BAC Information

Click to search

BAC

Clone NameB6Ng01-112E20
Chromosome15 (Build37)
Map Location 66,477,305 - 66,650,922
singlet/doubletdoublet
Overlap geneTg, Sla
Upstream geneC920006C10Rik, Oc90, F930104E18Rik, LOC100040835, Kcnq3, Lrrc6, LOC100040860, Tmem71, LOC100040881, Phf20l1
Downstream geneWisp1, Ndrg1, LOC100040667, St3gal1
LinkOpen Mouse BAC browser



BAC End Information

BAC end BAC-end 1BAC-end 2
end nameB6Ng01-112E20.bB6Ng01-112E20.g
ACCDH918401DH918402
length1,1281,118
definitionDH918401|Mus musculus domesticus DNA, BAC clone: B6Ng01-112E20, 5' end.DH918402|Mus musculus domesticus DNA, BAC clone: B6Ng01-112E20, 3' end.
singlet/doubletdoubletdoublet
BLAST hituniqueunique
Map location.(66,649,790 - 66,650,922)(66,477,305 - 66,478,422)
sequence
gaattcttgtgaaaatcaaatgaaaccacaggtataaaaagatgtaatct
ataaaaaattcttcatataaatatgtactattgatattcctattgatgct
caaactataattttaaaatggtagactattctctagtccagtgattctta
acctatatgttgtgatacattgagagccgaatgatgctttcatagggctt
gcctaagaccaagactaagtctgtgctaaggctaaggactgatatttaca
ttatgattcataacagtaacaagattacagttatgagatatcaacaaaaa
taattttatggttgggggccaccacagcatgaggaactgtgtaaaatggt
cacaagtgttaggttgagaaccgctgctctagactaacagatcagcatta
gagtttcatctcagccaaggcattttccacagcctccccttgctggtgca
attagtcatggatcagtgcatgctgagctgaccctgactgatagttttac
acctaaccagctggttctgactgcgtgtcagtgacttaagtaacatcaaa
gtcaacttcaagcttgcttttcttctgacaataaaatcttatcatgagga
agtggagcatccagccatgaggaggcatcctgggagagcatgaggtgggg
tttcagtgagtgtgataacaatcttgctatggatcttagcctcatgttgc
actgtctgaaatacccagaggtggctcgccagttactttggcatggttac
tcacacgatgagggtgctggggcagaatggtgccaaggtcttcctcggac
agtgtcaggaagtttgagcacagtggccttattcaccagccaggcagcca
gctgtttctagattcccagtataggtctttgtgctgctgtgagttcctct
attagagggctaattccggcacttctgcacaagatgcccagggaatccaa
atcagcagacatgattaggccttaagtgtttagagatcttaggggaaggg
ccttcttttctctctgttggaactcattcctcagtctttctcagctccct
cctccctatgacatctactggttctaccagacattgcaatacactgactg
gcttgtttgtccccgccctctttggaac
gaattcattaccaaaggctcctgtattgaatcaaactggagaggaattct
gttaccgagtaataacttgctatacggaaacagacacagattggtaatct
cagatttccttgtaattaatttactagcagtatgataccctgagctttgg
tttacttgtctataaatgatgacataccaacttggaactttgctttgaga
cttaaattatcaagaagcataatacatgaactcgatatcacctatcactg
agtgtcatctatgtgcaggccatgaaattagcatggttagagttggatag
aggataagatcatgttccataggctaatggagacagtaacattttctagt
gagagcccaaccaaagagacctttctttaaaggaagataattatacttga
atgtggtggagcagggagaatagatatatattcgttgaaacagtgttctc
ttaaatttgactagaacatccagaaaaatttaagactttgaaattcctag
tctttgttctctctaaactagagcccaaggaaagacttctgagtgtactt
agttcattagaaacaaaatcgaacaactcagtagcaggagggaagtgagg
gaacggaagaggggaggagaaagcaaataagcagaaggattgctgtgagc
aatggggtttggattctgcctttttaaatcctacatacagtatgtaattt
ccaagttgtaaatattaacattatatctaatcacatagaacattttaaaa
tgcatgtggttgaatctgatgcatcatgggttgttttgttgtttaccaac
atttttttaaaggacataggcagaattttgaagtaacatgacaaactaga
agcttcctacatgtctccttataaataagtcagaataaggagaaatggat
gctatccaatagagaaccatggaaatccatgtaatgatagatgagttaaa
agcttgtaggaaaaggtggagcatgctgaaaagtatttagcagcagcaca
gcttcctgaatagagaacggaaagcagaggttcattttcttagttacttt
tattattcccgtgtcttaattaaaagaaattttaggtcagatgaagtatt
ggcccctaaatgtaaaga
quality valuesOpen.Open.




