BAC Information

Click to search

BAC

Clone NameB6Ng01-106G24
Chromosome15 (Build37)
Map Location 87,232,773 - 87,371,439
singlet/doubletdoublet
Overlap genenone
Upstream geneTbc1d22a, LOC100042309
Downstream geneAW049604, LOC100042329, LOC100042340
LinkOpen Mouse BAC browser



BAC End Information

BAC end BAC-end 1BAC-end 2
end nameB6Ng01-106G24.bB6Ng01-106G24.g
ACCDH914179DH914180
length1,1331,116
definitionDH914179|Mus musculus domesticus DNA, BAC clone: B6Ng01-106G24, 5' end.DH914180|Mus musculus domesticus DNA, BAC clone: B6Ng01-106G24, 3' end.
singlet/doubletdoubletdoublet
BLAST hituniqueunique
Map location.(87,370,300 - 87,371,439)(87,232,773 - 87,233,900)
sequence
gaattcacaagacagggatgctgaagaaacacaatcctctacctcagact
gcatggtggcaggagttgtggaaaggataagagagattaaaatgaggctg
caaatggagcctccagaatatgaatagcacccttgacctaaagatcagca
tgcagcctagaagctgtagggacaggaccctggcccagtatgctccagcc
aggtcttgttccagagcctggtaagaaagcctggatggagctaaagatgg
ggcaatgagcagagcactgagtcctgttgctaggagacagaggctcggtt
cttgataccaacatgtgctaccaattgacaatttttgttgttattattga
tggactgcctttgatcaccagccagaatttgcaggacttcaaaatgtaag
ggctgagtactttggctggagaatcacaccattaccttaactctaagccc
aaaagacaagcaatggtgactgtttaaccagaggagagcctcaggtctca
cagaacagcagtctatagtcagagctccaaggaacctggccaggatagga
ccatccagcctggctgctccttataacagtcacagagtgtaacagatatg
gtaggttcctaggaggggatgctgagcagagagctctcccaggacatgca
ctctgcatcaaagagggaaatcatggttaagagcaccaactgctcttcca
gaggtccttagttcagttcccagcaactgcaaggtggcacataaccatct
gtaataggatctgatgtccttttctggtgtgtctcaagacagctacagtg
tactcatataaataaaataaataatttttaaaaatctcagcacatcaagg
tgtcagtattcccactgtgcttgggttgtatctcaactgtgcttggttga
gccacacaggctggcaaggctttccaccatctccatcttccagtgtctca
ttcactgtttgatcccaggagcacccagacactctgaatttagatctttg
tgtatggcctgaagcatgagtgtccccaaagagaagtgaaaagaggcctg
gcttcaaagagagaataccctggtttttaggaatcattaacgatcgttga
gaaggcaggagtgctcaagggcaggttgtgtgg
gaattccataatagaatgctacaggcctgcagagacacggcccaggaacg
caaaccctctacaactatgaacgagcaagccagggaagagctcattctaa
agatgagatctccttgcaaggaaaagttcaaaggcattaaagcccaaagg
gatcggagtccttttgctcatgttaataaacattcaaagactcctgctct
tcccgctccttttactaatccccagccaggccgcccttgatgccagtgtt
gagtccaggctctgtccatcaccagctcgtgcctggggctgattctcact
cagaagtggtattagctcagccaagtgtctcattagcttaatgtctgaag
actcccaagtgttaatgggccgcgttgctgtaaaacccgccaggctctga
agacgagccacacttggttcccctgagcaactgtccgacaaaacgaactt
gacagaagccaggatttagtgttgatgaagtctcccttgatgttttagat
atgagagaaggaaggtcaaaagggaacccttttctgctttattttggggt
actagccaggtgacaggtgttgcgtgtctactctccatgaccaggattat
agatccaatgggtgtccactctaagaatggagctctgctgagcaccaacc
tctcagtggggctgggcacagtccctgtatggtggctcagtccccacacc
atataaagtggcctatcccactgactggcttcagctccttgacgagagtt
tttccaaggtgagagaccagctttccaaggggactgtctctcactgcatc
atcatgccaactgggagaccagagctatgagaaactcttgattcaggatg
aggccctttgcatgtaaaacagaacggagcccagggcagcaaagcatggg
gtaccttggggtgacttcacaatccatcatcttgtctaattcatcttagc
taagacccagtgagagcatagcatgctcccctgctgactatagtagtctc
ctaatccatctctgggacgcagcttacgactctctagagcaagagaaatc
catatggctgaacactgtccattgccccatactagtgggtgtcagaggag
gcagcccttcacatcc
quality valuesOpen.Open.




