BAC Information

Click to search

BAC

Clone NameB6Ng01-086M10
Chromosome15 (Build37)
Map Location 86,090,590 - 86,223,801
singlet/doubletdoublet
Overlap geneTbc1d22a
Upstream geneFbln1, Atxn10, EG223745, Wnt7b, LOC100042240, Ppara, 2210021J22Rik, Pkdrej, AW124722, Gtse1, Trmu, Celsr1, BC021523, Cerk, LOC100042300
Downstream geneLOC100042309
LinkOpen Mouse BAC browser



BAC End Information

BAC end BAC-end 1BAC-end 2
end nameB6Ng01-086M10.bB6Ng01-086M10.g
ACCDH900083DH900084
length1,1181,132
definitionDH900083|Mus musculus domesticus DNA, BAC clone: B6Ng01-086M10, 5' end.DH900084|Mus musculus domesticus DNA, BAC clone: B6Ng01-086M10, 3' end.
singlet/doubletdoubletdoublet
BLAST hituniqueunique
Map location.(86,090,590 - 86,091,717)(86,222,656 - 86,223,801)
sequence
gaattcacagcctccctgaatgtggagggaggccattgccttccattggg
accacgaagcctctgaggagaagctgaaggagaagtagccctaagacaag
atgcctgaggactgtgccaagtcaacagtgccaggtttttgtgggccagt
ggccagtggtgtaccagggcttgctgtgaacagcacactgaggtgggggc
ctttgtgcctggggagtcagagggcagttccttagtgtctccagaatggc
acggccagccctgtccatggatgagcggaggaagaaaatgagttggttag
agtgggcatggcgggcatggggcccttgagtagggctcaagtcagctggt
ggagggatgctaggaacatgtgaaaattgtcttcttttcaccccagcgtc
atgggtagagtctgcattcctgtacctgagaagcacagtcagctagggcc
tgtcctctgtgaatcatgggtggaatcagcagtctacagtagtcagcacc
aaggccagggcctcgggggcagcctcctggaaggtgcactgctcagcata
tagaccacctatgccagtggcacactgatgtcctccagacttgctgcaga
cttgtgctgagggcttgatgtctcagggaatagcgctttgtaaatgtgac
catgtcatcgagtttcttcttgtggtcacttctctctcctgagctcagct
taatcactgagttcccttgctgccaaaggttagatgcacttggggagctt
ggcaggaggccctccttaacctgatggcaaagctgtcagtgctcagggag
gggatggtactaggacggcatagcagtggagcactcctgtcccaggtaag
atggtgcctcctgcagatgtgccatgtggaatctttaactatgtttagga
agagccaagcagctaggggcttagttttatttattaattaacccagtaaa
taaaatattgtcataacatactttcatgtgcgattagtttaagaaccgtt
ccagctgactgtggtgcctagtgtgtgtttcacacatagggagcatctta
tgtgggcatgttgtagtgtctgcagacactgcatggaagcaagattgcag
tagtgggtcaagcatctc
gaattctgtagctgccaagtcctagatagaaagcctacaaatcaagaaca
tgctctgccgtgaaaacacatccaaccacacagctcacagagcatcacca
cacaggcttccatgatggcaccagagaactcaggaggcagagcagacaga
aggcagttttagctacttgtcccacggcttcaacaaaacaccggcgaagc
agcttgagggaggatgggtatgcttggcttgcagatcgagggtacaggcc
atcatgttgggaaagtctcagaagtggtatctgcagtcaggaagcagcga
gcaatggaggctagagttcagacccccttctccttctcactcagtctgtc
agttgggaggagccttcccacctcaacctaacctacacaagccctcatag
acttgtccagaggctggcctaacgtaaatattctctcacaggtaggccca
gaggttaacccttaggtaactctagattctatcaagttgacagcattaac
tatcataataggtattaggagaaaaaaaaaaccaaagccaaacaaaatat
atccacagccccaacattcccagggcgggcacacagatgcaccaccagcg
cttagaatgaagggtgatgctatattcctgggagttccaaactcaggcac
aagggcccaacagcatcctggcctgtggggaaaatgcagcaccccaacga
tgtcctgcaatttctaaaccaaagatcccctaaaggtttagtctgtgcaa
gggtcctgcctgcaccaacctctgcatgcccacttgcaaagctctaacac
tgagtactatgtaaagcctgggcacatgccaccttatgctcacacataga
cacctagagccccatcttctagacctactcccaacaccaatgcagtgccc
cctttgcaaagccctggcacagagcccatccagagctctcacacaggagg
aattgattttttttatttttgtttgtttgtttatttcgagacaggtttct
ttgtgtagttctggctgtcttgcactcactctgtagaccagctgcctcaa
actcagaaatctgctgcctctgcctcccaggtgctgggataaaggcggtg
gccacgagccagctagagtttatctttactgt
quality valuesOpen.Open.




