BAC Information

Click to search

BAC

Clone NameB6Ng01-072I08
Chromosome15 (Build37)
Map Location 29,879,097 - 30,034,933
singlet/doubletdoublet
Overlap geneLOC382975
Upstream genenone
Downstream geneCtnnd2, 9630009A06Rik
LinkOpen Mouse BAC browser



BAC End Information

BAC end BAC-end 1BAC-end 2
end nameB6Ng01-072I08.bB6Ng01-072I08.g
ACCDH889918DH889919
length1,046988
definitionDH889918|Mus musculus domesticus DNA, BAC clone: B6Ng01-072I08, 5' end.DH889919|Mus musculus domesticus DNA, BAC clone: B6Ng01-072I08, 3' end.
singlet/doubletdoubletdoublet
BLAST hituniqueunique
Map location.(29,879,097 - 29,880,139)(30,033,947 - 30,034,933)
sequence
gaattctccattaacatttaattaccttagaaatattcagcctccacatt
taagcatggatcatatcaatctgaggggggtgtgtgtgtgtgtacgctca
tcacattctaaaattcacagagaaacatcaagtttcttgactgtttaggg
aaaaaaaatgacgtgtaggtgccacagcaaaataaaaaggacttggcctt
caaaaatatgaatctagagtattgggttaaaatgatttttaatgggtttg
gtatgatgatttatataatgctgattaaggacaatttttgtcacaaatga
ggaggttagtaagtttacaatacattcaccaataattcaagattcagctg
tgatcttcatactcctctgtcatcttcatgacccctcacctttcccaagc
aaaggaacaccacaggtgagctttgtggtccacataaactaagtacatca
ttaaaatctctgcagtttgggacttgacatcccaacccagtacatttggg
cctggaatattcttaagcaactgttacatgtcaagagacctgctactaga
aaaaaaatcatattaatgagctagcttatctagcctctgattatgttcac
tgttatctctaagagtaagtcaccaggggaatttgattgctaagtataac
tgcaagtagaatatccagaaagctacaaacctcaagcaactatactgctg
tcatgctgtcctactggtttggggcttgttaattttaaataatttgtgct
gaaaatattttttttaaaaaaatttatttcattgagatttgccatgttat
tcagcatataaaatgccatttatcttcataattgctgtttttaaaaactg
gagcataaaaccacatgaccacagctgttccctaattataaaagatacag
acctagaagtctacacaaaagaaaagacatgttcattgtctgtgagataa
tgacaatatcttgagaggtagaatgtggcctcagtggaagaccaccttgc
ttggtgtgcatacgtccaggtttgtagtggtggtggttagaggggc
gaattcacataccaaatacaaagaacatccctgttggtatgttattttct
tccctgagtagaatttccgatgtaaagataattgaacatcccattttctg
agaacgttatcactgttcaaaaatacgtcaaccactttctcttgtaccaa
caatagactgttagataaagaaaagtgatgaagttctgaatttttcttct
gtataatttagtgggcttaaaacaattcttctaggtagcaattgccagtc
tgaaactgaaatacatatttgcaatctcattatttgtcagaacaactttg
taaaactgctacctttgaacattatccaaaatcttttgtctaaaatacaa
ttctctcaaattttaaaaagacaagtatgggtgcctttcatataatattt
ttcagagagaaagtaagtgtggtattcctgttgatcgagtaataaggtat
ccaattgacaaaagtagatatgtccacctcaggttctctcattactgtat
ttactgttttatgctgttgtgaaatgaccaaaaccacttggagagaatgg
tatttattttaatattacacttgtgtacacaatttatcattgagggaagt
caggagaggaattctaggcaggaactccaggcagaagccatagaattagt
cttactggcttgttctgagattcctgttcagatagctgcataagctaagg
ctcaccaacctagggaattgtgcccgcccaccatgggcgtggcccctcaa
atcaaccagccaccgtaaccattcaccataaacatgccctgaggtcaatc
tgataaagacagctttcaactgagctctttcttccctactgactctagtt
gtgtcagcatacactagcaacattttatcgaaaggacccagatgtagctg
tctcttgtgagactatgctggggccttgcaaacacagaagtggatgatca
cagtcagctattgaatggatcacagagcccccaatgga
quality valuesOpen.Open.




