BAC Information

Click to search

BAC

Clone NameB6Ng01-069M04
Chromosome15 (Build37)
Map Location 63,506,999 - 63,696,024
singlet/doubletdoublet
Overlap geneLOC672194, Mlze, AI987692, Gsdmdc2, 9930109F21Rik
Upstream geneLOC100040430, Tsg101-ps, EG239502, EG432959
Downstream geneLOC665769, 9030605I04Rik, 4933426G20Rik, 0910001A06Rik, Ddef1, Adcy8
LinkOpen Mouse BAC browser



BAC End Information

BAC end BAC-end 1BAC-end 2
end nameB6Ng01-069M04.bB6Ng01-069M04.g
ACCDH887969DH887970
length1,084972
definitionDH887969|Mus musculus domesticus DNA, BAC clone: B6Ng01-069M04, 5' end.DH887970|Mus musculus domesticus DNA, BAC clone: B6Ng01-069M04, 3' end.
singlet/doubletdoubletdoublet
BLAST hituniqueunique
Map location.(63,506,999 - 63,508,087)(63,695,042 - 63,696,024)
sequence
gaattcattggggaggtggggggaggaaaaaaaaaaaaaagcaaaagaaa
gcccttgcttcttcaataccgggagcttacaaagacacataaaccatgag
gaattccaaggacttaactcagaagccgctctgcaaatacatggcttgaa
caaagggccaatgttcctttcagaaaagagtgcggggctggtttccggca
ttttctttaagtcattaggaccgtgccaacaaacaaacatatactggtcc
ccagagaaagactttcattcatcggagcttacaagagtttgattattggg
acaggggtgctccagggcacgtgcctcgccagcctgcccccaaatgtaca
gatttgcttaaagggttttattgatggtggctacagacagatagagcctg
tgggggagctgacagcccctggacactaacggattagtgtcatccaaacc
aacacactgtcctatcagagacagctgaaggctcggccttgttcctcagg
aatctgtttctgtaaacatgcaaaaatatagaacagcacacttgtgttta
gtaggcttgagattccctttactaggacagtcaaagggttctgaagattt
ggaatgaaatgtcactgggtgattttagatgatgtaatgtttggatcttt
acccggatacatgtttcagcttttaacaaacatgaaaatgaacagtgtcc
cgaaaacactggggcattcgatgaaggatgaagccctttccaaactccag
ctatccacacatcatcttaggtggcttttgataacctcttggctatagac
cctccatctttatgtcaacagtaaaaatagcataaatgtacaacagcaca
gaatagcattgtatatggttcattggaagtgcaccaggcatgagtcgttt
taacacagtggttctcaaccttcctaatgctgtgaccttttaatacagtt
ctcatgtccttatgttgggttgaccccacccaaccattttcattgcttct
tcacaacagtattttgctagtgttatgaactggaaaggtaaaatctaata
gtgaggtgtctgaatgtgaccccttgggtggttg
gaattcaatctctaggcctctgtaggcacacctcccacgtttcaatgtag
gcaaatattgtcatacaagggagaggagcagtaactggacatggggacca
ggaaggggggggagaaggaagggactgctagtattttctcttgagctttc
tacatttatttggcttttaaattacacacatacattttttttttggatta
aagtaaacatttttaatggttttatgagtcaaagaactacaagtccctag
gaatgttttgtctccccaggttcgaggcaaggcgggaaggtcggaaaagt
attcaatacctatcccaaagggttcggtgttggcctataagaagcagcaa
cttgtcattgagaataacacttgtggtgagcagcagtgggggcctggtgg
ggatggggtgtccaaagatgtgtacctcttctgactacaggccaggagca
ctcctcactgtcccaggcacatgccctaccttcagtcacctctaggcatg
gccatcctcatatacttctagctgtagttgcagaggtagcttcctgaata
ggaagggatctgacttggagtgtccaaatggaggtatttttagctgggtg
aagtccaggctaatcccaggcatctctgggcattcatctctagccattca
aggtcctgcttctctcagaagcccaatagggagctgccaagttcaccagg
tgacccataactccacattaaagctccttaaaaataacagaagcacaaca
caactgaagctgtagactgaatgccttaatgtagtacagaatttcctcca
cgagatgtaccactgcccaatacacacaccacacacacatacacacatca
ccctcacccataccatacattcagactttgccatgggtgtaagtgtgtgt
aagcatggaagacatgtttgtgagctgatgccagaacatgatagtcttag
agcccagttattcctcattgta
quality valuesOpen.Open.




