BAC Information

Click to search

BAC

Clone NameB6Ng01-147H04
Chromosome15 (Build37)
Map Location 95,053,661 - 95,196,629
singlet/doubletdoublet
Overlap geneNell2
Upstream geneD630010B17Rik, Adamts20, Pus7l, Irak4, Twf1, Tmem117, LOC100043315
Downstream geneDbx2, LOC100042684, LOC667849, EG629300, LOC667864, Tmem16f, LOC100043329, D030018L15Rik, LOC100043335, EG667869, LOC667874, LOC667894, Arid2
LinkOpen Mouse BAC browser



BAC End Information

BAC end BAC-end 1BAC-end 2
end nameB6Ng01-147H04.bB6Ng01-147H04.g
ACCDH944328DH944329
length1,2191,069
definitionDH944328|Mus musculus domesticus DNA, BAC clone: B6Ng01-147H04, 5' end.DH944329|Mus musculus domesticus DNA, BAC clone: B6Ng01-147H04, 3' end.
singlet/doubletdoubletdoublet
BLAST hituniqueunique
Map location.(95,195,391 - 95,196,629)(95,053,661 - 95,054,727)
sequence
gaattctttaactggggttggcttacagttcagaggtttggttatgatcc
tcatgacaggaaacatcccagcatagaggcagacatggtgctgaagaggt
agccaaggttctacatccagactgataagcagcaggaagaaaaggacaca
cttggcatagcttggcaatctgagacctcaaagctgaccccccctcccca
gtcacacacttcctgtgacaaagccacacctaatggtgcacttcctagga
gcctatgtggagccattgttatttaagccaccacaaccttgatcagactg
gaagaggcctgaccatatcagggggtctgaccatatcagatatctgctca
gtcaatatatttcaagaatcttcatctcataatcaaaaggatgtgaggtc
acacacagaagtggaaatagctgtctgctagtctgaataagctccccatg
tggcccggatctatagtatttcaagtcagccttgtagaatcttcaacatg
ggctgtcttcttccaatgaacttgagctcactgtgacagttctgaacatt
tctgctgaattactaaagttgaacttcctagaagctgttcttgacttgtt
cattgacttccctccagtcacaggtttcgctgcctcaaaagcattatcca
tccatgcataaccactttatacttattaaacattaatatctgaagagagg
caggatttttatttgtattttaaatgtaaagcttgtttttctcctctaat
acgaaataaagattacatctttaaaaaaaacaaactttgtaaagaaaaag
attttctgaatttcttcttgtgtatggtttctcaaacccattagaagaag
cattcatcaaatatcctttgaaccagtgtgccacagcatgtgaccctcta
ggtaggcaatatccatgcctacacatgcactgctcactaatatgcagatt
gaacttactggagttcaaaattgctcaagattcacaaagaaaataaaaga
ggacttcagttaccatagtgattagctgttgtttacagaactttgttttc
tccatggtgggtctcaagcccttgggacagggttatggacacttatctct
agctttattaaggaactttgtttagccacccattcattcatgataccgag
agcctcactatggtgctttggttagattataaaaagcagctgtaggacgg
ctgagaagagagcttagtc
gaattcactattggattgaacaggttagagatggcatgaaccagtaactg
tgaagagagcacagtagaaatgatccatctataaaacagaaagactgcat
ccaaacagagctttacctcagagccgtggagcaatctgagtggaatgtaa
cgggaatcctcgaagactaggaaggaggaacaggaatctcaaaatctcag
ctcgagcgtgtgggtgcacacacacacacacaaacacacacatacacaca
cacatgcacacatacacacacatacacacatacacacacatacacacaca
cacatacacacacacatccctaaaaatatcataagcaaactgctataaac
caaagatagagtgttatggaggagacaagaggcaggagacagacacatta
actacaaaagaacaaaagttcaaatgatggctcaatcagaaatgatagaa
acacaaaaacaatgaacacaccttgcaaagggctgcaacaatctgtcaga
ttgaactttatgtccactaacacatctttcagaaatattttcagataaat
gcaacttgagacagtttcttcctataggcctacagtacagactttcctct
acagacaacatacaagagacaaaaggggttctttaggctatggcagagtg
actgaatggaagcaggtgtcgactgccccatgtaagaagagataaggagc
aacagagatggtgagtatctgaacaaatataaaatattgtttattcctct
actttttaaaaaatacgggtgattagataaaaacaggagcatggaattat
gagtagagtgttaacaggcatactgtatatggtcagtgtgtacagatagg
cttatgataaagttctatgcttgcaacactcatactttaatgactagtgt
gatgctaagtcatgcaacacactgacacacattaaagccttcagaaaaaa
cagacactagtattgtagcttaagataaaagagtatgttcttattgcatt
cattggtcggtgtgagaagggcacacttgtacatggtgtacacattactg
gtcagaaggacatcttgtg
quality valuesOpen.Open.




