BAC Information

Click to search

BAC

Clone NameB6Ng01-073N08
Chromosome15 (Build37)
Map Location 38,311,620 - 38,397,336
singlet/doubletdoublet
Overlap genenone
Upstream geneNcald, LOC667498, 4930447A16Rik, LOC100041313, LOC667534, Rrm2b, LOC100041478, Edd1, Odf1, LOC382986, LOC667563, Klf10
Downstream geneAzin1, Siah1-ps2, Atp6v1c1, Baalc, TOB3L, Fzd6, LOC636952, Cthrc1, Slc25a32, Wdsof1, LOC671215, Rims2
LinkOpen Mouse BAC browser



BAC End Information

BAC end BAC-end 1BAC-end 2
end nameB6Ng01-073N08.bB6Ng01-073N08.g
ACCDH890846DH890847
length1,1591,084
definitionDH890846|Mus musculus domesticus DNA, BAC clone: B6Ng01-073N08, 5' end.DH890847|Mus musculus domesticus DNA, BAC clone: B6Ng01-073N08, 3' end.
singlet/doubletdoubletdoublet
BLAST hituniqueunique
Map location.(38,311,620 - 38,312,794)(38,396,250 - 38,397,336)
sequence
gaattcacttcctcaccttcccacctctagaaccttctttgctgtgtggt
cccttccagacgtgaagctgcctgtttgcagatgtcaccgcttcccattt
tacaaacagtatatacacctgaagagccagctacgggtattctagttaaa
catgaaatgcagaaatggatgtgaaggaagagcgcatgagccaaggaagg
tttccaggtgactgctgtggtcatgtgacccagggacagacaaggaacac
tgcagaaaacagaggggggaaattcctgccccggcggaccttggtatccc
ataggagactgacacagaacaagcaagatgcaggtcaggcatgcatgcca
caaatgactcaaggagtcaagagggaaactttgctccatgctgacccaaa
ggagggaggcactggggcctctacagctcacttgggtaccagggtttctt
gttaattgttgtgttgtttaattctctgtctgtttctctctgcctctgcc
tctgcctctgtctctgtctgtctgtctgtctgtctgtctctctctctctc
tcttggagttcactatgtaacccaggctttccttaacttgaaggttcctg
cttgatcttcctaactatagtgattacaggtgtgtgcaccattcccagac
tgcaggaggctgaagcagacaagagcaacgtcttcaaacttcctcatagc
taagcagatgtttactcaaacatatcttgggcaacaactacatccagagt
atcgactgttgtagcacagttgctctgatcagggtggaacccacctcctg
ctctgtggctccctcctcagcaacccaaggaaccttccagaatccccagg
gctctgcagagcctggacggtaatcacccttaataaaaggtgcgtgcttc
cacttcctctcaacagcccacgaggctactgcttcacgctgaagagtcag
cggcatagagggactgattgtctaagtgagtcggtgtctgaaacttgttt
tcccgtgctaggattgacccagggctgtgcatgccaggcagcaattctac
ttccaggctatagcccagacttgctgaagttgatgataaaagatgaatct
gggtctgcctttctctatttttctacacaccgattctccaccacccatac
agaatactg
gaattctgctgtcagacttgactatctaatgaagtagacaggcagtgtcc
cttcataaacaagcgctgtcaccttgggccatgtgctttttttttgagcc
atggtttttgcttttctgttattttttttttatttatttacatgggtgtc
ttgcctgtactatgtgtagtacctttaaaggctagaagaggtgttgattc
tcagaactggagttccaaacagttgtgagctaccatgtgggtgctgggaa
ctgggttcactgggagagcaatgtccttgactgatggaccagctctacag
cctgtttttgctttgttaacttgtaaaacagagataatttgttttacgta
aaagagaaaaacaatactctactcacagtctttgaccacatgttgggatt
ttccacaataaccagttctccagcaccagctagggcactgcagttaaaat
tcttttctgacactgtctaccaggaatgaagtcaggtcctataagttaaa
ggctcagtattataaaattgtgccctccttcagataccaataggagactc
acttccagaatgtctaccagctggtctataagctgaccccttctgaggcg
tgatcacaaactcaggcaagcatccgcatgtgtctgtttaaagggattaa
agggtgggggcaagggttataagggactctcaagaccacacatcaagaac
acagatgaactccggtggaaaaggtgtgtagagctaagtacaaagaaagc
gatggtgaatgtgcatgcctttgttgactttaggcctgcagcatcccctg
gaactctcccgtgctcactgtccagggatttctcagagagccttcactgc
cattacaggcttcattattggcctgtgtttccagctgcactgaaagtccc
aacttccaatcacggcctggactctctggagagcagctcctgagactgca
gactccttagaagaaaagacatttatagaacccagaaattcccaagtggc
aggagagaaatactgtcaccatgccatccagaaaggataagccttcagag
cttgttgctaggagcaatgggacggagactctgt
quality valuesOpen.Open.