Alignment Information

BAC End 1BAC End 2
seq1: chr15_63506999_63508087
seq2: B6Ng01-069M04.b_45_1128

seq1  GAATTCATTGGGGAGGTGGGGGGAGGAAAAAAAAAAAAAAGCAAAAGAAA  50
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAATTCATTGGGGAGGTGGGGGGAGGAAAAAAAAAAAAAAGCAAAAGAAA  50

seq1  GCCCTTGCTTCTTCAATACCGGGAGCTTACAAAGACACATAAACCATGAG  100
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GCCCTTGCTTCTTCAATACCGGGAGCTTACAAAGACACATAAACCATGAG  100

seq1  GAATTCCAAGGACTTAACTCAGAAGCCGCTCTGCAAATACATGGCTTGAA  150
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAATTCCAAGGACTTAACTCAGAAGCCGCTCTGCAAATACATGGCTTGAA  150

seq1  CAAAGGGCCAATGTTCCTTTCAGAAAAGAGTGCGGGGCTGGTTTCCGGCA  200
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CAAAGGGCCAATGTTCCTTTCAGAAAAGAGTGCGGGGCTGGTTTCCGGCA  200

seq1  TTTTCTTTAAGTCATTAGGACCGTGCCAACAAACAAACATATACTGGTCC  250
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTTTCTTTAAGTCATTAGGACCGTGCCAACAAACAAACATATACTGGTCC  250

seq1  CCAGAGAAAGACTTTCATTCATCGGAGCTTACAAGAGTTTGATTATTGGG  300
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCAGAGAAAGACTTTCATTCATCGGAGCTTACAAGAGTTTGATTATTGGG  300

seq1  ACAGGGGTGCTCCAGGGCACGTGCCTCGCCAGCCTGCCCCCAAATGTACA  350
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACAGGGGTGCTCCAGGGCACGTGCCTCGCCAGCCTGCCCCCAAATGTACA  350

seq1  GATTTGCTTAAAGGGTTTTATTGATGGTGGCTACAGACAGATAGAGCCTG  400
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GATTTGCTTAAAGGGTTTTATTGATGGTGGCTACAGACAGATAGAGCCTG  400

seq1  TGGGGGAGCTGACAGCCCCTGGACACTAACGGATTAGTGTCATCCAAACC  450
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGGGGGAGCTGACAGCCCCTGGACACTAACGGATTAGTGTCATCCAAACC  450

seq1  AACACACTGTCCTATCAGAGACAGCTGAAGGCTCGGCCTTGTTCCTCAGG  500
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AACACACTGTCCTATCAGAGACAGCTGAAGGCTCGGCCTTGTTCCTCAGG  500

seq1  AATCTGTTTCTGTAAACATGCAAAAATATAGAACAGCACACTTGTGTTTA  550
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AATCTGTTTCTGTAAACATGCAAAAATATAGAACAGCACACTTGTGTTTA  550

seq1  GTAGGCTTGAGATTCCCTTTACTAGGACAGTCAAAGGGTTCTGAAGATTT  600
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTAGGCTTGAGATTCCCTTTACTAGGACAGTCAAAGGGTTCTGAAGATTT  600

