BAC Information

Click to search

BAC

Clone NameB6Ng01-075C06
Chromosome15 (Build37)
Map Location 82,144,708 - 82,294,685
singlet/doubletdoublet
Overlap geneWbp2nl, Naga, C920005C14Rik, 1500032L24Rik, Ndufa6, Cyp2d22, LOC545123, Cyp2d10, Cyp2d9
Upstream geneSlc25a17, St13, Xpnpep3, Dnajb7, Rbx1, EG383080, Ep300, L3mbtl2, Rangap1, Zc3h7b, Tef, LOC667073, Tob2, Phf5a, Aco2, Polr3h, Csdc2, Pmm1, EG545121, 1700029P11Rik, D15Wsu75e, Xrcc6, Nhp2l1, 4930407I10Rik, Mei1, Ccdc134, Srebf2, LOC435145, Tnfrsf13c, Cenpm, 1500009C09Rik, Sept3
Downstream geneEG545124, EG667196, EG667177, 9030605E09Rik, BC018285, Cyp2d13, LOC380998, LOC627860, LOC676200, 1300013D18Rik, LOC271300, Cyp2d26, Tcf20, Nfam1, Serhl, 1110014J01Rik, Poldip3, Cyb5r3, A4galt, LOC100042119, Arfgap3, Pacsin2, LOC414359
LinkOpen Mouse BAC browser



BAC End Information

BAC end BAC-end 1BAC-end 2
end nameB6Ng01-075C06.bB6Ng01-075C06.g
ACCDH891782DH891783
length1,1581,117
definitionDH891782|Mus musculus domesticus DNA, BAC clone: B6Ng01-075C06, 5' end.DH891783|Mus musculus domesticus DNA, BAC clone: B6Ng01-075C06, 3' end.
singlet/doubletdoubletdoublet
BLAST hituniqueunique
Map location.(82,144,708 - 82,145,867)(82,293,572 - 82,294,685)
sequence
gaattccaggcatcttttccctctacctcgtcctcacaagtccactctcc
ccgctctaagatgtaaaccttgaagtttcaccaagcaaaacagcacccta
atgttgaagtcaagataacccggaacacttaggtatctgatcacagacct
gttctaggtagtttgtttccctccttgggagtttagtcacagggtggaac
caaatcttatctccatgtcttgcttgtagaagcagtgtgaattcttggtt
agctggataaagaagggacagcgtcagagggttaaatcccctaatgtctt
gcttgacataggatgcattttaaagcataccttgctgtgagtttgcaaaa
agcctcctgccttattctcatctgtgttcaaagttgctatactactctac
ttggtagttacaaagatctgttaaaatgtcatgttgagagctgggcctgg
cagtccgggcctggaaccccagcagccagagaggcagaaggatagcaagc
tcaaggcttgcctacactgtagagtccaagtcagtctaggcagcttagag
agatcctgtctcaaaaactatgaaaggggggccagggacagagctcagtt
gttgtgtgcttgccgcctatgctgatggttgtaggtttaacccccactga
ttaattaaaaattcaggtgacaggcctgagtgcacacacctgaaaaccca
aagtaacttgagaggcggaagcaggaggctcagaagtttaaggtcatctc
tggctatgttgggagttaactgtcagcctgggcaacattagaactgtctt
gaaggaaaagccaaactgcattatattgaacacatctgtttcatacagtg
ttatttacattaaagactagacaaccttaatttccagtgggagatcatat
agatttacagcgtatacatacagaaaaatgcagttgtggggaagtgtaga
gaaggcagcttctgaaaagacaaagcagtaagggtttaaaacaaacccag
gttattaggatagtagtagtttccagatggtgcaggaacagtctgttcag
aattatgtgaagcgctgcagagaaaagtggggtcagcgagcttgctcatt
gctccagcgcctgggggaaggcttaagggctggatgtttgccacagcact
tacaagaa
gaattcctgtgtggcaaagccattgcagtgatgtcttcagagcacttcac
ctcatgaatgacagcattggtgaagggcatgaggacctggtctgccatct
ctggatgccatacctgtcctatcaccttgtcgatttcctatagttctgag
cctggaaagagagcaacacctaagtaaaggagacacagtgtggagcccct
tttccctccactactgctctgttaagggctgaatccaagggaggaaatat
ggccatcttccttactggagtgtgggttaaaccatcacttggaacctgaa
gtatctcaagtaagcttaaggagtgtgcttctaccatcctcttcctttct
tcccagccccatcgaggctcactctgaacatctggattctagatcatgag
aagcagggtccaggtcagagtgactgaactcatcacaatcccagcaccca
acaggtgaaggataagcagatgtagagtggtttactgaagctactctcat
ggttcccctgcctaggacacaggaggacagcagactcactgtacacactg
gagttccccaaaataccttcctgatgatttcaggttgttacacttcggtg
tcacggacttattcacggctcaatgggcaacaattcccatagtctcacct
gctccatctcagccaggaaggcatcagtcaggtcacaatgtgactagtca
gggtcccatgtctttctaagatgttggtcagtcaacatcttgtccactat
ggcgagagatacctttttcccaggcaagactttgtcacccaaccctgaga
tgctcaggacattgggaatatgttgagaacctgtaacagccataggatat
gctaggccacccttgctgcctttatttaacaagttgggtaaataagattt
ctagtaataatatgcattattatttccaatgtgtttttgtgtatacatga
tgtgaggagagctatttgccacaacaaagatgttgaagtctgggataaac
attacagagtcagttctcacattactacatgggatggagaaatgaaactg
aagagcctgcttggcctggcagctctttaacaaatggacatttctcggaa
tcctgggaacacaggtt
quality valuesOpen.Open.




