BAC Information

Click to search

BAC

Clone NameB6Ng01-087K12
Chromosome15 (Build37)
Map Location 87,934,642 - 88,077,413
singlet/doubletdoublet
Overlap genenone
Upstream geneAW049604, LOC100042329, LOC100042340
Downstream geneZdhhc25, Brd1, Zbed4, Alg12, Creld2, Pim3, 1700019P01Rik, Mlc1, LOC667558, Mov10l1, Panx2, Trabd, 1300018J18Rik, Hdac10, Mapk12, Mapk11, Plxnb2, LOC100043185, 1700027J05Rik, Saps2
LinkOpen Mouse BAC browser



BAC End Information

BAC end BAC-end 1BAC-end 2
end nameB6Ng01-087K12.bB6Ng01-087K12.g
ACCDH900722DH900723
length1,2011,140
definitionDH900722|Mus musculus domesticus DNA, BAC clone: B6Ng01-087K12, 5' end.DH900723|Mus musculus domesticus DNA, BAC clone: B6Ng01-087K12, 3' end.
singlet/doubletdoubletdoublet
BLAST hituniqueunique
Map location.(88,076,212 - 88,077,413)(87,934,642 - 87,935,773)
sequence
gaattccaccccaaatctatctctctaccttcctctgtcaggttaatttg
gcagtttagataggagtgtacttatgaatgggtatgtctaaatagacagg
tatatgtgttggtatgtatggataaatacagaggtatgtttgtatatgtg
ttggggcacatgtgaatgcatgcctgtgtgtgtatacacatagatgcatg
ctgtgaggaatacacaggaatgcatgtttacatgtatacagacacgggta
catgcatgtatacacatgtgggtacatgcttctgtgcactcccacatgtg
ggtacgtacttgtgtatgcacaaatacggtgcatgtttctctttttaata
tcacatgtgggtgtgcagttatgcatgtggacacatgcgagtgtatgatt
atgtgtacagactcgcaggtgactacctgtgtgtgttcccacaggtggta
catggttggctctgtgcccacatgtgagtacatgtgtgggttcatataca
ctctctttggcggcagacatccccactgaaaccccgtaacaacctcttct
tgccaaaaccatgtctcctccttcccttctccctcctccttgcttcctag
gaccgagctcaggtcacagtggaaggctaaaccactggtttctttctgtt
cccactcgcctctcttgccttgctggtggggcactgttcctgacatgtaa
ttcatgctcatggcctctgctcccctgtccccgcccctgcccctgtccat
cccattgcgctgctcatcgctttgtgcctcccaatgagactgtgacatct
tgcttgtttgctctgagacttacttctcccagcctagtaattaatttgct
tgtttcgcctggcctgactccttcctaattgtctgcaagagtgacatccc
ctggggacaccacgcctccagagcctcttcactgtgggtcaggactcacc
ttcctcattccctttcgcgtcaagacaacctccaccagcgagcgttcctc
tccctcctagagagctagccacttgcagcccttgctggacagagcccctc
ccacccatctgggtctgagaaagaagcatgttcaatcttgcaagaagtca
tcttcaatctccctgcatttccttcccgaaatagaagctctcgggtgtga
aggaactcactaattcagccaatcggttccaaacctgcctcgcctgtggg
g
gaattctctttctcagcacacttgaccccaataagcattctgactgtgct
tctgtcaaaggtctgctcgtctctctccgcccctctttactggagtttat
gctagggtttctgcttgtcttgctctggctgcccaagtgttaggctgggc
tgtctgctggaataggcaagaaaggaggggacacaggttcttgccacgga
gagctgtactgtggtcctcagagtggcagagggaggtttgatggccaggc
cagtggcctctcaggtctatgaggaagctgcctagctgtgagggattgct
gggaagttcctgatgtctctgatcattatttctgggactcttctcgtgtt
tgttagggatcagtcatagctcattttaaaattctgtaagaaatcccaca
tttagcaaatggcacttggccttcctacactatggactggggattgcata
taaaagttagctaccattcttgtccccagaaccatcctggctgtatccag
gagccatctgtacagggcctccacccccagagcatcacaggaccagtcta
ccaccaggtaaagtggtgagccacaggggagggtcctggggtacacagcc
ctggagaccagcctctctataacaacttcccacctgaactttcctcccca
aagaccctttgcttctgaatcccttgaatcccatgaatgtagaggaatgt
gaggcctctcaggatgcggtgtgaaccttcctggtccatggtcactacca
gtgttcttgacatggggatgtttactgctaacacagaggtgtccctacat
ggtattggagctgctgtgagctttccctagcagagaccctggctcctgct
agccatctgaatgtagagtgaccacatgaggaaggaaagtgtgttggctt
tcctagctcagccgtgtgtttcttccaggaaagggaccaacagaatccac
agttcatttgctgcagcaaaagagcagtaaatgtgagcaaggaatgaaca
aatgatgagtagatgaccgatgattggatgaccgagtgagtggatgactg
atgaccgagtgagtgataaccgatgtatggaatgaccgattgaatgatga
ccgatggaatgatgactgaactgtgaaaccaatgtgagtg
quality valuesOpen.Open.