Alignment Information

BAC End 1BAC End 2
seq1: chr15_29879097_29880139
seq2: B6Ng01-072I08.b_46_1091

seq1  GAATTCTCCATTAACATTTAATTACCTTAGAAATATTCAGCCTCCACATT  50
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAATTCTCCATTAACATTTAATTACCTTAGAAATATTCAGCCTCCACATT  50

seq1  TAAGCATGGATCATATCAATCTGAGGGGGGTGTGTGTGTGTGTACGCTCA  100
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TAAGCATGGATCATATCAATCTGAGGGGGGTGTGTGTGTGTGTACGCTCA  100

seq1  TCACATTCTAAAATTCACAGAGAAACATCAAGTTTCTTGACTGTTTAGGG  150
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCACATTCTAAAATTCACAGAGAAACATCAAGTTTCTTGACTGTTTAGGG  150

seq1  AAAAAAAATGACGTGTAGGTGCCACAGCAAAATAAAAAGGACTTGGCCTT  200
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAAAAAAATGACGTGTAGGTGCCACAGCAAAATAAAAAGGACTTGGCCTT  200

seq1  CAAAAATATGAATCTAGAGTATTGGGTTAAAATGATTTTTAATGGGTTTG  250
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CAAAAATATGAATCTAGAGTATTGGGTTAAAATGATTTTTAATGGGTTTG  250

seq1  GTATGATGATTTATATAATGCTGATTAAGGACAATTTTTGTCACAAATGA  300
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTATGATGATTTATATAATGCTGATTAAGGACAATTTTTGTCACAAATGA  300

seq1  GGAGGTTAGTAAGTTTACAATACATTCACCAATAATTCAAGATTCAGCTG  350
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGAGGTTAGTAAGTTTACAATACATTCACCAATAATTCAAGATTCAGCTG  350

seq1  TGATCTTCATACTCCTCTGTCATCTTCATGACCCCTCACCTTTCCCAAGC  400
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGATCTTCATACTCCTCTGTCATCTTCATGACCCCTCACCTTTCCCAAGC  400

seq1  AAAGGAACACCACAGGTGAGCTTTGTGGTCCACATAAACTAAGTACATCA  450
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAAGGAACACCACAGGTGAGCTTTGTGGTCCACATAAACTAAGTACATCA  450

seq1  TTAAAATCTCTGCAGTTTGGGACTTGACATCCCAACCCAGTACATTTGGG  500
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTAAAATCTCTGCAGTTTGGGACTTGACATCCCAACCCAGTACATTTGGG  500

seq1  CCTGGAATATTCTTAAGCAACTGTTACATGTCAAGAGACCTGCTACTAGA  550
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCTGGAATATTCTTAAGCAACTGTTACATGTCAAGAGACCTGCTACTAGA  550

seq1  AAAAAAATCATATTAATGAGCTAGCTTATCTAGCCTCTGATTATGTTCAC  600
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAAAAAATCATATTAATGAGCTAGCTTATCTAGCCTCTGATTATGTTCAC  600

seq1  TGTTATCTCTAAGAGTAAGTCACCAGGGGAATTTGATTGCTAAGTATAAC  650
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGTTATCTCTAAGAGTAAGTCACCAGGGGAATTTGATTGCTAAGTATAAC  650

seq1  TGCAAGTAGAATATCCAGAAAGCTACAAACCTCAAGCAACTATACTGCTG  700
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGCAAGTAGAATATCCAGAAAGCTACAAACCTCAAGCAACTATACTGCTG  700

seq1  TCATGCTGTCCTACTGGTTTGGGGCTTGTTAATTTTAAATAATTTGTGCT  750
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCATGCTGTCCTACTGGTTTGGGGCTTGTTAATTTTAAATAATTTGTGCT  750

seq1  GAAAATATTTTTTTAAAAAAAATTTATTTCATTGAGATTTGCCATGTTAT  800
      |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAAAATATTTTTTTTAAAAAAATTTATTTCATTGAGATTTGCCATGTTAT  800

seq1  TCAGCATATAAAATGCCATTTATCTTCATAATTGCTGTTTTTAAAAACTG  850
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCAGCATATAAAATGCCATTTATCTTCATAATTGCTGTTTTTAAAAACTG  850

seq1  GAGCATAAAACCACATGACCACAAGCTGTTTCCTAATTATAAAAGATACA  900
      |||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||
seq2  GAGCATAAAACCACATGACCAC-AGCTGTTCCCTAATTATAAAAGATACA  899

seq1  GACCTAGAAGTCTACACAAAAGAAAAGACATG-TCATTGTCTGTGAGATA  949
      |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||
seq2  GACCTAGAAGTCTACACAAAAGAAAAGACATGTTCATTGTCTGTGAGATA  949

seq1  ATGACAATATCTTGAGAGGTAGAATGTGG-CTCAGTGGAAGACCA-CTTG  997
      ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||
seq2  ATGACAATATCTTGAGAGGTAGAATGTGGCCTCAGTGGAAGACCACCTTG  999

seq1  CTTGGTGTGCATAAGGTCCAGG-TTGTAGTGGTGGTGG-TAGAGGGGC  1043
      |||||||||||| | ||||||| ||||||||||||||| |||||||||
seq2  CTTGGTGTGCAT-ACGTCCAGGTTTGTAGTGGTGGTGGTTAGAGGGGC  1046

seq1: chr15_30033947_30034933
seq2: B6Ng01-072I08.g_69_1056 (reverse)

