BAC Information

Click to search

BAC

Clone NameB6Ng01-137N21
Chromosome15 (Build37)
Map Location 61,982,450 - 62,134,830
singlet/doubletdoublet
Overlap genePvt1, LOC100040584, H2afy3
Upstream geneLOC100040323, Myc
Downstream geneLOC100040430, Tsg101-ps
LinkOpen Mouse BAC browser



BAC End Information

BAC end BAC-end 1BAC-end 2
end nameB6Ng01-137N21.bB6Ng01-137N21.g
ACCDH937271DH937272
length1,0541,053
definitionDH937271|Mus musculus domesticus DNA, BAC clone: B6Ng01-137N21, 5' end.DH937272|Mus musculus domesticus DNA, BAC clone: B6Ng01-137N21, 3' end.
singlet/doubletdoubletdoublet
BLAST hituniqueunique
Map location.(61,982,450 - 61,983,512)(62,133,769 - 62,134,830)
sequence
gaattcctggaaaagctttacgccatgagacatggattttccttcttgct
atataactggaaccttcatttactgagtgcatgatcagtgtcagggactg
tattgagcctttctgacatagcttgtgagtgtgtgtgtgtgtttgcatat
tggtgcccatttgtgtgttgatgttagaggtctacattgagaatcttctg
caatcctttttttcccttttaaagatttatttttaagactaggcatggtg
gctcacacctttaattccagcactccagagagggaggcaggaggcaggag
gcaggaggcaggaggcaggtggatctccttgtgttcaaggccagctggtc
tatatagtgagttatatccatgaaagccagggctatctagagagagagag
agagagagagagagagagagagagagagagagagagagagagaaagacac
gttcaaacaaaagttgtttttgatattttaaatttgatgtgtttttatgt
gcgctggcatgtgtgtacgagtacaggtggccacagaagccaggggcact
ggatctcctggagctagagttacaggcaactgtaagcagcacagagatta
tagaaatgcactactatgcctggctttttacctgtgggctgggcatctaa
actctcaggttatcaacgcttatatggaaaacgcaactgagctgtctctt
cagcaatcctatgttccagcctttcatctgatgctccttctaacctgatc
tggtctccttctgactggttgggatgctaagctctcagctcggaagcatg
agagctacaggagaaagtactctcatcaatatcaggtgtcaaatatgtcc
tggggtaatgagtcaacctgaaatgggcatgctgttctgttgggcctttg
tacacaaggaagattaagacctgactcattgggtgccattagcagcaggc
tttatagccacaaagccgtagtgccttatgggaaggtagcgtgttcccag
tggccaaacttgggcctcaactcttgtaactgtttcacactatacactga
taag
gaattccaggaagattctggggaggaggatgctgagagagactatctaga
aatctagaagaggatgggggaagcagtccacaagatctgcccacagatgg
aagacagtgtgtctaactgcttttaaatatagggatgtgacaccatcaac
atgtactggttcaggaccatcttagatgctgcctgtcccttgagggaagc
caattgaagagttaatccaagaggctccaccattcatcatcaggctacaa
attgttaatgaattggtcctcacatcatctggtttatatagatagcattc
cagtcgccataagtgtgaagagtgtctttcatttcatggcgtcctgtggt
ctcccagccagacagtgtaatgctttgtgggaagctccaggacataggat
ggcaaacagcaaagttccctgagctgccttggtgggtgatgggtaccaca
gccaggcttggggaacacccatgtctatagctctcgtctgcatcctgtcc
ccagctgaaaaactctaacactacatcctgaccctcagaaggcctaaagg
tcatggaaagtaaatagtgtcaggaaagtcacagtgaatagatcaggatg
gtcgcagaaatgactctgaatttctcaaatctggctagaccccttccacc
gaactagctacttaacatggtacatggactaacacagtgagagaagccaa
aaaagcaaatgggaaaaactagtctcctgaaagagtggctttcaggtaca
gaggtgactgattgctgtgaagagggtgtgtccagaagctgatgctaagc
tagggtggaactgcccaggcttggctgcctctcaattatgtaaaaggtta
tattatgctgggcactcagtagctcttttaaaacatgttctaaatacttt
cagtgtccagtttctcttgggcttaacctggacacaaccacaggagtgtc
tttccaaattaccaatcagaccgtgtctttttctgctcagaccagcactg
gctctgccttaatggtagaatggaaacgattctgcgatgtgccacagttt
acc
quality valuesOpen.Open.