Alignment Information

BAC End 1BAC End 2
seq1: chr15_88076212_88077413
seq2: B6Ng01-087K12.b_45_1245 (reverse)

seq1  CCCCACAGGCAGAGCCAGGCTCGGAACCGGACTGGGCTGGAATTAGTGA-  49
      |||||||||| ||| |||| | |||||||   | |||| |||||||||| 
seq2  CCCCACAGGC-GAGGCAGGTTTGGAACCG--ATTGGCT-GAATTAGTGAG  46

seq1  -TCCTGTCACACCCGAGAGC-TCTATTTCTGGAAGGAAATGCA-GGAGAT  96
       |||| |||||||||||||| |||||||| ||||||||||||| ||||||
seq2  TTCCT-TCACACCCGAGAGCTTCTATTTCGGGAAGGAAATGCAGGGAGAT  95

seq1  TGAGAGTGACTCTTTGC-AGATTGAACACTGCTCTTTCCTCAGAACCCAG  145
      |||   |||||  |||| |||||||||| ||||  || ||||| ||||||
seq2  TGAAGATGACTTCTTGCAAGATTGAACA-TGCTTCTTTCTCAG-ACCCAG  143

seq1  ATGGGTGGGAGGGGCTCTGTCCAGCAGGGGCTGCAGGTGGCTAGCTCTCT  195
      |||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||
seq2  ATGGGTGGGAGGGGCTCTGTCCAGCAAGGGCTGCAAGTGGCTAGCTCTCT  193

seq1  AGGAGGGAG-GGGACGCTCGCTGGTGGGGGTTGTCTGGACGCG-AAGGGA  243
      ||||||||| || |||||||||||||| |||||||| |||||| ||||||
seq2  AGGAGGGAGAGGAACGCTCGCTGGTGGAGGTTGTCTTGACGCGAAAGGGA  243

seq1  ATGAGGAAGGTGAGTCCTGACCCACAGTGAAGAGGCCTCTGGAGGCGTGG  293
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||
seq2  ATGAGGAAGGTGAGTCCTGACCCACAGTGAAGAGG-CTCTGGAGGCGTGG  292

seq1  TGGTCCCCAGGGGATGTCACTCTTGCAGACAATTAGGAAGGAGTCAGGCC  343
      | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  T-GTCCCCAGGGGATGTCACTCTTGCAGACAATTAGGAAGGAGTCAGGCC  341

seq1  AGGCGAAACAAGC-AATTAATTACTAGGCTGGGAGAAGTAAGTCTCAGAG  392
      ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGGCGAAACAAGCAAATTAATTACTAGGCTGGGAGAAGTAAGTCTCAGAG  391

seq1  CAAACAAGCAAGATGTCACAGTCTCATTGGGAGGCACAAAGCGATGAGCA  442
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CAAACAAGCAAGATGTCACAGTCTCATTGGGAGGCACAAAGCGATGAGCA  441

seq1  GCGCAATGGGATGGACAGGGGCAGGGGCGGGGACAGGGGAGCAGAGGCCA  492
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GCGCAATGGGATGGACAGGGGCAGGGGCGGGGACAGGGGAGCAGAGGCCA  491

seq1  TGAGCATGAATTACATGTCAGGAACAGTGCCCCACCAGCAAGGCAAGAGA  542
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGAGCATGAATTACATGTCAGGAACAGTGCCCCACCAGCAAGGCAAGAGA  541

seq1  GGCGAGTGGGAACAGAAAGAAACCAGTGGTTTAGCCTTCCACTGTGACCT  592
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGCGAGTGGGAACAGAAAGAAACCAGTGGTTTAGCCTTCCACTGTGACCT  591

seq1  GAGCTCGGTCCTAGGAAGCAAGGAGGAGGGAGAAGGGAAGGAGGAGACAT  642
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAGCTCGGTCCTAGGAAGCAAGGAGGAGGGAGAAGGGAAGGAGGAGACAT  641