Alignment Information

BAC End 1BAC End 2
seq1: chr15_38311620_38312794
seq2: B6Ng01-073N08.b_45_1203

seq1  GAATTCACTTCCTCACCTTCCCACCTCTAGAACCTTCTTTGCTGTGTGGT  50
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAATTCACTTCCTCACCTTCCCACCTCTAGAACCTTCTTTGCTGTGTGGT  50

seq1  CCCTTCCAGACGTGAAGCTGCCTGTTTGCAGATGTCACCGCTTCCCATTT  100
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCCTTCCAGACGTGAAGCTGCCTGTTTGCAGATGTCACCGCTTCCCATTT  100

seq1  TACAAACAGTATATACACCTGAAGAGCCAGCTACGGGTATTCTAGTTAAA  150
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TACAAACAGTATATACACCTGAAGAGCCAGCTACGGGTATTCTAGTTAAA  150

seq1  CATGAAATGCAGAAATGGATGTGAAGGAAGAGCGCATGAGCCAAGGAAGG  200
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CATGAAATGCAGAAATGGATGTGAAGGAAGAGCGCATGAGCCAAGGAAGG  200

seq1  TTTCCAGGTGACTGCTGTGGTCATGTGACCCAGGGACAGACAAGGAACAC  250
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTTCCAGGTGACTGCTGTGGTCATGTGACCCAGGGACAGACAAGGAACAC  250

seq1  TGCAGAAAACAGAGGGGGGAAATTCCTGCCCCGGCGGACCTTGGTATCCC  300
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGCAGAAAACAGAGGGGGGAAATTCCTGCCCCGGCGGACCTTGGTATCCC  300

seq1  ATAGGAGACTGACACAGAACAAGCAAGATGCAGGTCAGGCATGCATGCCA  350
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATAGGAGACTGACACAGAACAAGCAAGATGCAGGTCAGGCATGCATGCCA  350

seq1  CAAATGACTCAAGGAGTCAAGAGGGAAACTTTGCTCCATGCTGACCCAAA  400
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CAAATGACTCAAGGAGTCAAGAGGGAAACTTTGCTCCATGCTGACCCAAA  400

seq1  GGAGGGAGGCACTGGGGCCTCTACAGCTCACTTGGGTACCAGGGTTTCTT  450
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGAGGGAGGCACTGGGGCCTCTACAGCTCACTTGGGTACCAGGGTTTCTT  450

seq1  GTTAATTGTTGTGTTGTTTAATTCTCTGTCTGTTTCTCTCTGCCTCTGCC  500
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTTAATTGTTGTGTTGTTTAATTCTCTGTCTGTTTCTCTCTGCCTCTGCC  500

seq1  TCTGCCTCTGTCTCTGTCTGTCTGTCTGTCTGTCTGTCTCTCTCTCTCTC  550
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCTGCCTCTGTCTCTGTCTGTCTGTCTGTCTGTCTGTCTCTCTCTCTCTC  550

seq1  TCTTGGAGTTCACTATGTAACCCAGGCTTTCCTTAACTTGAAGGTTCCTG  600
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCTTGGAGTTCACTATGTAACCCAGGCTTTCCTTAACTTGAAGGTTCCTG  600

seq1  CTTGATCTTCCTAACTATAGTGATTACAGGTGTGTGCACCATTCCCAGAC  650
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTTGATCTTCCTAACTATAGTGATTACAGGTGTGTGCACCATTCCCAGAC  650

seq1  TGCAGGAGGCTGAAGCAGACAAGAGCAACGTCTTCAAACTTCCTCATAGC  700
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGCAGGAGGCTGAAGCAGACAAGAGCAACGTCTTCAAACTTCCTCATAGC  700