Alignment Information

BAC End 1BAC End 2
seq1: chr15_95195391_95196629
seq2: B6Ng01-147H04.b_45_1263 (reverse)

seq1  GACTAAGCCTCTTCTTTCTCTTCTCCTCTGTCTCTCTACAGCTGCCTTTT  50
      ||||||||        |||||||||  | |||   ||||||||| |||||
seq2  GACTAAGC--------TCTCTTCTCAGCCGTC---CTACAGCTG-CTTTT  38

seq1  AATAATCTAACACCAAGCA-CATAGTGA-GCTCTCAGTTACTTAGAATGA  98
       |||||||||| | ||||| |||||||| |||||| ||  | | ||||||
seq2  TATAATCTAAC-CAAAGCACCATAGTGAGGCTCTCGGTATCAT-GAATGA  86

seq1  ATGGGT-GCTAAACAAAGTTTCCTTTAAATTAAGCCTGAGATAAGTTGTT  147
      |||||| ||||||||||| ||||||  ||| ||||  |||||||| ||| 
seq2  ATGGGTGGCTAAACAAAG-TTCCTT--AATAAAGCTAGAGATAAG-TGTC  132

seq1  CATAAACCCTTGTCCCAAGGGCTTGAGACCCACCATGGAGAGAACAAAGT  197
      |||||  || ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||
seq2  CATAA--CCCTGTCCCAAGGGCTTGAGACCCACCATGGAGAAAACAAAGT  180

seq1  TCTGTATACAACAGCTAATCACTATTGATAACTGAAGTCCTCTTTTATTT  247
      |||||| ||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||
seq2  TCTGTAAACAACAGCTAATCACTA-TGGTAACTGAAGTCCTCTTTTATTT  229

seq1  TCTTTGTCGAATCTTGAGCAATTTTGAACTCCAGTAAGTTCAATCTGCAT  297
      ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCTTTGT-GAATCTTGAGCAATTTTGAACTCCAGTAAGTTCAATCTGCAT  278

seq1  ATTTAGTGAGCAGTGCATGTGTAGGCATGGATATTGCCTACCTAGAGGGT  347
      | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  A-TTAGTGAGCAGTGCATGTGTAGGCATGGATATTGCCTACCTAGAGGGT  327

seq1  CACATGCTGTGGCACACTGGTTCAAAGGATATTTGATGAATGCTTCTTCT  397
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CACATGCTGTGGCACACTGGTTCAAAGGATATTTGATGAATGCTTCTTCT  377

seq1  AATGGGTTTGAGAAACCATACACAAGAAGAAATTCAGAAAATCTTTTTCT  447
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AATGGGTTTGAGAAACCATACACAAGAAGAAATTCAGAAAATCTTTTTCT  427

seq1  TTACAAAGTTTGTTTTTTTTAAAGATGTAATCTTTATTTCGTATTAGAGG  497
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTACAAAGTTTGTTTTTTTTAAAGATGTAATCTTTATTTCGTATTAGAGG  477

seq1  AGAAAAACAAGCTTTACATTTAAAATACAAATAAAAATCCTGCCTCTCTT  547
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGAAAAACAAGCTTTACATTTAAAATACAAATAAAAATCCTGCCTCTCTT  527

seq1  CAGATATTAATGTTTAATAAGTATAAAGTGGTTATGCATGGATGGATAAT  597
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CAGATATTAATGTTTAATAAGTATAAAGTGGTTATGCATGGATGGATAAT  577