Alignment Information

BAC End 1BAC End 2
seq1: chr15_61982450_61983512
seq2: B6Ng01-137N21.b_47_1099

seq1  GAATTCCTGGAAAAGCTTTACGCCATGAGACATGGATTTTCCTTCTTGCT  50
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAATTCCTGGAAAAGCTTTACGCCATGAGACATGGATTTTCCTTCTTGCT  50

seq1  ATATAACTGGAACCTTCATTTACTGAGTGCATGATCAGTGTCAGGGACTG  100
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATATAACTGGAACCTTCATTTACTGAGTGCATGATCAGTGTCAGGGACTG  100

seq1  TATTGAGCCTTTCTGACATAGCTTGTGAGTGTGTGTGTGTGTTTGCATAT  150
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TATTGAGCCTTTCTGACATAGCTTGTGAGTGTGTGTGTGTGTTTGCATAT  150

seq1  TGGTGCCCATTTGTGTGTTGATGTTAGAGGTCTACATTGAGAATCTTCTG  200
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGGTGCCCATTTGTGTGTTGATGTTAGAGGTCTACATTGAGAATCTTCTG  200

seq1  CAATCCTTTTTTTCCCTTTTAAAGATTTATTTTTAAGACTAGGCATGGTG  250
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CAATCCTTTTTTTCCCTTTTAAAGATTTATTTTTAAGACTAGGCATGGTG  250

seq1  GCTCACACCTTTAATTCCAGCACTCCAGAGAGGGAGGCAGGAGGCAGGAG  300
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GCTCACACCTTTAATTCCAGCACTCCAGAGAGGGAGGCAGGAGGCAGGAG  300

seq1  GCAGGAGGCAGGAGGCAGGTGGATCTCCTTGTGTTCAAGGCCAGCTGGTC  350
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GCAGGAGGCAGGAGGCAGGTGGATCTCCTTGTGTTCAAGGCCAGCTGGTC  350

seq1  TATATAGTGAGTTATATCCATGAAAGCCAGGGCTATCTAGAGAGAGAGAG  400
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TATATAGTGAGTTATATCCATGAAAGCCAGGGCTATCTAGAGAGAGAGAG  400

seq1  AGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAAAGACAC  450
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAAAGACAC  450

seq1  GTTCAAACAAAAGTTGTTTTTGATATTTTAAATTTGATGTGTTTTTATGT  500
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTTCAAACAAAAGTTGTTTTTGATATTTTAAATTTGATGTGTTTTTATGT  500

seq1  GCGCTGGCATGTGTGTACGAGTACAGGTGGCCACAGAAGCCAGGGGCACT  550
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GCGCTGGCATGTGTGTACGAGTACAGGTGGCCACAGAAGCCAGGGGCACT  550

seq1  GGATCTCCTGGAGCTAGAGTTACAGGCAACTGTAAGCAGCACAGAGATTA  600
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGATCTCCTGGAGCTAGAGTTACAGGCAACTGTAAGCAGCACAGAGATTA  600

seq1  TAGAAATGCACTACTATGCCTGGCTTTTTACCTGTGGGCTGGGCATCTAA  650
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TAGAAATGCACTACTATGCCTGGCTTTTTACCTGTGGGCTGGGCATCTAA  650

