BAC Information

Click to search

BAC

Clone NameB6Ng01-136H14
Chromosome15 (Build37)
Map Location 63,972,482 - 64,098,816
singlet/doubletdoublet
Overlap geneDdef1
Upstream geneEG239502, EG432959, LOC672194, Mlze, AI987692, Gsdmdc2, 9930109F21Rik, LOC665769, 9030605I04Rik, 4933426G20Rik, 0910001A06Rik
Downstream geneAdcy8, LOC268812, LOC100040790, LOC665836
LinkOpen Mouse BAC browser



BAC End Information

BAC end BAC-end 1BAC-end 2
end nameB6Ng01-136H14.bB6Ng01-136H14.g
ACCDH936238DH936239
length1,1791,154
definitionDH936238|Mus musculus domesticus DNA, BAC clone: B6Ng01-136H14, 5' end.DH936239|Mus musculus domesticus DNA, BAC clone: B6Ng01-136H14, 3' end.
singlet/doubletdoubletdoublet
BLAST hituniqueunique
Map location.(64,097,637 - 64,098,816)(63,972,482 - 63,973,646)
sequence
ttgtcttcctctgcatactgctaaaatagtttgagcagctcatggtggaa
agtcatgggcgttttagttcatgcagaacgtagacactgtttaaggtaaa
actgcttaggtgttgattattctgggttgttagcttttggcattgaaggt
aaatttttctttagctgaaacctcttgatgtcctgttaggacgttgagta
caattgttctgcttccaaaagaagtgtcagtgtccctgttgtagctgctt
gctttgacatttaactggagttccagactaccacaaggccaggctatggc
tgcagataactatagaaattttgcatgaagtgttcctttaaaactgttag
tttctctgacccattattgcaaattgaaatagcagtttcctttttaatgc
aggagatggggaaggagaactaaatttacatatgatctcttaaagggcaa
caaagatagagaaggaagtggtcctttaaaacatttccatataaggtcac
tttgtttcggtgaaaacaatggatatgtgtgagagcagtatctcatcaga
acatacttagttttggtcactgggttgctatggattttagtcacttggtc
cttcagaccacttgcctcctttcccaaaatgtactacatctccaagagaa
tttggttaatgaagacgcattcctggttcttgcatgaaaacctattagac
tcttaagggaggccaggcatgctggcagaactttaatccccagcacttga
ggaggcagaggcaggatctacagttccaggccagactggtctacagagag
agttacaggataattagggatccacataaaactctgctttgaaaacccag
aaagaaactctaaaggagagattcaaaacacagtgtccatgcctgcccag
gatgtgttctttctaagcaggcatgtgcttgctctctggctgaccttcgt
gactgggacactgctgtaattggatcaaatgtacgggacaccttacattt
gatgtctcctgggctgctcttccctagtcctctctagttgagtaacagag
acaaactcatgtccagaatcctgggatctgactgaaaagctgaacctact
tgaaggatgttcaggctagcttgtctctcaatggtaacctgggcatctgc
ttcaagccagacagattgagattcagatg
gaattcagtattagctgcgcatagacaagtcagccagcgtcctctcttct
cattgctaagtactcactggcttcaaagtatctgctggacagcttcacat
aagggctgaacccgtttactccactagcaataatacttgggtgatattta
tcctacagaatggtcaggctgcggcgtcaacacgaacctcaagtgacagg
gacacatcctgcctataccacacatattctcccccaggctgaactgcaat
aggtgtagcaaacaaagcagctgctacccaatgctgagcagagggacatg
agaaaaaggcttagggacggacgggcctggggaatgttctactcaagtcc
gaagagctttagcagaagcacagaaattagcaataatggtaattctagct
gtttgtttaagttacgaaatttcaaaaccactcttgacatttagactaaa
ttataggtatattgatgaaagacgacaatctttccacagattaaaatgag
agcaaaactaaacaacttggcccagctgcatcgtggtggggcagtccagg
aagtaaagtatgtatatactgtccccttcccactcgaacccctccacatc
tttctttccggtgtctagaggccgtggttcctgagccagcagccttcctc
tcacacaagccgcccatctctatggctgttttcctttcaaacaatggtgt
gcttcgtgcttactaaactatgccatgtatacagcaagcactcaaatatc
aatcaaagtcctaccttccaagaacacagtaaatacttcctgtacattcg
aagaaatgcttttagtttcctttactagacaacatgagggagagagatgc
taatgaccttccccagcatgctgagtaagccagtggctgaggggaccaga
gcccccactcttccctacaccaccgtgcaggccagcaggaaaaggcagaa
atagcggcagccctcaggagtggctgcgtatctgattccacccaaattcc
taagtcagctggatgaagagacattcagagtgaaatagttcttcattcat
ttggttactaaagtctcacgtctttaagtggctcgtgaaagcaccgctgt
accagctctaagaaggctgaataatctgaagcccgttctggcgctgttca
ggag
quality valuesOpen.Open.