Alignment Information

BAC End 1BAC End 2
seq1: chr15_87370300_87371439
seq2: B6Ng01-106G24.b_45_1177 (reverse)

seq1  CCACACAACCTGCCCCTTGAGCA-TCCTGCCCTCTC-ACGATCCGTAATG  48
      |||||||||||| |||||||||| ||||||| |||| ||||||  |||||
seq2  CCACACAACCTG-CCCTTGAGCACTCCTGCCTTCTCAACGATCGTTAATG  49

seq1  ATTCCCTAAAAAACCAGGGTTATCTCTCTTTGAAGCCAGCCCCTCTCTTC  98
      |||||   ||||||||||||  |||||||||||||||||  ||||| |||
seq2  ATTCC--TAAAAACCAGGGTATTCTCTCTTTGAAGCCAG-GCCTCTTTTC  96

seq1  ACTGTCTCTTTGGGGACAACCTCATGCTTCAGGCCAATACACAAAGATCT  148
      ||| ||||||||||||||  ||||||||||||||| ||||||||||||||
seq2  ACT-TCTCTTTGGGGACA--CTCATGCTTCAGGCC-ATACACAAAGATCT  142

seq1  AAATTCAGAGTGTCTGGGTGCTCCTGGGATCAAACAGTGAATGAGACACT  198
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAATTCAGAGTGTCTGGGTGCTCCTGGGATCAAACAGTGAATGAGACACT  192

seq1  GGAAGATGGAGATGGTGGGAAAGCCTTGCCAGCCTGTGTGGCTCAACCAA  248
      |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGAAGATGGAGATGGT-GGAAAGCCTTGCCAGCCTGTGTGGCTCAACCAA  241

seq1  GCACAGTTGAGATACAA-CCAAGCACAGTGGGAAATACTGACACCTTGAT  297
      ||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||
seq2  GCACAGTTGAGATACAACCCAAGCACAGTGGG-AATACTGACACCTTGAT  290

seq1  GTGCTGAGATTTTTAAAAATTATTTATTTTATTTATATGAGTACACTGTA  347
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTGCTGAGATTTTTAAAAATTATTTATTTTATTTATATGAGTACACTGTA  340

seq1  GCTGTCTTGAGACACACCAGAAAAGGACATCAGATCCTATTACAGATGGT  397
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GCTGTCTTGAGACACACCAGAAAAGGACATCAGATCCTATTACAGATGGT  390

seq1  TATGTGCCACCTTGCAGTTGCTGGGAACTGAACTAAGGACCTCTGGAAGA  447
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TATGTGCCACCTTGCAGTTGCTGGGAACTGAACTAAGGACCTCTGGAAGA  440

seq1  GCAGTTGGTGCTCTTAACCATGATTTCCCTCTTTGATGCAGAGTGCATGT  497
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GCAGTTGGTGCTCTTAACCATGATTTCCCTCTTTGATGCAGAGTGCATGT  490

seq1  CCTGGGAGAGCTCTCTGCTCAGCATCCCCTCCTAGGAACCTACCATATCT  547
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCTGGGAGAGCTCTCTGCTCAGCATCCCCTCCTAGGAACCTACCATATCT  540

seq1  GTTACACTCTGTGACTGTTATAAGGAGCAGCCAGGCTGGATGGTCCTATC  597
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTTACACTCTGTGACTGTTATAAGGAGCAGCCAGGCTGGATGGTCCTATC  590

seq1  CTGGCCAGGTTCCTTGGAGCTCTGACTATAGACTGCTGTTCTGTGAGACC  647
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTGGCCAGGTTCCTTGGAGCTCTGACTATAGACTGCTGTTCTGTGAGACC  640

seq1  TGAGGCTCTCCTCTGGTTAAACAGTCACCATTGCTTGTCTTTTGGGCTTA  697
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGAGGCTCTCCTCTGGTTAAACAGTCACCATTGCTTGTCTTTTGGGCTTA  690