seq1  GGAATGAAATGTCACTGGGTGATTTTAGATGATGTAATGTTTGGATCTTT  650
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGAATGAAATGTCACTGGGTGATTTTAGATGATGTAATGTTTGGATCTTT  650

seq1  ACCCGGATACATGTTTCAGCTTTTAACAAACATGAAAATGAACAGTGTCC  700
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACCCGGATACATGTTTCAGCTTTTAACAAACATGAAAATGAACAGTGTCC  700

seq1  CGAAAACACTGGGGCATTCGATGAAGGATGAAGCCCTTTCCAAACTCCAG  750
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CGAAAACACTGGGGCATTCGATGAAGGATGAAGCCCTTTCCAAACTCCAG  750

seq1  CTATCCACACATCATCTTAGGTGGC-TTTGATAACCTCTTGGCTATAGAC  799
      ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||
seq2  CTATCCACACATCATCTTAGGTGGCTTTTGATAACCTCTTGGCTATAGAC  800

seq1  CCTCCATCTTTATGTCAACAGTAAAAATAGCATAAATGTACAACAGCACA  849
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCTCCATCTTTATGTCAACAGTAAAAATAGCATAAATGTACAACAGCACA  850

seq1  GAATAGCATTGTATATGGTTCATTGGAAGTGCACCAGGCATGAGTCGTGT  899
      |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
seq2  GAATAGCATTGTATATGGTTCATTGGAAGTGCACCAGGCATGAGTCGTTT  900

seq1  TAACACAGTGGTTCTCAACCTTCCTAATGCTGTGACCTTTTAATACAGTT  949
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TAACACAGTGGTTCTCAACCTTCCTAATGCTGTGACCTTTTAATACAGTT  950

seq1  CCTCATGTCCTTATGTTGTGGTGACCCCCACCCCAACCATTTTCATTGCT  999
       ||||||||||||||||| | |||||||   |||||||||||||||||||
seq2  -CTCATGTCCTTATGTTGGGTTGACCCC--ACCCAACCATTTTCATTGCT  997

seq1  ACTTCACAACAGTAATTTTGCTAATGTTATGAACTGTAATGTAAATATCT  1049
       |||||||||||| ||||||||| |||||||||||| || |  || ||||
seq2  TCTTCACAACAGT-ATTTTGCTAGTGTTATGAACTGGAAAGGTAAAATCT  1046

seq1  AATATGTAGGTTGTCTGATATGTGACCCCTGTGGGGGTTG  1089
      |||| ||  | ||||||| |||||||||||  || |||||
seq2  AATA-GTGAGGTGTCTGA-ATGTGACCCCTTGGGTGGTTG  1084

seq1: chr15_63695042_63696024
seq2: B6Ng01-069M04.g_66_1037 (reverse)

seq1  TACACTGAGGAATAACTTGGGGCTCTAAGACCTACTCATGTTCTGGCACT  50
      |||| ||||||||||||  ||||||||||| ||| ||||||||||||| |
seq2  TACAATGAGGAATAACT--GGGCTCTAAGA-CTA-TCATGTTCTGGCA-T  45

seq1  CAGCTCACAAACATGTTCATCCATGCTTAACACAACACTTACACCCCATG  100
      ||||||||||||||| || ||||||||| |||| ||||||||| ||||||
seq2  CAGCTCACAAACATG-TCTTCCATGCTT-ACAC-ACACTTACA-CCCATG  91

seq1  GCAAAGTCTGAATGTATGGGTATGGGTGAGGGTGATGTGTGTATGTTGTG  150
      ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||
seq2  GCAAAGTCTGAATGTAT-GGTATGGGTGAGGGTGATGTGTGTATG-TGTG  139

seq1  TGTGGTGTGTGTATTGGGCAGTGGTACATCTCGTGGAGAAAATTCTGTAC  200
      |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||
seq2  TGTGGTGTGTGTATTGGGCAGTGGTACATCTCGTGGAGGAAATTCTGTAC  189

