BAC Information

Click to search

BAC

Clone NameB6Ng01-089O17
Chromosome15 (Build37)
Map Location 70,864,547 - 71,013,144
singlet/doubletdoublet
Overlap genenone
Upstream geneLOC383050
Downstream geneLOC383051, 1700010C24Rik, LOC100040847, Col22a1
LinkOpen Mouse BAC browser



BAC End Information

BAC end BAC-end 1BAC-end 2
end nameB6Ng01-089O17.bB6Ng01-089O17.g
ACCDH902367DH902368
length1,0911,026
definitionDH902367|Mus musculus domesticus DNA, BAC clone: B6Ng01-089O17, 5' end.DH902368|Mus musculus domesticus DNA, BAC clone: B6Ng01-089O17, 3' end.
singlet/doubletdoubletdoublet
BLAST hituniqueunique
Map location.(71,012,044 - 71,013,144)(70,864,547 - 70,865,574)
sequence
gaattcaattagacacaaatcaatagaaattaattccaagtgattagcct
tagcattcatcaatagaattaaatttcaaagggccagaagactgattcaa
cctgagtggtttttaagtctttaaaattttccttattttattaagatgtc
atattattgggacacgtttttgagggcaagtgtgaatcctaaggggcccc
ttgtgctgttggagctgaagagtgattatgaaaagatgacttcaatttct
gttttagggaagttaactttcaagcatatagaaaaagtaggttgaagtaa
aatttatattttaatgtgaatataacactgtgtcaatgctgggtgacttt
actattgaactcatatttgttagggtgcagatgtctatctgaaagcatat
tgacatatgtatgtactttctgttataaaaccactgatctgctctatagg
acctgtttggtaccatcttccttcttggcactgctttgctgcctagctat
ttattcttactaatagcaaaactgggttcttctttccacaacacaatcat
gatatttcattttataggtaatttacagatggcaggctggtatttgtata
atatttttattatatttattatgatgtaggtgattttacctattctactc
ccagttagaaaaaataaaacataaagtagtcgatagtcaaggttctctag
agaaacaaaccaaccgtatgtatagaattagcaagactgatgagctatta
gttataggagatagttaagtgccatttttctgtcttccgtagagtctttg
atgatttgaacgagaatgggcttcataggctcatacgtttgcatgttttg
tccaaagttgatgagctgtttgggaaggattagactgtaaggccttggtg
gaggagatgtgccactaaagtaggctttgacacttcaaaatcccatgcca
accatcctgtccttctcctgctcctttctctgcctgctgccagctgcctg
tagatagatgtaaaactaccacccactatgtaccaatatgtgtctgtctg
cttcctccatgagtaatggataagcctctaaagtgtgagca
gaattccagatctaacgcttatcgctgtgctttagatgcgctcttgcctt
caatgtccttttctaaatgaagtgatctgaactagactggagagcttttg
tgttaagataaggagttgaattttgtccttctagttgattgagaggcatc
gcagaggagcacaatgagcaagctggcattgtagaaggtcactttcagac
tataatggacaaaggcatgggagggatccagctggtgggagaatgatgat
actagctaaagtctgatgataattgagacactgtgagaacataaaaaaaa
taatggggttgggtagggtaatatatacttgcaatcctagctacttggga
ggtcaagacagtggcattgtaagtttgaggctagattgagctatgtaaca
aaatctagtttcaaaaaatggatgcctgtatacattcattcatatatgat
atatgaatacacacacacacacacacacacacacacacacacacaatgtg
gtaatgaagatttgtttccctatttaaatgggccctaatagggatttcat
ttgatcagagaggtttataattccaaagcacttggagtttccatttatga
aaattcaccaagattgtgtatgatactctatgagaactctcagccttagt
agttctgtaatatttcttcattctgatattactcaaacaatgtggatata
actttgtttctgaaaggaaatagaatctcaagatcattaaaaaaaaaaaa
acaaaaaaacagtagaggaagagaagagtttgggtttttgtgactcttca
tagccattcacctttgacagactttctaggttctttatccatcgacattg
tgaaagcctaccaaatatgatagctagtagtaagtgtcaacttgacacaa
ttttagaatcacatatgagacagacctctgaggagtttgtagatcagata
tttgatgaatgagatttacccttacatgcaggtcacataaaattccttag
ctgtgtcctattttggaataaagtgg
quality valuesOpen.Open.