seq1  TCCATTGGGGGCTCTGTGATCCATCCAATAGCTGACTGTGATCATCCACT  50
      |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||
seq2  TCCATTGGGGGCTCTGTGATCCATTCAATAGCTGACTGTGATCATCCACT  50

seq1  TCTGTGTTTGCAAGGCCCCAGCATAGTCTCACAAGAGACAGCTACATCTG  100
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCTGTGTTTGCAAGGCCCCAGCATAGTCTCACAAGAGACAGCTACATCTG  100

seq1  GGTCCTTTCGATAAAATGTTGCTAGTGTATGCTGACACAAACTAGAGTCA  150
      |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||
seq2  GGTCCTTTCGATAAAATGTTGCTAGTGTATGCTGACAC-AACTAGAGTCA  149

seq1  GTAGGGAAGAAAGAGCTCAGTTGAAAGCTGTCTTTATCAGATTGACCTCA  200
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTAGGGAAGAAAGAGCTCAGTTGAAAGCTGTCTTTATCAGATTGACCTCA  199

seq1  GGGCATGTTTATGGTGAATGGTTACGGTGGCTGGTTGATTTGAGGGGCCA  250
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGGCATGTTTATGGTGAATGGTTACGGTGGCTGGTTGATTTGAGGGGCCA  249

seq1  CGCCCATGGTGGGC-GGCACAATT-CCTAGGTTGGTGAGCCTTAGCTTAT  298
      |||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||
seq2  CGCCCATGGTGGGCGGGCACAATTCCCTAGGTTGGTGAGCCTTAGCTTAT  299

seq1  GCAGCTATCTGAACAGGAATCTCAGAACAAGCCAGTAAGACTAATTCTAT  348
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GCAGCTATCTGAACAGGAATCTCAGAACAAGCCAGTAAGACTAATTCTAT  349

seq1  GGCTTCTGCCTGGAGTTCCTGCCTAGAATTCCTCTCCTGACTTCCCTCAA  398
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGCTTCTGCCTGGAGTTCCTGCCTAGAATTCCTCTCCTGACTTCCCTCAA  399

seq1  TGATAAATTGTGTACACAAGTGTAATATTAAAATAAATACCATTCTCTCC  448
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGATAAATTGTGTACACAAGTGTAATATTAAAATAAATACCATTCTCTCC  449

seq1  AAGTGGTTTTGGTCATTTCACAACAGCATAAAACAGTAAATACAGTAATG  498
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAGTGGTTTTGGTCATTTCACAACAGCATAAAACAGTAAATACAGTAATG  499

seq1  AGAGAACCTGAGGTGGACATATCTACTTTTGTCAATTGGATACCTTATTA  548
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGAGAACCTGAGGTGGACATATCTACTTTTGTCAATTGGATACCTTATTA  549

seq1  CTCGATCAACAGGAATACCACACTTACTTTCTCTCTGAAAAATATTATAT  598
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTCGATCAACAGGAATACCACACTTACTTTCTCTCTGAAAAATATTATAT  599

seq1  GAAAGGCACCCATACTTGTCTTTTTAAAATTTGAGAGAATTGTATTTTAG  648
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAAAGGCACCCATACTTGTCTTTTTAAAATTTGAGAGAATTGTATTTTAG  649

seq1  ACAAAAGATTTTGGATAATGTTCAAAGGTAGCAGTTTTACAAAGTTGTTC  698
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACAAAAGATTTTGGATAATGTTCAAAGGTAGCAGTTTTACAAAGTTGTTC  699

seq1  TGACAAATAATGAGATTGCAAATATGTATTTCAGTTTCAGACTGGCAATT  748
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGACAAATAATGAGATTGCAAATATGTATTTCAGTTTCAGACTGGCAATT  749

seq1  GCTACCTAGAAGAATTGTTTTAAGCCCACTAAATTATACAGAAGAAAAAT  798
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GCTACCTAGAAGAATTGTTTTAAGCCCACTAAATTATACAGAAGAAAAAT  799

seq1  TCAGAACTTCATCACTTTTCTTTATCTAACAGTCTATTGTTGGTACAAGA  848
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCAGAACTTCATCACTTTTCTTTATCTAACAGTCTATTGTTGGTACAAGA  849

seq1  GAAAGTGGTTGACGTATTTTTGAACAGTGATAACGTTCTCAGAAAATGGG  898
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAAAGTGGTTGACGTATTTTTGAACAGTGATAACGTTCTCAGAAAATGGG  899

seq1  ATGTTCAATTATCTTTACATCGGAAATTCTACTCAGGGAAGAAAATAACA  948
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATGTTCAATTATCTTTACATCGGAAATTCTACTCAGGGAAGAAAATAACA  949

seq1  TACCAACAGGGATGTTCTTTGTATTTGGTATGTGAATTC  987
      |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TACCAACAGGGATGTTCTTTGTATTTGGTATGTGAATTC  988