seq1  ACTCTCAGGTTATCAACGCTTATATGGAAAACGCAACTGAGCTGTCTCTT  700
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACTCTCAGGTTATCAACGCTTATATGGAAAACGCAACTGAGCTGTCTCTT  700

seq1  CAGCAATCCTATGTTCCAGCCTTTCATCTGATGCTCCTTCTAACCTGATC  750
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CAGCAATCCTATGTTCCAGCCTTTCATCTGATGCTCCTTCTAACCTGATC  750

seq1  TGGTCTCCTTCTGACTGGTTGGGATGCTAAGCTCTCAGCTCGGAAGCATG  800
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGGTCTCCTTCTGACTGGTTGGGATGCTAAGCTCTCAGCTCGGAAGCATG  800

seq1  AGAGCTAACAGGAGAAAGTACTCTCATCAATATCAGGTGTCAAATATGTC  850
      |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGAGCT-ACAGGAGAAAGTACTCTCATCAATATCAGGTGTCAAATATGTC  849

seq1  CTGGGGTAATGAGTCAACCTGAAAT-GGCATGCTGTTCTTGTTGGCCCTT  899
      ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||| ||||
seq2  CTGGGGTAATGAGTCAACCTGAAATGGGCATGCTGTTC-TGTTGGGCCTT  898

seq1  TGTACACAAGGAAAGATTAAGACCTGACTCA-TGGGTGCCATTAGCAGCA  948
      ||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||
seq2  TGTACACAAGG-AAGATTAAGACCTGACTCATTGGGTGCCATTAGCAGCA  947

seq1  GGCTTTATAGCCACAAAGCCGTAGTGCCTTATGGGGAAGGTAAGCGTGGT  998
      |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||  
seq2  GGCTTTATAGCCACAAAGCCGTAGTGCCTTAT-GGGAAGGT-AGCGTG--  993

seq1  TTCCCCAGTTGGGCCAAACTTGGGGCCTCAGACTCTTTGTAACTGTTCTA  1048
       | ||||||  |||||||||| |||||||| |||| |||||||||||  |
seq2  -TTCCCAGT--GGCCAAACTT-GGGCCTCA-ACTC-TTGTAACTGTTTCA  1037

seq1  CACTAT-CACTGATAA  1063
      |||||| |||||||||
seq2  CACTATACACTGATAA  1053

seq1: chr15_62133769_62134830
seq2: B6Ng01-137N21.g_69_1121 (reverse)

seq1  GGTAAACTGTGGCAACATCTGCCAGGATCGTTTTCCATTCTACCACTAAG  50
      ||||||||||||| |||||   ||| |||| |||||||||||||| ||||
seq2  GGTAAACTGTGGC-ACATC--GCAGAATCG-TTTCCATTCTACCATTAAG  46

seq1  GCAGAGCCAGTGCTGTGTCTGAGCAGGAAAAAGACACGGTCTGATTGGTA  100
      ||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||
seq2  GCAGAGCCAGTGCTG-GTCTGAGCA-GAAAAAGACACGGTCTGATTGGTA  94

seq1  ATTTGGAAAGAACACTCCTGTGGTTGTGTTCCAGGTTAAGCCCAAGAGAA  150
      |||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||
seq2  ATTTGGAAAG-ACACTCCTGTGGTTGTG-TCCAGGTTAAGCCCAAGAGAA  142

seq1  ACTGGACACTGAAAGTATTTAGAACATGTTTTTAAAAGAGCTACTGAGTG  200
      |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||
seq2  ACTGGACACTGAAAGTATTTAGAACATG-TTTTAAAAGAGCTACTGAGTG  191

seq1  CCCAGCATAATATAACCTTTTACATAATTGAGAGGCAGCCAAGCCTGGGC  250
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCCAGCATAATATAACCTTTTACATAATTGAGAGGCAGCCAAGCCTGGGC  241

seq1  AGTTCCACCCTAGCTTAGCATCAGCTTCTGGACACACCCTCTTCACAGCA  300
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGTTCCACCCTAGCTTAGCATCAGCTTCTGGACACACCCTCTTCACAGCA  291

