BAC Information

Click to search

BAC

Clone NameB6Ng01-149A01
Chromosome15 (Build37)
Map Location 72,433,833 - 72,612,020
singlet/doubletdoublet
Overlap gene1810044A24Rik, LOC665621
Upstream geneLOC100040847, Col22a1, Kcnk9
Downstream genePeg13, LOC100041120, Chrac1, Eif2c2, Ptk2, LOC666053, LOC100040929, Dennd3, Slc45a4, Gpr20, LOC100040946, pPtp4a3
LinkOpen Mouse BAC browser



BAC End Information

BAC end BAC-end 1BAC-end 2
end nameB6Ng01-149A01.bB6Ng01-149A01.g
ACCDH945459DH945460
length1,0631,173
definitionDH945459|Mus musculus domesticus DNA, BAC clone: B6Ng01-149A01, 5' end.DH945460|Mus musculus domesticus DNA, BAC clone: B6Ng01-149A01, 3' end.
singlet/doubletdoubletdoublet
BLAST hituniqueunique
Map location.(72,610,953 - 72,612,020)(72,433,833 - 72,435,017)
sequence
gaattctggagtcccagagagaagtccaggttgctggcaaacatgaacct
ggcccagtagtatgtaccctgagctcagcagcatgcccatgggtcagggt
gaggtgcttaggagagggggctctgttgagtgtggggtgatcactctccc
aggttagaggccaggaggtagtggatgagttgcaagggacctgtccccaa
acacagacgactggcaggttctggcttctcaaagcacccacatggtactg
ctttccagccagccagtaccttaatcttgaatagattttaacaatgtgga
aaggaaatgggaatttagtactgagatgctctagcaatccaacatgtggc
tgcacggggctgaatgctgtatggaccaaggtcttcctttttgtcagaag
aagcgctgccctactaccgctggcatctgcagccttctgtggcctatctg
gtctgtgcacacagaaaggagagctgtggtttgtggatggtgggaacttg
cctgctgatgtaggaagcagcccacaggtaccatttcggggagctgccaa
gcatcagccgttactgtatgacagcaaacaggagagccctctgtgtgtca
agcccatcctggccgtgatgccttgtcctttcttgttagtcaggagtagc
tctggccccagagaaatggcatgtgtggattccagcgctgcctgcttgga
ctgtggcaaggactcacctggtccagtgtttgccaaactcccaaagtaag
aatctaaagggttctttttaatttcctctctgcacagtgccttggctgcc
ctccagcctccagcgttcagcctccagggtatatatggcagtttctcata
catcaactctctccagcttggaaaatttaatgctcaacacaagaaaattt
cagtgtgatctgtgcatgtatgcttcctgccttcaggagtcccaagcctg
cagatcggcacctgagctgccaaatgggcagggatattattttcttccca
ttctactaccttccaatgagtctgtctaccaactttaaatgcttggtatc
cccccaaacccgt
gaattccagccttcagactaggaaagcatacatttctgtgtgtaagccaa
caaatttatgacacttgtcataacagcctcaggacatagacacattagtt
ccctaaaaatgtgactgaggaactctgccacccatggagtggctatatag
caggcttatcagtgaagggaagaagacctcactttgggactgtctaagac
ctggctgaagggtctaaggcatcctagagaggagccctagagagctttgc
tttgagaaccaagaacagcttgccatctgcatgttatagctggtatgtaa
atgaagattctgacaaacaatctgttcttttcagtaatttaatcatcacc
atagtcaccttctgccatggcaaagcacagggctcataaaaggcatggac
aagcaagtgagagacctgatgctgtgagggacctctgacctctcctttta
cccctattgccccaggatccagaggtagggtggttatagccatgtacaga
acctatacatgcagcaggttatagccatgtacagaacctatacatgcagt
aaatggagggcatttactgtaggtgggcagggccaatacctcccacattg
ctaaaagtagagcacatgtctcaggtttgtgactggctgaaacctctcca
tcttgtgattgagtaggggacagaatgatctttccgagagcctgagtatc
tagtggcccggtgatggtactagatatagtacaggcttctaaactaccct
ttccgcatgtatagtaaactgtaagctgtgccatccaaaggaaagaaatc
agggaaaatggtgtaagccaaagggcagagctgagactccactaaagcta
agctctgagagcagaggaagcttgtagtacttcaccgtcactccttagtc
tttggcaagaattggagaagacacttagacttatgcaaggaaggaaaaca
cccttacagagccacagagacatggtatgggtgaaatgtggcctctcttg
gtggacagcactggggtttcttcattcatcctttaattcaacgactcact
cactcgctaatcatgtatgtagcaaagcccagtggaacatcatcacattc
agaccagagtccttcgtattaagaagaataagctctgttctccatgaatt
tatttctgatgacatgtctgcaa
quality valuesOpen.Open.




