BAC Information

Click to search

BAC

Clone NameB6Ng01-131I20
Chromosome15 (Build37)
Map Location 26,398,386 - 26,557,508
singlet/doubletdoublet
Overlap geneFbxl7
Upstream geneMyo10, LOC100040602, Ppia-ps15_175.1, 1810015C04Rik, Zfp622, AK162044
Downstream geneLOC622531, LOC625311, Ank, BC087945
LinkOpen Mouse BAC browser



BAC End Information

BAC end BAC-end 1BAC-end 2
end nameB6Ng01-131I20.bB6Ng01-131I20.g
ACCDH932582DH932583
length1,1341,097
definitionDH932582|Mus musculus domesticus DNA, BAC clone: B6Ng01-131I20, 5' end.DH932583|Mus musculus domesticus DNA, BAC clone: B6Ng01-131I20, 3' end.
singlet/doubletdoubletdoublet
BLAST hituniqueunique
Map location.(26,556,363 - 26,557,508)(26,398,386 - 26,399,486)
sequence
gaattctatgaatacatatttatgtgtgaaaagtactgttggattctcac
tagtgagatgcaaattttctgcatctatgccaaggctttgatataaaagc
acgattaaaataagtttgggtaccaagcaatgtttgcatcttcaaacgtg
ctgttgtaatagaaaacgtgacccacccattatattttatctcattgtta
gaaagcattccaaatttaattggtgggaataaatgaccagaataagttgc
tttgtaatttgtctaatcctatagtacgttctgaccttgggtgtaggaga
catgaccatcccccacccataaggaccttgagttttcaaatccagtgaac
acacagctaatttgatagttttagctttgtgtggtaagcactaaattagg
ctgagctaacaataaactgttgcatatgatagtacttggtgatgttaggc
tgtggtcctttcttggatttagtatcctcatctataaaagaagctgtttt
tcaatttttttattgctattgcattggcaaatacccaagtatttctaaaa
attcattggattctttataatattgatgcacattttatatgctgccttaa
tctcaaagttgattcaatttttttgtagtgctatgattcatgttttttat
gtaaagacactaaagttgacaatctctacaaaagctcctattttgacagt
catattgagaatttcatcagaaagaaaaaggcagctcttaatcaagtctt
tgtttaaaaaaaaaatctaaaagaacaatcatatcctagtgtcttcaaaa
ggtgtaactgcttcttagagaccatgaaatgtatgtgatcaaaggaaagt
gcctatgggttttggatctacaatgagaaagcaccacatctcctgttagg
gaggtttaggaaggtaaactccaccctttgtggcagactgatgggagaaa
gtactgagacttactaatggtagatggatgagtcccacgtagcagaaggt
aagtcttcaaaggcaataatactatagggatctttcctaataatctgtta
aggtttttaaactttgtttttctcttgtatctgattcgccatgcacaaca
gctcaacattttttttccagctcagtataagaat
gaattcctatttcccttaactgcacactcgtggggtttgatgtcatgaca
tgaaggaaaaaaattctctgcacttagagaagacagctaagaaagcctca
ttggaaatctcattgagtagaactccttgattcatctctgcactcccata
gctcacattacagaaacgtgagcctgcaacaagctatagtttgatgagaa
agatcaatgcttacttatttattagaggagaggtgcactatgtaactgta
aagagatagatattctgacaggccaatgggcagatcctttgctttcttgt
aggtgacatctttggagtggagttccctgtagtggggtctaacaggctct
gtgactagaacactgattctttttccaaagagcacaatttggtcaacaga
agttgactatcttagacttcaaagttttgccatgtatggtgatgcacatc
tttaagccaagtattcaggaggatttctgtgagtttgaggccatgctgat
ctacatagcaagttccaggacagtcagaactgcacagagaggcctagtct
aaaagcaaacaaacaaataaacaacaaaatttaaaggccagctgtgagca
tgcatttctctttggatagaaattggacctgctttggaacaaaactttgg
cctatcttcttgcagaatcctattcagtgaaccactgtttgcactgagtg
atggcttgctaaatgtgtgtgctgtgtgagaagtctaagacagataaaaa
tgttctcagggtcgagtcatgtgtttatcataaatatctccatgattatg
atgccaatcacaatggcttaaacactgcatcttaaaatctacataaacat
ccatgagagtgggtccagcttattgaaaaatgacaagcaaatcatatgga
ccctaagtagtctctagctcagggtccagtaactaaaattctcccattaa
aatttattttgctgaataatttcctcgcttctgtaattttaattctacaa
tacaaaaatattgtctatacctccattatgctatctataattcattagca
aatggaagtgaaatttttccaattcaaatatttaaggaatgagatga
quality valuesOpen.Open.