seq1  GCTTTTGAGGCAGCGAAACCTGTGACTGGAGGGAAGTCAATGAACAAGTC  647
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GCTTTTGAGGCAGCGAAACCTGTGACTGGAGGGAAGTCAATGAACAAGTC  627

seq1  AAGAACAGCTTCTAGGAAGTTCAACTTTAGTAATTCAGCAGAAATGTTCA  697
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAGAACAGCTTCTAGGAAGTTCAACTTTAGTAATTCAGCAGAAATGTTCA  677

seq1  GAACTGTCACAGTGAGCTCAAGTTCATTGGAAGAAGACAGCCCATGTTGA  747
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAACTGTCACAGTGAGCTCAAGTTCATTGGAAGAAGACAGCCCATGTTGA  727

seq1  AGATTCTACAAGGCTGACTTGAAATACTATAGATCCGGGCCACATGGGGA  797
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGATTCTACAAGGCTGACTTGAAATACTATAGATCCGGGCCACATGGGGA  777

seq1  GCTTATTCAGACTAGCAGACAGCTATTTCCACTTCTGTGTGTGACCTCAC  847
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GCTTATTCAGACTAGCAGACAGCTATTTCCACTTCTGTGTGTGACCTCAC  827

seq1  ATCCTTTTGATTATGAGATGAAGATTCTTGAAATATATTGACTGAGCAGA  897
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATCCTTTTGATTATGAGATGAAGATTCTTGAAATATATTGACTGAGCAGA  877

seq1  TATCTGATATGGTCAGACCCCCTGATATGGTCAGGCCTCTTCCAGTCTGA  947
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TATCTGATATGGTCAGACCCCCTGATATGGTCAGGCCTCTTCCAGTCTGA  927

seq1  TCAAGGTTGTGGTGGCTTAAATAACAATGGCTCCACATAGGCTCCTAGGA  997
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCAAGGTTGTGGTGGCTTAAATAACAATGGCTCCACATAGGCTCCTAGGA  977

seq1  AGTGCACCATTAGGTGTGGCTTTGTCACAGGAAGTGTGTGACTGGGGAGG  1047
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGTGCACCATTAGGTGTGGCTTTGTCACAGGAAGTGTGTGACTGGGGAGG  1027

seq1  GGGGGTCAGCTTTGAGGTCTCAGATTGCCAAGCTATGCCAAGTGTGTCCT  1097
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGGGGTCAGCTTTGAGGTCTCAGATTGCCAAGCTATGCCAAGTGTGTCCT  1077

seq1  TTTCTTCCTGCTGCTTATCAGTCTGGATGTAGAACCTTGGCTACCTCTTC  1147
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTTCTTCCTGCTGCTTATCAGTCTGGATGTAGAACCTTGGCTACCTCTTC  1127

seq1  AGCACCATGTCTGCCTCTATGCTGGGATGTTTCCTGTCATGAGGATCATA  1197
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGCACCATGTCTGCCTCTATGCTGGGATGTTTCCTGTCATGAGGATCATA  1177

seq1  ACCAAACCTCTGAACTGTAAGCCAACCCCAGTTAAAGAATTC  1239
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACCAAACCTCTGAACTGTAAGCCAACCCCAGTTAAAGAATTC  1219

seq1: chr15_95053661_95054727
seq2: B6Ng01-147H04.g_70_1138

seq1  GAATTCACTATTGGATTGAACAGGTTAGAGATGGCATGAACCAGTAACTG  50
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAATTCACTATTGGATTGAACAGGTTAGAGATGGCATGAACCAGTAACTG  50

seq1  TGAAGAGAGCACAGTAGAAATGATCCATCTATAAAACAGAAAGACTGCAT  100
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGAAGAGAGCACAGTAGAAATGATCCATCTATAAAACAGAAAGACTGCAT  100

seq1  CCAAACAGAGCTTTACCTCAGAGCCGTGGAGCAATCTGAGTGGAATGTAA  150
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCAAACAGAGCTTTACCTCAGAGCCGTGGAGCAATCTGAGTGGAATGTAA  150

seq1  CGGGAATCCTCGAAGACTAGGAAGGAGGAACAGGAATCTCAAAATCTCAG  200
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CGGGAATCCTCGAAGACTAGGAAGGAGGAACAGGAATCTCAAAATCTCAG  200