Alignment Information

BAC End 1BAC End 2
seq1: chr15_71012044_71013144
seq2: B6Ng01-089O17.b_48_1138 (reverse)

seq1  TGCTCACACTTTTAGAAGCTTAATCCATTAACATCATGGTAGGAAGCAGA  50
      ||||||||| |||||| |||| ||||||||   |||||| ||||||||||
seq2  TGCTCACAC-TTTAGAGGCTT-ATCCATTA--CTCATGG-AGGAAGCAGA  45

seq1  CAGACACCATATTGGTACAATAGTTGGTTGGTAGTTTTACATCCTATCTA  100
      |||||| ||||||||||| |||| ||| |||||||||||||| |||||||
seq2  CAGACA-CATATTGGTAC-ATAG-TGGGTGGTAGTTTTACAT-CTATCTA  91

seq1  CAGGCAGCTGGCAGCAGGCAGAGAAAGGAGCAGGAGAAGGACAGGATGGT  150
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CAGGCAGCTGGCAGCAGGCAGAGAAAGGAGCAGGAGAAGGACAGGATGGT  141

seq1  TGGCATGGGATTTTGAAGTGTCAAAGCCTACTTTTAGTGGCACATCTCCT  200
      ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||
seq2  TGGCATGGGATTTTGAAGTGTCAAAGCCTAC-TTTAGTGGCACATCTCCT  190

seq1  CCACCAAGGCCTTACAGTCTAATCCTTCCCAAACAGCTCATCAACTTTGG  250
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCACCAAGGCCTTACAGTCTAATCCTTCCCAAACAGCTCATCAACTTTGG  240

seq1  ACAAAACATGCAAACGTATGAGCCTATGAAGCCCATTCTCGTTCAAATCA  300
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACAAAACATGCAAACGTATGAGCCTATGAAGCCCATTCTCGTTCAAATCA  290

seq1  TCAAAGACTCTACGGAAGACAGAAAAATGGCACTTAACTATCTCCTATAA  350
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCAAAGACTCTACGGAAGACAGAAAAATGGCACTTAACTATCTCCTATAA  340

seq1  CTAATAGCTCATCAGTCTTGCTAATTCTATACATACGGTTGGTTTGTTTC  400
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTAATAGCTCATCAGTCTTGCTAATTCTATACATACGGTTGGTTTGTTTC  390

seq1  TCTAGAGAACCTTGACTATCGACTACTTTATGTTTTATTTTTTCTAACTG  450
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCTAGAGAACCTTGACTATCGACTACTTTATGTTTTATTTTTTCTAACTG  440

seq1  GGAGTAGAATAGGTAAAATCACCTACATCATAATAAATATAATAAAAATA  500
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGAGTAGAATAGGTAAAATCACCTACATCATAATAAATATAATAAAAATA  490

seq1  TTATACAAATACCAGCCTGCCATCTGTAAATTACCTATAAAATGAAATAT  550
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTATACAAATACCAGCCTGCCATCTGTAAATTACCTATAAAATGAAATAT  540

seq1  CATGATTGTGTTGTGGAAAGAAGAACCCAGTTTTGCTATTAGTAAGAATA  600
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CATGATTGTGTTGTGGAAAGAAGAACCCAGTTTTGCTATTAGTAAGAATA  590

seq1  AATAGCTAGGCAGCAAAGCAGTGCCAAGAAGGAAGATGGTACCAAACAGG  650
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AATAGCTAGGCAGCAAAGCAGTGCCAAGAAGGAAGATGGTACCAAACAGG  640

seq1  TCCTATAGAGCAGATCAGTGGTTTTATAACAGAAAGTACATACATATGTC  700
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCCTATAGAGCAGATCAGTGGTTTTATAACAGAAAGTACATACATATGTC  690

seq1  AATATGCTTTCAGATAGACATCTGCACCCTAACAAATATGAGTTCAATAG  750
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AATATGCTTTCAGATAGACATCTGCACCCTAACAAATATGAGTTCAATAG  740

seq1  TAAAGTCACCCAGCATTGACACAGTGTTATATTCACATTAAAATATAAAT  800
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TAAAGTCACCCAGCATTGACACAGTGTTATATTCACATTAAAATATAAAT  790

seq1  TTTACTTCAACCTACTTTTTCTATATGCTTGAAAGTTAACTTCCCTAAAA  850
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTTACTTCAACCTACTTTTTCTATATGCTTGAAAGTTAACTTCCCTAAAA  840

seq1  CAGAAATTGAAGTCATCTTTTCATAATCACTCTTCAGCTCCAACAGCACA  900
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CAGAAATTGAAGTCATCTTTTCATAATCACTCTTCAGCTCCAACAGCACA  890

seq1  AGGGGCCCCTTAGGATTCACACTTGCCCTCAAAAACGTGTCCCAATAATA  950
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGGGGCCCCTTAGGATTCACACTTGCCCTCAAAAACGTGTCCCAATAATA  940

seq1  TGACATCTTAATAAAATAAGGAAAATTTTAAAGACTTAAAAACCACTCAG  1000
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGACATCTTAATAAAATAAGGAAAATTTTAAAGACTTAAAAACCACTCAG  990

seq1  GTTGAATCAGTCTTCTGGCCCTTTGAAATTTAATTCTATTGATGAATGCT  1050
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTTGAATCAGTCTTCTGGCCCTTTGAAATTTAATTCTATTGATGAATGCT  1040

seq1  AAGGCTAATCACTTGGAATTGATTTCTATTGATTTGTGTCTAATTGAATT  1100
      |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAGGCTAATCACTTGGAATTAATTTCTATTGATTTGTGTCTAATTGAATT  1090

