BAC Information

Click to search

BAC

Clone NameB6Ng01-155O03
Chromosome15 (Build37)
Map Location 84,121,593 - 84,263,102
singlet/doubletdoublet
Overlap geneParvb, Parvg, LOC382988, 1810041L15Rik
Upstream geneLOC100042119, Arfgap3, Pacsin2, LOC414359, Ttll1, Bik, Mcat, Tspo, Ttll12, Scube1, Mpped1, 4931407K02Rik, LOC667167, Sult4a1, Pnpla5, Pnpla3, Samm50
Downstream geneLdoc1l, Arhgap8, 3110043J09Rik, Phf21b, LOC100043084, 4930513L16Rik, Nup50, 5031439G07Rik, LOC628135, Upk3a, 3110048E14Rik, Smc1b, Ribc2, Fbln1, Atxn10
LinkOpen Mouse BAC browser



BAC End Information

BAC end BAC-end 1BAC-end 2
end nameB6Ng01-155O03.bB6Ng01-155O03.g
ACCDH950538DH950539
length1,212532
definitionDH950538|Mus musculus domesticus DNA, BAC clone: B6Ng01-155O03, 5' end.DH950539|Mus musculus domesticus DNA, BAC clone: B6Ng01-155O03, 3' end.
singlet/doubletdoubletdoublet
BLAST hituniqueunique
Map location.(84,121,593 - 84,122,818)(84,262,568 - 84,263,102)
sequence
gaattcttgttgggacttgccaccagacacccagtacatacagttgtaca
aagcgaacctatctggcccattgtgggtggcccacggaggcagatgccca
gggacccatgatagctcaggaatgttacttgccagctggcttgagggggc
tgtgtcaccacagagggagcaggaagggatgagttgactaaaaaagccga
tggcttctgtcccatgttcctacctcctctggttctttgcaaggcaggtg
tgatgtggtctggtgcccgagactgctcttcagggctagggctctgtggc
ctgcatagagaacccagatcttggctgtggagatggggctggttctgtcc
ttgatttcttggcataactttagatcgacccatcctttctccccaggtgc
tgggcctatgggtaggagatgtcccaccaactgcaaagatttgctccaac
tcagactgaaactttacattcagagagcatcagggcaggcagccaggact
gactgcagcctagagcagtccctatccttgtcacccatccccatggggac
agccgattgcctaggagcagaagtcagaagttagcccagtgccaatgata
atggcatgtgttattatggtggatatgtggctgtgacaggcccttttctc
tgcaacctgcaattcccctctttaaaagacagtgctcttaaaagtggcta
ccagggccctgcatggtatcatacacttttaatcctggccctcaggaggc
tgaggcaggtgaatcactgtgagtttttaggccagctggtattggcctgc
cagggctatacagtgagaccctgccttaaaacaacaaacagaccaaaaca
taaaaccatggttgtcaagttgccttggagcaacaggaaaagaatagaga
gaggtcaggcatcagcaagcagaaggcccctgggacctagcatccctgtc
tatctgaggtctctttgtccttccctagagatctcttaagagataccctt
tgagggctggcaaaatgctcagcaggtaagagccactgactgctcttcaa
agtcctgattcaatccagcaccacattggtggctcataaccacccgtatg
gaatctacattcctctctgtgccctgaagacagctacaggtacttagatt
aataataaataaatctttgggctcgagcgagacagtactgacgagtgggt
tacctggagtga
ttggaaggccaagaagaagactggaacacaggcttctcccttcccctgag
ctgagaagaactatttacagaggaaggagtgagctcccaagagaccaagt
attccttggccattcggtggggctgcataagaggtgacctgggctctgag
agtggaacccctcgtgttagaccaaagcactgagatatgaagttactgtt
acatttgttactgttggccctggttaatgggtgaggaaacccagacatgg
ggtctctgaccaaagagtctcccagaggacagggttctggggctcccttg
aaggaggctgaaagtcactaggaaacaagtccttcttggggtaagaacat
ctgagcccggcccccaggaagcatgacctcagtgagaaggatccagtgtc
ccatgtgcctgcctgaggaggcatggtcatttatattttatttttaagct
tgagtgtacaacatgtgtgtgcgtgtgcgtgtgcgtgtgtgtgtgtgtgt
gcatgtgtgtgtgtgtgtgtgtgctttacgcg
quality valuesOpen.Open.