seq1  CTCGAGCGTGTGGGTGCACACACACACACACAAACACACACATACACACA  250
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTCGAGCGTGTGGGTGCACACACACACACACAAACACACACATACACACA  250

seq1  CACATGCACACATACACACACATACACACATACACACACATACACACACA  300
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CACATGCACACATACACACACATACACACATACACACACATACACACACA  300

seq1  CACATACACACACACATCCCTAAAAATATCATAAGCAAACTGCTATAAAC  350
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CACATACACACACACATCCCTAAAAATATCATAAGCAAACTGCTATAAAC  350

seq1  CAAAGATAGAGTGTTATGGAGGAGACAAGAGGCAGGAGACAGACACATTA  400
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CAAAGATAGAGTGTTATGGAGGAGACAAGAGGCAGGAGACAGACACATTA  400

seq1  ACTACAAAAGAACAAAAGTTCAAATGATGGCTCAATCAGAAATGATAGAA  450
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACTACAAAAGAACAAAAGTTCAAATGATGGCTCAATCAGAAATGATAGAA  450

seq1  ACACAAAAACAATGAACACACCTTGCAAAGGGCTGCAACAATCTGTCAGA  500
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACACAAAAACAATGAACACACCTTGCAAAGGGCTGCAACAATCTGTCAGA  500

seq1  TTGAACTTTATGTCCACTAACACATCTTTCAGAAATATTTTCAGATAAAT  550
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTGAACTTTATGTCCACTAACACATCTTTCAGAAATATTTTCAGATAAAT  550

seq1  GCAACTTGAGACAGTTTCTTCCTATAGGCCTACAGTACAGACTTTCCTCT  600
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GCAACTTGAGACAGTTTCTTCCTATAGGCCTACAGTACAGACTTTCCTCT  600

seq1  ACAGACAACATACAAGAGACAAAAGGGGTTCTTTAGGCTATGGCAGAGTG  650
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACAGACAACATACAAGAGACAAAAGGGGTTCTTTAGGCTATGGCAGAGTG  650

seq1  ACTGAATGGAAGCAGGTGTCGACTGCCCCATGTAAGAAGAGATAAGGAGC  700
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACTGAATGGAAGCAGGTGTCGACTGCCCCATGTAAGAAGAGATAAGGAGC  700

seq1  AACAGAGATGGTGAGTATCTGAACAAATATAAAATATTGTTTATTCCTCT  750
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AACAGAGATGGTGAGTATCTGAACAAATATAAAATATTGTTTATTCCTCT  750

seq1  ACTTTTTAAAAAATACGGGTGATTAGATAAAAACAGGAGCATGGAATTAT  800
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACTTTTTAAAAAATACGGGTGATTAGATAAAAACAGGAGCATGGAATTAT  800

seq1  GAGTAGAGTGTTAACAGGCATACTGTATATGGTCAGTGTGTACAGATAGG  850
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAGTAGAGTGTTAACAGGCATACTGTATATGGTCAGTGTGTACAGATAGG  850

seq1  CTTATGAT-AAGTTCTATGCTTGCAACACTCATACTTTAATGACTAGTGT  899
      |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTTATGATAAAGTTCTATGCTTGCAACACTCATACTTTAATGACTAGTGT  900

seq1  GATGCTAAGTCATGCAACACACTGACACACATTAAAGCCTTCAG-AAAAA  948
      |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||
seq2  GATGCTAAGTCATGCAACACACTGACACACATTAAAGCCTTCAGAAAAAA  950

seq1  CAGACACTAGTAATTGTAGCTTAAGATAAAAGAGTAATGTTCTTATTGCA  998
      ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||
seq2  CAGACACTAGT-ATTGTAGCTTAAGATAAAAGAGT-ATGTTCTTATTGCA  998

seq1  TTCATTGGTCGGTGTGAG-AGGGCACACTTGTACCATGGTGTACACA-TA  1046
      |||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||| ||
seq2  TTCATTGGTCGGTGTGAGAAGGGCACACTTGTA-CATGGTGTACACATTA  1047

seq1  CTGGCCAG-AGGACATCTTGTG  1067
      |||| ||| |||||||||||||
seq2  CTGGTCAGAAGGACATCTTGTG  1069