seq1  TACATTAAGGCATTCAGTCTACAGCTTCAGTTGTGTTGTGCTTCTGTTAT  250
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TACATTAAGGCATTCAGTCTACAGCTTCAGTTGTGTTGTGCTTCTGTTAT  239

seq1  TTTTAAGGAGCTTTAATGTGGAGTTATGGGTCACCTGGTGAACTTGGCAG  300
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTTTAAGGAGCTTTAATGTGGAGTTATGGGTCACCTGGTGAACTTGGCAG  289

seq1  CTCCCTATTGGGCTTCTGAGAGAAGCAGGACCTTGAATGGCTAGAGATGA  350
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTCCCTATTGGGCTTCTGAGAGAAGCAGGACCTTGAATGGCTAGAGATGA  339

seq1  ATGCCCAGAGATGCCTGGGATTAGCCTGGACTTCACCCAGCTAAAAATAC  400
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATGCCCAGAGATGCCTGGGATTAGCCTGGACTTCACCCAGCTAAAAATAC  389

seq1  CTCCATTTGGACACTCCAAGTCAGATCCCTTCCTATTCAGGAAGCTACCT  450
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTCCATTTGGACACTCCAAGTCAGATCCCTTCCTATTCAGGAAGCTACCT  439

seq1  CTGCAACTACAGCTAGAAGTATATGAGGATGGCCATGCCTAGAGGTGACT  500
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTGCAACTACAGCTAGAAGTATATGAGGATGGCCATGCCTAGAGGTGACT  489

seq1  GAAGGTAGGGCATGTGCCTGGGACAGTGAGGAGTGCTCCTGGCCTGTAGT  550
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAAGGTAGGGCATGTGCCTGGGACAGTGAGGAGTGCTCCTGGCCTGTAGT  539

seq1  CAGAAGAGGTACACATCTTTGGACACCCCATCCCCACCAGGCCCCCACTG  600
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CAGAAGAGGTACACATCTTTGGACACCCCATCCCCACCAGGCCCCCACTG  589

seq1  CTGCTCACCACAAGTGTTATTCTCAATGACAAGTTGCTGCTTCTTATAGG  650
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTGCTCACCACAAGTGTTATTCTCAATGACAAGTTGCTGCTTCTTATAGG  639

seq1  CCAACACCGAACCCTTTGGGATAGGTATTGAATACTTTTCCGACCTTCCC  700
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCAACACCGAACCCTTTGGGATAGGTATTGAATACTTTTCCGACCTTCCC  689

seq1  GCCTTGCCTCGAACCTGGGGAGACAAAACATTCCTAGGGACTTGTAGTTC  750
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GCCTTGCCTCGAACCTGGGGAGACAAAACATTCCTAGGGACTTGTAGTTC  739

seq1  TTTGACTCATAAAACCATTAAAAATGTTTACTTTAATCCAAAAAAAAAAT  800
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTTGACTCATAAAACCATTAAAAATGTTTACTTTAATCCAAAAAAAAAAT  789

seq1  GTATGTGTGTAATTTAAAAGCCAAATAAATGTAGAAAGCTCAAGAGAAAA  850
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTATGTGTGTAATTTAAAAGCCAAATAAATGTAGAAAGCTCAAGAGAAAA  839

seq1  TACTAGCAGTCCCTTCCTTCTCCCCCCCCTTCCTGGTCCCCATGTCCAGT  900
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TACTAGCAGTCCCTTCCTTCTCCCCCCCCTTCCTGGTCCCCATGTCCAGT  889

seq1  TACTGCTCCTCTCCCTTGTATGACAATATTTGCCTACATTGAAACGTGGG  950
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TACTGCTCCTCTCCCTTGTATGACAATATTTGCCTACATTGAAACGTGGG  939

seq1  AGGTGTGCCTACAGAGGCCTAGAGATTGAATTC  983
      |||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGGTGTGCCTACAGAGGCCTAGAGATTGAATTC  972