Alignment Information

BAC End 1BAC End 2
seq1: chr15_82144708_82145867
seq2: B6Ng01-075C06.b_45_1202

seq1  GAATTCCAGGCATCTTTTCCCTCTACCTCGTCCTCACAAGTCCACTCTCC  50
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAATTCCAGGCATCTTTTCCCTCTACCTCGTCCTCACAAGTCCACTCTCC  50

seq1  CCGCTCTAAGATGTAAACCTTGAAGTTTCACCAAGCAAAACAGCACCCTA  100
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCGCTCTAAGATGTAAACCTTGAAGTTTCACCAAGCAAAACAGCACCCTA  100

seq1  ATGTTGAAGTCAAGATAACCCGGAACACTTAGGTATCTGATCACAGACCT  150
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATGTTGAAGTCAAGATAACCCGGAACACTTAGGTATCTGATCACAGACCT  150

seq1  GTTCTAGGTAGTTTGTTTCCCTCCTTGGGAGTTTAGTCACAGGGTGGAAC  200
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTTCTAGGTAGTTTGTTTCCCTCCTTGGGAGTTTAGTCACAGGGTGGAAC  200

seq1  CAAATCTTATCTCCATGTCTTGCTTGTAGAAGCAGTGTGAATTCTTGGTT  250
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CAAATCTTATCTCCATGTCTTGCTTGTAGAAGCAGTGTGAATTCTTGGTT  250

seq1  AGCTGGATAAAGAAGGGACAGCGTCAGAGGGTTAAATCCCCTAATGTCTT  300
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGCTGGATAAAGAAGGGACAGCGTCAGAGGGTTAAATCCCCTAATGTCTT  300

seq1  GCTTGACATAGGATGCATTTTAAAGCATACCTTGCTGTGAGTTTGCAAAA  350
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GCTTGACATAGGATGCATTTTAAAGCATACCTTGCTGTGAGTTTGCAAAA  350

seq1  AGCCTCCTGCCTTATTCTCATCTGTGTTCAAAGTTGCTATACTACTCTAC  400
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGCCTCCTGCCTTATTCTCATCTGTGTTCAAAGTTGCTATACTACTCTAC  400

seq1  TTGGTAGTTACAAAGATCTGTTAAAATGTCATGTTGAGAGCTGGGCCTGG  450
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTGGTAGTTACAAAGATCTGTTAAAATGTCATGTTGAGAGCTGGGCCTGG  450

seq1  CAGTCCGGGCCTGGAACCCCAGCAGCCAGAGAGGCAGAAGGATAGCAAGC  500
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CAGTCCGGGCCTGGAACCCCAGCAGCCAGAGAGGCAGAAGGATAGCAAGC  500

seq1  TCAAGGCTTGCCTACACTGTAGAGTCCAAGTCAGTCTAGGCAGCTTAGAG  550
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCAAGGCTTGCCTACACTGTAGAGTCCAAGTCAGTCTAGGCAGCTTAGAG  550

seq1  AGATCCTGTCTCAAAAACTATGAAAGGGGGGCCAGGGACAGAGCTCAGTT  600
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGATCCTGTCTCAAAAACTATGAAAGGGGGGCCAGGGACAGAGCTCAGTT  600

seq1  GTTGTGTGCTTGCCGCCTATGCTGATGGTTGTAGGTTTAACCCCCACTGA  650
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTTGTGTGCTTGCCGCCTATGCTGATGGTTGTAGGTTTAACCCCCACTGA  650