seq1  GGTTTTGGCAAGAAGAGGTTGTTACGGGGTTTCAGTGGGGATGTCTGCCG  692
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGTTTTGGCAAGAAGAGGTTGTTACGGGGTTTCAGTGGGGATGTCTGCCG  691

seq1  CCAAAGAGAGTGTATATGAACCCACACATGTACTCACATGTGGGCACAGA  742
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCAAAGAGAGTGTATATGAACCCACACATGTACTCACATGTGGGCACAGA  741

seq1  GCCAACCATGTACCACCTGTGGGAACACACACAGGTAGTCACCTGCGAGT  792
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GCCAACCATGTACCACCTGTGGGAACACACACAGGTAGTCACCTGCGAGT  791

seq1  CTGTACACATAATCATACACTCGCATGTGTCCACATGCATAACTGCACAC  842
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTGTACACATAATCATACACTCGCATGTGTCCACATGCATAACTGCACAC  841

seq1  CCACATGTGATATTAAAAAGAGAAACATGCACCGTATTTGTGCATACACA  892
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCACATGTGATATTAAAAAGAGAAACATGCACCGTATTTGTGCATACACA  891

seq1  AGTACGTACCCACATGTGGGAGTGCACAGAAGCATGTACCCACATGTGTA  942
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGTACGTACCCACATGTGGGAGTGCACAGAAGCATGTACCCACATGTGTA  941

seq1  TACATGCATGTACCCGTGTCTGTATACATGTAAACATGCATTCCTGTGTA  992
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TACATGCATGTACCCGTGTCTGTATACATGTAAACATGCATTCCTGTGTA  991

seq1  TTCCTCACAGCATGCATCTATGTGTATACACACACAGGCATGCATTCACA  1042
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTCCTCACAGCATGCATCTATGTGTATACACACACAGGCATGCATTCACA  1041

seq1  TGTGCCCCAACACATATACAAACATACCTCTGTATTTATCCATACATACC  1092
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGTGCCCCAACACATATACAAACATACCTCTGTATTTATCCATACATACC  1091

seq1  AACACATATACCTGTCTATTTAGACATACCCATTCATAAGTACACTCCTA  1142
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AACACATATACCTGTCTATTTAGACATACCCATTCATAAGTACACTCCTA  1141

seq1  TCTAAACTGCCAAATTAACCTGACAGAGGAAGGTAGAGAGATAGATTTGG  1192
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCTAAACTGCCAAATTAACCTGACAGAGGAAGGTAGAGAGATAGATTTGG  1191

seq1  GGTGGAATTC  1202
      ||||||||||
seq2  GGTGGAATTC  1201

seq1: chr15_87934642_87935773
seq2: B6Ng01-087K12.g_68_1207

seq1  GAATTCTCTTTCTCAGCACACTTGACCCCAATAAGCATTCTGACTGTGCT  50
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAATTCTCTTTCTCAGCACACTTGACCCCAATAAGCATTCTGACTGTGCT  50

seq1  TCTGTCAAAGGTCTGCTCGTCTCTCTCCGCCCCTCTTTACTGGAGTTTAT  100
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCTGTCAAAGGTCTGCTCGTCTCTCTCCGCCCCTCTTTACTGGAGTTTAT  100

seq1  GCTAGGGTTTCTGCTTGTCTTGCTCTGGCTGCCCAAGTGTTAGGCTGGGC  150
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GCTAGGGTTTCTGCTTGTCTTGCTCTGGCTGCCCAAGTGTTAGGCTGGGC  150

seq1  TGTCTGCTGGAATAGGCAAGAAAGGAGGGGACACAGGTTCTTGCCACGGA  200
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGTCTGCTGGAATAGGCAAGAAAGGAGGGGACACAGGTTCTTGCCACGGA  200

seq1  GAGCTGTACTGTGGTCCTCAGAGTGGCAGAGGGAGGTTTGATGGCCAGGC  250
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAGCTGTACTGTGGTCCTCAGAGTGGCAGAGGGAGGTTTGATGGCCAGGC  250

seq1  CAGTGGCCTCTCAGGTCTATGAGGAAGCTGCCTAGCTGTGAGGGATTGCT  300
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CAGTGGCCTCTCAGGTCTATGAGGAAGCTGCCTAGCTGTGAGGGATTGCT  300