seq1  GAGTTAAGGTAATGGTGTGATTCTCCAGCCAAAGTACTCAGCCCTTACAT  747
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAGTTAAGGTAATGGTGTGATTCTCCAGCCAAAGTACTCAGCCCTTACAT  740

seq1  TTTGAAGTCCTGCAAATTCTGGCTGGTGATCAAAGGCAGTCCATCAATAA  797
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTTGAAGTCCTGCAAATTCTGGCTGGTGATCAAAGGCAGTCCATCAATAA  790

seq1  TAACAACAAAAATTGTCAATTGGTAGCACATGTTGGTATCAAGAACCGAG  847
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TAACAACAAAAATTGTCAATTGGTAGCACATGTTGGTATCAAGAACCGAG  840

seq1  CCTCTGTCTCCTAGCAACAGGACTCAGTGCTCTGCTCATTGCCCCATCTT  897
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCTCTGTCTCCTAGCAACAGGACTCAGTGCTCTGCTCATTGCCCCATCTT  890

seq1  TAGCTCCATCCAGGCTTTCTTACCAGGCTCTGGAACAAGACCTGGCTGGA  947
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TAGCTCCATCCAGGCTTTCTTACCAGGCTCTGGAACAAGACCTGGCTGGA  940

seq1  GCATACTGGGCCAGGGTCCTGTCCCTACAGCTTCTAGGCTGCATGCTGAT  997
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GCATACTGGGCCAGGGTCCTGTCCCTACAGCTTCTAGGCTGCATGCTGAT  990

seq1  CTTTAGGTCAAGGGTGCTATTCATATTCTGGAGGCTCCATTTGCAGCCTC  1047
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTTTAGGTCAAGGGTGCTATTCATATTCTGGAGGCTCCATTTGCAGCCTC  1040

seq1  ATTTTAATCTCTCTTATCCTTTCCACAACTCCTGCCACCATGCAGTCTGA  1097
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATTTTAATCTCTCTTATCCTTTCCACAACTCCTGCCACCATGCAGTCTGA  1090

seq1  GGTAGAGGATTGTGTTTCTTCAGCATCCCTGTCTTGTGAATTC  1140
      |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGTAGAGGATTGTGTTTCTTCAGCATCCCTGTCTTGTGAATTC  1133

seq1: chr15_87232773_87233900
seq2: B6Ng01-106G24.g_67_1182

seq1  GAATTCCATAATAGAATGCTACAGGCCTGCAGAGACACGGCCCAGGAACG  50
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAATTCCATAATAGAATGCTACAGGCCTGCAGAGACACGGCCCAGGAACG  50

seq1  CAAACCCTCTACAACTATGAACGAGCAAGCCAGGGAAGAGCTCATTCTAA  100
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CAAACCCTCTACAACTATGAACGAGCAAGCCAGGGAAGAGCTCATTCTAA  100

seq1  AGATGAGATCTCCTTGCAAGGAAAAGTTCAAAGGCATTAAAGCCCAAAGG  150
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGATGAGATCTCCTTGCAAGGAAAAGTTCAAAGGCATTAAAGCCCAAAGG  150

seq1  GATCGGAGTCCTTTTGCTCATGTTAATAAACATTCAAAGACTCCTGCTCT  200
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GATCGGAGTCCTTTTGCTCATGTTAATAAACATTCAAAGACTCCTGCTCT  200

seq1  TCCCGCTCCTTTTACTAATCCCCAGCCAGGCCGCCCTTGATGCCAGTGTT  250
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCCCGCTCCTTTTACTAATCCCCAGCCAGGCCGCCCTTGATGCCAGTGTT  250

seq1  GAGTCCAGGCTCTGTCCATCACCAGCTCGTGCCTGGGGCTGATTCTCACT  300
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAGTCCAGGCTCTGTCCATCACCAGCTCGTGCCTGGGGCTGATTCTCACT  300

seq1  CAGAAGTGGTATTAGCTCAGCCAAGTGTCTCATTAGCTTAATGTCTGAAG  350
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CAGAAGTGGTATTAGCTCAGCCAAGTGTCTCATTAGCTTAATGTCTGAAG  350