Alignment Information

BAC End 1BAC End 2
seq1: chr15_66649790_66650922
seq2: B6Ng01-112E20.b_46_1173 (reverse)

seq1  GTTCC-AAGA-GGCGGGGAC-AACAAG-CAGTCAGTGTGATGCAATGTCT  46
      ||||| |||| ||||||||| |||||| ||||||||||  ||||||||||
seq2  GTTCCAAAGAGGGCGGGGACAAACAAGCCAGTCAGTGTATTGCAATGTCT  50

seq1  GTGTAGAACAAGTAGATGTTCATAGGGAGGAGGGAGCTGAG-AAGACTGA  95
      | ||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||
seq2  G-GTAGAACCAGTAGATG-TCATAGGGAGGAGGGAGCTGAGAAAGACTGA  98

seq1  GGGAATGAGTTTCAAACAGAGAGAAAAGAAGGCCCCTTCCCCTAAGATCT  145
       |||||||| ||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||
seq2  -GGAATGAG-TTCCAACAGAGAGAAAAGAAGG-CCCTTCCCCTAAGATCT  145

seq1  CTAAACACCTTAAGGCCTTAATCATGTTCTGCTGATTTGGATTCCCTGGG  195
      ||||||| ||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||| ||
seq2  CTAAACA-CTTAAGGCC-TAATCATG-TCTGCTGATTTGGATTCCCT-GG  191

seq1  GCATCTTTGTGCAGAAGTTGCCGGAATTAGCCCTCTAATAGAGGAACTCA  245
      ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GCATC-TTGTGCAGAAG-TGCCGGAATTAGCCCTCTAATAGAGGAACTCA  239

seq1  CAGCAGCAACAAAGACCTATACTGGGAATCTAGAAACAGCTGGCTGCCTG  295
      ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CAGCAGC-ACAAAGACCTATACTGGGAATCTAGAAACAGCTGGCTGCCTG  288

seq1  GCTGGTG-ATAAGGCCACTGTGCTC-AACTTCCTGACACTGTCCGAGGAA  343
      ||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||
seq2  GCTGGTGAATAAGGCCACTGTGCTCAAACTTCCTGACACTGTCCGAGGAA  338

seq1  GACCTTGGCACCATTCTGCCCCAGCACCCTCATCGTGTGAGTAACCATGC  393
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GACCTTGGCACCATTCTGCCCCAGCACCCTCATCGTGTGAGTAACCATGC  388

seq1  CAAAGTAACTGGCGAGCCACCTCTGGGTATTTCAGACAGTGCAACATGAG  443
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CAAAGTAACTGGCGAGCCACCTCTGGGTATTTCAGACAGTGCAACATGAG  438

seq1  GCTAAGATCCATAGCAAGATTGTTATCACACTCACTGAAACCCCACCTCA  493
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GCTAAGATCCATAGCAAGATTGTTATCACACTCACTGAAACCCCACCTCA  488

seq1  TGCTCTCCCAGGATGCCTCCTCATGGCTGGATGCTCCACTTCCTCATGAT  543
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGCTCTCCCAGGATGCCTCCTCATGGCTGGATGCTCCACTTCCTCATGAT  538

seq1  AAGATTTTATTGTCAGAAGAAAAGCAAGCTTGAAGTTGACTTTGATGTTA  593
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAGATTTTATTGTCAGAAGAAAAGCAAGCTTGAAGTTGACTTTGATGTTA  588

seq1  CTTAAGTCACTGACACGCAGTCAGAACCAGCTGGTTAGGTGTAAAACTAT  643
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTTAAGTCACTGACACGCAGTCAGAACCAGCTGGTTAGGTGTAAAACTAT  638