Alignment Information

BAC End 1BAC End 2
seq1: chr15_26556363_26557508
seq2: B6Ng01-131I20.b_46_1179 (reverse)

seq1  ATTCTTATTACTGAGCTGGAAAAAAAAATGTTTGAGCTTGTTGTGCATGA  50
      ||||||| ||||||||||| |||||||||| |||||| ||||||||||| 
seq2  ATTCTTA-TACTGAGCTGG-AAAAAAAATG-TTGAGC-TGTTGTGCATGG  46

seq1  CGAATTCAGATACAAGAG-AAAACATAGTTTAAAAAAACCTTAACAGATT  99
      |||| ||||||||||||| |||||| |||||  ||||||||||||||| |
seq2  CGAA-TCAGATACAAGAGAAAAACAAAGTTT--AAAAACCTTAACAGA-T  92

seq1  TATTAGGAAAGATCCCTATAGTATTATTTGCCTTTGAAGACTTACCTTTC  149
      |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||
seq2  TATTAGGAAAGATCCCTATAGTATTA-TTGCCTTTGAAGACTTACC-TTC  140

seq1  TGCTACGTGGGACTCATCCATCTACCATTAGTAAGTCTCCAGTACTTTCT  199
      |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||
seq2  TGCTACGTGGGACTCATCCATCTACCATTAGTAAGTCT-CAGTACTTTCT  189

seq1  CCCATCAGTCTTGCCACAAAGGGTGGAGTTTACCTTCCTAAACCTCCCTA  249
      |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCCATCAGTC-TGCCACAAAGGGTGGAGTTTACCTTCCTAAACCTCCCTA  238

seq1  ACAGGAGATGTGGTGCTTTCTCATTGTAGATCCAAAAACCATAGGCACTT  299
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||
seq2  ACAGGAGATGTGGTGCTTTCTCATTGTAGATCCAAAACCCATAGGCACTT  288

seq1  TCCTTTTGATCACATACATTTCATGGTCTCTAAGAAGCAGTTACACCTTT  349
      ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCC-TTTGATCACATACATTTCATGGTCTCTAAGAAGCAGTTACACCTTT  337

seq1  TGAAGACACTAGGATATGATTGTTCTTTTAGATTTTTTTTTTAAACAAAG  399
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGAAGACACTAGGATATGATTGTTCTTTTAGATTTTTTTTTTAAACAAAG  387

seq1  ACTTGATTAAGAGCTGCCTTTTTCTTTCTGATGAAATTCTCAATATGACT  449
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACTTGATTAAGAGCTGCCTTTTTCTTTCTGATGAAATTCTCAATATGACT  437

seq1  GTCAAAATAGGAGCTTTTGTAGAGATTGTCAACTTTAGTGTCTTTACATA  499
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTCAAAATAGGAGCTTTTGTAGAGATTGTCAACTTTAGTGTCTTTACATA  487

seq1  AAAAACATGAATCATAGCACTACAAAAAAATTGAATCAACTTTGAGATTA  549
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAAAACATGAATCATAGCACTACAAAAAAATTGAATCAACTTTGAGATTA  537

seq1  AGGCAGCATATAAAATGTGCATCAATATTATAAAGAATCCAATGAATTTT  599
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGGCAGCATATAAAATGTGCATCAATATTATAAAGAATCCAATGAATTTT  587

seq1  TAGAAATACTTGGGTATTTGCCAATGCAATAGCAATAAAAAAATTGAAAA  649
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TAGAAATACTTGGGTATTTGCCAATGCAATAGCAATAAAAAAATTGAAAA  637

