BAC Information

Click to search

BAC

Clone NameB6Ng01-090K14
Chromosome15 (Build37)
Map Location 28,073,769 - 28,178,047
singlet/doubletdoublet
Overlap geneDnahc5
Upstream geneAnk, BC087945, LOC100040622, BC052328, Trio, LOC667126
Downstream geneEG382974, LOC100040675, LOC100040689, LOC100040702, LOC667153
LinkOpen Mouse BAC browser



BAC End Information

BAC end BAC-end 1BAC-end 2
end nameB6Ng01-090K14.bB6Ng01-090K14.g
ACCDH902901DH902902
length9501,059
definitionDH902901|Mus musculus domesticus DNA, BAC clone: B6Ng01-090K14, 5' end.DH902902|Mus musculus domesticus DNA, BAC clone: B6Ng01-090K14, 3' end.
singlet/doubletdoubletdoublet
BLAST hituniqueunique
Map location.(28,073,769 - 28,074,679)(28,176,992 - 28,178,047)
sequence
gaattctttaatctgagagtcttggggataaagacacagtggcagcttga
ttttctgttgcaagctgatggattgagtggggaattggttggagagaagt
tttaagtgtaggcatgtttgggtttaaggagaaaggacatgttccatgac
ctgaaatgcttttacttgctttcagtgttcggtgggatttacaagtgttc
ttccttacagagtcaaatggaatatatcatgcaaacaggacaaagagggt
tttcaacttacccaaaacaaagctatataactaatgacaacagtcatcaa
ggggactaaagaaacgtgaagtgggaagttgtggttccatgttacgctga
ggtgtgtgaactccgctcaggcagaggaaatattgtacactagactgcat
tttacctaacttcccgttctggtgctgggtggggaaacgtagcctaagat
ggggaccccaagaggaatggtgcaggctgaggctgaagctgtggttccct
aactcacaggcatccagtcactgctggaaactctgtagagttaggaacag
gtagagctgcctgggcttgctacggggagccagggtctgggggactaagc
ggtgattgtctaggaacttggaggggccttctgtgggagactgagtctct
gtacaatgagtgcttttccccaagaacagcagttcttgagcggttcatga
gagagaaggtccttcctggtccatactttttattcactgttcatcgtgga
aaatgggtgcacaccactccctcaggtgggaccaatgattaaattcctac
cttttgtaggaatgaatattggaaatattgggcttattgattacaccctc
aagggctcatctagataactcatcagcatggagagctctgtgaccacgtt
ctttattgggggtggcggtggttgtggtcaactgttttagccaggaatct

gaattcagtccataagaacccatataaacaagtcaacacacctgcaattc
cagccttggacaatggaaacaggaaagccccacagcaagttaaccagaga
tattagtcatattgatgagcaccaggcttgactcatagaccctgactcaa
ggagtaaggcgggggagtgatcaaagatgattgttgatgtcaaccttagg
tctccatgtgcacatacacacaggggctcatgcacatagaaacaaatgaa
aaaataaaacagaagaataaatgtacactagagccatctagcaaggggaa
gcaaacatgctataccttcatgtcactgaaattctttttgaacatgtccc
gcttctggaagagggcagctgcaaacggtgacacaggtagacccaactga
gacatgcattgtgtttctctaaataagactaatatctgaggatcaaagtt
cacaaacaactcccctgtgcctggagccttcaccaataaggaagcctcaa
gacctgcatgaatttcttcaatctgtgggaagaagtcaacattattagta
taagagtgtaatgtacacacagtatctgactcaaccatttcggggcttta
gtgaacacttattcaatattctcccttggacttgaccttactaaagccca
gacaatagggtcacctagtgttctcctaaattcccttcaggttcttggtg
gtgatattgcatagtcaactgaatgtattcttttcatttttgaaactcac
acatgacatttaggtagacactgcagaagcctcggtgatttcaaaaggtt
aaattttaaaagttctgaaacaaaacacccagggaatttggggacactat
gaaaagactaaatcttaagactaataggaaagttttcctaacttaaagaa
agaggtgcctataaataggaagtctataagcttatagcctataagctact
agagcttacagaacaccaaatagattggttcaaaagatatttagcacttt
atgcctatggtccaaaaagattatttagccactttatgcctccctccccc
ttccccaac
quality valuesOpen.Open.