Alignment Information

BAC End 1BAC End 2
seq1: chr15_72610953_72612020
seq2: B6Ng01-149A01.b_46_1108 (reverse)

seq1  ACGGGTTTGGGGGGATAACAAAGCATTCTAAAGTTGGTAAGACAGACTCA  50
      |||||||||||||||| || ||||||| |||||||||| |||||||||||
seq2  ACGGGTTTGGGGGGAT-ACCAAGCATT-TAAAGTTGGT-AGACAGACTCA  47

seq1  TTGGAAGGTAGTAGAATGGGAAGAAAATAATATCCCTGCCCATTTGGCAG  100
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTGGAAGGTAGTAGAATGGGAAGAAAATAATATCCCTGCCCATTTGGCAG  97

seq1  CTCAGGTGCCGATCTGCAGGCTTGGGACTCCTGGAAGGCAGGAAGCATAC  150
      |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||
seq2  CTCAGGTGCCGATCTGCAGGCTTGGGACTCCT-GAAGGCAGGAAGCATAC  146

seq1  ATGCACAGATCACACCTGAAATTCTCTTGTGTTGAGCATTAAATTTTCCA  200
      |||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATGCACAGATCACA-CTGAAATTTTCTTGTGTTGAGCATTAAATTTTCCA  195

seq1  AGCTGGAGAGAGTTGATGTATGAGAAACTGCCATATATACCCTGGAGGCT  250
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGCTGGAGAGAGTTGATGTATGAGAAACTGCCATATATACCCTGGAGGCT  245

seq1  GAACGCTGGAGGCTGGAGGGCAGCCAAGGCACTGTGCAGAGAGGAAATTA  300
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAACGCTGGAGGCTGGAGGGCAGCCAAGGCACTGTGCAGAGAGGAAATTA  295

seq1  AAAAGAACCCTTTAGATTCTTACTTTGGGAGTTTGGCAAACACTGGACCA  350
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAAAGAACCCTTTAGATTCTTACTTTGGGAGTTTGGCAAACACTGGACCA  345

seq1  GGTGAGTCCTTGCCACAGTCCAAGCAGGCAGCGCTGGAATCCACACATGC  400
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGTGAGTCCTTGCCACAGTCCAAGCAGGCAGCGCTGGAATCCACACATGC  395

seq1  CATTTCTCTGGGGCCAGAGCTACTCCTGACTAACAAGAAAGGACAAGGCA  450
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CATTTCTCTGGGGCCAGAGCTACTCCTGACTAACAAGAAAGGACAAGGCA  445

seq1  TCACGGCCAGGATGGGCTTGACACACAGAGGGCTCTCCTGTTTGCTGTCA  500
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCACGGCCAGGATGGGCTTGACACACAGAGGGCTCTCCTGTTTGCTGTCA  495

seq1  TACAGTAACGGCTGATGCTTGGCAGCTCCCCGAAATGGTACCTGTGGGCT  550
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TACAGTAACGGCTGATGCTTGGCAGCTCCCCGAAATGGTACCTGTGGGCT  545

seq1  GCTTCCTACATCAGCAGGCAAGTTCCCACCATCCACAAACCACAGCTCTC  600
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GCTTCCTACATCAGCAGGCAAGTTCCCACCATCCACAAACCACAGCTCTC  595

seq1  CTTTCTGTGTGCACAGACCAGATAGGCCACAGAAGGCTGCAGATGCCAGC  650
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTTTCTGTGTGCACAGACCAGATAGGCCACAGAAGGCTGCAGATGCCAGC  645