seq1  ACAGCTTCTTTTATAGATGAGGATACTAAATCCAAGAAAGGACCACAGCC  699
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACAGCTTCTTTTATAGATGAGGATACTAAATCCAAGAAAGGACCACAGCC  687

seq1  TAACATCACCAAGTACTATCATATGCAACAGTTTATTGTTAGCTCAGCCT  749
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TAACATCACCAAGTACTATCATATGCAACAGTTTATTGTTAGCTCAGCCT  737

seq1  AATTTAGTGCTTACCACACAAAGCTAAAACTATCAAATTAGCTGTGTGTT  799
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AATTTAGTGCTTACCACACAAAGCTAAAACTATCAAATTAGCTGTGTGTT  787

seq1  CACTGGATTTGAAAACTCAAGGTCCTTATGGGTGGGGGATGGTCATGTCT  849
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CACTGGATTTGAAAACTCAAGGTCCTTATGGGTGGGGGATGGTCATGTCT  837

seq1  CCTACACCCAAGGTCAGAACGTACTATAGGATTAGACAAATTACAAAGCA  899
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCTACACCCAAGGTCAGAACGTACTATAGGATTAGACAAATTACAAAGCA  887

seq1  ACTTATTCTGGTCATTTATTCCCACCAATTAAATTTGGAATGCTTTCTAA  949
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACTTATTCTGGTCATTTATTCCCACCAATTAAATTTGGAATGCTTTCTAA  937

seq1  CAATGAGATAAAATATAATGGGTGGGTCACGTTTTCTATTACAACAGCAC  999
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CAATGAGATAAAATATAATGGGTGGGTCACGTTTTCTATTACAACAGCAC  987

seq1  GTTTGAAGATGCAAACATTGCTTGGTACCCAAACTTATTTTAATCGTGCT  1049
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTTTGAAGATGCAAACATTGCTTGGTACCCAAACTTATTTTAATCGTGCT  1037

seq1  TTTATATCAAAGCCTTGGCATAGATGCAGAAAATTTGCATCTCACTAGTG  1099
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTTATATCAAAGCCTTGGCATAGATGCAGAAAATTTGCATCTCACTAGTG  1087

seq1  AGAATCCAACAGTACTTTTCACACATAAATATGTATTCATAGAATTC  1146
      |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGAATCCAACAGTACTTTTCACACATAAATATGTATTCATAGAATTC  1134

seq1: chr15_26398386_26399486
seq2: B6Ng01-131I20.g_69_1165

seq1  GAATTCCTATTTCCCTTAACTGCACACTCGTGGGGTTTGATGTCATGACA  50
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAATTCCTATTTCCCTTAACTGCACACTCGTGGGGTTTGATGTCATGACA  50

seq1  TGAAGGAAAAAAATTCTCTGCACTTAGAGAAGACAGCTAAGAAAGCCTCA  100
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGAAGGAAAAAAATTCTCTGCACTTAGAGAAGACAGCTAAGAAAGCCTCA  100

seq1  TTGGAAATCTCATTGAGTAGAACTCCTTGATTCATCTCTGCACTCCCATA  150
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTGGAAATCTCATTGAGTAGAACTCCTTGATTCATCTCTGCACTCCCATA  150

seq1  GCTCACATTACAGAAACGTGAGCCTGCAACAAGCTATAGTTTGATGAGAA  200
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GCTCACATTACAGAAACGTGAGCCTGCAACAAGCTATAGTTTGATGAGAA  200

seq1  AGATCAATGCTTACTTATTTATTAGAGGAGAGGTGCACTATGTAACTGTA  250
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGATCAATGCTTACTTATTTATTAGAGGAGAGGTGCACTATGTAACTGTA  250

seq1  AAGAGATAGATATTCTGACAGGCCAATGGGCAGATCCTTTGCTTTCTTGT  300
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAGAGATAGATATTCTGACAGGCCAATGGGCAGATCCTTTGCTTTCTTGT  300

seq1  AGGTGACATCTTTGGAGTGGAGTTCCCTGTAGTGGGGTCTAACAGGCTCT  350
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGGTGACATCTTTGGAGTGGAGTTCCCTGTAGTGGGGTCTAACAGGCTCT  350