seq1  CAGTCAGGGTCAGCTCAGCATGCACTGATCCATGACTAATTGCACCAGCA  693
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CAGTCAGGGTCAGCTCAGCATGCACTGATCCATGACTAATTGCACCAGCA  688

seq1  AGGGGAGGCTGTGGAAAATGCCTTGGCTGAGATGAAACTCTAATGCTGAT  743
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGGGGAGGCTGTGGAAAATGCCTTGGCTGAGATGAAACTCTAATGCTGAT  738

seq1  CTGTTAGTCTAGAGCAGCGGTTCTCAACCTAACACTTGTGACCATTTTAC  793
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTGTTAGTCTAGAGCAGCGGTTCTCAACCTAACACTTGTGACCATTTTAC  788

seq1  ACAGTTCCTCATGCTGTGGTGGCCCCCAACCATAAAATTATTTTTGTTGA  843
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACAGTTCCTCATGCTGTGGTGGCCCCCAACCATAAAATTATTTTTGTTGA  838

seq1  TATCTCATAACTGTAATCTTGTTACTGTTATGAATCATAATGTAAATATC  893
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TATCTCATAACTGTAATCTTGTTACTGTTATGAATCATAATGTAAATATC  888

seq1  AGTCCTTAGCCTTAGCACAGACTTAGTCTTGGTCTTAGGCAAGCCCTATG  943
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGTCCTTAGCCTTAGCACAGACTTAGTCTTGGTCTTAGGCAAGCCCTATG  938

seq1  AAAGCATCATTCGGCTCTCAATGTATCACAACATATAGGTTAAGAATCAC  993
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAAGCATCATTCGGCTCTCAATGTATCACAACATATAGGTTAAGAATCAC  988

seq1  TGGACTAGAGAATAGTCTACCATTTTAAAATTATAGTTTGAGCATCAATA  1043
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGGACTAGAGAATAGTCTACCATTTTAAAATTATAGTTTGAGCATCAATA  1038

seq1  GGAATATCAATAGTACATATTTATATGAAGAATTTTTTATAGATTACATC  1093
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGAATATCAATAGTACATATTTATATGAAGAATTTTTTATAGATTACATC  1088

seq1  TTTTTATACCTGTGGTTTCATTTGATTTTCACAAGAATTC  1133
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTTTTATACCTGTGGTTTCATTTGATTTTCACAAGAATTC  1128

seq1: chr15_66477305_66478422
seq2: B6Ng01-112E20.g_68_1185

seq1  GAATTCATTACCAAAGGCTCCTGTATTGAATCAAACTGGAGAGGAATTCT  50
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAATTCATTACCAAAGGCTCCTGTATTGAATCAAACTGGAGAGGAATTCT  50

seq1  GTTACCGAGTAATAACTTGCTATACGGAAACAGACACAGATTGGTAATCT  100
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTTACCGAGTAATAACTTGCTATACGGAAACAGACACAGATTGGTAATCT  100

seq1  CAGATTTCCTTGTAATTAATTTACTAGCAGTATGATACCCTGAGCTTTGG  150
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CAGATTTCCTTGTAATTAATTTACTAGCAGTATGATACCCTGAGCTTTGG  150

seq1  TTTACTTGTCTATAAATGATGACATACCAACTTGGAACTTTGCTTTGAGA  200
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTTACTTGTCTATAAATGATGACATACCAACTTGGAACTTTGCTTTGAGA  200

seq1  CTTAAATTATCAAGAAGCATAATACATGAACTCGATATCACCTATCACTG  250
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTTAAATTATCAAGAAGCATAATACATGAACTCGATATCACCTATCACTG  250

seq1  AGTGTCATCTATGTGCAGGCCATGAAATTAGCATGGTTAGAGTTGGATAG  300
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGTGTCATCTATGTGCAGGCCATGAAATTAGCATGGTTAGAGTTGGATAG  300

seq1  AGGATAAGATCATGTTCCATAGGCTAATGGAGACAGTAACATTTTCTAGT  350
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGGATAAGATCATGTTCCATAGGCTAATGGAGACAGTAACATTTTCTAGT  350