seq1  TTAATTAAAAATTCAGGTGACAGGCCTGAGTGCACACACCTGAAAACCCA  700
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTAATTAAAAATTCAGGTGACAGGCCTGAGTGCACACACCTGAAAACCCA  700

seq1  AAGTAACTTGAGAGGCGGAAGCAGGAGGCTCAGAAGTTTAAGGTCATCTC  750
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAGTAACTTGAGAGGCGGAAGCAGGAGGCTCAGAAGTTTAAGGTCATCTC  750

seq1  TGGCTATGTTGGGAGTTAACTGTCAGCCTGGGCAACATTAGAACTGTCTT  800
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGGCTATGTTGGGAGTTAACTGTCAGCCTGGGCAACATTAGAACTGTCTT  800

seq1  GAAAGGAAAAGCCAAACTGCATTATATTGAACACATCTGTTTCATACAGT  850
      | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  G-AAGGAAAAGCCAAACTGCATTATATTGAACACATCTGTTTCATACAGT  849

seq1  GTTATTTACATTAAAGACTAGGACAACCTTAATTTCCAGTGGGAGATCAT  900
      |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTTATTTACATTAAAGACTA-GACAACCTTAATTTCCAGTGGGAGATCAT  898

seq1  ATAGA-TTACAGCGTATACATACAAGAAATATGCAGTTGT-GGGAAGTGT  948
      ||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||||| |||||||||
seq2  ATAGATTTACAGCGTATACATAC-AGAAAAATGCAGTTGTGGGGAAGTGT  947

seq1  AGAGAAGGCAGCCTCTGAAAAGACAAAGCAGTAAGGGGTTAAAAACAAAA  998
      |||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||   |||
seq2  AGAGAAGGCAGCTTCTGAAAAGACAAAGCAGTAAGGGTTTAAAA--CAAA  995

seq1  CCCAGG-TACTAGGATAGTAGTAGTTTCCAGCATGTGCAGGAACAGTCTG  1047
      |||||| || |||||||||||||||||||||   ||||||||||||||||
seq2  CCCAGGTTATTAGGATAGTAGTAGTTTCCAGATGGTGCAGGAACAGTCTG  1045

seq1  GTCAGAA-TATGTGAAGCGCTGCAAGAGAGAAGTGGGGTCAGCGAGC-TG  1095
       |||||| ||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| ||
seq2  TTCAGAATTATGTGAAGCGCTGC-AGAGAAAAGTGGGGTCAGCGAGCTTG  1094

seq1  CTCCATTGCTCACGCGCCTGTGAG-AGGCCTAAGGGCTTGATGTTGCTCA  1144
      || ||||||||  ||||||| | | |||| |||||||| ||||||   ||
seq2  CT-CATTGCTCCAGCGCCTGGGGGAAGGCTTAAGGGCTGGATGTTTGCCA  1143

seq1  CCAGCACTTACAAGAA  1160
       |||||||||||||||
seq2  -CAGCACTTACAAGAA  1158

seq1: chr15_82293572_82294685
seq2: B6Ng01-075C06.g_68_1184 (reverse)

seq1  AACCTGTGTACCCAGGATCCAGAGAGATGTCCATTGTGTAAGGAGCTTGC  50
      ||||||||| |||||||| | |||| |||||||||   ||| |||| |||
seq2  AACCTGTGTTCCCAGGATTCCGAGAAATGTCCATTTGTTAAAGAGC-TGC  49

seq1  CAGG-CAAGCAGGGCTCTTCAGTTTCATTTCT-CATCCCATGTAGTAATG  98
      |||| |||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||
seq2  CAGGCCAAGCA-GGCTCTTCAGTTTCATTTCTCCATCCCATGTAGTAATG  98

seq1  TGAGAACTGACTCTGT-ATGTTTATCCCAGACCTCAACATCTTTGTTGTG  147
      |||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||
seq2  TGAGAACTGACTCTGTAATGTTTATCCCAGACTTCAACATCTTTGTTGTG  148

seq1  GC-AATAGCTCTCCTCACATCATGTATACACAAATACACATTGG-AATAA  195
      || ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||
seq2  GCAAATAGCTCTCCTCACATCATGTATACACAAAAACACATTGGAAATAA  198

seq1  TAATGCATATTATTACTAGAAATCTTATTTACCCAACTTGTTAAATTAAA  245
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||
seq2  TAATGCATATTATTACTAGAAATCTTATTTACCCAACTTGTTAAA-TAAA  247

