BAC Information

Click to search

BAC

Clone NameB6Ng01-132A17
Chromosome15 (Build37)
Map Location 68,607,601 - 68,731,964
singlet/doubletdoublet
Overlap geneEG633752
Upstream geneZfat1, LOC100041000, EG665945
Downstream geneKhdrbs3
LinkOpen Mouse BAC browser



BAC End Information

BAC end BAC-end 1BAC-end 2
end nameB6Ng01-132A17.bB6Ng01-132A17.g
ACCDH932952DH932953
length311987
definitionDH932952|Mus musculus domesticus DNA, BAC clone: B6Ng01-132A17, 5' end.DH932953|Mus musculus domesticus DNA, BAC clone: B6Ng01-132A17, 3' end.
singlet/doubletdoubletdoublet
BLAST hituniqueunique
Map location.(68,607,601 - 68,607,911)(68,730,983 - 68,731,964)
sequence
atcttcttcagagatgaacaccttagttgattatctaatatgaaatggcc
agccctgaaatcacatgcatctaagcaattccaaatgcactcggcatgtt
gtatttaaatataattatacatatgcatacatatacatgtatgtaatgta
tttgagaaggagtgaggggatcatcataggggttggtatgaggaagggag
atggtaacaatataattatatatgttcacttatgatatctaaaggggata
aattaagtaatgagttatcactttttaaaaaaccatctggaaaagtgtct
aagaaaagaga
gaattctttagcaaaaagcaatcaggtgaagggcatagactatagaacca
aagagaatcaaactgaatacctaccctagtatagtaatttcatttgtaaa
atagaaattatgagcccttcctggctaacttgttataaagattaaataag
atagtaatagacagaccttaccagtcttttgcaactctcccctcttgtac
agatatggatcatttgtttatatattcaacagataacactcattccaacc
cttaatacagacggactaaatttgattattctcatttttttctcctgaaa
gaagaccatacatcctaatcctgtctggatttttgggtgtgaaaccatat
agaacagagctgaatccaacctgtatcaatgcatgaagcatcacatgaca
ctgagaacagagatgaatccaacctgtatcagtgaatgaagcatcacatg
accctaagaacagagctgaatccaatttgtatcaatgaatgaagtatcac
atgacactggactttggggtcttatttttaacctcagctaattggatgtt
tctggtgtgaaatgagatgctgttttatgcctcatggaagttacacccag
gggaagtacagtttttagacaagttattataattaatgcaaacctcaaat
cctcccatgatacaaaaacaatgtacatgtatgcaaagagatttatttta
aggtcccagcctagaagattgtggtagcttgctgggtccacatttgacaa
aatagagacctaagaacgaactcaaattctagtccaaaggcaatcttctt
ctgatgtcagaagatgttgtttctgaattctgagggcacttgattggaga
attctctcttgcttgagagaagtgggtatattcccaaattacagcttcaa
gtggcgagagacgagagagagagagagagagagagagagagagagagaga
gagagagaggagagagtatgagagtgactgagagaga
quality valuesOpen.Open.




Alignment Information

BAC End 1BAC End 2
seq1: chr15_68607601_68607911
seq2: B6Ng01-132A17.b_51_361

seq1  ATCTTCTTCAGAGATGAACACCTTAGTTGATTATCTAATATGAAATGGCC  50
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATCTTCTTCAGAGATGAACACCTTAGTTGATTATCTAATATGAAATGGCC  50

seq1  AGCCCTGAAATCACATGCATCTAAGCAATTCCAAATGCACTCGGCATGTT  100
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGCCCTGAAATCACATGCATCTAAGCAATTCCAAATGCACTCGGCATGTT  100

seq1  GTATTTAAATATAATTATACATATGCATACATATACATGTATGTAATGTA  150
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTATTTAAATATAATTATACATATGCATACATATACATGTATGTAATGTA  150

seq1  TTTGAGAAGGAGTGAGGGGATCATCATAGGGGTTGGTATGAGGAAGGGAG  200
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTTGAGAAGGAGTGAGGGGATCATCATAGGGGTTGGTATGAGGAAGGGAG  200

seq1  ATGGTAACAATATAATTATATATGTTCACTTATGATATCTAAAGGGGATA  250
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATGGTAACAATATAATTATATATGTTCACTTATGATATCTAAAGGGGATA  250

seq1  AATTAAGTAATGAGTTATCACTTTTTAAAAAACCATCTGGAAAAGTGTCT  300
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AATTAAGTAATGAGTTATCACTTTTTAAAAAACCATCTGGAAAAGTGTCT  300

seq1  AAGAAAAGAGA  311
      |||||||||||
seq2  AAGAAAAGAGA  311

seq1: chr15_68730983_68731964
seq2: B6Ng01-132A17.g_67_1053 (reverse)