seq1  GAGAGCCCAACCAAAGAGACCTTTCTTTAAAGGAAGATAATTATACTTGA  400
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAGAGCCCAACCAAAGAGACCTTTCTTTAAAGGAAGATAATTATACTTGA  400

seq1  ATGTGGTGGAGCAGGGAGAATAGATATATATTCGTTGAAACAGTGTTCTC  450
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATGTGGTGGAGCAGGGAGAATAGATATATATTCGTTGAAACAGTGTTCTC  450

seq1  TTAAATTTGACTAGAACATCCAGAAAAATTTAAGACTTTGAAATTCCTAG  500
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTAAATTTGACTAGAACATCCAGAAAAATTTAAGACTTTGAAATTCCTAG  500

seq1  TCTTTGTTCTCTCTAAACTAGAGCCCAAGGAAAGACTTCTGAGTGTACTT  550
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCTTTGTTCTCTCTAAACTAGAGCCCAAGGAAAGACTTCTGAGTGTACTT  550

seq1  AGTTCATTAGAAACAAAATCGAACAACTCAGTAGCAGGAGGGAAGTGAGG  600
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGTTCATTAGAAACAAAATCGAACAACTCAGTAGCAGGAGGGAAGTGAGG  600

seq1  GAACGGAAGAGGGGAGGAGAAAGCAAATAAGCAGAAGGATTGCTGTGAGC  650
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAACGGAAGAGGGGAGGAGAAAGCAAATAAGCAGAAGGATTGCTGTGAGC  650

seq1  AATGGGGTTTGGATTCTGCCTTTTTAAATCCTACATACAGTATGTAATTT  700
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AATGGGGTTTGGATTCTGCCTTTTTAAATCCTACATACAGTATGTAATTT  700

seq1  CCAAGTTGTAAATATTAACATTATATCTAATCACATAGAACATTTTAAAA  750
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCAAGTTGTAAATATTAACATTATATCTAATCACATAGAACATTTTAAAA  750

seq1  TGCATGTGGTTGAATCTGATGCATCAT-GGTTGTTTTGTTGTTTACCAAC  799
      ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||
seq2  TGCATGTGGTTGAATCTGATGCATCATGGGTTGTTTTGTTGTTTACCAAC  800

seq1  ATTTTTTTAAAGGACATAGGCAGAATTTTGAAGTAACATGACAAACTAGA  849
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATTTTTTTAAAGGACATAGGCAGAATTTTGAAGTAACATGACAAACTAGA  850

seq1  AGCTTCCTACATGTCTCCTTATAAATAAGTCAGAATAAGGAGAAATGGAT  899
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGCTTCCTACATGTCTCCTTATAAATAAGTCAGAATAAGGAGAAATGGAT  900

seq1  GCTATCCAATAGAGAACCATGGAAATCCATGTAATGATAGATGAGTTAAA  949
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GCTATCCAATAGAGAACCATGGAAATCCATGTAATGATAGATGAGTTAAA  950

seq1  AGCCTGTAGGAAAAGGTGGAGCATGCTGAAAAGTATTTAGCAGCAGCACA  999
      ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGCTTGTAGGAAAAGGTGGAGCATGCTGAAAAGTATTTAGCAGCAGCACA  1000

seq1  GCTTCCTGATAAGGAGACGGAAAGCAGAAGTTTCATTTTCTTAGGTACTT  1049
      |||||||||  ||   ||||||||||| || ||||||||||||| |||||
seq2  GCTTCCTGAATAGAGAACGGAAAGCAG-AGGTTCATTTTCTTAGTTACTT  1049

seq1  TTATATATCCCGTGTCTTAATTAAAAAAAATTTTAAGGTCAAAATGAGTA  1099
      ||||   ||||||||||||||||||| ||||||| |||||| |   ||||
seq2  TTATTATTCCCGTGTCTTAATTAAAAGAAATTTT-AGGTCAGATGAAGTA  1098

seq1  TT-GCCCTAAAATTTAAAGA  1118
      || ||||  |||| ||||||
seq2  TTGGCCCCTAAATGTAAAGA  1118