Alignment Information

BAC End 1BAC End 2
seq1: chr15_64097637_64098816
seq2: B6Ng01-136H14.b_55_1233 (reverse)

seq1  CATCTGAATCTCAATCTGTCTGTGCCTGAAGCAGATGCCCAGCT--ACAC  48
      |||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||| |   || 
seq2  CATCTGAATCTCAATCTGTCTG-GCTTGAAGCAGATGCCCAGGTTACCAT  49

seq1  TG-GAGACAAGGCCTAGCCCTGACATCCTTC-AGTA-GTTCAGCTTTTCA  95
      || ||||||||  ||||||   ||||||||| |||| |||||||||||||
seq2  TGAGAGACAAG--CTAGCCTGAACATCCTTCAAGTAGGTTCAGCTTTTCA  97

seq1  GTCAGATCCCAGGATTCTGGACATGGGTTTGTCTCTGTTACTCAACTAGA  145
      ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||
seq2  GTCAGATCCCAGGATTCTGGACATGAGTTTGTCTCTGTTACTCAACTAGA  147

seq1  GA-GACTAGGGAAGGAGCAGCCCAGGAGAACATCAAATGTTAGGTGTCCC  194
      || |||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| |||||||||
seq2  GAGGACTAGGGAA-GAGCAGCCCAGGAG-ACATCAAATGTAAGGTGTCCC  195

seq1  GTACATTTGATCCAATTACAGCAGTGTCCCAGTCACGAAGGTCAGCCAGA  244
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTACATTTGATCCAATTACAGCAGTGTCCCAGTCACGAAGGTCAGCCAGA  245

seq1  GAGCAAGCACATGCCTGCTTAGAAAGAACACATCCTGGGCAGGCATGGAC  294
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAGCAAGCACATGCCTGCTTAGAAAGAACACATCCTGGGCAGGCATGGAC  295

seq1  ACTGTGTTTTGAATCTTCTCCTTTAGAGTTTCTTTTCTGGGTTTTCAAAG  344
      ||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||
seq2  ACTGTGTTTTGAATC-TCTCCTTTAGAGTTTC-TTTCTGGGTTTTCAAAG  343

seq1  CAGGGTTTTATGTGGATCCCTAATTATCCTGTAACTCTCTCTGTAGACCA  394
      ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CAGAGTTTTATGTGGATCCCTAATTATCCTGTAACTCTCTCTGTAGACCA  393

seq1  GTCTGGCCTGGAACTGTAGATCCTGCCTCTGCCTCCTCAAGTGCTGGGGA  444
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTCTGGCCTGGAACTGTAGATCCTGCCTCTGCCTCCTCAAGTGCTGGGGA  443

seq1  TTAAAGTTCTGCCAGCATGCCTGGCCTCCCTTAAGAGTCTAATAGGTTTT  494
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTAAAGTTCTGCCAGCATGCCTGGCCTCCCTTAAGAGTCTAATAGGTTTT  493

seq1  CATGCAAGAACCAGGAATGCGTCTTCATTAACCAAATTCTCTTGGAGATG  544
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CATGCAAGAACCAGGAATGCGTCTTCATTAACCAAATTCTCTTGGAGATG  543

seq1  TAGTACATTTTGGGAAAGGAGGCAAGTGGTCTGAAGGACCAAGTGACTAA  594
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TAGTACATTTTGGGAAAGGAGGCAAGTGGTCTGAAGGACCAAGTGACTAA  593

seq1  AATCCATAGCAACCCAGTGACCAAAACTAAGTATGTTCTGATGAGATACT  644
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AATCCATAGCAACCCAGTGACCAAAACTAAGTATGTTCTGATGAGATACT  643

seq1  GCTCTCACACATATCCATTGTTTTCACCGAAACAAAGTGACCTTATATGG  694
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GCTCTCACACATATCCATTGTTTTCACCGAAACAAAGTGACCTTATATGG  693

