BAC Information

Click to search

BAC

Clone NameB6Ng01-154G08
Chromosome15 (Build37)
Map Location 57,942,696 - 58,055,431
singlet/doubletdoublet
Overlap geneAtad2, LOC665244, 2410187C16Rik, Fbxo32
Upstream geneBC026439, Zhx2, Derl1, Wdr67, BC030396, 9130401M01Rik, Zhx1
Downstream gene8230402K04Rik, Anxa13, LOC100040231, D15Ertd621e, EG631797, Tmem65, EG546638, Trmt12, Rnf139, Tatdn1, Ndufb9, Mtss1, LOC100040330, EG268809
LinkOpen Mouse BAC browser

no map image available.



BAC End Information

BAC end BAC-end 1BAC-end 2
end nameB6Ng01-154G08.bB6Ng01-154G08.g
ACCDH949450DH949451
length1,0361,124
definitionDH949450|Mus musculus domesticus DNA, BAC clone: B6Ng01-154G08, 5' end.DH949451|Mus musculus domesticus DNA, BAC clone: B6Ng01-154G08, 3' end.
singlet/doubletdoubletdoublet
BLAST hituniqueunique
Map location.(58,054,386 - 58,055,431)(57,942,696 - 57,943,831)
sequence
gaattcaagataatcaccccttctgcttgggtgacagagtctggggagga
gagggcagaagatacaaattaggccccagctcatcaataactatattgat
aaagcaatgggctttaatagaatgccacttttagtaaagcagatgtttaa
aagactaaattaattatttcttaaattactatgggtggcaaaggctggtg
aaacataatatatcccttaaggggcctgatttctcaggctgaagtcaggt
ggaaaggaaaatgagtgttccatactcctttgtaaactcaattttcttct
ttcttaagcaaatgcactgtcatctaaaaggaaccttgggcttgttttgt
tcttatgtttcccgaatcatctgattcggcagtgaaatgatttacagttt
gcaaccgctgagcgttaacttggaaatgcaattctaaatactccaaatca
catccctgtaggcctctcgtatacaacagggagcaaggtgaacctataga
ctgaacaactacaggtacaccaggcagcagatatgtacaagatagataca
acacatccagggaaactggagataacgatgatttgtttcttggcaaaaaa
aaaaaaaaaaaaaaaaatgtaactgtcaatcagccttctgatggtgttgt
caaagaactgtacaatcacctctgtaacacatacgtatgtacagacgtga
actcagtaccacaaacaggtcaaaggacttctctgggatcccatatacat
ggggttgactcatccaaggaaacacacttaacctgactcactaaaggctc
actaaggtcaaccagtaagaacaagcagtgatgacaagcacttgtcaaaa
ataacgagcagggctggggatgtagcttgattggtatagtgcttgcctgc
cattcatgagccctgggttccatcatggacacccactcccagggctgctt
tgaaagcacactgagtctgtgtctgtagacatcagcactctgggacaagc
ttatctcaggtgctgctctgtatttagacactggtt
gaattctctgtcaaaccgaccgggcctccgtaaagcagggtctatggaat
ctagccggttggtagctccaatgaccacaatttctcctctgctgtccaaa
ccatccataagagctaacagggttgaaacaatagaactaaacataaaaaa
taagaaaacaaattagtattatggacaaagaatcacacagtagcatttct
tttggtaaaggtttatttcaatgtaaaaacgtgcaaatgaaattttttat
ggcacttagctattgttcaatggaaaacacagggaaactagagatggctc
agggattaagaacccatgctgagaagaggacggcaaccccccagctctcc
cacagaagccaggtattactgagtatgcttatcacctaaactttgtgaac
agggacaggtgagtcaccaaagctcactggccctagtcagcctagtcaaa
cagggaacttcaggttcagtgagagaattaatgtgggggtgagagatggc
tcagcagttcaagtgcttgctttgcaagcagaaggactgacattccaatc
ctcagaattcatttaattgccaagttagtgtggcaaacttgcctgtagtt
tccacctcataaagttaagacatgggacccccaaagttggcaattaatta
gccagactggttgagcaccaggataaaatgagagacccatctcagtaagt
gaaaagaggagctgtcaagatgatttacaacgtcaaccacaaacttccac
gtgcatccacaaacagcttgtctacatacatgcacatgtgcacatacaca
cgaagaatgtaaagtgaaaagtgagacattcagcatcctcccctggctgc
cacatgaatgcatgtgagcacccacgtgcacatatgcacacatttaaaaa
agaaaaccaaatacactgaaatcgagggctggaatgtacatagttcaggt
agagtgtttactaatatatgcaagctgtgtgctcagacaggaaaatatat
aaatatataatatgagcacaaagtaaataatctgtagagtcacaaataga
tcctggacgtaatttttataaaggcatatttcacaggaactgaaagttct
ttacaacataaattgagggacttt
quality valuesOpen.Open.