Alignment Information

BAC End 1BAC End 2
seq1: chr15_28073769_28074679
seq2: B6Ng01-090K14.b_48_960

seq1  GAATTCTTTAATCTGAGAGTCTTGGGGATAAAGACACAGTGGCAGCTTGA  50
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAATTCTTTAATCTGAGAGTCTTGGGGATAAAGACACAGTGGCAGCTTGA  50

seq1  TTTTCTGTTGCAAGCTGATGGATTGAGTGGGGAATTGGTTGGAGAGAAGT  100
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTTTCTGTTGCAAGCTGATGGATTGAGTGGGGAATTGGTTGGAGAGAAGT  100

seq1  TTTAAGTGTAGGCATGTTTGGGTTTAAGGAGAAAGGACATGTTCCATGAC  150
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTTAAGTGTAGGCATGTTTGGGTTTAAGGAGAAAGGACATGTTCCATGAC  150

seq1  CTGAAATGCTTTTACTTGCTTTCAGTGTTCGGTGGGATTTACAAGTGTTC  200
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTGAAATGCTTTTACTTGCTTTCAGTGTTCGGTGGGATTTACAAGTGTTC  200

seq1  TTCCTTACAGAGTCAAATGGAATATATCATGCAAACAGGACAAAGAGGGT  250
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTCCTTACAGAGTCAAATGGAATATATCATGCAAACAGGACAAAGAGGGT  250

seq1  TTTCAACTTACCCAAAACAAAGCTATATAACTAATGACAACAGTCATCAA  300
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTTCAACTTACCCAAAACAAAGCTATATAACTAATGACAACAGTCATCAA  300

seq1  GGGGACTAAAGAAACGTGAAGTGGGAAGTTGTGGTTCCATGTTACGCTGA  350
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGGGACTAAAGAAACGTGAAGTGGGAAGTTGTGGTTCCATGTTACGCTGA  350

seq1  GGTGTGTGAACTCCGCTCAGGCAGAGGAAATATTGTACACTAGACTGCAT  400
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGTGTGTGAACTCCGCTCAGGCAGAGGAAATATTGTACACTAGACTGCAT  400

seq1  TTTACCTAACTTCCCGTTCTGGTGCTGGGTGGGGAAACGTAGCCTAAGAT  450
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTTACCTAACTTCCCGTTCTGGTGCTGGGTGGGGAAACGTAGCCTAAGAT  450

seq1  GGGGACCCCAAGAGGAATGGTGCAGGCTGAGGCTGAAGCTGTGGTTCCCT  500
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGGGACCCCAAGAGGAATGGTGCAGGCTGAGGCTGAAGCTGTGGTTCCCT  500

seq1  AACTCACAGGCATCCAGTCACTGCTGGAAACTCTGTAGAGTTAGGAACAG  550
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AACTCACAGGCATCCAGTCACTGCTGGAAACTCTGTAGAGTTAGGAACAG  550

seq1  GTAGAGCTGCCTGGGCTTGCTACGGGGAGCCAGGGTCTGGGGGACTAAGC  600
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTAGAGCTGCCTGGGCTTGCTACGGGGAGCCAGGGTCTGGGGGACTAAGC  600

seq1  GGTGATTGTCTAGGAACTTGGAGGGGCCTTCTGTGGGAGACTGAGTCTCT  650
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGTGATTGTCTAGGAACTTGGAGGGGCCTTCTGTGGGAGACTGAGTCTCT  650

seq1  GTACAATGAGTGCTTTTCCCCAAGAACAGCAGTTCTTGAGCGGTTCATGA  700
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTACAATGAGTGCTTTTCCCCAAGAACAGCAGTTCTTGAGCGGTTCATGA  700

seq1  GAGAGAAGGTCCTTCCTGGTCCATACTTTTTATTCACTGTTCATCGTGGA  750
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAGAGAAGGTCCTTCCTGGTCCATACTTTTTATTCACTGTTCATCGTGGA  750

seq1  AAATGGGTGCACACCACTCCCTCAGGGTGGACCAATGATTAAATTCCTAC  800
      ||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||
seq2  AAATGGGTGCACACCACTCCCTCAGGTGGGACCAATGATTAAATTCCTAC  800

seq1  CTTTTGTAGGAATGAATATTGGAAATATT-GGCTTATTGATTACACCCTC  849
      ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||
seq2  CTTTTGTAGGAATGAATATTGGAAATATTGGGCTTATTGATTACACCCTC  850

seq1  AA-GGCTCATCTAGATAACTCATCAGCATGGAGAGCTCTGTGACCACGTT  898
      || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAGGGCTCATCTAGATAACTCATCAGCATGGAGAGCTCTGTGACCACGTT  900

seq1  CTTTATTGGGGGT  911
      |||||||||||||
seq2  CTTTATTGGGGGT  913

seq1: chr15_28176992_28178047
seq2: B6Ng01-090K14.g_69_1127 (reverse)

seq1  GTTGGGG-AGGGGGAGGGAGGCATAAAGT-GCTAAAT-ATCTTTTTGGAC  47
      ||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||
seq2  GTTGGGGAAGGGGGAGGGAGGCATAAAGTGGCTAAATAATCTTTTTGGAC  50

seq1  CATAGGCATAAAGTGCTAAATATCTTTTTGGACCAATCTATTTGGTGTTC  97
      |||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||
seq2  CATAGGCATAAAGTGCTAAATATC-TTTTGAACCAATCTATTTGGTGTTC  99

