BAC Information

Click to search

BAC

Clone NameB6Ng01-115D04
Chromosome15 (Build37)
Map Location 56,394,387 - 56,495,617
singlet/doubletdoublet
Overlap genenone
Upstream geneMtbp, Sntb1, LOC665348, LOC100039908, Hba-ps3
Downstream geneHas2, EG594843, LOC435442, LOC100040067, LOC100039984, BC026439
LinkOpen Mouse BAC browser



BAC End Information

BAC end BAC-end 1BAC-end 2
end nameB6Ng01-115D04.bB6Ng01-115D04.g
ACCDH920524DH920525
length1,1521,153
definitionDH920524|Mus musculus domesticus DNA, BAC clone: B6Ng01-115D04, 5' end.DH920525|Mus musculus domesticus DNA, BAC clone: B6Ng01-115D04, 3' end.
singlet/doubletdoubletdoublet
BLAST hituniqueunique
Map location.(56,494,462 - 56,495,617)(56,394,387 - 56,395,554)
sequence
gaattccagaataaaactcagtgctcacaagcttgtatctgacaaaataa
gtgtatcaggatagccaaaaacactggaatgttgggaagaaggatgtgat
gttgatgcccagtggattggagttctcattccactccacggatccacttc
ttattcaacactccagttgtttcagttagaagagtataatgatgcccctg
cagccacctgtgtaggggtgttaatagatctttaaaaatgaaaactgaaa
agaaaaccatttcaaattcagagaagctctgcagaattgttttgctctta
ttatttatgaacattgggtgaccctcaaattttccccatgatagagaaat
gtgtggccttccatcttcctgcactcctcttcttacccttattgtgactg
tcctgggccaagctcagcacagtgtgctcattgtcagagtcttctgcctc
ttattctctcttgctggtctttaaattttttatgaaacagtaaattggag
gacttgtcacccacctgcttagatgcatttatgcactattctgctcagga
taccatggaccatgaggcccaatacatttgccactctctcttttcatgac
tgcttgttaaacatacctcttctgtatttactacacactttgactatatt
tttctgttccttggccaaaacaaacttgttctttctcaggactataaaca
gttactatttactctgcccaaagcactcttctccaataagataccatggc
tgatttcttcttgtcatacagatcacctcctcaagagtcctttcatggct
gtgctgtggaatgggatcctctaatctcctccattaagtactatcacatt
caattacattattaaaacgtatttatcatgatcagagagtagaatatgta
tctatttacttgattggtgacccccttagtacaagggtcatacaaatcag
aaagcagaggcatactctatatctcagagccaaggaaatcactggcacac
agaaagtgctaacaaatatggctgaattcacataatatggtataatgcca
aatatcatcactttgcataatctagtagaaaatacctttagcatcattgg
atttccctttggcagatataacatcccataaattttgaaattaatatttt
aa
gaattccagatgtgcattgcctttcttgattatccctattactaccttga
gcatttcagctagggagttcttatttgctgaccccagtgtctcttcagtt
gagttaatcctgggaacccagacagagcactcagcatctgggaatcatgg
aaaaacctccagttagcttccccagggctatgatgggatgagaaacatct
gttacatctcttctacatatgatgggtttattttttgctttttgtattcg
taactcagcaaaatcttttcatgagtgcatcatcacaagcaaggtatgat
gaacatgtgacctcagggtgttagcaatcataaaagtgctacatagcatt
ccagccatttctctttcccattattgaaaaacacagtgaagatattgaaa
aaaaatgatcaatttagctctctgcaaaacactgctaaataaacaagcac
tctgtgttagtcgtttgaacaaaactttaggaaataaaagtatgtattgc
aacaggtgcaagggtgtgagaggcattgaagcattgatgtcactgcctca
agtcccataaaatagtagcatttggcaggggtctgtataaacccagtgag
gctcgccagaaaagtaaagtaacatgactggtaagttagaaaaccatatc
ctatcagaatttccctacattctatccaaaaacttctatgaaaccttggt
aacaggctgagtcaccacttaaaatttccttccaaaacaaaatgagaaac
tctaactttcccaccattgctctgtataaaagcagatagtgaagacacag
gtgccaattcttaaacatagataaatacaccacttttattttgtgctggt
cttttttcctggacctgtattccactagctattaggatgataataaggga
atatctgctgaagggctattgaaaatgaattacaggttaaagagcttgtc
tatcttgtgagtgagaggctctggttacactgtgtaaatgtatgcatggt
aaacttccatgattgcaattggtatcatgttagtttcaaactaaatatta
cctcaccatagagtgagtaagtcagtgaaaatcagctcataactaagatg
atgcttaatcagaataaatgaatgagagcatagtcatcaattttgactct
ttt
quality valuesOpen.Open.