seq1  GGCAGC-AGGGTGGCCTAGCATATCCTATGGCTGTTACAGGTTCTCAACA  294
      |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGCAGCAAGGGTGGCCTAGCATATCCTATGGCTGTTACAGGTTCTCAACA  297

seq1  TATTCCCAATTGTCCTGAGCATCTCAGGGTTGGGTGACAAAGTCTTGCCT  344
      ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TATTCCCAA-TGTCCTGAGCATCTCAGGGTTGGGTGACAAAGTCTTGCCT  346

seq1  GGGAAAAAGGTATCTCTCGCCATAGTGGACAAGATGTTGACTGACCAACA  394
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGGAAAAAGGTATCTCTCGCCATAGTGGACAAGATGTTGACTGACCAACA  396

seq1  TCTTAG-AAGACATGGGACCCTGACTAGTCACATTGTGACCTGACTGATG  443
      |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCTTAGAAAGACATGGGACCCTGACTAGTCACATTGTGACCTGACTGATG  446

seq1  CCTTCCTGGCTGAGATGGAGCAGGTGAGACTATGGGAATTGTTGCCCATT  493
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCTTCCTGGCTGAGATGGAGCAGGTGAGACTATGGGAATTGTTGCCCATT  496

seq1  GAGCCGTGAATAAGTCCGTGACACCGAAGTGTAACAACCTGAAATCATCA  543
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAGCCGTGAATAAGTCCGTGACACCGAAGTGTAACAACCTGAAATCATCA  546

seq1  GGAAGGTATTTTGGGGAACTCCAGTGTGTACAGTGAGTCTGCTGTCCTCC  593
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGAAGGTATTTTGGGGAACTCCAGTGTGTACAGTGAGTCTGCTGTCCTCC  596

seq1  TGTGTCCTAGGCAGGGGAACCATGAGAGTAGCTTCAGTAAACCACTCTAC  643
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGTGTCCTAGGCAGGGGAACCATGAGAGTAGCTTCAGTAAACCACTCTAC  646

seq1  ATCTGCTTATCCTTCACCTGTTGGGTGCTGGGATTGTGATGAGTTCAGTC  693
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATCTGCTTATCCTTCACCTGTTGGGTGCTGGGATTGTGATGAGTTCAGTC  696

seq1  ACTCTGACCTGGACCCTGCTTCTCATGATCTAGAATCCAGATGTTCAGAG  743
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACTCTGACCTGGACCCTGCTTCTCATGATCTAGAATCCAGATGTTCAGAG  746

seq1  TGAGCCTCGATGGGGCTGGGAAGAAAGGAAGAGGATGGTAGAAGCACACT  793
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGAGCCTCGATGGGGCTGGGAAGAAAGGAAGAGGATGGTAGAAGCACACT  796

seq1  CCTTAAGCTTACTTGAGATACTTCAGGTTCCAAGTGATGGTTTAACCCAC  843
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCTTAAGCTTACTTGAGATACTTCAGGTTCCAAGTGATGGTTTAACCCAC  846

seq1  ACTCCAGTAAGGAAGATGGCCATATTTCCTCCCTTGGATTCAGCCCTTAA  893
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACTCCAGTAAGGAAGATGGCCATATTTCCTCCCTTGGATTCAGCCCTTAA  896

seq1  CAGAGCAGTAGTGGAGGGAAAAGGGGCTCCACACTGTGTCTCCTTTACTT  943
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CAGAGCAGTAGTGGAGGGAAAAGGGGCTCCACACTGTGTCTCCTTTACTT  946

seq1  AGGTGTTGCTCTCTTTCCAGGCTCAGAACTATAGGAAATCGACAAGGTGA  993
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGGTGTTGCTCTCTTTCCAGGCTCAGAACTATAGGAAATCGACAAGGTGA  996

seq1  TAGGACAGGTATGGCATCCAGAGATGGCAGACCAGGTCCTCATGCCCTTC  1043
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TAGGACAGGTATGGCATCCAGAGATGGCAGACCAGGTCCTCATGCCCTTC  1046

seq1  ACCAATGCTGTCATTCATGAGGTGAAGTGCTCTGAAGACATCACTGCAAT  1093
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACCAATGCTGTCATTCATGAGGTGAAGTGCTCTGAAGACATCACTGCAAT  1096

seq1  GGCTTTGCCACACAGGAATTC  1114
      |||||||||||||||||||||
seq2  GGCTTTGCCACACAGGAATTC  1117