seq1  TAAGCAGATGTTTACTCAAACATATCTTGGGCAACAACTACATCCAGAGT  750
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TAAGCAGATGTTTACTCAAACATATCTTGGGCAACAACTACATCCAGAGT  750

seq1  ATCGACTGTTGTAGCACAGTTGCTCTGATCAGGGTGGAACCCACCTCCTG  800
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATCGACTGTTGTAGCACAGTTGCTCTGATCAGGGTGGAACCCACCTCCTG  800

seq1  CTCTGTGGCTCCCTCCTCAGCAACCCAAGGAACCTTCCAGAATCCCCAGG  850
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTCTGTGGCTCCCTCCTCAGCAACCCAAGGAACCTTCCAGAATCCCCAGG  850

seq1  GCTCTGCAGAGCCTGGACGGTAATCACCCTTAATAAAAGGTGCGTGCTTC  900
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GCTCTGCAGAGCCTGGACGGTAATCACCCTTAATAAAAGGTGCGTGCTTC  900

seq1  CACTTCCTCTCAACAGCCCACGAGGCTACTGCTTCACGCTGAAGAGTCAG  950
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CACTTCCTCTCAACAGCCCACGAGGCTACTGCTTCACGCTGAAGAGTCAG  950

seq1  CGGCATAGAGGGACTGATTGTCTAAGTGAGTCGGTGTCTGAAACTTGTTT  1000
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CGGCATAGAGGGACTGATTGTCTAAGTGAGTCGGTGTCTGAAACTTGTTT  1000

seq1  TCCCGTGCTAGGAATTGAACCCAGGGCCTTGTGCATGCCAGGCAGCACAT  1050
      |||||||||||| |||| |||||||||  |||||||||||||||||| ||
seq2  TCCCGTGCTAGG-ATTG-ACCCAGGGC--TGTGCATGCCAGGCAGCA-AT  1045

seq1  CCTACTCCCAGGCTATAGCCCCAGACCTGCTTGAAGTTTGATGGAATAAA  1100
       ||||| ||||||||||| ||||||| ||| ||||| ||||||  |||||
seq2  TCTACTTCCAGGCTATAG-CCCAGACTTGC-TGAAG-TTGATG--ATAAA  1090

seq1  AGTAGAATCTGGGTCCTGCCTGTCTCTATTTCTATACACACACCACCATC  1150
      ||  |||||||||| |||||| ||||||||| | ||||||| | |   ||
seq2  AGATGAATCTGGGT-CTGCCTTTCTCTATTTTTCTACACAC-CGA--TTC  1136

seq1  ACCACCACCCCATACACACATACTG  1175
       |||||| |||||||| | ||||||
seq2  TCCACCA-CCCATACAGA-ATACTG  1159

seq1: chr15_38396250_38397336
seq2: B6Ng01-073N08.g_69_1152 (reverse)

seq1  ACAGAGTCTCTGT-CCATTGCTCCTAGCACAAAGCTCTGAAGGCTTATCC  49
      |||||||||| || |||||||||||||||  |||||||||||||||||||
seq2  ACAGAGTCTCCGTCCCATTGCTCCTAGCAACAAGCTCTGAAGGCTTATCC  50

seq1  TTTCTTGGATGGCATTGGTGACAGTATTTCTCTCCTGCCACTTGGGAATT  99
      |||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |
seq2  TTTC-TGGATGGCA-TGGTGACAGTATTTCTCTCCTGCCACTTGGGAA-T  97

seq1  TTCTGGGTTCTATAAATGTCTTTTCTTCTAAGGAGTCTTGCAGTCTCAGG  149
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||
seq2  TTCTGGGTTCTATAAATGTCTTTTCTTCTAAGGAGTC-TGCAGTCTCAGG  146

seq1  AGCTGCTCTCCAGAGAGTCCAGGCCGTGATTGGAAGTTGGGACTTTCAGT  199
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 
seq2  AGCTGCTCTCCAGAGAGTCCAGGCCGTGATTGGAAGTTGGGACTTTCAG-  195

seq1  TGCAGCTGGAAACACAGG-CAATAATGAAGCCTGTAATGGCAGTGAAGGC  248
      |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGCAGCTGGAAACACAGGCCAATAATGAAGCCTGTAATGGCAGTGAAGGC  245