seq1  GGGAAGTTCCTGATGTCTCTGATCATTATTTCTGGGACTCTTCTCGTGTT  350
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGGAAGTTCCTGATGTCTCTGATCATTATTTCTGGGACTCTTCTCGTGTT  350

seq1  TGTTAGGGATCAGTCATAGCTCATTTTAAAATTCTGTAAGAAATCCCACA  400
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGTTAGGGATCAGTCATAGCTCATTTTAAAATTCTGTAAGAAATCCCACA  400

seq1  TTTAGCAAATGGCACTTGGCCTTCCTACACTATGGACTGGGGATTGCATA  450
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTTAGCAAATGGCACTTGGCCTTCCTACACTATGGACTGGGGATTGCATA  450

seq1  TAAAAGTTAGCTACCATTCTTGTCCCCAGAACCATCCTGGCTGTATCCAG  500
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TAAAAGTTAGCTACCATTCTTGTCCCCAGAACCATCCTGGCTGTATCCAG  500

seq1  GAGCCATCTGTACAGGGCCTCCACCCCCAGAGCATCACAGGACCAGTCTA  550
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAGCCATCTGTACAGGGCCTCCACCCCCAGAGCATCACAGGACCAGTCTA  550

seq1  CCACCAGGTAAAGTGGTGAGCCACAGGGGAGGGTCCTGGGGTACACAGCC  600
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCACCAGGTAAAGTGGTGAGCCACAGGGGAGGGTCCTGGGGTACACAGCC  600

seq1  CTGGAGACCAGCCTCTCTATAACAACTTCCCACCTGAACTTTCCTCCCCA  650
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTGGAGACCAGCCTCTCTATAACAACTTCCCACCTGAACTTTCCTCCCCA  650

seq1  AAGACCCTTTGCTTCTGAATCCCTTGAATCCCATGAATGTAGAGGAATGT  700
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAGACCCTTTGCTTCTGAATCCCTTGAATCCCATGAATGTAGAGGAATGT  700

seq1  GAGGCCTCTCAGGATGCGGTGTGAACCTTCCTGGTCCATGGTCACTACCA  750
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAGGCCTCTCAGGATGCGGTGTGAACCTTCCTGGTCCATGGTCACTACCA  750

seq1  GTGTTCTTGACATGGGGATGTTTACTGCTAACACAGAGGTGTCCCTACAT  800
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTGTTCTTGACATGGGGATGTTTACTGCTAACACAGAGGTGTCCCTACAT  800

seq1  GGTATTGGAGCTGCTGTGAGCTTTCCCTAGCAGAGACCCTGGCTCCTGCT  850
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGTATTGGAGCTGCTGTGAGCTTTCCCTAGCAGAGACCCTGGCTCCTGCT  850

seq1  AGCCATCTGAATGTAGAGTGACCACATGAGGAAGGAAGGTGTGTTGGCTT  900
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||
seq2  AGCCATCTGAATGTAGAGTGACCACATGAGGAAGGAAAGTGTGTTGGCTT  900

seq1  T-CTAGCTCAGCCGTGTGTTCCTCCAGGGAAAGGGACCAACAGAA-CCAC  948
      | |||||||||||||||||| || |  |||||||||||||||||| ||||
seq2  TCCTAGCTCAGCCGTGTGTTTCTTCCAGGAAAGGGACCAACAGAATCCAC  950

seq1  AGTTCATTTGCTGCAGCAAAAGAGCAGGTAAATGTTGAGCAAGGGAATGA  998
      |||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||| |||||||
seq2  AGTTCATTTGCTGCAGCAAAAGAGCA-GTAAATG-TGAGCAA-GGAATGA  997

seq1  ACAAATGAATGAGTAGATGACCGAGTGAGTGGATGACCGAGTGAGTGGAT  1048
      ||||||| |||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||
seq2  ACAAATG-ATGAGTAGATGACCGA-TGATTGGATGACCGAGTGAGTGGAT  1045

seq1  GACTGATGACCGAGTGAGTGGATAACCGATTGAATGG-ATGACCGATTGA  1097
      ||||||||||||||||||| ||||||||| || |||| ||||||||||||
seq2  GACTGATGACCGAGTGAGT-GATAACCGA-TGTATGGAATGACCGATTGA  1093

seq1  ATGGATGACCGAGTGAATAGATGACTGA--------------GTGAGTG  1132
      || |||||||||  |||| |||||||||              |||||||
seq2  AT-GATGACCGATGGAAT-GATGACTGAACTGTGAAACCAATGTGAGTG  1140