Alignment Information

BAC End 1BAC End 2
seq1: chr15_86090590_86091717
seq2: B6Ng01-086M10.b_44_1161

seq1  GAATTCACAGCCTCCCTGAATGTGGAGGGAGGCCATTGCCTTCCATTGGG  50
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAATTCACAGCCTCCCTGAATGTGGAGGGAGGCCATTGCCTTCCATTGGG  50

seq1  ACCACGAAGCCTCTGAGGAGAAGCTGAAGGAGAAGTAGCCCTAAGACAAG  100
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACCACGAAGCCTCTGAGGAGAAGCTGAAGGAGAAGTAGCCCTAAGACAAG  100

seq1  ATGCCTGAGGACTGTGCCAAGTCAACAGTGCCAGGTTTTTGTGGGCCAGT  150
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATGCCTGAGGACTGTGCCAAGTCAACAGTGCCAGGTTTTTGTGGGCCAGT  150

seq1  GGCCAGTGGTGTACCAGGGCTTGCTGTGAACAGCACACTGAGGTGGGGGC  200
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGCCAGTGGTGTACCAGGGCTTGCTGTGAACAGCACACTGAGGTGGGGGC  200

seq1  CTTTGTGCCTGGGGAGTCAGAGGGCAGTTCCTTAGTGTCTCCAGAATGGC  250
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTTTGTGCCTGGGGAGTCAGAGGGCAGTTCCTTAGTGTCTCCAGAATGGC  250

seq1  ACGGCCAGCCCTGTCCATGGATGAGCGGAGGAAGAAAATGAGTTGGTTAG  300
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACGGCCAGCCCTGTCCATGGATGAGCGGAGGAAGAAAATGAGTTGGTTAG  300

seq1  AGTGGGCATGGCGGGCATGGGGCCCTTGAGTAGGGCTCAAGTCAGCTGGT  350
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGTGGGCATGGCGGGCATGGGGCCCTTGAGTAGGGCTCAAGTCAGCTGGT  350

seq1  GGAGGGATGCTAGGAACATGTGAAAATTGTCTTCTTTTCACCCCAGCGTC  400
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGAGGGATGCTAGGAACATGTGAAAATTGTCTTCTTTTCACCCCAGCGTC  400

seq1  ATGGGTAGAGTCTGCATTCCTGTACCTGAGAAGCACAGTCAGCTAGGGCC  450
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATGGGTAGAGTCTGCATTCCTGTACCTGAGAAGCACAGTCAGCTAGGGCC  450

seq1  TGTCCTCTGTGAATCATGGGTGGAATCAGCAGTCTACAGTAGTCAGCACC  500
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGTCCTCTGTGAATCATGGGTGGAATCAGCAGTCTACAGTAGTCAGCACC  500

seq1  AAGGCCAGGGCCTCGGGGGCAGCCTCCTGGAAGGTGCACTGCTCAGCATA  550
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAGGCCAGGGCCTCGGGGGCAGCCTCCTGGAAGGTGCACTGCTCAGCATA  550

seq1  TAGACCACCTATGCCAGTGGCACACTGATGTCCTCCAGACTTGCTGCAGA  600
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TAGACCACCTATGCCAGTGGCACACTGATGTCCTCCAGACTTGCTGCAGA  600

seq1  CTTGTGCTGAGGGCTTGATGTCTCAGGGAATAGCGCTTTGTAAATGTGAC  650
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTTGTGCTGAGGGCTTGATGTCTCAGGGAATAGCGCTTTGTAAATGTGAC  650

seq1  CATGTCATCGAGTTTCTTCTTGTGGTCACTTCTCTCTCCTGAGCTCAGCT  700
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CATGTCATCGAGTTTCTTCTTGTGGTCACTTCTCTCTCCTGAGCTCAGCT  700