seq1  GGTAGTAGGGCAGCGCTTCTTCTGACAAAAAGGAAGACCTTGGTCCATAC  700
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGTAGTAGGGCAGCGCTTCTTCTGACAAAAAGGAAGACCTTGGTCCATAC  695

seq1  AGCATTCAGCCCCGTGCAGCCACATGTTGGATTGCTAGAGCATCTCAGTA  750
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGCATTCAGCCCCGTGCAGCCACATGTTGGATTGCTAGAGCATCTCAGTA  745

seq1  CTAAATTCCCATTTCCTTTCCACATTGTTAAAATCTATTCAAGATTAAGG  800
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTAAATTCCCATTTCCTTTCCACATTGTTAAAATCTATTCAAGATTAAGG  795

seq1  TACTGGCTGGCTGGAAAGCAGTACCATGTGGGTGCTTTGAGAAGCCAGAA  850
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TACTGGCTGGCTGGAAAGCAGTACCATGTGGGTGCTTTGAGAAGCCAGAA  845

seq1  CCTGCCAGTCGTCTGTGTTTGGGGACAGGTCCCTTGCAACTCATCCACTA  900
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCTGCCAGTCGTCTGTGTTTGGGGACAGGTCCCTTGCAACTCATCCACTA  895

seq1  CCTCCTGGCCTCTAACCTGGGAGAGTGATCACCCCACACTCAACAGAGCC  950
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCTCCTGGCCTCTAACCTGGGAGAGTGATCACCCCACACTCAACAGAGCC  945

seq1  CCCTCTCCTAAGCACCTCACCCTGACCCATGGGCATGCTGCTGAGCTCAG  1000
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCCTCTCCTAAGCACCTCACCCTGACCCATGGGCATGCTGCTGAGCTCAG  995

seq1  GGTACATACTACTGGGCCAGGTTCATGTTTGCCAGCAACCTGGACTTCTC  1050
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGTACATACTACTGGGCCAGGTTCATGTTTGCCAGCAACCTGGACTTCTC  1045

seq1  TCTGGGACTCCAGAATTC  1068
      ||||||||||||||||||
seq2  TCTGGGACTCCAGAATTC  1063

seq1: chr15_72433833_72435017
seq2: B6Ng01-149A01.g_64_1236

seq1  GAATTCCAGCCTTCAGACTAGGAAAGCATACATTTCTGTGTGTAAGCCAA  50
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAATTCCAGCCTTCAGACTAGGAAAGCATACATTTCTGTGTGTAAGCCAA  50

seq1  CAAATTTATGACACTTGTCATAACAGCCTCAGGACATAGACACATTAGTT  100
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CAAATTTATGACACTTGTCATAACAGCCTCAGGACATAGACACATTAGTT  100

seq1  CCCTAAAAATGTGACTGAGGAACTCTGCCACCCATGGAGTGGCTATATAG  150
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCCTAAAAATGTGACTGAGGAACTCTGCCACCCATGGAGTGGCTATATAG  150

seq1  CAGGCTTATCAGTGAAGGGAAGAAGACCTCACTTTGGGACTGTCTAAGAC  200
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CAGGCTTATCAGTGAAGGGAAGAAGACCTCACTTTGGGACTGTCTAAGAC  200

seq1  CTGGCTGAAGGGTCTAAGGCATCCTAGAGAGGAGCCCTAGAGAGCTTTGC  250
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTGGCTGAAGGGTCTAAGGCATCCTAGAGAGGAGCCCTAGAGAGCTTTGC  250

seq1  TTTGAGAACCAAGAACAGCTTGCCATCTGCATGTTATAGCTGGTATGTAA  300
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTTGAGAACCAAGAACAGCTTGCCATCTGCATGTTATAGCTGGTATGTAA  300

seq1  ATGAAGATTCTGACAAACAATCTGTTCTTTTCAGTAATTTAATCATCACC  350
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATGAAGATTCTGACAAACAATCTGTTCTTTTCAGTAATTTAATCATCACC  350

seq1  ATAGTCACCTTCTGCCATGGCAAAGCACAGGGCTCATAAAAGGCATGGAC  400
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATAGTCACCTTCTGCCATGGCAAAGCACAGGGCTCATAAAAGGCATGGAC  400