seq1  ACTCCCAAGTGTTAATGGGCCGCGTTGCTGTAAAACCCGCCAGGCTCTGA  400
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACTCCCAAGTGTTAATGGGCCGCGTTGCTGTAAAACCCGCCAGGCTCTGA  400

seq1  AGACGAGCCACACTTGGTTCCCCTGAGCAACTGTCCGACAAAACGAACTT  450
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGACGAGCCACACTTGGTTCCCCTGAGCAACTGTCCGACAAAACGAACTT  450

seq1  GACAGAAGCCAGGATTTAGTGTTGATGAAGTCTCCCTTGATGTTTTAGAT  500
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GACAGAAGCCAGGATTTAGTGTTGATGAAGTCTCCCTTGATGTTTTAGAT  500

seq1  ATGAGAGAAGGAAGGTCAAAAGGGAACCCTTTTCTGCTTTATTTTGGGGT  550
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATGAGAGAAGGAAGGTCAAAAGGGAACCCTTTTCTGCTTTATTTTGGGGT  550

seq1  ACTAGCCAGGTGACAGGTGTTGCGTGTCTACTCTCCATGACCAGGATTAT  600
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACTAGCCAGGTGACAGGTGTTGCGTGTCTACTCTCCATGACCAGGATTAT  600

seq1  AGATCCAATGGGTGTCCACTCTAAGAATGGAGCTCTGCTGAGCACCAACC  650
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGATCCAATGGGTGTCCACTCTAAGAATGGAGCTCTGCTGAGCACCAACC  650

seq1  TCTCAGTGGGGCTGGGCACAGTCCCTGTATGGTGGCTCAGTCCCCACACC  700
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCTCAGTGGGGCTGGGCACAGTCCCTGTATGGTGGCTCAGTCCCCACACC  700

seq1  ATATAAAGTGGCCTATCCCACTGACTGGCTTCAGCTCCTTGACGAGAGTT  750
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATATAAAGTGGCCTATCCCACTGACTGGCTTCAGCTCCTTGACGAGAGTT  750

seq1  TTTCCAAGGTGAGAGACCAGCTTTCCAAGGGGACTGTCTCTCACTGCATC  800
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTTCCAAGGTGAGAGACCAGCTTTCCAAGGGGACTGTCTCTCACTGCATC  800

seq1  ATCATGCCAACT-GGAGACCAGAGCTATGAGAAACTC-TGATTCAGGATG  848
      |||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||
seq2  ATCATGCCAACTGGGAGACCAGAGCTATGAGAAACTCTTGATTCAGGATG  850

seq1  AGGCCC-TTGCATGTAAAACAGAACGGAGGCCCAGGGCAGCAAAGCATGG  897
      |||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||
seq2  AGGCCCTTTGCATGTAAAACAGAACGGA-GCCCAGGGCAGCAAAGCATGG  899

seq1  GGTACCTT-GGGTGACTTCCACAATCCATCATCTTGTCTAATTCATCTTA  946
      |||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGTACCTTGGGGTGACTT-CACAATCCATCATCTTGTCTAATTCATCTTA  948

seq1  GCCTAAGACCCAGTGAGAGCATAGGCATGCTCCCCCTGCTGACTATAGTA  996
      | ||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||
seq2  G-CTAAGACCCAGTGAGAGCATA-GCATGCT-CCCCTGCTGACTATAGTA  995

seq1  GGTCTCCCTAATCCATCTCTGGGACGCCAGCTACAGACTCTCTAGGAGCA  1046
       |||| |||||||||||||||||||| |||||   ||||||||| |||||
seq2  -GTCT-CCTAATCCATCTCTGGGACG-CAGCTTACGACTCTCTA-GAGCA  1041

seq1  AGGAGAAATCACATATGGGCTGAACACTGTCCATTGCCCCATACCAAGTG  1096
      | |||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| | ||||
seq2  A-GAGAAATC-CATAT-GGCTGAACACTGTCCATTGCCCCATA-CTAGTG  1087

seq1  GGTGTCCAGAGTGAGCGATGCCCCTCACATCC  1128
      ||||| ||||| ||| |  |||| ||||||||
seq2  GGTGT-CAGAG-GAG-GCAGCCCTTCACATCC  1116