seq1  TCTCTCTCTGTCTCTCT----CTCTCT-CTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCT  45
      |||||||| ||| ||||    |||||| ||||||||||||||||||||||
seq2  TCTCTCTCAGTCACTCTCATACTCTCTCCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCT  50

seq1  CTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCT-GTCTCTCTGCCACTTGAAGCTGTAA  94
      |||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||
seq2  CTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCGTCTCTC-GCCACTTGAAGCTGTAA  99

seq1  TTTGGGAATATACCCACTTCTCTCAAGCAAGAGAGAATTCTCCAATCAAG  144
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTTGGGAATATACCCACTTCTCTCAAGCAAGAGAGAATTCTCCAATCAAG  149

seq1  TGCCCTCAGAATTCAGAAACAACATCTTCTGACATCAGAAGAAGATTGCC  194
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGCCCTCAGAATTCAGAAACAACATCTTCTGACATCAGAAGAAGATTGCC  199

seq1  TTTGGACTAGAATTTGAGTTCGTTCTTAGGTCTCTATTTTGTCAAATGTG  244
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTTGGACTAGAATTTGAGTTCGTTCTTAGGTCTCTATTTTGTCAAATGTG  249

seq1  GACCCAGCAAGCTACCACAATCTTCTAGGCTGGGACCTTAAAATAAATCT  294
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GACCCAGCAAGCTACCACAATCTTCTAGGCTGGGACCTTAAAATAAATCT  299

seq1  CTTTGCATACATGTACATTGTTTTTGTATCATGGGAGGATTTGAGGTTTG  344
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTTTGCATACATGTACATTGTTTTTGTATCATGGGAGGATTTGAGGTTTG  349

seq1  CATTAATTATAATAACTTGTCTAAAAACTGTACTTCCCCTGGGTGTAACT  394
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CATTAATTATAATAACTTGTCTAAAAACTGTACTTCCCCTGGGTGTAACT  399

seq1  TCCATGAGGCATAAAACAGCATCTCATTTCACACCAGAAACATCCAATTA  444
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCCATGAGGCATAAAACAGCATCTCATTTCACACCAGAAACATCCAATTA  449

seq1  GCTGAGGTTAAAAATAAGACCCCAAAGTCCAGTGTCATGTGATACTTCAT  494
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GCTGAGGTTAAAAATAAGACCCCAAAGTCCAGTGTCATGTGATACTTCAT  499

seq1  TCATTGATACAAATTGGATTCAGCTCTGTTCTTAGGGTCATGTGATGCTT  544
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCATTGATACAAATTGGATTCAGCTCTGTTCTTAGGGTCATGTGATGCTT  549

seq1  CATTCACTGATACAGGTTGGATTCATCTCTGTTCTCAGTGTCATGTGATG  594
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CATTCACTGATACAGGTTGGATTCATCTCTGTTCTCAGTGTCATGTGATG  599

seq1  CTTCATGCATTGATACAGGTTGGATTCAGCTCTGTTCTATATGGTTTCAC  644
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTTCATGCATTGATACAGGTTGGATTCAGCTCTGTTCTATATGGTTTCAC  649

seq1  ACCCAAAAATCCAGACAGGATTAGGATGTATGGTCTTCTTTCAGGAGAAA  694
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACCCAAAAATCCAGACAGGATTAGGATGTATGGTCTTCTTTCAGGAGAAA  699

seq1  AAAATGAGAATAATCAAATTTAGTCCGTCTGTATTAAGGGTTGGAATGAG  744
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAAATGAGAATAATCAAATTTAGTCCGTCTGTATTAAGGGTTGGAATGAG  749

seq1  TGTTATCTGTTGAATATATAAACAAATGATCCATATCTGTACAAGAGGGG  794
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGTTATCTGTTGAATATATAAACAAATGATCCATATCTGTACAAGAGGGG  799

seq1  AGAGTTGCAAAAGACTGGTAAGGTCTGTCTATTACTATCTTATTTAATCT  844
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGAGTTGCAAAAGACTGGTAAGGTCTGTCTATTACTATCTTATTTAATCT  849

seq1  TTATAACAAGTTAGCCAGGAAGGGCTCATAATTTCTATTTTACAAATGAA  894
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTATAACAAGTTAGCCAGGAAGGGCTCATAATTTCTATTTTACAAATGAA  899

seq1  ATTACTATACTAGGGTAGGTATTCAGTTTGATTCTCTTTGGTTCTATAGT  944
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATTACTATACTAGGGTAGGTATTCAGTTTGATTCTCTTTGGTTCTATAGT  949

seq1  CTATGCCCTTCACCTGATTGCTTTTTGCTAAAGAATTC  982
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTATGCCCTTCACCTGATTGCTTTTTGCTAAAGAATTC  987