seq1  ATCAGTCACCTCTGTACCTGAAAGCCACTCTTTCAGGAGACTAGTTTTTC  350
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATCAGTCACCTCTGTACCTGAAAGCCACTCTTTCAGGAGACTAGTTTTTC  341

seq1  CCATTTGCTTTTTTGGCTTCTCTCACTGTGTTAGTCCATGTACCATGTTA  400
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCATTTGCTTTTTTGGCTTCTCTCACTGTGTTAGTCCATGTACCATGTTA  391

seq1  AGTAGCTAGTTCGGTGGAAGGGGTCTAGCCAGATTTGAGAAATTCAGAGT  450
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGTAGCTAGTTCGGTGGAAGGGGTCTAGCCAGATTTGAGAAATTCAGAGT  441

seq1  CATTTCTGCGACCATCCTGATCTATTCACTGTGACTTTCCTGACACTATT  500
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CATTTCTGCGACCATCCTGATCTATTCACTGTGACTTTCCTGACACTATT  491

seq1  TACTTTCCATGACCTTTAGGCCTTCTGAGGGTCAGGATGTAGTGTTAGAG  550
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TACTTTCCATGACCTTTAGGCCTTCTGAGGGTCAGGATGTAGTGTTAGAG  541

seq1  TTTTTCAGCTGGGGACAGGATGCAGACGAGAGCTATAGACATGGGTGTTC  600
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTTTTCAGCTGGGGACAGGATGCAGACGAGAGCTATAGACATGGGTGTTC  591

seq1  CCCAAGCCTGGCTGTGGTACCCATCACCCACCAAGGCAGCTCAGGGAACT  650
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCCAAGCCTGGCTGTGGTACCCATCACCCACCAAGGCAGCTCAGGGAACT  641

seq1  TTGCTGTTTGCCATCCTATGTCCTGGAGCTTCCCACAAAGCATTACACTG  700
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTGCTGTTTGCCATCCTATGTCCTGGAGCTTCCCACAAAGCATTACACTG  691

seq1  TCTGGCTGGGAGACCACAGGACGCCATGAAATGAAAGACACTCTTCACAC  750
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCTGGCTGGGAGACCACAGGACGCCATGAAATGAAAGACACTCTTCACAC  741

seq1  TTATGGCGACTGGAATGCTATCTATATAAACCAGATGATGTGAGGACCAA  800
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTATGGCGACTGGAATGCTATCTATATAAACCAGATGATGTGAGGACCAA  791

seq1  TTCATTAACAATTTGTAGCCTGATGATGAATGGTGGAGCCTCTTGGATTA  850
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTCATTAACAATTTGTAGCCTGATGATGAATGGTGGAGCCTCTTGGATTA  841

seq1  ACTCTTCAATTGGCTTCCCTCAAGGGACAGGCAGCATCTAAGATGGTCCT  900
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACTCTTCAATTGGCTTCCCTCAAGGGACAGGCAGCATCTAAGATGGTCCT  891

seq1  GAACCAGTACATGTTGATGGTGTCACATCCCTATATTTAAAAGCAGTTAG  950
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAACCAGTACATGTTGATGGTGTCACATCCCTATATTTAAAAGCAGTTAG  941

seq1  ACACACTGTCTTCCATCTGTGGGCAGATCTTGTGGACTGCTTCCCCCATC  1000
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACACACTGTCTTCCATCTGTGGGCAGATCTTGTGGACTGCTTCCCCCATC  991

seq1  CTCTTCTAGATTTCTAGATAGTCTCTCTCAGCATCCTCCTCCCCAGAATC  1050
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTCTTCTAGATTTCTAGATAGTCTCTCTCAGCATCCTCCTCCCCAGAATC  1041

seq1  TTCCTGGAATTC  1062
      ||||||||||||
seq2  TTCCTGGAATTC  1053