Tatdn1, Ndufb9, Mtss1, LOC100040330, EG268809, LOC665565, Sqle, E430025E21Rik, Nsmce2
LinkOpen Mouse BAC browser



BAC End Information

BAC end BAC-end 1BAC-end 2
end nameB6Ng01-069A17.bB6Ng01-069A17.g
ACCDH887462DH887463
length1,2291,020
definitionDH887462|Mus musculus domesticus DNA, BAC clone: B6Ng01-069A17, 5' end.DH887463|Mus musculus domesticus DNA, BAC clone: B6Ng01-069A17, 3' end.
singlet/doubletdoubletdoublet
BLAST hituniqueunique
Map location.(58,306,352 - 58,307,619)(58,461,234 - 58,462,263)
sequence
gaattcaagaactagaaagcatgggagataccaaggaatcaaggccttct
agactcaacagggctggcacacatgaacttgcagagactgaggcagcatg
cacagggcctgcaggggtctgaccatggggttctagagctgaaaggagaa
atgaatacaacccatccctaacccagaagcgagttccaggacaaccaaag
ctacacaatgagaccttgtcatgaaaacagacaagcaaataataatccaa
taaataaaatattaagggctggtgagatggctcagtgggtaagagcaccc
gactgctcttccgaaggtccggagttcaaatcccagcaaccacatggtgg
ctcacaaccacctgtaatgagatctgactctctcttctggagtgtcggaa
gacagctacagtgtacttacatataataaaaaaaaaaaagaataaaatat
taaaagtttaaaattttaaattctaaaactcggcaagagtgacagaatgt
gggtttcttttaggaggggaagcaggttgtgtggggacatatataggaca
tatatagggtgacaatctcacatcagggtttaggtcacagcccaaggcaa
ggatgcgccatggttttcagtggctcaggtattgcacctgtgtctgtctt
cccttacagtcttgcagctattaccagatctggctggcagtctgggaagg
gagagggaatatggagaaagcttgcccacccttagctttcttagctagca
tcagcatccgtcctgctcatttttaatagcaccaggacttcatccagatg
ctaaaggattggaaaaattagcttatcaattgtttttgaatctgtggctt
tgggaagcatttaatgaactcctgccaaagagagtttgaatgtgtgtaaa
ggcactgtgtgtaggaatagctctgagttccctagacatgagctgtgtgt
gagagagtcctagtgacggggatcattcactccacacaccctcgctgcac
accttgcacatgctatactgtctcatggtgcattctacagctaagactta
caagagcgcagcgcagttgggactcattgtgacaggttctggagttagca
caccattagatcatgggagcacctgttctgggtccgctggggataagaag
gtgctgaactctttcacggatacctaccccagttcctcgcggctttgaca
gacaccgattgcatcgtcggaatacagga
gaattccttgctggattctcagctgaccactgtcctctgaggtagaatcc
tctgggcttttgtagatgcagaaggagccctggtaccacagaacacaagc
cagaaaacagaattgtcatctgacctataagaaaccatagtgagccctgt
ggtggaaatataaacacagcccaagtgtttgaaggacatgggctagtgtt
agcattggtcagggttgcatctttgggtgatgtatacaagctgcgtgctc
agcacttactcatggcacactagtggatggggccagcatgttaatgccct
catcaggagccatcacacgaggagtatggcaatgggatctgagtgctctt
tatacatggaatgctgtgcccaggtctccctattttctcagtcagtcctg
agtttccagatacagtaactgaagctttgggaggtgaacaatattgcttg
aggtcatgcaactagctgctgtcataagcaagatttaaatccaggttggc
aaactgggttccttggtcagcacactgtgcaacaccttagaggcccatca
tagagtgagctccagatattaatgactgctttgttatactgaaaccgcaa
gtctgccagaaaagggtttgggttatttgacttatcttaggttttcaact
ggcaaatctgcatggatcacatatttaatgtgttatgtatggatgggaca
gcaaggcaaagggcagtggtccttatggctagtggctacgtcttcatata
tattacacagagtgagtttaacccattggccacaaatcaaaaatatcttc
agctttctcaggagctgaagggatctgcaaccctataggtggaacaacaa
tatgaactaacccgtaccccccagagctcgtatctctagctgcatatgta
gcagagatggcctagtcggccatcactgggaagagaggctccttggtatt
gcaactttatatgccctagtacatgaatgccaggccagagcagaatgggt
gggtagggagcaggctgggg
quality valuesOpen.Open.