seq1  AAGCAAGTGAGAGACCTGATGCTGTGAGGGACCTCTGACCTCTCCTTTTA  450
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAGCAAGTGAGAGACCTGATGCTGTGAGGGACCTCTGACCTCTCCTTTTA  450

seq1  CCCCTATTGCCCCAGGATCCAGAGGTAGGGTGGTTATAGCCATGTACAGA  500
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCCCTATTGCCCCAGGATCCAGAGGTAGGGTGGTTATAGCCATGTACAGA  500

seq1  ACCTATACATGCAGCAGGTTATAGCCATGTACAGAACCTATACATGCAGT  550
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACCTATACATGCAGCAGGTTATAGCCATGTACAGAACCTATACATGCAGT  550

seq1  AAATGGAGGGCATTTACTGTAGGTGGGCAGGGCCAATACCTCCCACATTG  600
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAATGGAGGGCATTTACTGTAGGTGGGCAGGGCCAATACCTCCCACATTG  600

seq1  CTAAAAGTAGAGCACATGTCTCAGGTTTGTGACTGGCTGAAACCTCTCCA  650
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTAAAAGTAGAGCACATGTCTCAGGTTTGTGACTGGCTGAAACCTCTCCA  650

seq1  TCTTGTGATTGAGTAGGGGACAGAATGATCTTTCCGAGAGCCTGAGTATC  700
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCTTGTGATTGAGTAGGGGACAGAATGATCTTTCCGAGAGCCTGAGTATC  700

seq1  TAGTGGCCCGGTGATGGTACTAGATATAGTACAGGCTTCTAAACTACCCT  750
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TAGTGGCCCGGTGATGGTACTAGATATAGTACAGGCTTCTAAACTACCCT  750

seq1  TTCCGCATGTATAGTAAACTGTAAGCTGTGCCATCCAAAGGAAAGAAATC  800
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTCCGCATGTATAGTAAACTGTAAGCTGTGCCATCCAAAGGAAAGAAATC  800

seq1  AGGGAAAATGGTGTAAGCCAAAGGGCAGAGCTGAGACTCCACTAAAGCTA  850
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGGGAAAATGGTGTAAGCCAAAGGGCAGAGCTGAGACTCCACTAAAGCTA  850

seq1  AGCTCTGAGAGCAGAGGAAGCTTGTAGTACTTCACCGTCACTCCTTAGTC  900
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGCTCTGAGAGCAGAGGAAGCTTGTAGTACTTCACCGTCACTCCTTAGTC  900

seq1  TTTGGCAAGAA-TGGAGAAGACACTTAGACTTATGCAAGGAAGGAAAACA  949
      ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||   |
seq2  TTTGGCAAGAATTGGAGAAGACACTTAGACTTATGCAAGGAAGGAA---A  947

seq1  ACACCCTTACAGAGCCACAGAGACATGGTATGGGTGAAATGTGGCCTCTC  999
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACACCCTTACAGAGCCACAGAGACATGGTATGGGTGAAATGTGGCCTCTC  997

seq1  TTGTGGGACAGCACTGGGGTTTCTTCATCCATCCTTTAATTCAACCACTC  1049
      |||  ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||
seq2  TTGGTGGACAGCACTGGGGTTTCTTCATTCATCCTTTAATTCAACGACTC  1047

seq1  ACTCACTCGCTCACTCATGTATGTAGCAAAGCCCAGT-GAACATCCATCA  1098
      ||||||||||| | ||||||||||||||||||||||| |||||| |||||
seq2  ACTCACTCGCT-AATCATGTATGTAGCAAAGCCCAGTGGAACAT-CATCA  1095

seq1  CATGCCAGACACAGAAGTCCCTCAGTATTAAGAAGAAAATAAAGCTCTGT  1148
      |||  ||||| ||| ||||| || |||||||||||||    |||||||||
seq2  CAT-TCAGAC-CAG-AGTCCTTC-GTATTAAGAAGAA---TAAGCTCTGT  1138

seq1  CTCCCATGAGTTTATTTCTGATGGACAATGTCTGCAA  1185
         |||||| |||||||||||| ||| ||||||||||
seq2  TCTCCATGAATTTATTTCTGAT-GAC-ATGTCTGCAA  1173