Alignment Information

BAC End 1BAC End 2
seq1: chr15_56494462_56495617
seq2: B6Ng01-115D04.b_50_1201 (reverse)

seq1  TTAAAAT-----TTTCAAAGGGTTTATGGGAATGTTATTATCTGGCAAAG  45
      |||||||     |||||||   |||||||| |||||| |||||| |||| 
seq2  TTAAAATATTAATTTCAAA--ATTTATGGG-ATGTTA-TATCTGCCAAA-  45

seq1  GGGAAATCCAATGATGCTATAGGTATTTTCCTACTAGATTTATGCAAAGT  95
      ||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||| |||||||||| 
seq2  GGGAAATCCAATGATGCTAAAGGTATTTT-CTACTAGA-TTATGCAAAG-  92

seq1  TGATGATATTTGGCATTATACCATATTATGTGAATTCAGCCATATTTGTT  145
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGATGATATTTGGCATTATACCATATTATGTGAATTCAGCCATATTTGTT  142

seq1  AGCACTTTCTGTGTGCCTAGTGATTTCCTTGGCTCTGAGATATAGAGTAT  195
      ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGCACTTTCTGTGTGCC-AGTGATTTCCTTGGCTCTGAGATATAGAGTAT  191

seq1  GCCTCTGCTTTCTGATTTGTATGACCCTTGTACTAAGGGGGTCACCAATC  245
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GCCTCTGCTTTCTGATTTGTATGACCCTTGTACTAAGGGGGTCACCAATC  241

seq1  AAGTAAATAGATACATATTCTACTCTCTGATCATGATAAATACGTTTTAA  295
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAGTAAATAGATACATATTCTACTCTCTGATCATGATAAATACGTTTTAA  291

seq1  TAATGTAATTGAATGTGATAGTACTTAATGGAGGAGATTAGAGGATCCCA  345
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TAATGTAATTGAATGTGATAGTACTTAATGGAGGAGATTAGAGGATCCCA  341

seq1  TTCCACAGCACAGCCATGAAAGGACTCTTGAGGAGGTGATCTGTATGACA  395
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTCCACAGCACAGCCATGAAAGGACTCTTGAGGAGGTGATCTGTATGACA  391

seq1  AGAAGAAATCAGCCATGGTATCTTATTGGAGAAGAGTGCTTTGGGCAGAG  445
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGAAGAAATCAGCCATGGTATCTTATTGGAGAAGAGTGCTTTGGGCAGAG  441

seq1  TAAATAGTAACTGTTTATAGTCCTGAGAAAGAACAAGTTTGTTTTGGCCA  495
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TAAATAGTAACTGTTTATAGTCCTGAGAAAGAACAAGTTTGTTTTGGCCA  491

seq1  AGGAACAGAAAAATATAGTCAAAGTGTGTAGTAAATACAGAAGAGGTATG  545
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGGAACAGAAAAATATAGTCAAAGTGTGTAGTAAATACAGAAGAGGTATG  541

seq1  TTTAACAAGCAGTCATGAAAAGAGAGAGTGGCAAATGTATTGGGCCTCAT  595
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTTAACAAGCAGTCATGAAAAGAGAGAGTGGCAAATGTATTGGGCCTCAT  591

seq1  GGTCCATGGTATCCTGAGCAGAATAGTGCATAAATGCATCTAAGCAGGTG  645
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGTCCATGGTATCCTGAGCAGAATAGTGCATAAATGCATCTAAGCAGGTG  641

seq1  GGTGACAAGTCCTCCAATTTACTGTTTCATAAAAAATTTAAAGACCAGCA  695
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGTGACAAGTCCTCCAATTTACTGTTTCATAAAAAATTTAAAGACCAGCA  691