seq1  C  1101
      |
seq2  C  1091

seq1: chr15_70864547_70865574
seq2: B6Ng01-089O17.g_72_1097

seq1  GAATTCCAGATCTAACGCTTATCGCTGTGCTTTAGATGCGCTCTTGCCTT  50
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAATTCCAGATCTAACGCTTATCGCTGTGCTTTAGATGCGCTCTTGCCTT  50

seq1  CAATGTCCTTTTCTAAATGAAGTGATCTGAACTAGACTGGAGAGCTTTTG  100
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CAATGTCCTTTTCTAAATGAAGTGATCTGAACTAGACTGGAGAGCTTTTG  100

seq1  TGTTAAGATAAGGAGTTGAATTTTGTCCTTCTAGTTGATTGAGAGGCATC  150
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGTTAAGATAAGGAGTTGAATTTTGTCCTTCTAGTTGATTGAGAGGCATC  150

seq1  GCAGAGGAGCACAATGAGCAAGCTGGCATTGTAGAAGGTCACTTTCAGAC  200
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GCAGAGGAGCACAATGAGCAAGCTGGCATTGTAGAAGGTCACTTTCAGAC  200

seq1  TATAATGGACAAAGGCATGGGAGGGATCCAGCTGGTGGGAGAATGATGAT  250
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TATAATGGACAAAGGCATGGGAGGGATCCAGCTGGTGGGAGAATGATGAT  250

seq1  ACTAGCTAAAGTCTGATGATAATTGAGACACTGTGAGAACATAAAAAAAA  300
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACTAGCTAAAGTCTGATGATAATTGAGACACTGTGAGAACATAAAAAAAA  300

seq1  TAATGGGGTTGGGTAGGGTAATATATACTTGCAATCCTAGCTACTTGGGA  350
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TAATGGGGTTGGGTAGGGTAATATATACTTGCAATCCTAGCTACTTGGGA  350

seq1  GGTCAAGACAGTGGCATTGTAAGTTTGAGGCTAGATTGAGCTATGTAACA  400
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGTCAAGACAGTGGCATTGTAAGTTTGAGGCTAGATTGAGCTATGTAACA  400

seq1  AAATCTAGTTTCAAAAAATGGATGCCTGTATACATTCATTCATATATGAT  450
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAATCTAGTTTCAAAAAATGGATGCCTGTATACATTCATTCATATATGAT  450

seq1  ATATGAATACACACACACACACACACACACACACACACACACACAATGTG  500
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATATGAATACACACACACACACACACACACACACACACACACACAATGTG  500

seq1  GTAATGAAGATTTGTTTCCCTATTTAAATGGGCCCTAATAGGGATTTCAT  550
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTAATGAAGATTTGTTTCCCTATTTAAATGGGCCCTAATAGGGATTTCAT  550

seq1  TTGATCAGAGAGGTTTATAATTCCAAAGCACTTGGAGTTTCCATTTATGA  600
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTGATCAGAGAGGTTTATAATTCCAAAGCACTTGGAGTTTCCATTTATGA  600

seq1  AAATTCACCAAGATTGTGTATGATACTCTATGAGAACTCTCAGCCTTAGT  650
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAATTCACCAAGATTGTGTATGATACTCTATGAGAACTCTCAGCCTTAGT  650

seq1  AGTTCTGTAATATTTCTTCATTCTGATATTACTCAAACAATGTGGATATA  700
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGTTCTGTAATATTTCTTCATTCTGATATTACTCAAACAATGTGGATATA  700

seq1  ACTTTGTTTCTGAAAGGAAATAGAATCTCAAGATCATTAAAAAAAAAAAA  750
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACTTTGTTTCTGAAAGGAAATAGAATCTCAAGATCATTAAAAAAAAAAAA  750

seq1  ACAAAAAAACAGTAGAGGAAGAGAAGAGTTTGGGTTTTTGTGACTCTTCA  800
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACAAAAAAACAGTAGAGGAAGAGAAGAGTTTGGGTTTTTGTGACTCTTCA  800

seq1  TAGCCATTCACCTTTGACAGAC-TTCTAGGTTCTTTATCCATCGACATTG  849
      |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||
seq2  TAGCCATTCACCTTTGACAGACTTTCTAGGTTCTTTATCCATCGACATTG  850

seq1  TGAAAGCCTACCAAATATGATAGCTAGTAGTAAGTGTCAACTTGACACAA  899
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGAAAGCCTACCAAATATGATAGCTAGTAGTAAGTGTCAACTTGACACAA  900

seq1  -TTTAGAATCACATATGAGACAGACCTCTGAGGGAGTTTGTAGATCAGGA  948
       |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||
seq2  TTTTAGAATCACATATGAGACAGACCTCTGA-GGAGTTTGTAGATCA-GA  948

seq1  TAATTGATGAATGAAGATTTACCC-TACATGCAGGTCACATAAAATTCCT  997
      || |||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||
seq2  TATTTGATGAATG-AGATTTACCCTTACATGCAGGTCACATAAAATTCCT  997

seq1  TAGGCTTGTGTCCTATTTTGAATAAAAGTGG  1028
      |||   |||||||||||||| |  |||||||
seq2  TAG--CTGTGTCCTATTTTGGAATAAAGTGG  1026