seq1  TAATCACTGAGTTCCCTTGCTGCCAAAGGTTAGATGCACTTGGGGAGCTT  750
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TAATCACTGAGTTCCCTTGCTGCCAAAGGTTAGATGCACTTGGGGAGCTT  750

seq1  GGCAGGAGGCCCTCCTTAACCTGATGGCAAAGCTGTCAGTGCTCAGGGAG  800
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGCAGGAGGCCCTCCTTAACCTGATGGCAAAGCTGTCAGTGCTCAGGGAG  800

seq1  GGGATGGTACTAGGACGGCATAGCAGTGGAGCACTCCTGTCCCAGGTAAG  850
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGGATGGTACTAGGACGGCATAGCAGTGGAGCACTCCTGTCCCAGGTAAG  850

seq1  ATGGTGCCTCCTGCAGATGTGCCATGTGGAATCTTTAACTATGTTTAGGA  900
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATGGTGCCTCCTGCAGATGTGCCATGTGGAATCTTTAACTATGTTTAGGA  900

seq1  AGAGCCAAGCAGCTAGGGGCTTAGTTTTTATTTTATTAATTAACCCAGTA  950
      ||||||||||||||||||||||||||||   |||||||||||||||||||
seq2  AGAGCCAAGCAGCTAGGGGCTTAGTTTT--ATTTATTAATTAACCCAGTA  948

seq1  AATAAAAATATTGTCATAACATACTTTCATGTGCGATTAGTTTAAGAACC  1000
      ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAT-AAAATATTGTCATAACATACTTTCATGTGCGATTAGTTTAAGAACC  997

seq1  GTTCCAGCTGACTGTGGTGCCTAGTGTGTGTTTCACACATAGGGAGCATC  1050
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTTCCAGCTGACTGTGGTGCCTAGTGTGTGTTTCACACATAGGGAGCATC  1047

seq1  TTATGTGGGCATGTTGTAGGTGTCTGCAGACACTGCATTGGAAAGCACAG  1100
      |||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||    || 
seq2  TTATGTGGGCATGTTGTA-GTGTCTGCAGACACTGCA-TGGAA---GCAA  1092

seq1  GATTGCAGTTAGGTGGGTCAAGCATCTC  1128
      |||||||||   ||||||||||||||||
seq2  GATTGCAGT--AGTGGGTCAAGCATCTC  1118

seq1: chr15_86222656_86223801
seq2: B6Ng01-086M10.g_67_1198 (reverse)

seq1  ACAGTAAAAGATGAACTCCTAGCTGGGCTTCGTGGCACACGCCTTTAATC  50
      ||||| |||||| |||| ||||||||   |||||||   ||||||| |||
seq2  ACAGT-AAAGATAAACT-CTAGCTGG--CTCGTGGCCACCGCCTTT-ATC  45

seq1  CCAGCACTTGGGAGGCAGAGGCAGGCAGATTTCTGAGTTTGAGGCCAGCC  100
      ||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||| |
seq2  CCAGCACCTGGGAGGCAGAGGCA-GCAGATTTCTGAGTTTGAGG-CAG-C  92

seq1  TGGTCTACAGAGTGAGTGCCAGGACAGCCAGAACTACACAAAGAAACCCT  150
      |||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||| |||
seq2  TGGTCTACAGAGTGAGTG-CAAGACAGCCAGAACTACACAAAGAAA-CCT  140

seq1  GTCTCGAAATAAACAAACAAACAAAAAATAAAAAAAAATCAATTCCTCCC  200
      |||||||||||||||||||||||||||   ||||||||||||||||| ||
seq2  GTCTCGAAATAAACAAACAAACAAAAA--TAAAAAAAATCAATTCCT-CC  187

seq1  TGTTGTGAGAGCTCTGGATGGGCTCTGTGCCAGGGCTTTGCAAAGGGGGC  250
      || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TG-TGTGAGAGCTCTGGATGGGCTCTGTGCCAGGGCTTTGCAAAGGGGGC  236

seq1  ACTGCATTGGTGTTGGGAGTAGGTCTAGAAGATGGGGCTCTAGGTGTCTA  300
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACTGCATTGGTGTTGGGAGTAGGTCTAGAAGATGGGGCTCTAGGTGTCTA  286