Alignment Information

BAC End 1BAC End 2
seq1: chr15_58306352_58307619
seq2: B6Ng01-069A17.b_44_1272

seq1  GAATTCAAGAACTAGAAAGCATGGGAGATACCAAGGAATCAAGGCCTTCT  50
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAATTCAAGAACTAGAAAGCATGGGAGATACCAAGGAATCAAGGCCTTCT  50

seq1  AGACTCAACAGGGCTGGCACACATGAACTTGCAGAGACTGAGGCAGCATG  100
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGACTCAACAGGGCTGGCACACATGAACTTGCAGAGACTGAGGCAGCATG  100

seq1  CACAGGGCCTGCAGGGGTCTGACCATGGGGTTCTAGAGCTGAAAGGAGAA  150
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CACAGGGCCTGCAGGGGTCTGACCATGGGGTTCTAGAGCTGAAAGGAGAA  150

seq1  ATGAATACAACCCATCCCTAACCCAGAAGCGAGTTCCAGGACAACCAAAG  200
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATGAATACAACCCATCCCTAACCCAGAAGCGAGTTCCAGGACAACCAAAG  200

seq1  CTACACAATGAGACCTTGTCATGAAAACAGACAAGCAAATAATAATCCAA  250
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTACACAATGAGACCTTGTCATGAAAACAGACAAGCAAATAATAATCCAA  250

seq1  TAAATAAAATATTAAGGGCTGGTGAGATGGCTCAGTGGGTAAGAGCACCC  300
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TAAATAAAATATTAAGGGCTGGTGAGATGGCTCAGTGGGTAAGAGCACCC  300

seq1  GACTGCTCTTCCGAAGGTCCGGAGTTCAAATCCCAGCAACCACATGGTGG  350
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GACTGCTCTTCCGAAGGTCCGGAGTTCAAATCCCAGCAACCACATGGTGG  350

seq1  CTCACAACCACCTGTAATGAGATCTGACTCTCTCTTCTGGAGTGTCGGAA  400
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTCACAACCACCTGTAATGAGATCTGACTCTCTCTTCTGGAGTGTCGGAA  400

seq1  GACAGCTACAGTGTACTTACATATAATAAAAAAAAAAAAGAATAAAATAT  450
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GACAGCTACAGTGTACTTACATATAATAAAAAAAAAAAAGAATAAAATAT  450

seq1  TAAAAGTTTAAAATTTTAAATTCTAAAACTCGGCAAGAGTGACAGAATGT  500
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TAAAAGTTTAAAATTTTAAATTCTAAAACTCGGCAAGAGTGACAGAATGT  500

seq1  GGGTTTCTTTTAGGAGGGGAAGCAGGTTGTGTGGGGACATATATAGGACA  550
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGGTTTCTTTTAGGAGGGGAAGCAGGTTGTGTGGGGACATATATAGGACA  550

seq1  TATATAGGGTGACAATCTCACATCAGGGTTTAGGTCACAGCCCAAGGCAA  600
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TATATAGGGTGACAATCTCACATCAGGGTTTAGGTCACAGCCCAAGGCAA  600

seq1  GGATGCGCCATGGTTTTCAGTGGCTCAGGTATTGCACCTGTGTCTGTCTT  650
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGATGCGCCATGGTTTTCAGTGGCTCAGGTATTGCACCTGTGTCTGTCTT  650

seq1  CCCTTACAGTCTTGCAGCTATTACCAGATCTGGCTGGCAGTCTGGGAAGG  700
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCCTTACAGTCTTGCAGCTATTACCAGATCTGGCTGGCAGTCTGGGAAGG  700

seq1  GAGAGGGAATATGGAGAAAGCTTGCCCACCCTTAGCTTTCTTAGCTAGCA  750
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAGAGGGAATATGGAGAAAGCTTGCCCACCCTTAGCTTTCTTAGCTAGCA  750