Alignment Information

BAC End 1BAC End 2
seq1: chr15_84121593_84122818
seq2: B6Ng01-155O03.b_44_1255

seq1  GAATTCTTGTTGGGACTTGCCACCAGACACCCAGTACATACAGTTGTACA  50
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAATTCTTGTTGGGACTTGCCACCAGACACCCAGTACATACAGTTGTACA  50

seq1  AAGCGAACCTATCTGGCCCATTGTGGGTGGCCCACGGAGGCAGATGCCCA  100
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAGCGAACCTATCTGGCCCATTGTGGGTGGCCCACGGAGGCAGATGCCCA  100

seq1  GGGACCCATGATAGCTCAGGAATGTTACTTGCCAGCTGGCTTGAGGGGGC  150
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGGACCCATGATAGCTCAGGAATGTTACTTGCCAGCTGGCTTGAGGGGGC  150

seq1  TGTGTCACCACAGAGGGAGCAGGAAGGGATGAGTTGACTAAAAAAGCCGA  200
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGTGTCACCACAGAGGGAGCAGGAAGGGATGAGTTGACTAAAAAAGCCGA  200

seq1  TGGCTTCTGTCCCATGTTCCTACCTCCTCTGGTTCTTTGCAAGGCAGGTG  250
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGGCTTCTGTCCCATGTTCCTACCTCCTCTGGTTCTTTGCAAGGCAGGTG  250

seq1  TGATGTGGTCTGGTGCCCGAGACTGCTCTTCAGGGCTAGGGCTCTGTGGC  300
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGATGTGGTCTGGTGCCCGAGACTGCTCTTCAGGGCTAGGGCTCTGTGGC  300

seq1  CTGCATAGAGAACCCAGATCTTGGCTGTGGAGATGGGGCTGGTTCTGTCC  350
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTGCATAGAGAACCCAGATCTTGGCTGTGGAGATGGGGCTGGTTCTGTCC  350

seq1  TTGATTTCTTGGCATAACTTTAGATCGACCCATCCTTTCTCCCCAGGTGC  400
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTGATTTCTTGGCATAACTTTAGATCGACCCATCCTTTCTCCCCAGGTGC  400

seq1  TGGGCCTATGGGTAGGAGATGTCCCACCAACTGCAAAGATTTGCTCCAAC  450
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGGGCCTATGGGTAGGAGATGTCCCACCAACTGCAAAGATTTGCTCCAAC  450

seq1  TCAGACTGAAACTTTACATTCAGAGAGCATCAGGGCAGGCAGCCAGGACT  500
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCAGACTGAAACTTTACATTCAGAGAGCATCAGGGCAGGCAGCCAGGACT  500

seq1  GACTGCAGCCTAGAGCAGTCCCTATCCTTGTCACCCATCCCCATGGGGAC  550
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GACTGCAGCCTAGAGCAGTCCCTATCCTTGTCACCCATCCCCATGGGGAC  550

seq1  AGCCGATTGCCTAGGAGCAGAAGTCAGAAGTTAGCCCAGTGCCAATGATA  600
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGCCGATTGCCTAGGAGCAGAAGTCAGAAGTTAGCCCAGTGCCAATGATA  600

seq1  ATGGCATGTGTTATTATGGTGGATATGTGGCTGTGACAGGCCCTTTTCTC  650
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATGGCATGTGTTATTATGGTGGATATGTGGCTGTGACAGGCCCTTTTCTC  650

seq1  TGCAACCTGCAATTCCCCTCTTTAAAAGACAGTGCTCTTAAAAGTGGCTA  700
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGCAACCTGCAATTCCCCTCTTTAAAAGACAGTGCTCTTAAAAGTGGCTA  700

seq1  CCAGGGCCCTGCATGGTATCATACACTTTTAATCCTGGCCCTCAGGAGGC  750
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCAGGGCCCTGCATGGTATCATACACTTTTAATCCTGGCCCTCAGGAGGC  750

seq1  TGAGGCAGGTGAATCACTGTGAGTTTTTAGGCCAGCTGGTATTGGCCTGC  800
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGAGGCAGGTGAATCACTGTGAGTTTTTAGGCCAGCTGGTATTGGCCTGC  800

seq1  CAGGGCTATACAGTGAGACCCTGCCTTAAAACAAACAAACAGACCAAAAC  850
      |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||
seq2  CAGGGCTATACAGTGAGACCCTGCCTTAAAAC-AACAAACAGACCAAAAC  849

seq1  ATAAAACCATGGTTGTCAAGTTGCCTTGGAGCAACAGGAAAAGAATAGAG  900
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATAAAACCATGGTTGTCAAGTTGCCTTGGAGCAACAGGAAAAGAATAGAG  899

seq1  AGAGGTCAGGCATCAGCAAGCAGAAGGCCCCTGGGACCTTAGCATCCCTG  950
      |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||
seq2  AGAGGTCAGGCATCAGCAAGCAGAAGGCCCCTGGGACC-TAGCATCCCTG  948