seq1  GTGACTAGAACACTGATTCTTTTTCCAAAGAGCACAATTTGGTCAACAGA  400
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTGACTAGAACACTGATTCTTTTTCCAAAGAGCACAATTTGGTCAACAGA  400

seq1  AGTTGACTATCTTAGACTTCAAAGTTTTGCCATGTATGGTGATGCACATC  450
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGTTGACTATCTTAGACTTCAAAGTTTTGCCATGTATGGTGATGCACATC  450

seq1  TTTAAGCCAAGTATTCAGGAGGATTTCTGTGAGTTTGAGGCCATGCTGAT  500
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTTAAGCCAAGTATTCAGGAGGATTTCTGTGAGTTTGAGGCCATGCTGAT  500

seq1  CTACATAGCAAGTTCCAGGACAGTCAGAACTGCACAGAGAGGCCTAGTCT  550
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTACATAGCAAGTTCCAGGACAGTCAGAACTGCACAGAGAGGCCTAGTCT  550

seq1  AAAAGCAAACAAACAAATAAACAACAAAATTTAAAGGCCAGCTGTGAGCA  600
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAAAGCAAACAAACAAATAAACAACAAAATTTAAAGGCCAGCTGTGAGCA  600

seq1  TGCATTTCTCTTTGGATAGAAATTGGACCTGCTTTGGAACAAAACTTTGG  650
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGCATTTCTCTTTGGATAGAAATTGGACCTGCTTTGGAACAAAACTTTGG  650

seq1  CCTATCTTCTTGCAGAATCCTATTCAGTGAACCACTGTTTGCACTGAGTG  700
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCTATCTTCTTGCAGAATCCTATTCAGTGAACCACTGTTTGCACTGAGTG  700

seq1  ATGGCTTGCTAAATGTGTGTGCTGTGTGAGAAGTCTAAGACAGATAAAAA  750
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATGGCTTGCTAAATGTGTGTGCTGTGTGAGAAGTCTAAGACAGATAAAAA  750

seq1  TGTTCTCAGGGTCGAGTCATGTGTTTATCATAAATATCTCCATGATTATG  800
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGTTCTCAGGGTCGAGTCATGTGTTTATCATAAATATCTCCATGATTATG  800

seq1  ATGCCAATCACAATGGCTTAAACACTGCATCTTAAAATCTACATAAACAT  850
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATGCCAATCACAATGGCTTAAACACTGCATCTTAAAATCTACATAAACAT  850

seq1  CCATGAGAGTGGGTCCAGCTTATTGAAAAATGACAAGCAAATCATATGGA  900
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCATGAGAGTGGGTCCAGCTTATTGAAAAATGACAAGCAAATCATATGGA  900

seq1  CCCTAAGTAGTTCTCTAGCTCAGGGTCCAGTAACTAAAATTCTCCCATTA  950
      |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCCTAAGTAG-TCTCTAGCTCAGGGTCCAGTAACTAAAATTCTCCCATTA  949

seq1  AAATTTATTTTGCTGTAATAATTTCCTCCGTCTCTGTTAATTTTAATTTC  1000
      ||||||||||||||| ||||||||||| ||  |||| ||||||||| |||
seq2  AAATTTATTTTGCTG-AATAATTTCCT-CGCTTCTG-TAATTTTAA-TTC  995

seq1  TACAATACAAAAATATTGTCTATAC--TCATAATGCATATCTATAA-TCA  1047
      |||||||||||||||||||||||||   ||| |||| ||||||||| |||
seq2  TACAATACAAAAATATTGTCTATACCTCCATTATGC-TATCTATAATTCA  1044

seq1  TTAGCAAATGAAGGTGAAATTTTTCAAATATCAAAATATTAAAGG-ATGA  1096
      |||||||||| | |||||||||||| ||| || ||||||| |||| ||||
seq2  TTAGCAAATGGAAGTGAAATTTTTCCAAT-TC-AAATATTTAAGGAATGA  1092

seq1  GATGA  1101
      |||||
seq2  GATGA  1097