seq1  TCAGCATCCGTCCTGCTCATTTTTAATAGCACCAGGACTTCATCCAGATG  800
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCAGCATCCGTCCTGCTCATTTTTAATAGCACCAGGACTTCATCCAGATG  800

seq1  CTAAAGGATTGGAAAAATTAGCTTATCAATTGTTTTTGAATCTGTGGCTT  850
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTAAAGGATTGGAAAAATTAGCTTATCAATTGTTTTTGAATCTGTGGCTT  850

seq1  TGGGAAGCATTTAATGAACTCCTGCCAAAGAGAGTTTGAATGTGTGTAAA  900
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGGGAAGCATTTAATGAACTCCTGCCAAAGAGAGTTTGAATGTGTGTAAA  900

seq1  GGCACTGTGTGTAGGAATAGCTCTGAGTTCCCTAGAACATGAGCTGTGTG  950
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||
seq2  GGCACTGTGTGTAGGAATAGCTCTGAGTTCCCTAG-ACATGAGCTGTGTG  949

seq1  TGAGAAGAGTCCTAGTGAACGGGGATCATTCACTCCACACACCCTCGCTG  1000
      |||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGAG-AGAGTCCTAGTG-ACGGGGATCATTCACTCCACACACCCTCGCTG  997

seq1  CACACCTGCCACATGCTATACTGTCTTCATGGTGCCAATTCTACAGCTAA  1050
      |||||||  |||||||||||||||| |||||||||  |||||||||||||
seq2  CACACCTTGCACATGCTATACTGTC-TCATGGTGC--ATTCTACAGCTAA  1044

seq1  GAC-TACAGAGAAGCGCAAGCGCAGTTGGGACTCATTGTGACAGGTTCTG  1099
      ||| |||| || ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GACTTACA-AG-AGCGC-AGCGCAGTTGGGACTCATTGTGACAGGTTCTG  1091

seq1  ATGTAAGCACACCATTTAGATCAT-GGAGCAGCTG-TCTGGCTCGGCTGG  1147
        || ||||||||| ||||||||| |||||| ||| ||||| || |||||
seq2  GAGTTAGCACACCA-TTAGATCATGGGAGCACCTGTTCTGGGTCCGCTGG  1140

seq1  GTAATAAGGTAAGGTGCCTGAACTCTTGTCCACCTGATTCACCTACCCCA  1197
      |  |||||  |||||| |||||||||| ||   | |||  ||||||||||
seq2  G-GATAAG--AAGGTG-CTGAACTCTT-TC--ACGGAT--ACCTACCCCA  1181

seq1  CAGTTCTCTTCCTGGCGTGCTTATGACAGACACAACCAGATTATGCAATA  1247
              ||||| ||| |||| |||||||||    | |||  ||||   
seq2  -------GTTCCTCGCG-GCTT-TGACAGACA----CCGAT--TGCA---  1213

seq1  CCCTTTCCTGAGAATACAGGA  1268
           || |  ||||||||||
seq2  -----TCGTCGGAATACAGGA  1229

seq1: chr15_58461234_58462263
seq2: B6Ng01-069A17.g_65_1084 (reverse)

seq1  CCCCAGCCCTGCTCCCCTACCCACCCATTCCTGCTTCCTGGCCCTGGCAT  50
      |||||| |||||| ||||||||||||||| |||||  |||| ||||||||
seq2  CCCCAG-CCTGCT-CCCTACCCACCCATT-CTGCT--CTGG-CCTGGCAT  44

seq1  TCCCTTGTACTAGGGCATATAAAGTTTGCAATACCAAGGGGCCTCTCTTC  100
      |  | ||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||
seq2  T--CATGTACTAGGGCATATAAAG-TTGCAATACCAAGGAGCCTCTCTTC  91

seq1  CCAGTGATGGCCGACTAGGCCATCTTCTGCTACATATGCAGCTAGAGATA  150
      |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||
seq2  CCAGTGATGGCCGACTAGGCCATC-TCTGCTACATATGCAGCTAGAGATA  140

seq1  CGAGCTCTGGGGGGTACGGGTTAGTTCATATTGTTGTTCCACCTATAGGG  200
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CGAGCTCTGGGGGGTACGGGTTAGTTCATATTGTTGTTCCACCTATAGGG  190