seq1  AAATGTTTTAAAGGACCACTTCCTTCTCTATCTTTGTTGCCCTTTAAGAG  744
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAATGTTTTAAAGGACCACTTCCTTCTCTATCTTTGTTGCCCTTTAAGAG  743

seq1  ATCATATGTAAATTTAGTTCTCCTTCCCCATCTCCTGCATTAAAAAGGAA  794
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATCATATGTAAATTTAGTTCTCCTTCCCCATCTCCTGCATTAAAAAGGAA  793

seq1  ACTGCTATTTCAATTTGCAATAATGGGTCAGAGAAACTAACAGTTTTAAA  844
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACTGCTATTTCAATTTGCAATAATGGGTCAGAGAAACTAACAGTTTTAAA  843

seq1  GGAACACTTCATGCAAAATTTCTATAGTTATCTGCAGCCATAGCCTGGCC  894
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGAACACTTCATGCAAAATTTCTATAGTTATCTGCAGCCATAGCCTGGCC  893

seq1  TTGTGGTAGTCTGGAACTCCAGTTAAATGTCAAAGCAAGCAGCTACAACA  944
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTGTGGTAGTCTGGAACTCCAGTTAAATGTCAAAGCAAGCAGCTACAACA  943

seq1  GGGACACTGACACTTCTTTTGGAAGCAGAACAATTGTACTCAACGTCCTA  994
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGGACACTGACACTTCTTTTGGAAGCAGAACAATTGTACTCAACGTCCTA  993

seq1  ACAGGACATCAAGAGGTTTCAGCTAAAGAAAAATTTACCTTCAATGCCAA  1044
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACAGGACATCAAGAGGTTTCAGCTAAAGAAAAATTTACCTTCAATGCCAA  1043

seq1  AAGCTAACAACCCAGAATAATCAACACCTAAGCAGTTTTACCTTAAACAG  1094
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAGCTAACAACCCAGAATAATCAACACCTAAGCAGTTTTACCTTAAACAG  1093

seq1  TGTCTACGTTCTGCATGAACTAAAACGCCCATGACTTTCCACCATGAGCT  1144
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGTCTACGTTCTGCATGAACTAAAACGCCCATGACTTTCCACCATGAGCT  1143

seq1  GCTCAAACTATTTTAGCAGTATGCAGAGGAAGACAA  1180
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GCTCAAACTATTTTAGCAGTATGCAGAGGAAGACAA  1179

seq1: chr15_63972482_63973646
seq2: B6Ng01-136H14.g_67_1220

seq1  GAATTCAGTATTAGCTGCGCATAGACAAGTCAGCCAGCGTCCTCTCTTCT  50
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAATTCAGTATTAGCTGCGCATAGACAAGTCAGCCAGCGTCCTCTCTTCT  50

seq1  CATTGCTAAGTACTCACTGGCTTCAAAGTATCTGCTGGACAGCTTCACAT  100
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CATTGCTAAGTACTCACTGGCTTCAAAGTATCTGCTGGACAGCTTCACAT  100

seq1  AAGGGCTGAACCCGTTTACTCCACTAGCAATAATACTTGGGTGATATTTA  150
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAGGGCTGAACCCGTTTACTCCACTAGCAATAATACTTGGGTGATATTTA  150

seq1  TCCTACAGAATGGTCAGGCTGCGGCGTCAACACGAACCTCAAGTGACAGG  200
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCCTACAGAATGGTCAGGCTGCGGCGTCAACACGAACCTCAAGTGACAGG  200

seq1  GACACATCCTGCCTATACCACACATATTCTCCCCCAGGCTGAACTGCAAT  250
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GACACATCCTGCCTATACCACACATATTCTCCCCCAGGCTGAACTGCAAT  250

seq1  AGGTGTAGCAAACAAAGCAGCTGCTACCCAATGCTGAGCAGAGGGACATG  300
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGGTGTAGCAAACAAAGCAGCTGCTACCCAATGCTGAGCAGAGGGACATG  300

seq1  AGAAAAAGGCTTAGGGACGGACGGGCCTGGGGAATGTTCTACTCAAGTCC  350
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGAAAAAGGCTTAGGGACGGACGGGCCTGGGGAATGTTCTACTCAAGTCC  350