Alignment Information

BAC End 1BAC End 2
seq1: chr15_58054386_58055431
seq2: B6Ng01-154G08.b_44_1079 (reverse)

seq1  AACCAGTGTTCTTAAAATACAGAGCAGCACCTGGAGATAAGCTTTGGTCC  50
      |||||||| |||  |||||||||||||||||| |||||||||||  ||||
seq2  AACCAGTG-TCT--AAATACAGAGCAGCACCT-GAGATAAGCTT--GTCC  44

seq1  CAAGAAGTGCTGATGTCTACAGAACACAGACTCAGTGTGCTTTCAAAGCA  100
      ||   ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||
seq2  CA--GAGTGCTGATGTCTACAG-ACACAGACTCAGTGTGCTTTCAAAGCA  91

seq1  GCCCTGGGAGTTGGGTGTCCATGATGGAACCCAGGGCTCATGAATGGCAG  150
      |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GCCCTGGGAG-TGGGTGTCCATGATGGAACCCAGGGCTCATGAATGGCAG  140

seq1  GCAAGCACTATACCAATCAAGCTACATCCCCAGCCCTGCTCGTTATTTTT  200
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GCAAGCACTATACCAATCAAGCTACATCCCCAGCCCTGCTCGTTATTTTT  190

seq1  GACAAGTGCTTGTCATCACTGCTTGTTCTTACTGGTTGACCTTAGTGAGC  250
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GACAAGTGCTTGTCATCACTGCTTGTTCTTACTGGTTGACCTTAGTGAGC  240

seq1  CTTTAGTGAGTCAGGTTAAGTGTGTTTCCTTGGATGAGTCAACCCCATGT  300
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTTTAGTGAGTCAGGTTAAGTGTGTTTCCTTGGATGAGTCAACCCCATGT  290

seq1  ATATGGGATCCCAGAGAAGTCCTTTGACCTGTTTGTGGTACTGAGTTCAC  350
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATATGGGATCCCAGAGAAGTCCTTTGACCTGTTTGTGGTACTGAGTTCAC  340

seq1  GTCTGTACATACGTATGTGTTACAGAGGTGATTGTACAGTTCTTTGACAA  400
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTCTGTACATACGTATGTGTTACAGAGGTGATTGTACAGTTCTTTGACAA  390

seq1  CACCATCAGAAGGCTGATTGACAGTTACATTTTTTTTTTTTTTTTTTTTT  450
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CACCATCAGAAGGCTGATTGACAGTTACATTTTTTTTTTTTTTTTTTTTT  440

seq1  TTGCCAAGAAACAAATCATCGTTATCTCCAGTTTCCCTGGATGTGTTGTA  500
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTGCCAAGAAACAAATCATCGTTATCTCCAGTTTCCCTGGATGTGTTGTA  490

seq1  TCTATCTTGTACATATCTGCTGCCTGGTGTACCTGTAGTTGTTCAGTCTA  550
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCTATCTTGTACATATCTGCTGCCTGGTGTACCTGTAGTTGTTCAGTCTA  540

seq1  TAGGTTCACCTTGCTCCCTGTTGTATACGAGAGGCCTACAGGGATGTGAT  600
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TAGGTTCACCTTGCTCCCTGTTGTATACGAGAGGCCTACAGGGATGTGAT  590