seq1  TGTAAGCTTCTAGTAGCTTATAGGCTATAAGCTTATAGACTTCCTATTTA  147
      ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGTAAGC-TCTAGTAGCTTATAGGCTATAAGCTTATAGACTTCCTATTTA  148

seq1  TAGGCACCTCTTTCTTTAGGTTAGGGAAACTTTCCTATTAGTCTT-AGGT  196
      |||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||| || |
seq2  TAGGCACCTCTTTCTTTAAGTTAGGAAAACTTTCCTATTAGTCTTAAGAT  198

seq1  TTAGTCTTTTCATAGTGT-CCCAAATTCCCTGGGTGTTTTGTTTCAGAAC  245
      |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTAGTCTTTTCATAGTGTCCCCAAATTCCCTGGGTGTTTTGTTTCAGAAC  248

seq1  TTTTAAAATTTAACCTTTTGAAATCACCGAGGCTTCTGCAGTGTCTACCT  295
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTTTAAAATTTAACCTTTTGAAATCACCGAGGCTTCTGCAGTGTCTACCT  298

seq1  AAATGTCATGTGTGAGTTTCAAAAATGAAAAGAATACATTCAGTTGACTA  345
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAATGTCATGTGTGAGTTTCAAAAATGAAAAGAATACATTCAGTTGACTA  348

seq1  TGCAATATCACCACCAAGAACCTGAAGGGAATTTAGGAGAACACTAGGTG  395
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGCAATATCACCACCAAGAACCTGAAGGGAATTTAGGAGAACACTAGGTG  398

seq1  ACCCTATTGTCTGGGCTTTAGTAAGGTCAAGTCCAAGGGAGAATATTGAA  445
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACCCTATTGTCTGGGCTTTAGTAAGGTCAAGTCCAAGGGAGAATATTGAA  448

seq1  TAAGTGTTCACTAAAGCCCCGAAATGGTTGAGTCAGATACTGTGTGTACA  495
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TAAGTGTTCACTAAAGCCCCGAAATGGTTGAGTCAGATACTGTGTGTACA  498

seq1  TTACACTCTTATACTAATAATGTTGACTTCTTCCCACAGATTGAAGAAAT  545
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTACACTCTTATACTAATAATGTTGACTTCTTCCCACAGATTGAAGAAAT  548

seq1  TCATGCAGGTCTTGAGGCTTCCTTATTGGTGAAGGCTCCAGGCACAGGGG  595
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCATGCAGGTCTTGAGGCTTCCTTATTGGTGAAGGCTCCAGGCACAGGGG  598

seq1  AGTTGTTTGTGAACTTTGATCCTCAGATATTAGTCTTATTTAGAGAAACA  645
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGTTGTTTGTGAACTTTGATCCTCAGATATTAGTCTTATTTAGAGAAACA  648

seq1  CAATGCATGTCTCAGTTGGGTCTACCTGTGTCACCGTTTGCAGCTGCCCT  695
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CAATGCATGTCTCAGTTGGGTCTACCTGTGTCACCGTTTGCAGCTGCCCT  698

seq1  CTTCCAGAAGCGGGACATGTTCAAAAAGAATTTCAGTGACATGAAGGTAT  745
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTTCCAGAAGCGGGACATGTTCAAAAAGAATTTCAGTGACATGAAGGTAT  748

seq1  AGCATGTTTGCTTCCCCTTGCTAGATGGCTCTAGTGTACATTTATTCTTC  795
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGCATGTTTGCTTCCCCTTGCTAGATGGCTCTAGTGTACATTTATTCTTC  798

seq1  TGTTTTATTTTTTCATTTGTTTCTATGTGCATGAGCCCCTGTGTGTATGT  845
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGTTTTATTTTTTCATTTGTTTCTATGTGCATGAGCCCCTGTGTGTATGT  848

seq1  GCACATGGAGACCTAAGGTTGACATCAACAATCATCTTTGATCACTCCCC  895
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GCACATGGAGACCTAAGGTTGACATCAACAATCATCTTTGATCACTCCCC  898

seq1  CGCCTTACTCCTTGAGTCAGGGTCTATGAGTCAAGCCTGGTGCTCATCAA  945
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CGCCTTACTCCTTGAGTCAGGGTCTATGAGTCAAGCCTGGTGCTCATCAA  948

seq1  TATGACTAATATCTCTGGTTAACTTGCTGTGGGGCTTTCCTGTTTCCATT  995
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TATGACTAATATCTCTGGTTAACTTGCTGTGGGGCTTTCCTGTTTCCATT  998

seq1  GTCCAAGGCTGGAATTGCAGGTGTGTTGACTTGTTTATATGGGTTCTTAT  1045
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTCCAAGGCTGGAATTGCAGGTGTGTTGACTTGTTTATATGGGTTCTTAT  1048

seq1  GGACTGAATTC  1056
      |||||||||||
seq2  GGACTGAATTC  1059