seq1  TTGCAGATCCCTTCAGCTCCTGAGAAAGCTGAAGATATTTTTGATTTGTG  250
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTGCAGATCCCTTCAGCTCCTGAGAAAGCTGAAGATATTTTTGATTTGTG  240

seq1  GCCAATGGGTTAAACTCACTCTGTGTAATATATATGAAGACGTAGCCACT  300
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GCCAATGGGTTAAACTCACTCTGTGTAATATATATGAAGACGTAGCCACT  290

seq1  AGCCATAAGGACCACTGCCCTTTGCCTTGCTGTCCCATCCATACATAACA  350
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGCCATAAGGACCACTGCCCTTTGCCTTGCTGTCCCATCCATACATAACA  340

seq1  CATTAAATATGTGATCCATGCAGATTTGCCAGTTGAAAACCTAAGATAAG  400
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CATTAAATATGTGATCCATGCAGATTTGCCAGTTGAAAACCTAAGATAAG  390

seq1  TCAAATAACCCAAACCCTTTTCTGGCAGACTTGCGGTTTCAGTATAACAA  450
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCAAATAACCCAAACCCTTTTCTGGCAGACTTGCGGTTTCAGTATAACAA  440

seq1  AGCAGTCATTAATATCTGGAGCTCACTCTATGATGGGCCTCTAAGGTGTT  500
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGCAGTCATTAATATCTGGAGCTCACTCTATGATGGGCCTCTAAGGTGTT  490

seq1  GCACAGTGTGCTGACCAAGGAACCCAGTTTGCCAACCTGGATTTAAATCT  550
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GCACAGTGTGCTGACCAAGGAACCCAGTTTGCCAACCTGGATTTAAATCT  540

seq1  TGCTTATGACAGCAGCTAGTTGCATGACCTCAAGCAATATTGTTCACCTC  600
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGCTTATGACAGCAGCTAGTTGCATGACCTCAAGCAATATTGTTCACCTC  590

seq1  CCAAAGCTTCAGTTACTGTATCTGGAAACTCAGGACTGACTGAGAAAATA  650
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCAAAGCTTCAGTTACTGTATCTGGAAACTCAGGACTGACTGAGAAAATA  640

seq1  GGGAGACCTGGGCACAGCATTCCATGTATAAAGAGCACTCAGATCCCATT  700
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGGAGACCTGGGCACAGCATTCCATGTATAAAGAGCACTCAGATCCCATT  690

seq1  GCCATACTCCTCGTGTGATGGCTCCTGATGAGGGCATTAACATGCTGGCC  750
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GCCATACTCCTCGTGTGATGGCTCCTGATGAGGGCATTAACATGCTGGCC  740

seq1  CCATCCACTAGTGTGCCATGAGTAAGTGCTGAGCACGCAGCTTGTATACA  800
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCATCCACTAGTGTGCCATGAGTAAGTGCTGAGCACGCAGCTTGTATACA  790

seq1  TCACCCAAAGATGCAACCCTGACCAATGCTAACACTAGCCCATGTCCTTC  850
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCACCCAAAGATGCAACCCTGACCAATGCTAACACTAGCCCATGTCCTTC  840

seq1  AAACACTTGGGCTGTGTTTATATTTCCACCACAGGGCTCACTATGGTTTC  900
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAACACTTGGGCTGTGTTTATATTTCCACCACAGGGCTCACTATGGTTTC  890

seq1  TTATAGGTCAGATGACAATTCTGTTTTCTGGCTTGTGTTCTGTGGTACCA  950
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTATAGGTCAGATGACAATTCTGTTTTCTGGCTTGTGTTCTGTGGTACCA  940

seq1  GGGCTCCTTCTGCATCTACAAAAGCCCAGAGGATTCTACCTCAGAGGACA  1000
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGGCTCCTTCTGCATCTACAAAAGCCCAGAGGATTCTACCTCAGAGGACA  990

seq1  GTGGTCAGCTGAGAATCCAGCAAGGAATTC  1030
      ||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTGGTCAGCTGAGAATCCAGCAAGGAATTC  1020