seq1  TCTCTGAGAAATCCCTGGACAGTGAGCACGGGAGAGTTCCAGGGGATGCT  298
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCTCTGAGAAATCCCTGGACAGTGAGCACGGGAGAGTTCCAGGGGATGCT  295

seq1  GCAGGCCTAAAGTCAACAAAGGCATGCACATTCACCATCGCTTTCTTTGT  348
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GCAGGCCTAAAGTCAACAAAGGCATGCACATTCACCATCGCTTTCTTTGT  345

seq1  ACTTAGCTCTACACACCTTTTCCACCGGAGTTCATCTGTGTTCTTGATGT  398
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACTTAGCTCTACACACCTTTTCCACCGGAGTTCATCTGTGTTCTTGATGT  395

seq1  GTGGTCTTGAGAGTCCCTTATAACCCTTGCCCCCACCCTTTAATCCCTTT  448
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTGGTCTTGAGAGTCCCTTATAACCCTTGCCCCCACCCTTTAATCCCTTT  445

seq1  AAACAGACACATGCGGATGCTTGCCTGAGTTTGTGATCACGCCTCAGAAG  498
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAACAGACACATGCGGATGCTTGCCTGAGTTTGTGATCACGCCTCAGAAG  495

seq1  GGGTCAGCTTATAGACCAGCTGGTAGACATTCTGGAAGTGAGTCTCCTAT  548
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGGTCAGCTTATAGACCAGCTGGTAGACATTCTGGAAGTGAGTCTCCTAT  545

seq1  TGGTATCTGAAGGAGGGCACAATTTTATAATACTGAGCCTTTAACTTATA  598
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGGTATCTGAAGGAGGGCACAATTTTATAATACTGAGCCTTTAACTTATA  595

seq1  GGACCTGACTTCATTCCTGGTAGACAGTGTCAGAAAAGAATTTTAACTGC  648
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGACCTGACTTCATTCCTGGTAGACAGTGTCAGAAAAGAATTTTAACTGC  645

seq1  AGTGCCCTAGCTGGTGCTGGAGAACTGGTTATTGTGGAAAATCCCAACAT  698
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGTGCCCTAGCTGGTGCTGGAGAACTGGTTATTGTGGAAAATCCCAACAT  695

seq1  GTGGTCAAAGACTGTGAGTAGAGTATTGTTTTTCTCTTTTACGTAAAACA  748
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTGGTCAAAGACTGTGAGTAGAGTATTGTTTTTCTCTTTTACGTAAAACA  745

seq1  AATTATCTCTGTTTTACAAGTTAACAAAGCAAAAACAGGCTGTAGAGCTG  798
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AATTATCTCTGTTTTACAAGTTAACAAAGCAAAAACAGGCTGTAGAGCTG  795

seq1  GTCCATCAGTCAAGGACATTGCTCTCCCAGTGAACCCAGTTCCCAGCACC  848
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTCCATCAGTCAAGGACATTGCTCTCCCAGTGAACCCAGTTCCCAGCACC  845

seq1  CACATGGTAGCTCACAACTGTTTGGAACTCCAGTTCTGAGAATCAACACC  898
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CACATGGTAGCTCACAACTGTTTGGAACTCCAGTTCTGAGAATCAACACC  895

seq1  TCTTCTAGCCTTTAAAGGTACTACACATAGTACAGGCAAGACACCCATGT  948
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCTTCTAGCCTTTAAAGGTACTACACATAGTACAGGCAAGACACCCATGT  945

seq1  AAATAAATAAAAAAAAAATAACAGAAAAGCAAAAACCATGGCTCAAAAAA  998
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAATAAATAAAAAAAAAATAACAGAAAAGCAAAAACCATGGCTCAAAAAA  995

seq1  AAAGCACATGGCCCAAGGTGACAGCGCTTGTTTATGAAGGGACACTGCCT  1048
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAAGCACATGGCCCAAGGTGACAGCGCTTGTTTATGAAGGGACACTGCCT  1045

seq1  GTCTACTTCATTAGATAGTCAAGTCTGACAGCAGAATTC  1087
      |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTCTACTTCATTAGATAGTCAAGTCTGACAGCAGAATTC  1084