seq1  AGAGAGAATAAGAGGCAGAAGACTCTGACAATGAGCACACTGTGCTGAGC  745
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGAGAGAATAAGAGGCAGAAGACTCTGACAATGAGCACACTGTGCTGAGC  741

seq1  TTGGCCCAGGACAGTCACAATAAGGGTAAGAAGAGGAGTGCAGGAAGATG  795
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTGGCCCAGGACAGTCACAATAAGGGTAAGAAGAGGAGTGCAGGAAGATG  791

seq1  GAAGGCCACACATTTCTCTATCATGGGGAAAATTTGAGGGTCACCCAATG  845
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAAGGCCACACATTTCTCTATCATGGGGAAAATTTGAGGGTCACCCAATG  841

seq1  TTCATAAATAATAAGAGCAAAACAATTCTGCAGAGCTTCTCTGAATTTGA  895
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTCATAAATAATAAGAGCAAAACAATTCTGCAGAGCTTCTCTGAATTTGA  891

seq1  AATGGTTTTCTTTTCAGTTTTCATTTTTAAAGATCTATTAACACCCCTAC  945
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AATGGTTTTCTTTTCAGTTTTCATTTTTAAAGATCTATTAACACCCCTAC  941

seq1  ACAGGTGGCTGCAGGGGCATCATTATACTCTTCTAACTGAAACAACTGGA  995
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACAGGTGGCTGCAGGGGCATCATTATACTCTTCTAACTGAAACAACTGGA  991

seq1  GTGTTGAATAAGAAGTGGATCCGTGGAGTGGAATGAGAACTCCAATCCAC  1045
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTGTTGAATAAGAAGTGGATCCGTGGAGTGGAATGAGAACTCCAATCCAC  1041

seq1  TGGGCATCAACATCACATCCTTCTTCCCAACATTCCAGTGTTTTTGGCTA  1095
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGGGCATCAACATCACATCCTTCTTCCCAACATTCCAGTGTTTTTGGCTA  1091

seq1  TCCTGATACACTTATTTTGTCAGATACAAGCTTGTGAGCACTGAGTTTTA  1145
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCCTGATACACTTATTTTGTCAGATACAAGCTTGTGAGCACTGAGTTTTA  1141

seq1  TTCTGGAATTC  1156
      |||||||||||
seq2  TTCTGGAATTC  1152

seq1: chr15_56394387_56395554
seq2: B6Ng01-115D04.g_68_1220

seq1  GAATTCCAGATGTGCATTGCCTTTCTTGATTATCCCTATTACTACCTTGA  50
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAATTCCAGATGTGCATTGCCTTTCTTGATTATCCCTATTACTACCTTGA  50

seq1  GCATTTCAGCTAGGGAGTTCTTATTTGCTGACCCCAGTGTCTCTTCAGTT  100
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GCATTTCAGCTAGGGAGTTCTTATTTGCTGACCCCAGTGTCTCTTCAGTT  100

seq1  GAGTTAATCCTGGGAACCCAGACAGAGCACTCAGCATCTGGGAATCATGG  150
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAGTTAATCCTGGGAACCCAGACAGAGCACTCAGCATCTGGGAATCATGG  150

seq1  AAAAACCTCCAGTTAGCTTCCCCAGGGCTATGATGGGATGAGAAACATCT  200
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAAAACCTCCAGTTAGCTTCCCCAGGGCTATGATGGGATGAGAAACATCT  200

seq1  GTTACATCTCTTCTACATATGATGGGTTTATTTTTTGCTTTTTGTATTCG  250
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTTACATCTCTTCTACATATGATGGGTTTATTTTTTGCTTTTTGTATTCG  250

seq1  TAACTCAGCAAAATCTTTTCATGAGTGCATCATCACAAGCAAGGTATGAT  300
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TAACTCAGCAAAATCTTTTCATGAGTGCATCATCACAAGCAAGGTATGAT  300

seq1  GAACATGTGACCTCAGGGTGTTAGCAATCATAAAAGTGCTACATAGCATT  350
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAACATGTGACCTCAGGGTGTTAGCAATCATAAAAGTGCTACATAGCATT  350