seq1  TGTGTGAGCATAAGGTGGCATGTGCCCAGGCTTTACATAGTACTCAGTGT  350
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGTGTGAGCATAAGGTGGCATGTGCCCAGGCTTTACATAGTACTCAGTGT  336

seq1  TAGAGCTTTGCAAGTGGGCATGCAGAGGTTGGTGCAGGCAGGACCCTTGC  400
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TAGAGCTTTGCAAGTGGGCATGCAGAGGTTGGTGCAGGCAGGACCCTTGC  386

seq1  ACAGACTAAACCTTTAGGGGATCTTTGGTTTAGAAATTGCAGGACATCGT  450
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACAGACTAAACCTTTAGGGGATCTTTGGTTTAGAAATTGCAGGACATCGT  436

seq1  TGGGGTGCTGCATTTTCCCCACAGGCCAGGATGCTGTTGGGCCCTTGTGC  500
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGGGGTGCTGCATTTTCCCCACAGGCCAGGATGCTGTTGGGCCCTTGTGC  486

seq1  CTGAGTTTGGAACTCCCAGGAATATAGCATCACCCTTCATTCTAAGCGCT  550
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTGAGTTTGGAACTCCCAGGAATATAGCATCACCCTTCATTCTAAGCGCT  536

seq1  GGTGGTGCATCTGTGTGCCCGCCCTGGGAATGTTGGGGCTGTGGATATAT  600
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGTGGTGCATCTGTGTGCCCGCCCTGGGAATGTTGGGGCTGTGGATATAT  586

seq1  TTTGTTTGGCTTTGGTTTTTTTTTTCTCCTAATACCTATTATGATAGTTA  650
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTTGTTTGGCTTTGGTTTTTTTTTTCTCCTAATACCTATTATGATAGTTA  636

seq1  ATGCTGTCAACTTGATAGAATCTAGAGTTACCTAAGGGTTAACCTCTGGG  700
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATGCTGTCAACTTGATAGAATCTAGAGTTACCTAAGGGTTAACCTCTGGG  686

seq1  CCTACCTGTGAGAGAATATTTACGTTAGGCCAGCCTCTGGACAAGTCTAT  750
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCTACCTGTGAGAGAATATTTACGTTAGGCCAGCCTCTGGACAAGTCTAT  736

seq1  GAGGGCTTGTGTAGGTTAGGTTGAGGTGGGAAGGCTCCTCCCAACTGACA  800
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAGGGCTTGTGTAGGTTAGGTTGAGGTGGGAAGGCTCCTCCCAACTGACA  786

seq1  GACTGAGTGAGAAGGAGAAGGGGGTCTGAACTCTAGCCTCCATTGCTCGC  850
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GACTGAGTGAGAAGGAGAAGGGGGTCTGAACTCTAGCCTCCATTGCTCGC  836

seq1  TGCTTCCTGACTGCAGATACCACTTCTGAGACTTTCCCAACATGATGGCC  900
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGCTTCCTGACTGCAGATACCACTTCTGAGACTTTCCCAACATGATGGCC  886

seq1  TGTACCCTCGATCTGCAAGCCAAGCATACCCATCCTCCCTCAAGCTGCTT  950
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGTACCCTCGATCTGCAAGCCAAGCATACCCATCCTCCCTCAAGCTGCTT  936

seq1  CGCCGGTGTTTTGTTGAAGCCGTGGGACAAGTAGCTAAAACTGCCTTCTG  1000
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CGCCGGTGTTTTGTTGAAGCCGTGGGACAAGTAGCTAAAACTGCCTTCTG  986

seq1  TCTGCTCTGCCTCCTGAGTTCTCTGGTGCCATCATGGAAGCCTGTGTGGT  1050
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCTGCTCTGCCTCCTGAGTTCTCTGGTGCCATCATGGAAGCCTGTGTGGT  1036

seq1  GATGCTCTGTGAGCTGTGTGGTTGGATGTGTTTTCACGGCAGAGCATGTT  1100
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GATGCTCTGTGAGCTGTGTGGTTGGATGTGTTTTCACGGCAGAGCATGTT  1086

seq1  CTTGATTTGTAGGCTTTCTATCTAGGACTTGGCAGCTACAGAATTC  1146
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTTGATTTGTAGGCTTTCTATCTAGGACTTGGCAGCTACAGAATTC  1132