seq1  TTGGAGTATTTAGAATTGCATTTCCAAGTTAACGCTCAGCGGTTGCAAAC  650
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTGGAGTATTTAGAATTGCATTTCCAAGTTAACGCTCAGCGGTTGCAAAC  640

seq1  TGTAAATCATTTCACTGCCGAATCAGATGATTCGGGAAACATAAGAACAA  700
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGTAAATCATTTCACTGCCGAATCAGATGATTCGGGAAACATAAGAACAA  690

seq1  AACAAGCCCAAGGTTCCTTTTAGATGACAGTGCATTTGCTTAAGAAAGAA  750
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AACAAGCCCAAGGTTCCTTTTAGATGACAGTGCATTTGCTTAAGAAAGAA  740

seq1  GAAAATTGAGTTTACAAAGGAGTATGGAACACTCATTTTCCTTTCCACCT  800
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAAAATTGAGTTTACAAAGGAGTATGGAACACTCATTTTCCTTTCCACCT  790

seq1  GACTTCAGCCTGAGAAATCAGGCCCCTTAAGGGATATATTATGTTTCACC  850
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GACTTCAGCCTGAGAAATCAGGCCCCTTAAGGGATATATTATGTTTCACC  840

seq1  AGCCTTTGCCACCCATAGTAATTTAAGAAATAATTAATTTAGTCTTTTAA  900
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGCCTTTGCCACCCATAGTAATTTAAGAAATAATTAATTTAGTCTTTTAA  890

seq1  ACATCTGCTTTACTAAAAGTGGCATTCTATTAAAGCCCATTGCTTTATCA  950
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACATCTGCTTTACTAAAAGTGGCATTCTATTAAAGCCCATTGCTTTATCA  940

seq1  ATATAGTTATTGATGAGCTGGGGCCTAATTTGTATCTTCTGCCCTCTCCT  1000
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATATAGTTATTGATGAGCTGGGGCCTAATTTGTATCTTCTGCCCTCTCCT  990

seq1  CCCCAGACTCTGTCACCCAAGCAGAAGGGGTGATTATCTTGAATTC  1046
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCCCAGACTCTGTCACCCAAGCAGAAGGGGTGATTATCTTGAATTC  1036

seq1: chr15_57942696_57943831
seq2: B6Ng01-154G08.g_66_1189

seq1  GAATTCTCTGTCAAACCGACCGGGCCTCCGTAAAGCAGGGTCTATGGAAT  50
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAATTCTCTGTCAAACCGACCGGGCCTCCGTAAAGCAGGGTCTATGGAAT  50

seq1  CTAGCCGGTTGGTAGCTCCAATGACCACAATTTCTCCTCTGCTGTCCAAA  100
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTAGCCGGTTGGTAGCTCCAATGACCACAATTTCTCCTCTGCTGTCCAAA  100

seq1  CCATCCATAAGAGCTAACAGGGTTGAAACAATAGAACTAAACATAAAAAA  150
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCATCCATAAGAGCTAACAGGGTTGAAACAATAGAACTAAACATAAAAAA  150

seq1  TAAGAAAACAAATTAGTATTATGGACAAAGAATCACACAGTAGCATTTCT  200
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TAAGAAAACAAATTAGTATTATGGACAAAGAATCACACAGTAGCATTTCT  200

seq1  TTTGGTAAAGGTTTATTTCAATGTAAAAACGTGCAAATGAAATTTTTTAT  250
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTTGGTAAAGGTTTATTTCAATGTAAAAACGTGCAAATGAAATTTTTTAT  250

seq1  GGCACTTAGCTATTGTTCAATGGAAAACACAGGGAAACTAGAGATGGCTC  300
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGCACTTAGCTATTGTTCAATGGAAAACACAGGGAAACTAGAGATGGCTC  300

seq1  AGGGATTAAGAACCCATGCTGAGAAGAGGACGGCAACCCCCCAGCTCTCC  350
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGGGATTAAGAACCCATGCTGAGAAGAGGACGGCAACCCCCCAGCTCTCC  350