seq1  CCAGCCATTTCTCTTTCCCATTATTGAAAAACACAGTGAAGATATTGAAA  400
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCAGCCATTTCTCTTTCCCATTATTGAAAAACACAGTGAAGATATTGAAA  400

seq1  AAAAATGATCAATTTAGCTCTCTGCAAAACACTGCTAAATAAACAAGCAC  450
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAAAATGATCAATTTAGCTCTCTGCAAAACACTGCTAAATAAACAAGCAC  450

seq1  TCTGTGTTAGTCGTTTGAACAAAACTTTAGGAAATAAAAGTATGTATTGC  500
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCTGTGTTAGTCGTTTGAACAAAACTTTAGGAAATAAAAGTATGTATTGC  500

seq1  AACAGGTGCAAGGGTGTGAGAGGCATTGAAGCATTGATGTCACTGCCTCA  550
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AACAGGTGCAAGGGTGTGAGAGGCATTGAAGCATTGATGTCACTGCCTCA  550

seq1  AGTCCCATAAAATAGTAGCATTTGGCAGGGGTCTGTATAAACCCAGTGAG  600
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGTCCCATAAAATAGTAGCATTTGGCAGGGGTCTGTATAAACCCAGTGAG  600

seq1  GCTCGCCAGAAAAGTAAAGTAACATGACTGGTAAGTTAGAAAACCATATC  650
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GCTCGCCAGAAAAGTAAAGTAACATGACTGGTAAGTTAGAAAACCATATC  650

seq1  CTATCAGAATTTCCCTACATTCTATCCAAAAACTTCTATGAAACCTTGGT  700
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTATCAGAATTTCCCTACATTCTATCCAAAAACTTCTATGAAACCTTGGT  700

seq1  AACAGGCTGAGTCACCACTTAAAATTTCCTTCCAAAACAAAATGAGAAAC  750
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AACAGGCTGAGTCACCACTTAAAATTTCCTTCCAAAACAAAATGAGAAAC  750

seq1  TCTAACTTTCCCACCATTGCTCTGTATAAAAGCAGATAGTGAAGACACAG  800
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCTAACTTTCCCACCATTGCTCTGTATAAAAGCAGATAGTGAAGACACAG  800

seq1  GTGCCAATTCTTAAACATAGATAAATACACCACTTTTATTTTGTGCTGGT  850
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTGCCAATTCTTAAACATAGATAAATACACCACTTTTATTTTGTGCTGGT  850

seq1  CTTTTTTCCTGGACCTGTATTCCACTAGGCTATTAGGATGATAATAAGGG  900
      ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||
seq2  CTTTTTTCCTGGACCTGTATTCCACTA-GCTATTAGGATGATAATAAGGG  899

seq1  AATATCTGCTGAAGGGCTATTGAAAATGAATTACAGGTTAAAGAGCTTGT  950
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AATATCTGCTGAAGGGCTATTGAAAATGAATTACAGGTTAAAGAGCTTGT  949

seq1  CTATCTTGTGAGTGAAGAGGCTCTGGTTACACTGTGTAAATGTATGCATG  1000
      |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTATCTTGTGAGTG-AGAGGCTCTGGTTACACTGTGTAAATGTATGCATG  998

seq1  GTAAACTTCCATGATTGCAAATTGGTATTCATGTTAGTTTCAAACTAAAA  1050
      |||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||| |||
seq2  GTAAACTTCCATGATTGC-AATTGGTA-TCATGTTAGTTTCAAACT-AAA  1045

seq1  TATTACCTCACCATAGAGTGAGTTAAGTCAGTGAAAAATCAGCTCATAAC  1100
      |||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||
seq2  TATTACCTCACCATAGAGTGAG-TAAGTCAGTG-AAAATCAGCTCATAAC  1093

seq1  TAAGATGAATGGCTTTAATCAGGGATTAAATGACATGAGAGCCATAGTCA  1150
      ||||||| |||   |||||||  || ||||||| ||||||| ||||||||
seq2  TAAGATG-ATG--CTTAATCA--GAATAAATGA-ATGAGAG-CATAGTCA  1136

seq1  TCAAATCTTGACTCTTTT  1168
      || ||| |||||||||||
seq2  TC-AATTTTGACTCTTTT  1153