seq1  TCTATCTGAGGTCTCTTTGTCCTTCCCTAGAGATCTTCTTAAGAGATACC  1000
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||
seq2  TCTATCTGAGGTCTCTTTGTCCTTCCCTAGAGATC-TCTTAAGAGATACC  997

seq1  C-TTGAGGGCTGGCAAAATGGCTCAGCAGGTAAGAG-CACTGACTGCTCT  1048
      | ||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||
seq2  CTTTGAGGGCTGGCAAAAT-GCTCAGCAGGTAAGAGCCACTGACTGCTCT  1046

seq1  TCCAAAGGTCCTGATTCAAATCCCAGCAACCACA-TGGTGGCTCATAACC  1097
      ||  || ||||||||||||   ||||| |||||| |||||||||||||||
seq2  TC--AAAGTCCTGATTCAA--TCCAGC-ACCACATTGGTGGCTCATAACC  1091

seq1  ACCCGTAATGAGATCTGACA-TCCTCTTCTGGTGCGCCTGAAGACAGCTA  1146
      |||||| |||  |||| ||| ||||| ||| |||| ||||||||||||||
seq2  ACCCGT-ATGGAATCT-ACATTCCTC-TCT-GTGC-CCTGAAGACAGCTA  1136

seq1  CAGTGTACTTATGTATAATAATAAATAAATCTTTGGGCTGGAGCGAGCAG  1196
      ||| ||||||| |  |||||||||||||||||||||||| |||||||   
seq2  CAG-GTACTTA-GATTAATAATAAATAAATCTTTGGGCTCGAGCGAGACA  1184

seq1  GGACTGAGCGAGTGGGGTTGACTGGAGTGA  1226
      | ||||| ||||| |||||  |||||||||
seq2  GTACTGA-CGAGT-GGGTTACCTGGAGTGA  1212

seq1: chr15_84262568_84263102
seq2: B6Ng01-155O03.g_68_605 (reverse)

seq1  CGCGT---GCACACACACACACACACACATGCACACACACACACACACGC  47
      |||||   ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CGCGTAAAGCACACACACACACACACACATGCACACACACACACACACGC  50

seq1  ACACGCACACGCACACACATGTTGTACACTCAAGCTTAAAAATAAAATAT  97
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACACGCACACGCACACACATGTTGTACACTCAAGCTTAAAAATAAAATAT  100

seq1  AAATGACCATGCCTCCTCAGGCAGGCACATGGGACACTGGATCCTTCTCA  147
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAATGACCATGCCTCCTCAGGCAGGCACATGGGACACTGGATCCTTCTCA  150

seq1  CTGAGGTCATGCTTCCTGGGGGCCGGGCTCAGATGTTCTTACCCCAAGAA  197
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTGAGGTCATGCTTCCTGGGGGCCGGGCTCAGATGTTCTTACCCCAAGAA  200

seq1  GGACTTGTTTCCTAGTGACTTTCAGCCTCCTTCAAGGGAGCCCCAGAACC  247
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGACTTGTTTCCTAGTGACTTTCAGCCTCCTTCAAGGGAGCCCCAGAACC  250

seq1  CTGTCCTCTGGGAGACTCTTTGGTCAGAGACCCCATGTCTGGGTTTCCTC  297
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTGTCCTCTGGGAGACTCTTTGGTCAGAGACCCCATGTCTGGGTTTCCTC  300

seq1  ACCCATTAACCAGGGCCAACAGTAACAAATGTAACAGTAACTTCATATCT  347
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACCCATTAACCAGGGCCAACAGTAACAAATGTAACAGTAACTTCATATCT  350

seq1  CAGTGCTTTGGTCTAACACGAGGGGTTCCACTCTCAGAGCCCAGGTCACC  397
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CAGTGCTTTGGTCTAACACGAGGGGTTCCACTCTCAGAGCCCAGGTCACC  400

seq1  TCTTATGCAGCCCCACCGAATGGCCAAGGAATACTTGGTCTCTTGGGAGC  447
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCTTATGCAGCCCCACCGAATGGCCAAGGAATACTTGGTCTCTTGGGAGC  450

seq1  TCACTCCTTCCTCTGTAAATAGTTCTTCTCAGCTCAGGGGAAGGGAGAAG  497
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCACTCCTTCCTCTGTAAATAGTTCTTCTCAGCTCAGGGGAAGGGAGAAG  500

seq1  CCTGTGTTCCAGTCTTCTTCTTGGCCTTCCAAGAATTC  535
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCTGTGTTCCAGTCTTCTTCTTGGCCTTCCAAGAATTC  538