seq1  GAAGAGCTTTAGCAGAAGCACAGAAATTAGCAATAATGGTAATTCTAGCT  400
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAAGAGCTTTAGCAGAAGCACAGAAATTAGCAATAATGGTAATTCTAGCT  400

seq1  GTTTGTTTAAGTTACGAAATTTCAAAACCACTCTTGACATTTAGACTAAA  450
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTTTGTTTAAGTTACGAAATTTCAAAACCACTCTTGACATTTAGACTAAA  450

seq1  TTATAGGTATATTGATGAAAGACGACAATCTTTCCACAGATTAAAATGAG  500
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTATAGGTATATTGATGAAAGACGACAATCTTTCCACAGATTAAAATGAG  500

seq1  AGCAAAACTAAACAACTTGGCCCAGCTGCATCGTGGTGGGGCAGTCCAGG  550
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGCAAAACTAAACAACTTGGCCCAGCTGCATCGTGGTGGGGCAGTCCAGG  550

seq1  AAGTAAAGTATGTATATACTGTCCCCTTCCCACTCGAACCCCTCCACATC  600
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAGTAAAGTATGTATATACTGTCCCCTTCCCACTCGAACCCCTCCACATC  600

seq1  TTTCTTTCCGGTGTCTAGAGGCCGTGGTTCCTGAGCCAGCAGCCTTCCTC  650
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTTCTTTCCGGTGTCTAGAGGCCGTGGTTCCTGAGCCAGCAGCCTTCCTC  650

seq1  TCACACAAGCCGCCCATCTCTATGGCTGTTTTCCTTTCAAACAATGGTGT  700
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCACACAAGCCGCCCATCTCTATGGCTGTTTTCCTTTCAAACAATGGTGT  700

seq1  GCTTCGTGCTTACTAAACTATGCCATGTATACAGCAAGCACTCAAATATC  750
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GCTTCGTGCTTACTAAACTATGCCATGTATACAGCAAGCACTCAAATATC  750

seq1  AATCAAAGTCCTACCTTCCAAGAACACAGTAAATACTTCCTGTACATTCG  800
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AATCAAAGTCCTACCTTCCAAGAACACAGTAAATACTTCCTGTACATTCG  800

seq1  AAGAAATGCTTTTAGTTTCCTTTACTAGACAACATGAGGGAGAGAGATGC  850
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAGAAATGCTTTTAGTTTCCTTTACTAGACAACATGAGGGAGAGAGATGC  850

seq1  TAATGACCTTCCCCAGCATGCTGAGTAAGCCAGTGGCTGAGGGGACCAGA  900
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TAATGACCTTCCCCAGCATGCTGAGTAAGCCAGTGGCTGAGGGGACCAGA  900

seq1  GCCCCCACTCTTCCCTACACCACCGTGCAGGCCAGCAGGGAAAGGCAGAA  950
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||
seq2  GCCCCCACTCTTCCCTACACCACCGTGCAGGCCAGCAGGAAAAGGCAGAA  950

seq1  ATAGCGGCAGCCCTCAGGGAGTGGCTGCGTATCTGATTCCCACCCAAATT  1000
      |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||
seq2  ATAGCGGCAGCCCTCA-GGAGTGGCTGCGTATCTGATT-CCACCCAAATT  998

seq1  CCTAAGTCAGCTGGATGAAGAGACATTTCAGAAGGTGAAATAGTTTCTCA  1050
      ||||||||||||||||||||||||| ||||||  |||||||||||  |||
seq2  CCTAAGTCAGCTGGATGAAGAGACA-TTCAGA--GTGAAATAGTTCTTCA  1045

seq1  TTCATTTGGTTACTAAAGGTTCTTCCACGTCTTTAAGT-GCTCGTGAAAA  1099
      ||||||||||||||||||  |||  ||||||||||||| ||||||| |||
seq2  TTCATTTGGTTACTAAAG--TCT--CACGTCTTTAAGTGGCTCGTG-AAA  1090

seq1  GCACCGCTGTCACCAGCTCTAGGAAAAGCTG-ATTATCTGAGAGCCCG-T  1147
      |||||||||| |||||||||| | || |||| || |||||| |||||| |
seq2  GCACCGCTGT-ACCAGCTCTAAG-AAGGCTGAATAATCTGA-AGCCCGTT  1137

seq1  CTGCCGGCTGTTCAGGAG  1165
      ||| | ||||||||||||
seq2  CTGGC-GCTGTTCAGGAG  1154