seq1  CACAGAAGCCAGGTATTACTGAGTATGCTTATCACCTAAACTTTGTGAAC  400
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CACAGAAGCCAGGTATTACTGAGTATGCTTATCACCTAAACTTTGTGAAC  400

seq1  AGGGACAGGTGAGTCACCAAAGCTCACTGGCCCTAGTCAGCCTAGTCAAA  450
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGGGACAGGTGAGTCACCAAAGCTCACTGGCCCTAGTCAGCCTAGTCAAA  450

seq1  CAGGGAACTTCAGGTTCAGTGAGAGAATTAATGTGGGGGTGAGAGATGGC  500
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CAGGGAACTTCAGGTTCAGTGAGAGAATTAATGTGGGGGTGAGAGATGGC  500

seq1  TCAGCAGTTCAAGTGCTTGCTTTGCAAGCAGAAGGACTGACATTCCAATC  550
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCAGCAGTTCAAGTGCTTGCTTTGCAAGCAGAAGGACTGACATTCCAATC  550

seq1  CTCAGAATTCATTTAATTGCCAAGTTAGTGTGGCAAACTTGCCTGTAGTT  600
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTCAGAATTCATTTAATTGCCAAGTTAGTGTGGCAAACTTGCCTGTAGTT  600

seq1  TCCACCTCATAAAGTTAAGACATGGGACCCCCAAAGTTGGCAATTAATTA  650
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCCACCTCATAAAGTTAAGACATGGGACCCCCAAAGTTGGCAATTAATTA  650

seq1  GCCAGACTGGTTGAGCACCAGGATAAAATGAGAGACCCATCTCAGTAAGT  700
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GCCAGACTGGTTGAGCACCAGGATAAAATGAGAGACCCATCTCAGTAAGT  700

seq1  GAAAAGAGGAGCTGTCAAGATGATTTACAACGTCAACCACAAACTTCCAC  750
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAAAAGAGGAGCTGTCAAGATGATTTACAACGTCAACCACAAACTTCCAC  750

seq1  GTGCATCCACAAACAGCTTGTCTACATACATGCACATGTGCACATACACA  800
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTGCATCCACAAACAGCTTGTCTACATACATGCACATGTGCACATACACA  800

seq1  CGAAGAATGTAAAGTGAAAAGTGAGACATTCAGCATCCTCCCCTGGCTGC  850
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CGAAGAATGTAAAGTGAAAAGTGAGACATTCAGCATCCTCCCCTGGCTGC  850

seq1  CACATGAATGCATGTGAGCACCCACGTGCACATATGCACACATTTAAAAA  900
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CACATGAATGCATGTGAGCACCCACGTGCACATATGCACACATTTAAAAA  900

seq1  AGAAAACCAAATACACTGAAATCGAGGGCTGGAATGTACATAGTTCAGGG  950
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||
seq2  AGAAAACCAAATACACTGAAATCGAGGGCTGGAATGTACATAGTTCA-GG  949

seq1  TAGAGTGTTTACCTAATAATATGCAAGGCTGTGTGCTCAGGACCAGGAAA  1000
      ||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||   ||||   
seq2  TAGAGTGTTTA-CTAAT-ATATGCAA-GCTGTGTGCTCAG--ACAGG---  991

seq1  AAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAGAGCAACAAAGTAAATAATCTGTAGA  1050
        |||| | | ||| | | || | |||| |||||||||||||||||||||
seq2  --AAAATATATAAATATATAATATGAGC-ACAAAGTAAATAATCTGTAGA  1038

seq1  GTCACAAATAGATCCTGGACGTAATTTTTATAAA-GCATATTTCACAGGG  1099
      |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||
seq2  GTCACAAATAGATCCTGGACGTAATTTTTATAAAGGCATATTTCACA-GG  1087

seq1  AACTTGAAAGTTC-CTACAACATAAATATGA-GGACTTT  1136
      ||| |||||||||  |||||||||||| ||| |||||||
seq2  AAC-TGAAAGTTCTTTACAACATAAAT-TGAGGGACTTT  1124